RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298564.14

TSPAN17-201, Transcript of tetraspanin 17, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TSPAN17, Length 2,810 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN17-201ENST00000298564 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa23.17■■□□□ 1.3
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TSPAN17-201ENST00000298564 APAF1O14727 1248 aa23.14■■□□□ 1.3
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TSPAN17-201ENST00000298564 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa23.13■■□□□ 1.29
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TSPAN17-201ENST00000298564 STK26Q9P289 416 aa23.02■■□□□ 1.28
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TSPAN17-201ENST00000298564 CABP2Q9NPB3 220 aa23.01■■□□□ 1.27
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TSPAN17-201ENST00000298564 SEC24BO95487 1268 aa22.99■■□□□ 1.27
TSPAN17-201ENST00000298564 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
TSPAN17-201ENST00000298564 E9PSI1 815 aa22.98■■□□□ 1.27
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TSPAN17-201ENST00000298564 FAM69CQ0P6D2 419 aa22.98■■□□□ 1.27
TSPAN17-201ENST00000298564 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
TSPAN17-201ENST00000298564 IGHDP01880 384 aa22.97■■□□□ 1.27
TSPAN17-201ENST00000298564 MTHFSP49914 203 aa22.97■■□□□ 1.27
TSPAN17-201ENST00000298564 TULP4Q9NRJ4 1543 aa22.97■■□□□ 1.27
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TSPAN17-201ENST00000298564 NEUROD2Q15784 382 aa22.96■■□□□ 1.27
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TSPAN17-201ENST00000298564 CFAP53Q96M91 514 aa22.9■■□□□ 1.26
TSPAN17-201ENST00000298564 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
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TSPAN17-201ENST00000298564 COG6Q9Y2V7 657 aa22.89■■□□□ 1.25
TSPAN17-201ENST00000298564 USP32Q8NFA0 1604 aa22.89■■□□□ 1.25
TSPAN17-201ENST00000298564 STAG3Q9UJ98 1225 aa22.88■■□□□ 1.25
TSPAN17-201ENST00000298564 A0A1W2PP64 1363 aa22.86■■□□□ 1.25
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TSPAN17-201ENST00000298564 PTPRMP28827 1452 aa22.84■■□□□ 1.25
TSPAN17-201ENST00000298564 GGNBP2Q9H3C7 697 aa22.84■■□□□ 1.25
TSPAN17-201ENST00000298564 USP19O94966 1318 aa22.84■■□□□ 1.25
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TSPAN17-201ENST00000298564 TNNQ9UQP3 1299 aa22.82■■□□□ 1.24
TSPAN17-201ENST00000298564 MLECQ14165 292 aa22.81■■□□□ 1.24
TSPAN17-201ENST00000298564 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
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TSPAN17-201ENST00000298564 IQSEC2Q5JU85 1478 aa22.8■■□□□ 1.24
TSPAN17-201ENST00000298564 DIP2BQ9P265 1576 aa22.8■■□□□ 1.24
TSPAN17-201ENST00000298564 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa22.79■■□□□ 1.24
TSPAN17-201ENST00000298564 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa22.79■■□□□ 1.24
TSPAN17-201ENST00000298564 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa22.79■■□□□ 1.24
TSPAN17-201ENST00000298564 NINLQ9Y2I6 1382 aa22.79■■□□□ 1.24
TSPAN17-201ENST00000298564 ATAD2Q6PL18 1390 aa22.78■■□□□ 1.24
TSPAN17-201ENST00000298564 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
TSPAN17-201ENST00000298564 TERF2IPQ9NYB0 399 aa22.78■■□□□ 1.24
TSPAN17-201ENST00000298564 WDR63Q8IWG1 891 aa22.78■■□□□ 1.24
TSPAN17-201ENST00000298564 FYB1O15117 783 aa22.77■■□□□ 1.24
TSPAN17-201ENST00000298564 CLUAP1Q96AJ1 413 aa22.77■■□□□ 1.24
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