RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296642.4

PGGT1B-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 552 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-201ENST00000296642 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP12.05□□□□□ -0.48
PGGT1B-201ENST00000296642 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP12.05□□□□□ -0.48
PGGT1B-201ENST00000296642 METP08581 1390 aa12.04□□□□□ -0.48
PGGT1B-201ENST00000296642 LAMC1P11047 1609 aa12.04□□□□□ -0.48
PGGT1B-201ENST00000296642 ROCK1Q13464 1354 aa12.04□□□□□ -0.48
PGGT1B-201ENST00000296642 VGFO15240 615 aaPredicted RBP12.03□□□□□ -0.48
PGGT1B-201ENST00000296642 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa12.02□□□□□ -0.49
PGGT1B-201ENST00000296642 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa12.02□□□□□ -0.49
PGGT1B-201ENST00000296642 NALCNQ8IZF0 1738 aa12.02□□□□□ -0.49
PGGT1B-201ENST00000296642 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP12.01□□□□□ -0.49
PGGT1B-201ENST00000296642 ESCO1Q5FWF5 840 aa12.01□□□□□ -0.49
PGGT1B-201ENST00000296642 ORAI2Q96SN7 254 aa12.01□□□□□ -0.49
PGGT1B-201ENST00000296642 HFM1A2PYH4 1435 aa12.01□□□□□ -0.49
PGGT1B-201ENST00000296642 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP12□□□□□ -0.49
PGGT1B-201ENST00000296642 UNC5CLQ8IV45 518 aa11.99□□□□□ -0.49
PGGT1B-201ENST00000296642 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa11.99□□□□□ -0.49
PGGT1B-201ENST00000296642 MYOM2P54296 1465 aa11.98□□□□□ -0.49
PGGT1B-201ENST00000296642 BAG6P46379 1132 aa11.98□□□□□ -0.49
PGGT1B-201ENST00000296642 BCL9LQ86UU0 1499 aa11.97□□□□□ -0.49
PGGT1B-201ENST00000296642 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
PGGT1B-201ENST00000296642 LRP5O75197 1615 aa11.97□□□□□ -0.49
PGGT1B-201ENST00000296642 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa11.96□□□□□ -0.49
PGGT1B-201ENST00000296642 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.49
PGGT1B-201ENST00000296642 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.49
PGGT1B-201ENST00000296642 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa11.96□□□□□ -0.5
PGGT1B-201ENST00000296642 FOXO3O43524 673 aa11.95□□□□□ -0.5
PGGT1B-201ENST00000296642 KIF1BO60333 1816 aa11.95□□□□□ -0.5
PGGT1B-201ENST00000296642 RALGAPBQ86X10 1494 aa11.95□□□□□ -0.5
PGGT1B-201ENST00000296642 PRAG1Q86YV5 1406 aa11.94□□□□□ -0.5
PGGT1B-201ENST00000296642 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa11.94□□□□□ -0.5
PGGT1B-201ENST00000296642 ROBO2Q9HCK4 1378 aa11.94□□□□□ -0.5
PGGT1B-201ENST00000296642 A0A0G2JS52 829 aa11.94□□□□□ -0.5
PGGT1B-201ENST00000296642 MYT1Q01538 1121 aa11.94□□□□□ -0.5
PGGT1B-201ENST00000296642 PSME1Q06323 249 aa11.94□□□□□ -0.5
PGGT1B-201ENST00000296642 KRT27Q7Z3Y8 459 aa11.94□□□□□ -0.5
PGGT1B-201ENST00000296642 DEFB132Q7Z7B7 95 aa11.94□□□□□ -0.5
PGGT1B-201ENST00000296642 SEPT12Q8IYM1 358 aa11.94□□□□□ -0.5
PGGT1B-201ENST00000296642 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa11.93□□□□□ -0.5
PGGT1B-201ENST00000296642 CCDC144AA2RUR9 1427 aa11.93□□□□□ -0.5
PGGT1B-201ENST00000296642 PXDNQ92626 1479 aa11.92□□□□□ -0.5
PGGT1B-201ENST00000296642 ITGAEP38570 1179 aa11.92□□□□□ -0.5
PGGT1B-201ENST00000296642 VPS72Q15906 364 aa11.92□□□□□ -0.5
PGGT1B-201ENST00000296642 SLIT2O94813 1529 aa11.91□□□□□ -0.5
PGGT1B-201ENST00000296642 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa11.9□□□□□ -0.5
PGGT1B-201ENST00000296642 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
PGGT1B-201ENST00000296642 CLTCL1P53675 1640 aa11.89□□□□□ -0.51
PGGT1B-201ENST00000296642 HRCP23327 699 aa11.89□□□□□ -0.51
PGGT1B-201ENST00000296642 GLI3P10071 1580 aa11.88□□□□□ -0.51
PGGT1B-201ENST00000296642 KIF1AQ12756 1690 aa11.88□□□□□ -0.51
PGGT1B-201ENST00000296642 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
PGGT1B-201ENST00000296642 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
PGGT1B-201ENST00000296642 KRT28Q7Z3Y7 464 aa11.88□□□□□ -0.51
PGGT1B-201ENST00000296642 NAIPQ13075 1403 aa11.87□□□□□ -0.51
PGGT1B-201ENST00000296642 USP32Q8NFA0 1604 aa11.87□□□□□ -0.51
PGGT1B-201ENST00000296642 ARHGEF10O15013 1369 aa11.87□□□□□ -0.51
PGGT1B-201ENST00000296642 NWD2Q9ULI1 1742 aa11.86□□□□□ -0.51
PGGT1B-201ENST00000296642 NUTM2FA1L443 756 aa11.86□□□□□ -0.51
PGGT1B-201ENST00000296642 LMOD2Q6P5Q4 547 aa11.86□□□□□ -0.51
PGGT1B-201ENST00000296642 EP400Q96L91 3159 aa11.86□□□□□ -0.51
PGGT1B-201ENST00000296642 BRWD3Q6RI45 1802 aa11.85□□□□□ -0.51
PGGT1B-201ENST00000296642 TNS3Q68CZ2 1445 aa11.85□□□□□ -0.51
PGGT1B-201ENST00000296642 YY1P25490 414 aa11.84□□□□□ -0.51
PGGT1B-201ENST00000296642 STK26Q9P289 416 aa11.84□□□□□ -0.51
PGGT1B-201ENST00000296642 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
PGGT1B-201ENST00000296642 PHF8Q9UPP1 1060 aa11.83□□□□□ -0.52
PGGT1B-201ENST00000296642 TECPR2O15040 1411 aa11.83□□□□□ -0.52
PGGT1B-201ENST00000296642 RGPD1P0DJD0 1748 aa11.83□□□□□ -0.52
PGGT1B-201ENST00000296642 SBNO1A3KN83 1393 aa11.82□□□□□ -0.52
PGGT1B-201ENST00000296642 ABCC11Q96J66 1382 aa11.82□□□□□ -0.52
PGGT1B-201ENST00000296642 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP11.82□□□□□ -0.52
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP11.82□□□□□ -0.52
PGGT1B-201ENST00000296642 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa11.81□□□□□ -0.52
PGGT1B-201ENST00000296642 ADGRB2O60241 1585 aa11.81□□□□□ -0.52
PGGT1B-201ENST00000296642 NBPF8Q3BBV2 869 aa11.81□□□□□ -0.52
PGGT1B-201ENST00000296642 NBPF14Q5TI25 921 aa11.81□□□□□ -0.52
PGGT1B-201ENST00000296642 WAPLQ7Z5K2 1190 aa11.81□□□□□ -0.52
PGGT1B-201ENST00000296642 SIRT1Q96EB6 747 aa11.81□□□□□ -0.52
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP11.81□□□□□ -0.52
PGGT1B-201ENST00000296642 PLCH1Q4KWH8 1693 aa11.81□□□□□ -0.52
PGGT1B-201ENST00000296642 PARD3Q8TEW0 1356 aa11.8□□□□□ -0.52
PGGT1B-201ENST00000296642 PPLO60437 1756 aa11.8□□□□□ -0.52
PGGT1B-201ENST00000296642 PLEKHG5O94827 1062 aa11.8□□□□□ -0.52
PGGT1B-201ENST00000296642 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP11.8□□□□□ -0.52
PGGT1B-201ENST00000296642 FMN2Q9NZ56 1722 aa11.8□□□□□ -0.52
PGGT1B-201ENST00000296642 DISP2A7MBM2 1401 aa11.79□□□□□ -0.52
PGGT1B-201ENST00000296642 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP11.79□□□□□ -0.52
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM196AQ6ZSG2 479 aa11.79□□□□□ -0.52
PGGT1B-201ENST00000296642 CABLES1Q8TDN4 633 aa11.79□□□□□ -0.52
PGGT1B-201ENST00000296642 BTG4Q9NY30 223 aa11.79□□□□□ -0.52
PGGT1B-201ENST00000296642 KNDC1Q76NI1 1749 aa11.78□□□□□ -0.52
PGGT1B-201ENST00000296642 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP11.78□□□□□ -0.52
PGGT1B-201ENST00000296642 GPRASP1Q5JY77 1395 aa11.78□□□□□ -0.52
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM83GA6ND36 823 aa11.77□□□□□ -0.53
PGGT1B-201ENST00000296642 NRXN1Q9ULB1 1477 aa11.76□□□□□ -0.53
PGGT1B-201ENST00000296642 DSG3P32926 999 aa11.76□□□□□ -0.53
PGGT1B-201ENST00000296642 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
PGGT1B-201ENST00000296642 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
PGGT1B-201ENST00000296642 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
PGGT1B-201ENST00000296642 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
PGGT1B-201ENST00000296642 RGL3Q3MIN7 710 aa11.75□□□□□ -0.53
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