RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000294964.5

PKDCC-201, Transcript of protein kinase domain containing, cytoplasmic, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PKDCC, Length 2,502 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCC-201ENST00000294964 CCDC146Q8IYE0 955 aa31.76■■■□□ 2.67
PKDCC-201ENST00000294964 PREX1Q8TCU6 1659 aa31.73■■■□□ 2.67
PKDCC-201ENST00000294964 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP31.73■■■□□ 2.67
PKDCC-201ENST00000294964 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP31.72■■■□□ 2.67
PKDCC-201ENST00000294964 RGS3P49796 1198 aa31.72■■■□□ 2.67
PKDCC-201ENST00000294964 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa31.71■■■□□ 2.67
PKDCC-201ENST00000294964 SYNMO15061 1565 aa31.7■■■□□ 2.67
PKDCC-201ENST00000294964 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa31.7■■■□□ 2.67
PKDCC-201ENST00000294964 NOS1P29475 1434 aa31.7■■■□□ 2.67
PKDCC-201ENST00000294964 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP31.7■■■□□ 2.67
PKDCC-201ENST00000294964 CDCA8Q53HL2 280 aa31.69■■■□□ 2.66
PKDCC-201ENST00000294964 MROH2AA6NES4 1674 aa31.67■■■□□ 2.66
PKDCC-201ENST00000294964 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP31.66■■■□□ 2.66
PKDCC-201ENST00000294964 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP31.66■■■□□ 2.66
PKDCC-201ENST00000294964 ZMYM3Q14202 1370 aa31.65■■■□□ 2.66
PKDCC-201ENST00000294964 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP31.65■■■□□ 2.66
PKDCC-201ENST00000294964 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP31.65■■■□□ 2.66
PKDCC-201ENST00000294964 CARD14Q9BXL6 1004 aa31.65■■■□□ 2.66
PKDCC-201ENST00000294964 ERVK-7P63135 1459 aa31.64■■■□□ 2.65
PKDCC-201ENST00000294964 PIK3C2BO00750 1634 aa31.63■■■□□ 2.65
PKDCC-201ENST00000294964 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP31.63■■■□□ 2.65
PKDCC-201ENST00000294964 TRAK1Q9UPV9 953 aa31.63■■■□□ 2.65
PKDCC-201ENST00000294964 USP19O94966 1318 aa31.62■■■□□ 2.65
PKDCC-201ENST00000294964 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP31.61■■■□□ 2.65
PKDCC-201ENST00000294964 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa31.61■■■□□ 2.65
PKDCC-201ENST00000294964 MYOM1P52179 1685 aa31.61■■■□□ 2.65
PKDCC-201ENST00000294964 TMEM132EQ6IEE7 984 aa31.6■■■□□ 2.65
PKDCC-201ENST00000294964 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa31.6■■■□□ 2.65
PKDCC-201ENST00000294964 RRP9O43818 475 aaKnown RBP31.59■■■□□ 2.65
PKDCC-201ENST00000294964 KIF1BO60333 1816 aa31.59■■■□□ 2.65
PKDCC-201ENST00000294964 ADAMTSL3P82987 1691 aa31.59■■■□□ 2.65
PKDCC-201ENST00000294964 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP31.59■■■□□ 2.65
PKDCC-201ENST00000294964 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP31.59■■■□□ 2.65
PKDCC-201ENST00000294964 DUSP27Q5VZP5 1158 aa31.58■■■□□ 2.65
PKDCC-201ENST00000294964 STAC3Q96MF2 364 aa31.58■■■□□ 2.65
PKDCC-201ENST00000294964 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP31.58■■■□□ 2.65
PKDCC-201ENST00000294964 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP31.58■■■□□ 2.65
PKDCC-201ENST00000294964 C3P01024 1663 aa31.58■■■□□ 2.65
PKDCC-201ENST00000294964 ARXQ96QS3 562 aa31.58■■■□□ 2.65
PKDCC-201ENST00000294964 CLCN1P35523 988 aa31.57■■■□□ 2.65
PKDCC-201ENST00000294964 INSRP06213 1382 aa31.57■■■□□ 2.64
PKDCC-201ENST00000294964 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP31.57■■■□□ 2.64
PKDCC-201ENST00000294964 APAF1O14727 1248 aa31.56■■■□□ 2.64
PKDCC-201ENST00000294964 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP31.56■■■□□ 2.648e-6■■□□□ 13.6
PKDCC-201ENST00000294964 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP31.55■■■□□ 2.64
PKDCC-201ENST00000294964 GOLGA2Q08379 1002 aa31.53■■■□□ 2.64
PKDCC-201ENST00000294964 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP31.52■■■□□ 2.64
PKDCC-201ENST00000294964 ADGRB3O60242 1522 aa31.52■■■□□ 2.64
PKDCC-201ENST00000294964 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP31.51■■■□□ 2.63
PKDCC-201ENST00000294964 NEURL4Q96JN8 1562 aa31.51■■■□□ 2.63
PKDCC-201ENST00000294964 BECN1Q14457 450 aa31.5■■■□□ 2.63
PKDCC-201ENST00000294964 IDI1Q13907 227 aa31.49■■■□□ 2.63
PKDCC-201ENST00000294964 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa31.49■■■□□ 2.63
PKDCC-201ENST00000294964 DMRT2Q9Y5R5 561 aa31.49■■■□□ 2.63
PKDCC-201ENST00000294964 ZNF521Q96K83 1311 aa31.49■■■□□ 2.63
PKDCC-201ENST00000294964 PANK2Q9BZ23 570 aa31.48■■■□□ 2.63
PKDCC-201ENST00000294964 ANTXR1Q9H6X2 564 aa31.48■■■□□ 2.63
PKDCC-201ENST00000294964 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa31.48■■■□□ 2.63
PKDCC-201ENST00000294964 SEC24BO95487 1268 aa31.48■■■□□ 2.63
PKDCC-201ENST00000294964 MYO5BQ9ULV0 1848 aa31.47■■■□□ 2.63
PKDCC-201ENST00000294964 FSD2A1L4K1 749 aa31.46■■■□□ 2.63
PKDCC-201ENST00000294964 SLC52A1Q9NWF4 448 aa31.46■■■□□ 2.63
PKDCC-201ENST00000294964 MYOM2P54296 1465 aa31.45■■■□□ 2.63
PKDCC-201ENST00000294964 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP31.45■■■□□ 2.63
PKDCC-201ENST00000294964 PIK3C2GO75747 1445 aa31.45■■■□□ 2.63
PKDCC-201ENST00000294964 SLFN5Q08AF3 891 aa31.44■■■□□ 2.62
PKDCC-201ENST00000294964 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP31.44■■■□□ 2.62
PKDCC-201ENST00000294964 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa31.44■■■□□ 2.62
PKDCC-201ENST00000294964 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa31.43■■■□□ 2.62
PKDCC-201ENST00000294964 IFT172Q9UG01 1749 aa31.43■■■□□ 2.62
PKDCC-201ENST00000294964 NEUROD2Q15784 382 aa31.42■■■□□ 2.62
PKDCC-201ENST00000294964 PLPPR3Q6T4P5 718 aa31.42■■■□□ 2.62
PKDCC-201ENST00000294964 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP31.41■■■□□ 2.62
PKDCC-201ENST00000294964 TNRQ92752 1358 aa31.41■■■□□ 2.62
PKDCC-201ENST00000294964 BCAR3O75815 825 aa31.41■■■□□ 2.62
PKDCC-201ENST00000294964 NLRP1Q9C000 1473 aa31.39■■■□□ 2.62
PKDCC-201ENST00000294964 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP31.38■■■□□ 2.61
PKDCC-201ENST00000294964 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa31.38■■■□□ 2.61
PKDCC-201ENST00000294964 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP31.37■■■□□ 2.61
PKDCC-201ENST00000294964 PPLO60437 1756 aa31.36■■■□□ 2.61
PKDCC-201ENST00000294964 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP31.36■■■□□ 2.61
PKDCC-201ENST00000294964 MORC1Q86VD1 984 aa31.35■■■□□ 2.61
PKDCC-201ENST00000294964 NSD3Q9BZ95 1437 aa31.35■■■□□ 2.61
PKDCC-201ENST00000294964 IGHDP01880 384 aa31.35■■■□□ 2.61
PKDCC-201ENST00000294964 NRXN1Q9ULB1 1477 aa31.33■■■□□ 2.61
PKDCC-201ENST00000294964 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa31.31■■■□□ 2.6
PKDCC-201ENST00000294964 A2ML1A8K2U0 1454 aa31.3■■■□□ 2.6
PKDCC-201ENST00000294964 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP31.29■■■□□ 2.6
PKDCC-201ENST00000294964 UBR1Q8IWV7 1749 aa31.29■■■□□ 2.6
PKDCC-201ENST00000294964 MYO3AQ8NEV4 1616 aa31.29■■■□□ 2.6
PKDCC-201ENST00000294964 MCM4P33991 863 aa31.29■■■□□ 2.6
PKDCC-201ENST00000294964 PTPRMP28827 1452 aa31.28■■■□□ 2.6
PKDCC-201ENST00000294964 TBC1D2Q9BYX2 928 aa31.28■■■□□ 2.6
PKDCC-201ENST00000294964 STK26Q9P289 416 aa31.28■■■□□ 2.6
PKDCC-201ENST00000294964 CABP2Q9NPB3 220 aa31.26■■■□□ 2.59
PKDCC-201ENST00000294964 SLC24A1O60721 1099 aa31.26■■■□□ 2.59
PKDCC-201ENST00000294964 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa31.25■■■□□ 2.59
PKDCC-201ENST00000294964 STAG3Q9UJ98 1225 aa31.25■■■□□ 2.59
PKDCC-201ENST00000294964 ERBB4Q15303 1308 aa31.24■■■□□ 2.59
PKDCC-201ENST00000294964 MRE11P49959 708 aa31.24■■■□□ 2.59
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