RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000282841.9

GGPS1-201, Transcript of geranylgeranyl diphosphate synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GGPS1, Length 2,895 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGPS1-201ENST00000282841 MYOM1P52179 1685 aa14.86□□□□□ -0.03
GGPS1-201ENST00000282841 UBR1Q8IWV7 1749 aa14.86□□□□□ -0.03
GGPS1-201ENST00000282841 PARD3Q8TEW0 1356 aa14.86□□□□□ -0.03
GGPS1-201ENST00000282841 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
GGPS1-201ENST00000282841 TULP4Q9NRJ4 1543 aa14.85□□□□□ -0.03
GGPS1-201ENST00000282841 EID1Q9Y6B2 187 aa14.85□□□□□ -0.03
GGPS1-201ENST00000282841 HDGFP51858 240 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
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GGPS1-201ENST00000282841 CABP1Q9NZU7 370 aa14.83□□□□□ -0.04
GGPS1-201ENST00000282841 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa14.83□□□□□ -0.04
GGPS1-201ENST00000282841 PPP2R1AP30153 589 aa14.83□□□□□ -0.04
GGPS1-201ENST00000282841 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa14.82□□□□□ -0.04
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GGPS1-201ENST00000282841 MYO3AQ8NEV4 1616 aa14.82□□□□□ -0.04
GGPS1-201ENST00000282841 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
GGPS1-201ENST00000282841 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
GGPS1-201ENST00000282841 NLRP1Q9C000 1473 aa14.8□□□□□ -0.04
GGPS1-201ENST00000282841 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa14.8□□□□□ -0.04
GGPS1-201ENST00000282841 ROBO2Q9HCK4 1378 aa14.8□□□□□ -0.04
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GGPS1-201ENST00000282841 GGNBP2Q9H3C7 697 aa14.79□□□□□ -0.04
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GGPS1-201ENST00000282841 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
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GGPS1-201ENST00000282841 MORC1Q86VD1 984 aa14.77□□□□□ -0.04
GGPS1-201ENST00000282841 A0A1W2PP64 1363 aa14.77□□□□□ -0.05
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GGPS1-201ENST00000282841 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
GGPS1-201ENST00000282841 CGNL1Q0VF96 1302 aa14.72□□□□□ -0.05
GGPS1-201ENST00000282841 ADAMTSL3P82987 1691 aa14.71□□□□□ -0.05
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GGPS1-201ENST00000282841 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa14.71□□□□□ -0.05
GGPS1-201ENST00000282841 FKBP8Q14318 412 aa14.71□□□□□ -0.05
GGPS1-201ENST00000282841 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa14.71□□□□□ -0.06
GGPS1-201ENST00000282841 ZBED9Q6R2W3 1325 aa14.71□□□□□ -0.06
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GGPS1-201ENST00000282841 MTHFSP49914 203 aa14.7□□□□□ -0.06
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GGPS1-201ENST00000282841 ARHGAP23Q9P227 1491 aa14.7□□□□□ -0.06
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GGPS1-201ENST00000282841 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
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GGPS1-201ENST00000282841 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa14.68□□□□□ -0.06
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GGPS1-201ENST00000282841 SIRT1Q96EB6 747 aa14.61□□□□□ -0.07
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GGPS1-201ENST00000282841 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
GGPS1-201ENST00000282841 KNDC1Q76NI1 1749 aa14.57□□□□□ -0.08
GGPS1-201ENST00000282841 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
GGPS1-201ENST00000282841 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
GGPS1-201ENST00000282841 NUDCQ9Y266 331 aa14.56□□□□□ -0.08
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GGPS1-201ENST00000282841 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
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