RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000263233.8

SYP-201, Transcript of synaptophysin, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYP, Length 2,498 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYP-201ENST00000263233 NRXN1Q9ULB1 1477 aa19.19■□□□□ 0.66
SYP-201ENST00000263233 NLRP1Q9C000 1473 aa19.18■□□□□ 0.66
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SYP-201ENST00000263233 NSD3Q9BZ95 1437 aa19.18■□□□□ 0.66
SYP-201ENST00000263233 IQSEC2Q5JU85 1478 aa19.17■□□□□ 0.66
SYP-201ENST00000263233 NEUROD2Q15784 382 aa19.17■□□□□ 0.66
SYP-201ENST00000263233 RUNDC1Q96C34 613 aa19.17■□□□□ 0.66
SYP-201ENST00000263233 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP19.17■□□□□ 0.66
SYP-201ENST00000263233 ABCA9Q8IUA7 1624 aa19.17■□□□□ 0.66
SYP-201ENST00000263233 MORC1Q86VD1 984 aa19.16■□□□□ 0.66
SYP-201ENST00000263233 EFCAB6Q5THR3 1501 aa19.16■□□□□ 0.66
SYP-201ENST00000263233 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP19.16■□□□□ 0.66
SYP-201ENST00000263233 FANCAO15360 1455 aa19.16■□□□□ 0.66
SYP-201ENST00000263233 TCP11L2Q8N4U5 519 aa19.15■□□□□ 0.66
SYP-201ENST00000263233 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP19.14■□□□□ 0.66
SYP-201ENST00000263233 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa19.14■□□□□ 0.66
SYP-201ENST00000263233 TNNQ9UQP3 1299 aa19.14■□□□□ 0.66
SYP-201ENST00000263233 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa19.14■□□□□ 0.66
SYP-201ENST00000263233 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa19.14■□□□□ 0.65
SYP-201ENST00000263233 RLBP1P12271 317 aa19.14■□□□□ 0.65
SYP-201ENST00000263233 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP19.13■□□□□ 0.65
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SYP-201ENST00000263233 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP19.13■□□□□ 0.65
SYP-201ENST00000263233 AAMPQ13685 434 aa19.13■□□□□ 0.65
SYP-201ENST00000263233 BECN1Q14457 450 aa19.13■□□□□ 0.65
SYP-201ENST00000263233 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa19.13■□□□□ 0.65
SYP-201ENST00000263233 WDR63Q8IWG1 891 aa19.12■□□□□ 0.65
SYP-201ENST00000263233 ADGRB3O60242 1522 aa19.11■□□□□ 0.65
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SYP-201ENST00000263233 ADGRL1O94910 1474 aa19.1■□□□□ 0.65
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SYP-201ENST00000263233 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa19.1■□□□□ 0.65
SYP-201ENST00000263233 ZMYM3Q14202 1370 aa19.1■□□□□ 0.65
SYP-201ENST00000263233 FAM69CQ0P6D2 419 aa19.1■□□□□ 0.65
SYP-201ENST00000263233 BCL2L13Q9BXK5 485 aa19.1■□□□□ 0.65
SYP-201ENST00000263233 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa19.1■□□□□ 0.65
SYP-201ENST00000263233 USP32Q8NFA0 1604 aa19.09■□□□□ 0.65
SYP-201ENST00000263233 CCDC27Q2M243 656 aa19.09■□□□□ 0.65
SYP-201ENST00000263233 MTHFSP49914 203 aa19.08■□□□□ 0.65
SYP-201ENST00000263233 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP19.08■□□□□ 0.65
SYP-201ENST00000263233 LMTK2Q8IWU2 1503 aa19.08■□□□□ 0.64
SYP-201ENST00000263233 TBC1D32Q96NH3 1257 aa19.07■□□□□ 0.64
SYP-201ENST00000263233 ANTXR1Q9H6X2 564 aa19.07■□□□□ 0.64
SYP-201ENST00000263233 ADGRB1O14514 1584 aa19.07■□□□□ 0.64
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SYP-201ENST00000263233 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP19.07■□□□□ 0.64
SYP-201ENST00000263233 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP19.07■□□□□ 0.64
SYP-201ENST00000263233 POGKQ9P215 609 aa19.07■□□□□ 0.64
SYP-201ENST00000263233 CD109Q6YHK3 1445 aa19.06■□□□□ 0.64
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SYP-201ENST00000263233 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa19.05■□□□□ 0.64
SYP-201ENST00000263233 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP19.05■□□□□ 0.64
SYP-201ENST00000263233 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP19.05■□□□□ 0.64
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SYP-201ENST00000263233 TBC1D2Q9BYX2 928 aa19.03■□□□□ 0.64
SYP-201ENST00000263233 MYH16Q9H6N6 1097 aa19.03■□□□□ 0.64
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SYP-201ENST00000263233 TSPOAP1O95153 1857 aa19.02■□□□□ 0.64
SYP-201ENST00000263233 ADGRB2O60241 1585 aa19.01■□□□□ 0.63
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SYP-201ENST00000263233 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa18.99■□□□□ 0.63
SYP-201ENST00000263233 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP18.99■□□□□ 0.63
SYP-201ENST00000263233 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP18.99■□□□□ 0.63
SYP-201ENST00000263233 FAM43AQ8N2R8 423 aa18.99■□□□□ 0.63
SYP-201ENST00000263233 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP18.98■□□□□ 0.63
SYP-201ENST00000263233 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa18.97■□□□□ 0.63
SYP-201ENST00000263233 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP18.97■□□□□ 0.63
SYP-201ENST00000263233 NSD2O96028 1365 aa18.97■□□□□ 0.63
SYP-201ENST00000263233 TULP4Q9NRJ4 1543 aa18.97■□□□□ 0.63
SYP-201ENST00000263233 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP18.96■□□□□ 0.63
SYP-201ENST00000263233 GLI2P10070 1586 aa18.96■□□□□ 0.63
SYP-201ENST00000263233 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP18.96■□□□□ 0.63
SYP-201ENST00000263233 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP18.96■□□□□ 0.63
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SYP-201ENST00000263233 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa18.95■□□□□ 0.62
SYP-201ENST00000263233 EVC2Q86UK5 1308 aa18.95■□□□□ 0.62
SYP-201ENST00000263233 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP18.94■□□□□ 0.62
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SYP-201ENST00000263233 TRIM27P14373 513 aa18.92■□□□□ 0.62
SYP-201ENST00000263233 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP18.92■□□□□ 0.62
SYP-201ENST00000263233 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP18.92■□□□□ 0.62
SYP-201ENST00000263233 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa18.92■□□□□ 0.62
SYP-201ENST00000263233 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa18.92■□□□□ 0.62
SYP-201ENST00000263233 PLEKHF1Q96S99 279 aa18.92■□□□□ 0.62
SYP-201ENST00000263233 C22orf23Q9BZE7 217 aa18.92■□□□□ 0.62
SYP-201ENST00000263233 GGT6Q6P531 493 aa18.91■□□□□ 0.62
SYP-201ENST00000263233 CABP2Q9NPB3 220 aa18.91■□□□□ 0.62
SYP-201ENST00000263233 DIP2BQ9P265 1576 aa18.9■□□□□ 0.62
SYP-201ENST00000263233 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP18.9■□□□□ 0.62
SYP-201ENST00000263233 SSH1Q8WYL5 1049 aa18.9■□□□□ 0.62
SYP-201ENST00000263233 TRIM35Q9UPQ4 493 aa18.9■□□□□ 0.62
SYP-201ENST00000263233 TMPOP42166 694 aaKnown RBP18.9■□□□□ 0.62
SYP-201ENST00000263233 HECW2Q9P2P5 1572 aa18.89■□□□□ 0.61
SYP-201ENST00000263233 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP18.89■□□□□ 0.61
SYP-201ENST00000263233 DDX19BQ9UMR2 479 aa18.89■□□□□ 0.61
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