RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262395.9

TRAF4-201, Transcript of TNF receptor associated factor 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAF4, Length 2,923 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF4-201ENST00000262395 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
TRAF4-201ENST00000262395 TBC1D32Q96NH3 1257 aa22.92■■□□□ 1.26
TRAF4-201ENST00000262395 ABCA6Q8N139 1617 aa22.91■■□□□ 1.26
TRAF4-201ENST00000262395 NGEFQ8N5V2 710 aa22.91■■□□□ 1.26
TRAF4-201ENST00000262395 ANTXR1Q9H6X2 564 aa22.91■■□□□ 1.26
TRAF4-201ENST00000262395 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
TRAF4-201ENST00000262395 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP22.91■■□□□ 1.263e-7■■□□□ 12.8
TRAF4-201ENST00000262395 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
TRAF4-201ENST00000262395 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa22.9■■□□□ 1.26
TRAF4-201ENST00000262395 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.26
TRAF4-201ENST00000262395 NINLQ9Y2I6 1382 aa22.89■■□□□ 1.25
TRAF4-201ENST00000262395 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
TRAF4-201ENST00000262395 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
TRAF4-201ENST00000262395 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP22.88■■□□□ 1.25
TRAF4-201ENST00000262395 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
TRAF4-201ENST00000262395 NOS1P29475 1434 aa22.87■■□□□ 1.25
TRAF4-201ENST00000262395 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa22.86■■□□□ 1.25
TRAF4-201ENST00000262395 TET3O43151 1660 aa22.85■■□□□ 1.25
TRAF4-201ENST00000262395 WDR63Q8IWG1 891 aa22.85■■□□□ 1.25
TRAF4-201ENST00000262395 FAM43AQ8N2R8 423 aa22.85■■□□□ 1.25
TRAF4-201ENST00000262395 SLC24A1O60721 1099 aa22.85■■□□□ 1.25
TRAF4-201ENST00000262395 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa22.84■■□□□ 1.25
TRAF4-201ENST00000262395 MVPQ14764 893 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
TRAF4-201ENST00000262395 CFAP53Q96M91 514 aa22.84■■□□□ 1.25
TRAF4-201ENST00000262395 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
TRAF4-201ENST00000262395 SHPRHQ149N8 1683 aa22.83■■□□□ 1.24
TRAF4-201ENST00000262395 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.24
TRAF4-201ENST00000262395 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
TRAF4-201ENST00000262395 SMC4Q9NTJ3 1288 aa22.82■■□□□ 1.24
TRAF4-201ENST00000262395 SHROOM2Q13796 1616 aa22.82■■□□□ 1.24
TRAF4-201ENST00000262395 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa22.81■■□□□ 1.24
TRAF4-201ENST00000262395 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
TRAF4-201ENST00000262395 MYH16Q9H6N6 1097 aa22.81■■□□□ 1.24
TRAF4-201ENST00000262395 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
TRAF4-201ENST00000262395 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
TRAF4-201ENST00000262395 ITPRIPQ8IWB1 547 aa22.81■■□□□ 1.24
TRAF4-201ENST00000262395 ATP7AQ04656 1500 aa22.8■■□□□ 1.24
TRAF4-201ENST00000262395 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa22.79■■□□□ 1.24
TRAF4-201ENST00000262395 GGT6Q6P531 493 aa22.79■■□□□ 1.24
TRAF4-201ENST00000262395 C22orf23Q9BZE7 217 aa22.79■■□□□ 1.24
TRAF4-201ENST00000262395 CABP2Q9NPB3 220 aa22.79■■□□□ 1.24
TRAF4-201ENST00000262395 IQSEC2Q5JU85 1478 aa22.79■■□□□ 1.24
TRAF4-201ENST00000262395 DEPDC5O75140 1603 aa22.78■■□□□ 1.24
TRAF4-201ENST00000262395 MYOM2P54296 1465 aa22.78■■□□□ 1.24
TRAF4-201ENST00000262395 PANK2Q9BZ23 570 aa22.78■■□□□ 1.24
TRAF4-201ENST00000262395 FANCAO15360 1455 aa22.78■■□□□ 1.24
TRAF4-201ENST00000262395 MROH2AA6NES4 1674 aa22.77■■□□□ 1.24
TRAF4-201ENST00000262395 TRIM27P14373 513 aa22.77■■□□□ 1.24
TRAF4-201ENST00000262395 MCM4P33991 863 aa22.76■■□□□ 1.23
TRAF4-201ENST00000262395 SSH1Q8WYL5 1049 aa22.76■■□□□ 1.23
TRAF4-201ENST00000262395 KIF1BO60333 1816 aa22.75■■□□□ 1.23
TRAF4-201ENST00000262395 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP22.75■■□□□ 1.233e-10■■□□□ 12.6
TRAF4-201ENST00000262395 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa22.75■■□□□ 1.23
TRAF4-201ENST00000262395 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
TRAF4-201ENST00000262395 GGNBP2Q9H3C7 697 aa22.75■■□□□ 1.23
TRAF4-201ENST00000262395 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
TRAF4-201ENST00000262395 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
TRAF4-201ENST00000262395 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa22.73■■□□□ 1.23
TRAF4-201ENST00000262395 AAMPQ13685 434 aa22.73■■□□□ 1.23
TRAF4-201ENST00000262395 CCDC27Q2M243 656 aa22.73■■□□□ 1.23
TRAF4-201ENST00000262395 VWDEQ8N2E2 1590 aa22.72■■□□□ 1.23
TRAF4-201ENST00000262395 ADGRL1O94910 1474 aa22.72■■□□□ 1.23
TRAF4-201ENST00000262395 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa22.72■■□□□ 1.23
TRAF4-201ENST00000262395 STK26Q9P289 416 aa22.72■■□□□ 1.23
TRAF4-201ENST00000262395 MROH1Q8NDA8 1641 aa22.7■■□□□ 1.22
TRAF4-201ENST00000262395 TMEM57Q8N5G2 664 aa22.7■■□□□ 1.22
TRAF4-201ENST00000262395 TRAK2O60296 914 aa22.69■■□□□ 1.22
TRAF4-201ENST00000262395 RSPH6AQ9H0K4 717 aa22.69■■□□□ 1.22
TRAF4-201ENST00000262395 TMPOP42166 694 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
TRAF4-201ENST00000262395 LNPKQ9C0E8 428 aa22.68■■□□□ 1.22
TRAF4-201ENST00000262395 CHMP5Q9NZZ3 219 aa22.68■■□□□ 1.22
TRAF4-201ENST00000262395 TRIM35Q9UPQ4 493 aa22.68■■□□□ 1.22
TRAF4-201ENST00000262395 QRICH2Q9H0J4 1663 aa22.68■■□□□ 1.22
TRAF4-201ENST00000262395 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa22.68■■□□□ 1.22
TRAF4-201ENST00000262395 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
TRAF4-201ENST00000262395 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
TRAF4-201ENST00000262395 EFCAB6Q5THR3 1501 aa22.67■■□□□ 1.22
TRAF4-201ENST00000262395 FOXD4L1Q9NU39 408 aa22.67■■□□□ 1.22
TRAF4-201ENST00000262395 EVC2Q86UK5 1308 aa22.66■■□□□ 1.22
TRAF4-201ENST00000262395 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
TRAF4-201ENST00000262395 HSCBQ8IWL3 235 aa22.66■■□□□ 1.22
TRAF4-201ENST00000262395 NRXN1Q9ULB1 1477 aa22.66■■□□□ 1.22
TRAF4-201ENST00000262395 DDX19BQ9UMR2 479 aa22.65■■□□□ 1.22
TRAF4-201ENST00000262395 IFT172Q9UG01 1749 aa22.65■■□□□ 1.22
TRAF4-201ENST00000262395 RIPK4P57078 832 aa22.65■■□□□ 1.22
TRAF4-201ENST00000262395 MYO3AQ8NEV4 1616 aa22.65■■□□□ 1.22
TRAF4-201ENST00000262395 CD109Q6YHK3 1445 aa22.64■■□□□ 1.22
TRAF4-201ENST00000262395 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa22.63■■□□□ 1.21
TRAF4-201ENST00000262395 PLEKHF1Q96S99 279 aa22.63■■□□□ 1.21
TRAF4-201ENST00000262395 FBLN1P23142 703 aa22.63■■□□□ 1.21
TRAF4-201ENST00000262395 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
TRAF4-201ENST00000262395 FSD2A1L4K1 749 aa22.61■■□□□ 1.21
TRAF4-201ENST00000262395 C1orf115Q9H7X2 142 aa22.61■■□□□ 1.21
TRAF4-201ENST00000262395 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa22.61■■□□□ 1.21
TRAF4-201ENST00000262395 NPATQ14207 1427 aa22.61■■□□□ 1.21
TRAF4-201ENST00000262395 ZMYM3Q14202 1370 aa22.6■■□□□ 1.21
TRAF4-201ENST00000262395 SMC5Q8IY18 1101 aa22.6■■□□□ 1.21
TRAF4-201ENST00000262395 ADGRB1O14514 1584 aa22.6■■□□□ 1.21
TRAF4-201ENST00000262395 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa22.6■■□□□ 1.21
TRAF4-201ENST00000262395 ADGRB3O60242 1522 aa22.6■■□□□ 1.21
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