RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000253462.7

GINS2-201, Transcript of GINS complex subunit 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GINS2, Length 2,673 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS2-201ENST00000253462 POGKQ9P215 609 aa21.42■■□□□ 1.02
GINS2-201ENST00000253462 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
GINS2-201ENST00000253462 CCDC136Q96JN2 1154 aa21.41■■□□□ 1.02
GINS2-201ENST00000253462 ALKQ9UM73 1620 aa21.41■■□□□ 1.02
GINS2-201ENST00000253462 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
GINS2-201ENST00000253462 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
GINS2-201ENST00000253462 RIMS2Q9UQ26 1411 aa21.4■■□□□ 1.02
GINS2-201ENST00000253462 CDCA7LQ96GN5 454 aa21.39■■□□□ 1.01
GINS2-201ENST00000253462 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
GINS2-201ENST00000253462 TRHP20396 242 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
GINS2-201ENST00000253462 PLPPR3Q6T4P5 718 aa21.38■■□□□ 1.01
GINS2-201ENST00000253462 PTPRMP28827 1452 aa21.37■■□□□ 1.01
GINS2-201ENST00000253462 MORC1Q86VD1 984 aa21.36■■□□□ 1.01
GINS2-201ENST00000253462 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
GINS2-201ENST00000253462 WAPLQ7Z5K2 1190 aa21.34■■□□□ 1.01
GINS2-201ENST00000253462 CCDC146Q8IYE0 955 aa21.34■■□□□ 1.01
GINS2-201ENST00000253462 ERICH6Q7L0X2 663 aa21.32■■□□□ 1
GINS2-201ENST00000253462 TNRQ92752 1358 aa21.32■■□□□ 1
GINS2-201ENST00000253462 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
GINS2-201ENST00000253462 CGNL1Q0VF96 1302 aa21.31■■□□□ 1
GINS2-201ENST00000253462 INSRP06213 1382 aa21.31■■□□□ 1
GINS2-201ENST00000253462 PDE3BQ13370 1112 aa21.31■■□□□ 1
GINS2-201ENST00000253462 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa21.3■■□□□ 1
GINS2-201ENST00000253462 EXOC6Q8TAG9 804 aa21.3■■□□□ 1
GINS2-201ENST00000253462 RRP1P56182 461 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
GINS2-201ENST00000253462 CDK19Q9BWU1 502 aa21.29■■□□□ 1
GINS2-201ENST00000253462 RCAN3Q9UKA8 241 aa21.28■■□□□ 1
GINS2-201ENST00000253462 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa21.28■■□□□ 1
GINS2-201ENST00000253462 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP21.28■■□□□ 1
GINS2-201ENST00000253462 A0A1W2PP64 1363 aa21.27■■□□□ 1
GINS2-201ENST00000253462 METP08581 1390 aa21.26■□□□□ 0.99
GINS2-201ENST00000253462 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP21.26■□□□□ 0.99
GINS2-201ENST00000253462 TXNDC2Q86VQ3 553 aa21.25■□□□□ 0.99
GINS2-201ENST00000253462 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa21.25■□□□□ 0.99
GINS2-201ENST00000253462 APAF1O14727 1248 aa21.24■□□□□ 0.99
GINS2-201ENST00000253462 MTHFSP49914 203 aa21.24■□□□□ 0.99
GINS2-201ENST00000253462 ATAD2Q6PL18 1390 aa21.24■□□□□ 0.99
GINS2-201ENST00000253462 GGNBP2Q9H3C7 697 aa21.23■□□□□ 0.99
GINS2-201ENST00000253462 CABP1Q9NZU7 370 aa21.23■□□□□ 0.99
GINS2-201ENST00000253462 HDGFP51858 240 aaKnown RBP21.23■□□□□ 0.99
GINS2-201ENST00000253462 PLIN1O60240 522 aa21.22■□□□□ 0.99
GINS2-201ENST00000253462 USP32Q8NFA0 1604 aa21.22■□□□□ 0.99
GINS2-201ENST00000253462 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP21.22■□□□□ 0.99
GINS2-201ENST00000253462 UBR1Q8IWV7 1749 aa21.22■□□□□ 0.99
GINS2-201ENST00000253462 TERF2IPQ9NYB0 399 aa21.22■□□□□ 0.99
GINS2-201ENST00000253462 TMEM2Q9UHN6 1383 aa21.21■□□□□ 0.99
GINS2-201ENST00000253462 ABCC11Q96J66 1382 aa21.2■□□□□ 0.98
GINS2-201ENST00000253462 NINLQ9Y2I6 1382 aa21.19■□□□□ 0.98
GINS2-201ENST00000253462 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP21.19■□□□□ 0.98
GINS2-201ENST00000253462 LTKP29376 864 aa21.18■□□□□ 0.98
GINS2-201ENST00000253462 CD163L1Q9NR16 1453 aa21.18■□□□□ 0.98
GINS2-201ENST00000253462 DLC1Q96QB1 1528 aa21.18■□□□□ 0.98
GINS2-201ENST00000253462 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP21.17■□□□□ 0.98
GINS2-201ENST00000253462 FYB1O15117 783 aa21.17■□□□□ 0.98
GINS2-201ENST00000253462 GOLGA2Q08379 1002 aa21.16■□□□□ 0.98
GINS2-201ENST00000253462 ZNF521Q96K83 1311 aa21.16■□□□□ 0.98
GINS2-201ENST00000253462 NSD2O96028 1365 aa21.15■□□□□ 0.98
GINS2-201ENST00000253462 SHPRHQ149N8 1683 aa21.15■□□□□ 0.98
GINS2-201ENST00000253462 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP21.15■□□□□ 0.98
GINS2-201ENST00000253462 C3P01024 1663 aa21.14■□□□□ 0.98
GINS2-201ENST00000253462 NEUROD2Q15784 382 aa21.14■□□□□ 0.98
GINS2-201ENST00000253462 CFAP53Q96M91 514 aa21.14■□□□□ 0.98
GINS2-201ENST00000253462 DUSP27Q5VZP5 1158 aa21.14■□□□□ 0.97
GINS2-201ENST00000253462 SLC26A8Q96RN1 970 aa21.14■□□□□ 0.97
GINS2-201ENST00000253462 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa21.13■□□□□ 0.97
GINS2-201ENST00000253462 WASLO00401 505 aaPredicted RBP21.13■□□□□ 0.97
GINS2-201ENST00000253462 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP21.13■□□□□ 0.97
GINS2-201ENST00000253462 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa21.13■□□□□ 0.97
GINS2-201ENST00000253462 SKAP1Q86WV1 359 aa21.12■□□□□ 0.97
GINS2-201ENST00000253462 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP21.12■□□□□ 0.97
GINS2-201ENST00000253462 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP21.12■□□□□ 0.97
GINS2-201ENST00000253462 DMRT2Q9Y5R5 561 aa21.11■□□□□ 0.97
GINS2-201ENST00000253462 NLRP1Q9C000 1473 aa21.1■□□□□ 0.97
GINS2-201ENST00000253462 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa21.1■□□□□ 0.97
GINS2-201ENST00000253462 SLFN5Q08AF3 891 aa21.1■□□□□ 0.97
GINS2-201ENST00000253462 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP21.09■□□□□ 0.97
GINS2-201ENST00000253462 FBLN1P23142 703 aa21.09■□□□□ 0.97
GINS2-201ENST00000253462 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP21.09■□□□□ 0.97
GINS2-201ENST00000253462 EID1Q9Y6B2 187 aa21.09■□□□□ 0.97
GINS2-201ENST00000253462 CRBNQ96SW2 442 aa21.08■□□□□ 0.97
GINS2-201ENST00000253462 ROBO2Q9HCK4 1378 aa21.08■□□□□ 0.96
GINS2-201ENST00000253462 C20orf194Q5TEA3 1177 aa21.08■□□□□ 0.96
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GINS2-201ENST00000253462 RUNDC1Q96C34 613 aa21.07■□□□□ 0.96
GINS2-201ENST00000253462 NUTM2FA1L443 756 aa21.07■□□□□ 0.96
GINS2-201ENST00000253462 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa21.07■□□□□ 0.96
GINS2-201ENST00000253462 TCP11L2Q8N4U5 519 aa21.07■□□□□ 0.96
GINS2-201ENST00000253462 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa21.06■□□□□ 0.96
GINS2-201ENST00000253462 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP21.06■□□□□ 0.96
GINS2-201ENST00000253462 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP21.06■□□□□ 0.96
GINS2-201ENST00000253462 NBR1Q14596 966 aa21.05■□□□□ 0.96
GINS2-201ENST00000253462 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP21.05■□□□□ 0.96
GINS2-201ENST00000253462 FAM135BQ49AJ0 1406 aa21.05■□□□□ 0.96
GINS2-201ENST00000253462 WWC1Q8IX03 1113 aa21.05■□□□□ 0.96
GINS2-201ENST00000253462 KNDC1Q76NI1 1749 aa21.05■□□□□ 0.96
GINS2-201ENST00000253462 TECPR2O15040 1411 aa21.05■□□□□ 0.96
GINS2-201ENST00000253462 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa21.04■□□□□ 0.96
GINS2-201ENST00000253462 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP21.04■□□□□ 0.96
GINS2-201ENST00000253462 SIRT1Q96EB6 747 aa21.03■□□□□ 0.96
GINS2-201ENST00000253462 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP21.03■□□□□ 0.96
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