RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000252771.11

FCHO1-201, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene FCHO1, Length 3,118 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-201ENST00000252771 PRAM1Q96QH2 718 aa22.67■■□□□ 1.22
FCHO1-201ENST00000252771 RIMS2Q9UQ26 1411 aa22.67■■□□□ 1.22
FCHO1-201ENST00000252771 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
FCHO1-201ENST00000252771 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa22.65■■□□□ 1.22
FCHO1-201ENST00000252771 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa22.65■■□□□ 1.22
FCHO1-201ENST00000252771 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa22.64■■□□□ 1.22
FCHO1-201ENST00000252771 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
FCHO1-201ENST00000252771 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
FCHO1-201ENST00000252771 MORC1Q86VD1 984 aa22.62■■□□□ 1.21
FCHO1-201ENST00000252771 RCAN3Q9UKA8 241 aa22.62■■□□□ 1.21
FCHO1-201ENST00000252771 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa22.61■■□□□ 1.21
FCHO1-201ENST00000252771 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
FCHO1-201ENST00000252771 POGKQ9P215 609 aa22.61■■□□□ 1.21
FCHO1-201ENST00000252771 ZNF521Q96K83 1311 aa22.61■■□□□ 1.21
FCHO1-201ENST00000252771 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
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FCHO1-201ENST00000252771 CCDC146Q8IYE0 955 aa22.6■■□□□ 1.21
FCHO1-201ENST00000252771 A0A1W2PP64 1363 aa22.59■■□□□ 1.21
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FCHO1-201ENST00000252771 SHPRHQ149N8 1683 aa22.58■■□□□ 1.21
FCHO1-201ENST00000252771 CD163L1Q9NR16 1453 aa22.57■■□□□ 1.2
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FCHO1-201ENST00000252771 TNRQ92752 1358 aa22.56■■□□□ 1.2
FCHO1-201ENST00000252771 NINLQ9Y2I6 1382 aa22.56■■□□□ 1.2
FCHO1-201ENST00000252771 WAPLQ7Z5K2 1190 aa22.55■■□□□ 1.2
FCHO1-201ENST00000252771 ATAD2Q6PL18 1390 aa22.54■■□□□ 1.2
FCHO1-201ENST00000252771 CDK19Q9BWU1 502 aa22.54■■□□□ 1.2
FCHO1-201ENST00000252771 APAF1O14727 1248 aa22.53■■□□□ 1.2
FCHO1-201ENST00000252771 METP08581 1390 aa22.53■■□□□ 1.2
FCHO1-201ENST00000252771 ABCC11Q96J66 1382 aa22.53■■□□□ 1.2
FCHO1-201ENST00000252771 UBR1Q8IWV7 1749 aa22.53■■□□□ 1.2
FCHO1-201ENST00000252771 NSD2O96028 1365 aa22.52■■□□□ 1.2
FCHO1-201ENST00000252771 DUSP27Q5VZP5 1158 aa22.52■■□□□ 1.2
FCHO1-201ENST00000252771 MTHFSP49914 203 aa22.52■■□□□ 1.2
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FCHO1-201ENST00000252771 GOLGA2Q08379 1002 aa22.49■■□□□ 1.19
FCHO1-201ENST00000252771 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
FCHO1-201ENST00000252771 TMEM2Q9UHN6 1383 aa22.48■■□□□ 1.19
FCHO1-201ENST00000252771 NLRP1Q9C000 1473 aa22.48■■□□□ 1.19
FCHO1-201ENST00000252771 CABP1Q9NZU7 370 aa22.47■■□□□ 1.19
FCHO1-201ENST00000252771 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
FCHO1-201ENST00000252771 SLFN5Q08AF3 891 aa22.46■■□□□ 1.19
FCHO1-201ENST00000252771 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
FCHO1-201ENST00000252771 GGNBP2Q9H3C7 697 aa22.46■■□□□ 1.19
FCHO1-201ENST00000252771 TERF2IPQ9NYB0 399 aa22.46■■□□□ 1.19
FCHO1-201ENST00000252771 FYB1O15117 783 aa22.46■■□□□ 1.19
FCHO1-201ENST00000252771 EXOC6Q8TAG9 804 aa22.46■■□□□ 1.19
FCHO1-201ENST00000252771 PLIN1O60240 522 aa22.46■■□□□ 1.19
FCHO1-201ENST00000252771 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
FCHO1-201ENST00000252771 CCDC136Q96JN2 1154 aa22.45■■□□□ 1.18
FCHO1-201ENST00000252771 DMRT2Q9Y5R5 561 aa22.44■■□□□ 1.18
FCHO1-201ENST00000252771 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa22.44■■□□□ 1.18
FCHO1-201ENST00000252771 TXNDC2Q86VQ3 553 aa22.44■■□□□ 1.18
FCHO1-201ENST00000252771 KNDC1Q76NI1 1749 aa22.42■■□□□ 1.18
FCHO1-201ENST00000252771 HDGFP51858 240 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
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FCHO1-201ENST00000252771 C3P01024 1663 aa22.41■■□□□ 1.18
FCHO1-201ENST00000252771 LTKP29376 864 aa22.41■■□□□ 1.18
FCHO1-201ENST00000252771 TECPR2O15040 1411 aa22.41■■□□□ 1.18
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FCHO1-201ENST00000252771 CPS1P31327 1500 aa22.38■■□□□ 1.17
FCHO1-201ENST00000252771 WWC1Q8IX03 1113 aa22.38■■□□□ 1.17
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FCHO1-201ENST00000252771 SIRT1Q96EB6 747 aa22.37■■□□□ 1.17
FCHO1-201ENST00000252771 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
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FCHO1-201ENST00000252771 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
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FCHO1-201ENST00000252771 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa22.34■■□□□ 1.17
FCHO1-201ENST00000252771 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
FCHO1-201ENST00000252771 NEUROD2Q15784 382 aa22.33■■□□□ 1.17
FCHO1-201ENST00000252771 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa22.33■■□□□ 1.17
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FCHO1-201ENST00000252771 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
FCHO1-201ENST00000252771 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP22.32■■□□□ 1.16
FCHO1-201ENST00000252771 PLPPR3Q6T4P5 718 aa22.32■■□□□ 1.16
FCHO1-201ENST00000252771 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
FCHO1-201ENST00000252771 FBLN1P23142 703 aa22.29■■□□□ 1.16
FCHO1-201ENST00000252771 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
FCHO1-201ENST00000252771 PNPLA6Q8IY17 1366 aa22.29■■□□□ 1.16
FCHO1-201ENST00000252771 SLIT1O75093 1534 aa22.29■■□□□ 1.16
FCHO1-201ENST00000252771 ADGRB2O60241 1585 aa22.28■■□□□ 1.16
FCHO1-201ENST00000252771 ARHGAP23Q9P227 1491 aa22.28■■□□□ 1.16
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