RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249440.4

HOXD3-201, Transcript of homeobox D3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD3, Length 2,303 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD3-201ENST00000249440 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
HOXD3-201ENST00000249440 QRICH2Q9H0J4 1663 aa21.43■■□□□ 1.02
HOXD3-201ENST00000249440 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
HOXD3-201ENST00000249440 ADGRB1O14514 1584 aa21.4■■□□□ 1.02
HOXD3-201ENST00000249440 NSD3Q9BZ95 1437 aa21.39■■□□□ 1.02
HOXD3-201ENST00000249440 MORC1Q86VD1 984 aa21.38■■□□□ 1.01
HOXD3-201ENST00000249440 ABCC3O15438 1527 aa21.38■■□□□ 1.01
HOXD3-201ENST00000249440 BCL11AQ9H165 835 aa21.37■■□□□ 1.01
HOXD3-201ENST00000249440 SKAP1Q86WV1 359 aa21.36■■□□□ 1.01
HOXD3-201ENST00000249440 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa21.36■■□□□ 1.01
HOXD3-201ENST00000249440 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa21.35■■□□□ 1.01
HOXD3-201ENST00000249440 MLECQ14165 292 aa21.35■■□□□ 1.01
HOXD3-201ENST00000249440 TMEM132EQ6IEE7 984 aa21.35■■□□□ 1.01
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HOXD3-201ENST00000249440 USP32Q8NFA0 1604 aa21.34■■□□□ 1.01
HOXD3-201ENST00000249440 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
HOXD3-201ENST00000249440 SHPRHQ149N8 1683 aa21.33■■□□□ 1.01
HOXD3-201ENST00000249440 BCAR3O75815 825 aa21.33■■□□□ 1.01
HOXD3-201ENST00000249440 WWC1Q8IX03 1113 aa21.33■■□□□ 1.01
HOXD3-201ENST00000249440 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1.01
HOXD3-201ENST00000249440 VGFO15240 615 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
HOXD3-201ENST00000249440 DDRGK1Q96HY6 314 aa21.32■■□□□ 1
HOXD3-201ENST00000249440 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa21.32■■□□□ 1
HOXD3-201ENST00000249440 CGNL1Q0VF96 1302 aa21.31■■□□□ 1
HOXD3-201ENST00000249440 PIK3C2BO00750 1634 aa21.31■■□□□ 1
HOXD3-201ENST00000249440 DMRT2Q9Y5R5 561 aa21.31■■□□□ 1
HOXD3-201ENST00000249440 RUNDC1Q96C34 613 aa21.3■■□□□ 1
HOXD3-201ENST00000249440 EVC2Q86UK5 1308 aa21.3■■□□□ 1
HOXD3-201ENST00000249440 NINLQ9Y2I6 1382 aa21.3■■□□□ 1
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HOXD3-201ENST00000249440 PDE3AQ14432 1141 aa21.29■■□□□ 1
HOXD3-201ENST00000249440 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP21.28■■□□□ 1
HOXD3-201ENST00000249440 FAM161AQ3B820 660 aa21.28■■□□□ 1
HOXD3-201ENST00000249440 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa21.27■■□□□ 1
HOXD3-201ENST00000249440 CFAP53Q96M91 514 aa21.27■■□□□ 1
HOXD3-201ENST00000249440 NSD2O96028 1365 aa21.26■□□□□ 0.99
HOXD3-201ENST00000249440 MTHFSP49914 203 aa21.26■□□□□ 0.99
HOXD3-201ENST00000249440 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa21.26■□□□□ 0.99
HOXD3-201ENST00000249440 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa21.25■□□□□ 0.99
HOXD3-201ENST00000249440 TCP11L2Q8N4U5 519 aa21.24■□□□□ 0.99
HOXD3-201ENST00000249440 CANXP27824 592 aaKnown RBP21.24■□□□□ 0.99
HOXD3-201ENST00000249440 NEUROD2Q15784 382 aa21.24■□□□□ 0.99
HOXD3-201ENST00000249440 IQSEC2Q5JU85 1478 aa21.24■□□□□ 0.99
HOXD3-201ENST00000249440 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP21.23■□□□□ 0.99
HOXD3-201ENST00000249440 WDR63Q8IWG1 891 aa21.23■□□□□ 0.99
HOXD3-201ENST00000249440 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP21.23■□□□□ 0.99
HOXD3-201ENST00000249440 TULP4Q9NRJ4 1543 aa21.23■□□□□ 0.99
HOXD3-201ENST00000249440 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP21.23■□□□□ 0.99
HOXD3-201ENST00000249440 C8orf34Q49A92 452 aa21.22■□□□□ 0.99
HOXD3-201ENST00000249440 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP21.22■□□□□ 0.99
HOXD3-201ENST00000249440 USP35Q9P2H5 1018 aa21.22■□□□□ 0.99
HOXD3-201ENST00000249440 CCDC27Q2M243 656 aa21.21■□□□□ 0.99
HOXD3-201ENST00000249440 ZFYVE9O95405 1425 aa21.21■□□□□ 0.99
HOXD3-201ENST00000249440 RGS3P49796 1198 aa21.21■□□□□ 0.99
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HOXD3-201ENST00000249440 SLC52A1Q9NWF4 448 aa21.21■□□□□ 0.99
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HOXD3-201ENST00000249440 CLUAP1Q96AJ1 413 aa21.2■□□□□ 0.98
HOXD3-201ENST00000249440 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP21.19■□□□□ 0.98
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HOXD3-201ENST00000249440 RARSP54136 660 aaKnown RBP21.17■□□□□ 0.98
HOXD3-201ENST00000249440 AAMPQ13685 434 aa21.17■□□□□ 0.98
HOXD3-201ENST00000249440 IGHDP01880 384 aa21.17■□□□□ 0.98
HOXD3-201ENST00000249440 COG6Q9Y2V7 657 aa21.17■□□□□ 0.98
HOXD3-201ENST00000249440 NEFMP07197 916 aa21.16■□□□□ 0.98
HOXD3-201ENST00000249440 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP21.16■□□□□ 0.98
HOXD3-201ENST00000249440 PANK1Q8TE04 598 aa21.16■□□□□ 0.98
HOXD3-201ENST00000249440 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP21.16■□□□□ 0.98
HOXD3-201ENST00000249440 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP21.16■□□□□ 0.98
HOXD3-201ENST00000249440 AGLP35573 1532 aa21.16■□□□□ 0.98
HOXD3-201ENST00000249440 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP21.16■□□□□ 0.98
HOXD3-201ENST00000249440 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP21.14■□□□□ 0.97
HOXD3-201ENST00000249440 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP21.14■□□□□ 0.97
HOXD3-201ENST00000249440 MYO5BQ9ULV0 1848 aa21.14■□□□□ 0.97
HOXD3-201ENST00000249440 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP21.13■□□□□ 0.97
HOXD3-201ENST00000249440 MYH16Q9H6N6 1097 aa21.13■□□□□ 0.97
HOXD3-201ENST00000249440 ABCC11Q96J66 1382 aa21.13■□□□□ 0.97
HOXD3-201ENST00000249440 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP21.13■□□□□ 0.97
HOXD3-201ENST00000249440 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP21.12■□□□□ 0.97
HOXD3-201ENST00000249440 PLPPR3Q6T4P5 718 aa21.12■□□□□ 0.97
HOXD3-201ENST00000249440 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa21.12■□□□□ 0.97
HOXD3-201ENST00000249440 A0A1W2PP64 1363 aa21.12■□□□□ 0.97
HOXD3-201ENST00000249440 PREX1Q8TCU6 1659 aa21.12■□□□□ 0.97
HOXD3-201ENST00000249440 STK26Q9P289 416 aa21.11■□□□□ 0.97
HOXD3-201ENST00000249440 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa21.11■□□□□ 0.97
HOXD3-201ENST00000249440 ADGRB2O60241 1585 aa21.11■□□□□ 0.97
HOXD3-201ENST00000249440 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa21.1■□□□□ 0.97
HOXD3-201ENST00000249440 ATAD2Q6PL18 1390 aa21.1■□□□□ 0.97
HOXD3-201ENST00000249440 PTPRMP28827 1452 aa21.08■□□□□ 0.97
HOXD3-201ENST00000249440 TERF2IPQ9NYB0 399 aa21.08■□□□□ 0.97
HOXD3-201ENST00000249440 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP21.07■□□□□ 0.96
HOXD3-201ENST00000249440 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP21.06■□□□□ 0.96
HOXD3-201ENST00000249440 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa21.06■□□□□ 0.96
HOXD3-201ENST00000249440 POGKQ9P215 609 aa21.06■□□□□ 0.96
HOXD3-201ENST00000249440 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP21.05■□□□□ 0.96
HOXD3-201ENST00000249440 GGNBP2Q9H3C7 697 aa21.05■□□□□ 0.96
HOXD3-201ENST00000249440 RLBP1P12271 317 aa21.05■□□□□ 0.96
HOXD3-201ENST00000249440 SLC4A3P48751 1232 aa21.05■□□□□ 0.96
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