RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249330.2

VGF-201, Transcript of VGF nerve growth factor inducible, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene VGF, Length 2,575 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGF-201ENST00000249330 QRICH2Q9H0J4 1663 aa26.69■■□□□ 1.86
VGF-201ENST00000249330 MYOM1P52179 1685 aa26.68■■□□□ 1.86
VGF-201ENST00000249330 ALKQ9UM73 1620 aa26.68■■□□□ 1.86
VGF-201ENST00000249330 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP26.66■■□□□ 1.86
VGF-201ENST00000249330 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP26.65■■□□□ 1.86
VGF-201ENST00000249330 PRAM1Q96QH2 718 aa26.65■■□□□ 1.86
VGF-201ENST00000249330 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
VGF-201ENST00000249330 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa26.64■■□□□ 1.85
VGF-201ENST00000249330 CARD14Q9BXL6 1004 aa26.63■■□□□ 1.85
VGF-201ENST00000249330 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP26.63■■□□□ 1.85
VGF-201ENST00000249330 NLRP13Q86W25 1043 aa26.62■■□□□ 1.85
VGF-201ENST00000249330 RCAN3Q9UKA8 241 aa26.62■■□□□ 1.85
VGF-201ENST00000249330 EXOC6Q8TAG9 804 aa26.61■■□□□ 1.85
VGF-201ENST00000249330 PTPRMP28827 1452 aa26.61■■□□□ 1.85
VGF-201ENST00000249330 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP26.61■■□□□ 1.85
VGF-201ENST00000249330 CABP2Q9NPB3 220 aa26.61■■□□□ 1.85
VGF-201ENST00000249330 POGKQ9P215 609 aa26.61■■□□□ 1.85
VGF-201ENST00000249330 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP26.6■■□□□ 1.85
VGF-201ENST00000249330 EVC2Q86UK5 1308 aa26.59■■□□□ 1.85
VGF-201ENST00000249330 C3P01024 1663 aa26.59■■□□□ 1.85
VGF-201ENST00000249330 TMEM2Q9UHN6 1383 aa26.58■■□□□ 1.85
VGF-201ENST00000249330 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa26.58■■□□□ 1.85
VGF-201ENST00000249330 PDE3BQ13370 1112 aa26.57■■□□□ 1.84
VGF-201ENST00000249330 WAPLQ7Z5K2 1190 aa26.57■■□□□ 1.84
VGF-201ENST00000249330 TULP4Q9NRJ4 1543 aa26.57■■□□□ 1.84
VGF-201ENST00000249330 UBR1Q8IWV7 1749 aa26.57■■□□□ 1.84
VGF-201ENST00000249330 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
VGF-201ENST00000249330 METP08581 1390 aa26.56■■□□□ 1.84
VGF-201ENST00000249330 LTKP29376 864 aa26.55■■□□□ 1.84
VGF-201ENST00000249330 HDGFP51858 240 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
VGF-201ENST00000249330 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
VGF-201ENST00000249330 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa26.53■■□□□ 1.84
VGF-201ENST00000249330 MS4A1P11836 297 aa26.52■■□□□ 1.84
VGF-201ENST00000249330 PDE4AP27815 886 aa26.52■■□□□ 1.84
VGF-201ENST00000249330 NLRP1Q9C000 1473 aa26.52■■□□□ 1.84
VGF-201ENST00000249330 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.83
VGF-201ENST00000249330 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa26.51■■□□□ 1.83
VGF-201ENST00000249330 PPP2R1AP30153 589 aa26.51■■□□□ 1.83
VGF-201ENST00000249330 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
VGF-201ENST00000249330 TXNDC2Q86VQ3 553 aa26.5■■□□□ 1.83
VGF-201ENST00000249330 BACH2Q9BYV9 841 aa26.48■■□□□ 1.83
VGF-201ENST00000249330 NSD3Q9BZ95 1437 aa26.46■■□□□ 1.83
VGF-201ENST00000249330 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
VGF-201ENST00000249330 CDK19Q9BWU1 502 aa26.46■■□□□ 1.83
VGF-201ENST00000249330 ABCC11Q96J66 1382 aa26.46■■□□□ 1.83
VGF-201ENST00000249330 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa26.45■■□□□ 1.82
VGF-201ENST00000249330 SLC26A8Q96RN1 970 aa26.45■■□□□ 1.82
VGF-201ENST00000249330 EID1Q9Y6B2 187 aa26.42■■□□□ 1.82
VGF-201ENST00000249330 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa26.41■■□□□ 1.82
VGF-201ENST00000249330 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP26.41■■□□□ 1.82
VGF-201ENST00000249330 USP35Q9P2H5 1018 aa26.41■■□□□ 1.82
VGF-201ENST00000249330 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP26.4■■□□□ 1.82
VGF-201ENST00000249330 CDCA7LQ96GN5 454 aa26.4■■□□□ 1.82
VGF-201ENST00000249330 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP26.4■■□□□ 1.82
VGF-201ENST00000249330 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP26.39■■□□□ 1.82
VGF-201ENST00000249330 INSRP06213 1382 aa26.39■■□□□ 1.82
VGF-201ENST00000249330 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP26.39■■□□□ 1.82
VGF-201ENST00000249330 DLC1Q96QB1 1528 aa26.39■■□□□ 1.81
VGF-201ENST00000249330 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa26.39■■□□□ 1.81
VGF-201ENST00000249330 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa26.38■■□□□ 1.81
VGF-201ENST00000249330 NEFMP07197 916 aa26.38■■□□□ 1.81
VGF-201ENST00000249330 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP26.37■■□□□ 1.81
VGF-201ENST00000249330 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP26.36■■□□□ 1.81
VGF-201ENST00000249330 CABP1Q9NZU7 370 aa26.36■■□□□ 1.81
VGF-201ENST00000249330 A0A1W2PP64 1363 aa26.36■■□□□ 1.81
VGF-201ENST00000249330 ATAD2Q6PL18 1390 aa26.35■■□□□ 1.81
VGF-201ENST00000249330 MORC1Q86VD1 984 aa26.35■■□□□ 1.81
VGF-201ENST00000249330 ADAMTS8Q9UP79 889 aa26.35■■□□□ 1.81
VGF-201ENST00000249330 ARHGAP23Q9P227 1491 aa26.34■■□□□ 1.81
VGF-201ENST00000249330 SLIT1O75093 1534 aa26.33■■□□□ 1.81
VGF-201ENST00000249330 CGNL1Q0VF96 1302 aa26.33■■□□□ 1.81
VGF-201ENST00000249330 PLIN1O60240 522 aa26.33■■□□□ 1.81
VGF-201ENST00000249330 ROBO2Q9HCK4 1378 aa26.33■■□□□ 1.81
VGF-201ENST00000249330 DDRGK1Q96HY6 314 aa26.32■■□□□ 1.8
VGF-201ENST00000249330 CRBNQ96SW2 442 aa26.32■■□□□ 1.8
VGF-201ENST00000249330 WASLO00401 505 aaPredicted RBP26.3■■□□□ 1.8
VGF-201ENST00000249330 TECPR2O15040 1411 aa26.29■■□□□ 1.8
VGF-201ENST00000249330 CD163L1Q9NR16 1453 aa26.29■■□□□ 1.8
VGF-201ENST00000249330 TERF2IPQ9NYB0 399 aa26.29■■□□□ 1.8
VGF-201ENST00000249330 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa26.29■■□□□ 1.8
VGF-201ENST00000249330 NINLQ9Y2I6 1382 aa26.29■■□□□ 1.8
VGF-201ENST00000249330 PTPRUQ92729 1446 aa26.28■■□□□ 1.8
VGF-201ENST00000249330 MED14O60244 1454 aa26.28■■□□□ 1.8
VGF-201ENST00000249330 ADAMTSL3P82987 1691 aa26.28■■□□□ 1.8
VGF-201ENST00000249330 SIRT1Q96EB6 747 aa26.28■■□□□ 1.8
VGF-201ENST00000249330 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP26.27■■□□□ 1.8
VGF-201ENST00000249330 FAM135BQ49AJ0 1406 aa26.27■■□□□ 1.8
VGF-201ENST00000249330 GGNBP2Q9H3C7 697 aa26.26■■□□□ 1.79
VGF-201ENST00000249330 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa26.26■■□□□ 1.79
VGF-201ENST00000249330 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP26.26■■□□□ 1.79
VGF-201ENST00000249330 TBX22Q9Y458 520 aa26.25■■□□□ 1.79
VGF-201ENST00000249330 CPS1P31327 1500 aa26.24■■□□□ 1.79
VGF-201ENST00000249330 KNDC1Q76NI1 1749 aa26.23■■□□□ 1.79
VGF-201ENST00000249330 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP26.23■■□□□ 1.79
VGF-201ENST00000249330 NUTM2FA1L443 756 aa26.22■■□□□ 1.79
VGF-201ENST00000249330 FYB1O15117 783 aa26.22■■□□□ 1.79
VGF-201ENST00000249330 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP26.22■■□□□ 1.79
VGF-201ENST00000249330 USP32Q8NFA0 1604 aa26.21■■□□□ 1.79
VGF-201ENST00000249330 MTHFSP49914 203 aa26.2■■□□□ 1.79
VGF-201ENST00000249330 IL27Q8NEV9 243 aa26.2■■□□□ 1.79
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