RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000216121.11

NIPSNAP1-201, Transcript of nipsnap homolog 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NIPSNAP1, Length 2,237 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP1-201ENST00000216121 KDM2BQ8NHM5 1336 aa28.85■■■□□ 2.21
NIPSNAP1-201ENST00000216121 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP28.83■■■□□ 2.21
NIPSNAP1-201ENST00000216121 SHPRHQ149N8 1683 aa28.82■■■□□ 2.2
NIPSNAP1-201ENST00000216121 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP28.8■■■□□ 2.2
NIPSNAP1-201ENST00000216121 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP28.79■■■□□ 2.2
NIPSNAP1-201ENST00000216121 EVC2Q86UK5 1308 aa28.79■■■□□ 2.2
NIPSNAP1-201ENST00000216121 ZFYVE9O95405 1425 aa28.79■■■□□ 2.2
NIPSNAP1-201ENST00000216121 CGNL1Q0VF96 1302 aa28.78■■■□□ 2.2
NIPSNAP1-201ENST00000216121 TULP4Q9NRJ4 1543 aa28.77■■■□□ 2.2
NIPSNAP1-201ENST00000216121 IDI1Q13907 227 aa28.77■■■□□ 2.2
NIPSNAP1-201ENST00000216121 SLC52A1Q9NWF4 448 aa28.77■■■□□ 2.2
NIPSNAP1-201ENST00000216121 DMRT2Q9Y5R5 561 aa28.77■■■□□ 2.2
NIPSNAP1-201ENST00000216121 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP28.76■■■□□ 2.19
NIPSNAP1-201ENST00000216121 WWC1Q8IX03 1113 aa28.76■■■□□ 2.19
NIPSNAP1-201ENST00000216121 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa28.75■■■□□ 2.19
NIPSNAP1-201ENST00000216121 YEATS2Q9ULM3 1422 aa28.73■■■□□ 2.19
NIPSNAP1-201ENST00000216121 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP28.73■■■□□ 2.19
NIPSNAP1-201ENST00000216121 RUNDC1Q96C34 613 aa28.73■■■□□ 2.19
NIPSNAP1-201ENST00000216121 NSD2O96028 1365 aa28.73■■■□□ 2.19
NIPSNAP1-201ENST00000216121 BCAR3O75815 825 aa28.71■■■□□ 2.19
NIPSNAP1-201ENST00000216121 SKAP1Q86WV1 359 aa28.71■■■□□ 2.19
NIPSNAP1-201ENST00000216121 MTHFSP49914 203 aa28.7■■■□□ 2.18
NIPSNAP1-201ENST00000216121 IQSEC2Q5JU85 1478 aa28.69■■■□□ 2.18
NIPSNAP1-201ENST00000216121 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP28.69■■■□□ 2.18
NIPSNAP1-201ENST00000216121 PREX1Q8TCU6 1659 aa28.68■■■□□ 2.18
NIPSNAP1-201ENST00000216121 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP28.68■■■□□ 2.18
NIPSNAP1-201ENST00000216121 MYO5BQ9ULV0 1848 aa28.68■■■□□ 2.18
NIPSNAP1-201ENST00000216121 CFAP53Q96M91 514 aa28.67■■■□□ 2.18
NIPSNAP1-201ENST00000216121 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa28.67■■■□□ 2.18
NIPSNAP1-201ENST00000216121 TCP11L2Q8N4U5 519 aa28.65■■■□□ 2.18
NIPSNAP1-201ENST00000216121 CABP2Q9NPB3 220 aa28.65■■■□□ 2.18
NIPSNAP1-201ENST00000216121 NINLQ9Y2I6 1382 aa28.65■■■□□ 2.18
NIPSNAP1-201ENST00000216121 PDE3AQ14432 1141 aa28.65■■■□□ 2.18
NIPSNAP1-201ENST00000216121 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP28.63■■■□□ 2.17
NIPSNAP1-201ENST00000216121 WDR63Q8IWG1 891 aa28.63■■■□□ 2.17
NIPSNAP1-201ENST00000216121 CCDC27Q2M243 656 aa28.62■■■□□ 2.17
NIPSNAP1-201ENST00000216121 PTPRMP28827 1452 aa28.6■■■□□ 2.17
NIPSNAP1-201ENST00000216121 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP28.59■■■□□ 2.17
NIPSNAP1-201ENST00000216121 ABCC11Q96J66 1382 aa28.59■■■□□ 2.17
NIPSNAP1-201ENST00000216121 NEUROD2Q15784 382 aa28.59■■■□□ 2.17
NIPSNAP1-201ENST00000216121 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP28.58■■■□□ 2.17
NIPSNAP1-201ENST00000216121 STK26Q9P289 416 aa28.58■■■□□ 2.17
NIPSNAP1-201ENST00000216121 NBR1Q14596 966 aa28.57■■■□□ 2.16
NIPSNAP1-201ENST00000216121 A0A1W2PP64 1363 aa28.57■■■□□ 2.16
NIPSNAP1-201ENST00000216121 ATAD2Q6PL18 1390 aa28.54■■■□□ 2.16
NIPSNAP1-201ENST00000216121 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP28.54■■■□□ 2.16
NIPSNAP1-201ENST00000216121 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP28.54■■■□□ 2.16
NIPSNAP1-201ENST00000216121 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP28.54■■■□□ 2.16
NIPSNAP1-201ENST00000216121 FAM161AQ3B820 660 aa28.54■■■□□ 2.16
NIPSNAP1-201ENST00000216121 RARSP54136 660 aaKnown RBP28.53■■■□□ 2.16
NIPSNAP1-201ENST00000216121 ADGRB2O60241 1585 aa28.52■■■□□ 2.16
NIPSNAP1-201ENST00000216121 DDRGK1Q96HY6 314 aa28.51■■■□□ 2.16
NIPSNAP1-201ENST00000216121 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP28.51■■■□□ 2.15
NIPSNAP1-201ENST00000216121 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP28.51■■■□□ 2.15
NIPSNAP1-201ENST00000216121 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP28.51■■■□□ 2.15
NIPSNAP1-201ENST00000216121 CANXP27824 592 aaKnown RBP28.5■■■□□ 2.15
NIPSNAP1-201ENST00000216121 C8orf34Q49A92 452 aa28.5■■■□□ 2.15
NIPSNAP1-201ENST00000216121 PRAM1Q96QH2 718 aa28.5■■■□□ 2.15
NIPSNAP1-201ENST00000216121 ALKQ9UM73 1620 aa28.49■■■□□ 2.15
NIPSNAP1-201ENST00000216121 MED14O60244 1454 aa28.49■■■□□ 2.15
NIPSNAP1-201ENST00000216121 PANK1Q8TE04 598 aa28.49■■■□□ 2.15
NIPSNAP1-201ENST00000216121 CLUAP1Q96AJ1 413 aa28.49■■■□□ 2.15
NIPSNAP1-201ENST00000216121 TERF2IPQ9NYB0 399 aa28.49■■■□□ 2.15
NIPSNAP1-201ENST00000216121 CYB5RLQ6IPT4 315 aa28.49■■■□□ 2.15
NIPSNAP1-201ENST00000216121 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa28.48■■■□□ 2.15
NIPSNAP1-201ENST00000216121 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP28.48■■■□□ 2.15
NIPSNAP1-201ENST00000216121 IGHDP01880 384 aa28.48■■■□□ 2.15
NIPSNAP1-201ENST00000216121 POGKQ9P215 609 aa28.48■■■□□ 2.15
NIPSNAP1-201ENST00000216121 CD163L1Q9NR16 1453 aa28.48■■■□□ 2.15
NIPSNAP1-201ENST00000216121 COG6Q9Y2V7 657 aa28.47■■■□□ 2.15
NIPSNAP1-201ENST00000216121 AAMPQ13685 434 aa28.47■■■□□ 2.15
NIPSNAP1-201ENST00000216121 MYH16Q9H6N6 1097 aa28.47■■■□□ 2.15
NIPSNAP1-201ENST00000216121 REREQ9P2R6 1566 aa28.46■■■□□ 2.15
NIPSNAP1-201ENST00000216121 PPP6R1Q9UPN7 881 aa28.46■■■□□ 2.15
NIPSNAP1-201ENST00000216121 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP28.46■■■□□ 2.15
NIPSNAP1-201ENST00000216121 GGNBP2Q9H3C7 697 aa28.45■■■□□ 2.15
NIPSNAP1-201ENST00000216121 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP28.45■■■□□ 2.14
NIPSNAP1-201ENST00000216121 FYB1O15117 783 aa28.45■■■□□ 2.14
NIPSNAP1-201ENST00000216121 RGS3P49796 1198 aa28.45■■■□□ 2.14
NIPSNAP1-201ENST00000216121 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP28.45■■■□□ 2.14
NIPSNAP1-201ENST00000216121 NLRP1Q9C000 1473 aa28.44■■■□□ 2.14
NIPSNAP1-201ENST00000216121 DEKP35659 375 aaKnown RBP28.44■■■□□ 2.14
NIPSNAP1-201ENST00000216121 AGLP35573 1532 aa28.44■■■□□ 2.14
NIPSNAP1-201ENST00000216121 FAM69CQ0P6D2 419 aa28.43■■■□□ 2.14
NIPSNAP1-201ENST00000216121 DIP2BQ9P265 1576 aa28.43■■■□□ 2.14
NIPSNAP1-201ENST00000216121 PLEKHF1Q96S99 279 aa28.42■■■□□ 2.14
NIPSNAP1-201ENST00000216121 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa28.42■■■□□ 2.14
NIPSNAP1-201ENST00000216121 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP28.41■■■□□ 2.14
NIPSNAP1-201ENST00000216121 STAG3Q9UJ98 1225 aa28.4■■■□□ 2.14
NIPSNAP1-201ENST00000216121 CDK19Q9BWU1 502 aa28.39■■■□□ 2.14
NIPSNAP1-201ENST00000216121 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP28.38■■■□□ 2.13
NIPSNAP1-201ENST00000216121 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP28.38■■■□□ 2.13
NIPSNAP1-201ENST00000216121 RLBP1P12271 317 aa28.37■■■□□ 2.13
NIPSNAP1-201ENST00000216121 DLC1Q96QB1 1528 aa28.36■■■□□ 2.13
NIPSNAP1-201ENST00000216121 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP28.36■■■□□ 2.13
NIPSNAP1-201ENST00000216121 TMPOP42166 694 aaKnown RBP28.36■■■□□ 2.13
NIPSNAP1-201ENST00000216121 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa28.35■■■□□ 2.13
NIPSNAP1-201ENST00000216121 A2ML1A8K2U0 1454 aa28.35■■■□□ 2.13
NIPSNAP1-201ENST00000216121 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa28.35■■■□□ 2.13
NIPSNAP1-201ENST00000216121 PNPLA6Q8IY17 1366 aa28.35■■■□□ 2.13
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