RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000211413.9

PRRT1-201, Transcript of proline rich transmembrane protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRRT1, Length 1,909 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT1-201ENST00000211413 CPS1P31327 1500 aa25.9■■□□□ 1.74
PRRT1-201ENST00000211413 CCDC7Q96M83 1385 aa25.9■■□□□ 1.74
PRRT1-201ENST00000211413 DLC1Q96QB1 1528 aa25.9■■□□□ 1.74
PRRT1-201ENST00000211413 TMF1P82094 1093 aa25.89■■□□□ 1.74
PRRT1-201ENST00000211413 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP25.89■■□□□ 1.73
PRRT1-201ENST00000211413 PIK3R4Q99570 1358 aa25.89■■□□□ 1.73
PRRT1-201ENST00000211413 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP25.88■■□□□ 1.73
PRRT1-201ENST00000211413 CABP2Q9NPB3 220 aa25.86■■□□□ 1.73
PRRT1-201ENST00000211413 TULP4Q9NRJ4 1543 aa25.85■■□□□ 1.73
PRRT1-201ENST00000211413 NUTM2FA1L443 756 aa25.84■■□□□ 1.73
PRRT1-201ENST00000211413 FAM135BQ49AJ0 1406 aa25.84■■□□□ 1.73
PRRT1-201ENST00000211413 SIRT1Q96EB6 747 aa25.84■■□□□ 1.73
PRRT1-201ENST00000211413 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP25.83■■□□□ 1.73
PRRT1-201ENST00000211413 PTCH1Q13635 1447 aa25.82■■□□□ 1.72
PRRT1-201ENST00000211413 CDK19Q9BWU1 502 aa25.82■■□□□ 1.72
PRRT1-201ENST00000211413 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa25.81■■□□□ 1.72
PRRT1-201ENST00000211413 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa25.8■■□□□ 1.72
PRRT1-201ENST00000211413 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP25.8■■□□□ 1.72
PRRT1-201ENST00000211413 NWD1Q149M9 1564 aa25.8■■□□□ 1.72
PRRT1-201ENST00000211413 EVC2Q86UK5 1308 aa25.79■■□□□ 1.72
PRRT1-201ENST00000211413 DMRT2Q9Y5R5 561 aa25.77■■□□□ 1.72
PRRT1-201ENST00000211413 C14orf37Q86TY3 774 aa25.76■■□□□ 1.72
PRRT1-201ENST00000211413 WASLO00401 505 aaPredicted RBP25.76■■□□□ 1.71
PRRT1-201ENST00000211413 NALCNQ8IZF0 1738 aa25.75■■□□□ 1.71
PRRT1-201ENST00000211413 TMC1Q8TDI8 760 aa25.73■■□□□ 1.71
PRRT1-201ENST00000211413 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa25.73■■□□□ 1.71
PRRT1-201ENST00000211413 TMEM94Q12767 1356 aa25.73■■□□□ 1.71
PRRT1-201ENST00000211413 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP25.73■■□□□ 1.71
PRRT1-201ENST00000211413 PRR36Q9H6K5 1346 aa25.7■■□□□ 1.71
PRRT1-201ENST00000211413 MYOM1P52179 1685 aa25.69■■□□□ 1.7
PRRT1-201ENST00000211413 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP25.69■■□□□ 1.7
PRRT1-201ENST00000211413 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP25.69■■□□□ 1.7
PRRT1-201ENST00000211413 CDCA8Q53HL2 280 aa25.69■■□□□ 1.7
PRRT1-201ENST00000211413 MYT1Q01538 1121 aa25.68■■□□□ 1.7
PRRT1-201ENST00000211413 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP25.68■■□□□ 1.7
PRRT1-201ENST00000211413 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP25.67■■□□□ 1.7
PRRT1-201ENST00000211413 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP25.67■■□□□ 1.7
PRRT1-201ENST00000211413 PANK3Q9H999 370 aa25.67■■□□□ 1.7
PRRT1-201ENST00000211413 SLC24A1O60721 1099 aa25.67■■□□□ 1.7
PRRT1-201ENST00000211413 LRRC7Q96NW7 1537 aa25.66■■□□□ 1.7
PRRT1-201ENST00000211413 CABP1Q9NZU7 370 aa25.66■■□□□ 1.7
PRRT1-201ENST00000211413 ADGRB2O60241 1585 aa25.65■■□□□ 1.7
PRRT1-201ENST00000211413 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa25.65■■□□□ 1.7
PRRT1-201ENST00000211413 USP32Q8NFA0 1604 aa25.62■■□□□ 1.69
PRRT1-201ENST00000211413 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa25.61■■□□□ 1.69
PRRT1-201ENST00000211413 ATP7BP35670 1465 aa25.6■■□□□ 1.69
PRRT1-201ENST00000211413 C19orf44Q9H6X5 657 aa25.6■■□□□ 1.69
PRRT1-201ENST00000211413 CARD14Q9BXL6 1004 aa25.59■■□□□ 1.69
PRRT1-201ENST00000211413 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa25.58■■□□□ 1.69
PRRT1-201ENST00000211413 ATAD2Q6PL18 1390 aa25.58■■□□□ 1.69
PRRT1-201ENST00000211413 FMN2Q9NZ56 1722 aa25.58■■□□□ 1.69
PRRT1-201ENST00000211413 CCDC61Q9Y6R9 512 aa25.57■■□□□ 1.68
PRRT1-201ENST00000211413 LTBP4Q8N2S1 1624 aa25.57■■□□□ 1.68
PRRT1-201ENST00000211413 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP25.57■■□□□ 1.68
PRRT1-201ENST00000211413 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa25.55■■□□□ 1.68
PRRT1-201ENST00000211413 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP25.55■■□□□ 1.68
PRRT1-201ENST00000211413 ORAI2Q96SN7 254 aa25.55■■□□□ 1.68
PRRT1-201ENST00000211413 CD163L1Q9NR16 1453 aa25.54■■□□□ 1.68
PRRT1-201ENST00000211413 ATF3P18847 181 aa25.53■■□□□ 1.68
PRRT1-201ENST00000211413 A0A1W2PP64 1363 aa25.52■■□□□ 1.68
PRRT1-201ENST00000211413 MSH6P52701 1360 aa25.52■■□□□ 1.68
PRRT1-201ENST00000211413 ESCO1Q5FWF5 840 aa25.52■■□□□ 1.68
PRRT1-201ENST00000211413 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa25.5■■□□□ 1.67
PRRT1-201ENST00000211413 ACEP12821 1306 aa25.5■■□□□ 1.67
PRRT1-201ENST00000211413 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
PRRT1-201ENST00000211413 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa25.48■■□□□ 1.67
PRRT1-201ENST00000211413 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa25.48■■□□□ 1.67
PRRT1-201ENST00000211413 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
PRRT1-201ENST00000211413 NSD3Q9BZ95 1437 aa25.47■■□□□ 1.67
PRRT1-201ENST00000211413 MST1RQ04912 1400 aa25.46■■□□□ 1.67
PRRT1-201ENST00000211413 C1orf167Q5SNV9 1468 aa25.46■■□□□ 1.67
PRRT1-201ENST00000211413 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP25.46■■□□□ 1.67
PRRT1-201ENST00000211413 KNSTRNQ9Y448 316 aa25.46■■□□□ 1.67
PRRT1-201ENST00000211413 PLEKHG3A1L390 1219 aa25.45■■□□□ 1.67
PRRT1-201ENST00000211413 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.67
PRRT1-201ENST00000211413 CADPS2Q86UW7 1296 aa25.45■■□□□ 1.67
PRRT1-201ENST00000211413 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.67
PRRT1-201ENST00000211413 TERF2IPQ9NYB0 399 aa25.45■■□□□ 1.67
PRRT1-201ENST00000211413 PHF8Q9UPP1 1060 aa25.45■■□□□ 1.67
PRRT1-201ENST00000211413 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.66
PRRT1-201ENST00000211413 ANKARQ7Z5J8 1434 aa25.45■■□□□ 1.66
PRRT1-201ENST00000211413 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
PRRT1-201ENST00000211413 ITSN1Q15811 1721 aa25.43■■□□□ 1.66
PRRT1-201ENST00000211413 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
PRRT1-201ENST00000211413 FOXO3O43524 673 aa25.43■■□□□ 1.66
PRRT1-201ENST00000211413 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
PRRT1-201ENST00000211413 NINLQ9Y2I6 1382 aa25.42■■□□□ 1.66
PRRT1-201ENST00000211413 SLAIN2Q9P270 581 aa25.41■■□□□ 1.66
PRRT1-201ENST00000211413 ZRANB1Q9UGI0 708 aa25.41■■□□□ 1.66
PRRT1-201ENST00000211413 DCCP43146 1447 aa25.41■■□□□ 1.66
PRRT1-201ENST00000211413 AKAP12Q02952 1782 aa25.4■■□□□ 1.66
PRRT1-201ENST00000211413 ANP32CO43423 234 aa25.39■■□□□ 1.66
PRRT1-201ENST00000211413 GGNBP2Q9H3C7 697 aa25.38■■□□□ 1.65
PRRT1-201ENST00000211413 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
PRRT1-201ENST00000211413 NME9Q86XW9 330 aa25.36■■□□□ 1.65
PRRT1-201ENST00000211413 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
PRRT1-201ENST00000211413 BRINP3Q76B58 766 aa25.35■■□□□ 1.65
PRRT1-201ENST00000211413 MON2Q7Z3U7 1717 aa25.35■■□□□ 1.65
PRRT1-201ENST00000211413 FYB1O15117 783 aa25.35■■□□□ 1.65
PRRT1-201ENST00000211413 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP25.35■■□□□ 1.65
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