RNA–Protein interactions for RNA: YDL117W

CYK3, Transcript of SH3-domain protein located in the bud neck and cytokinetic actin ring, yeastyeast

Gene CYK3, Length 2,658 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CYK3YDL117W HUB1Q6Q546 73 aa3.72□□□□□ -1.81
CYK3YDL117W QCR8P08525 94 aa3.7□□□□□ -1.82
CYK3YDL117W YPR013CQ12145 317 aa3.7□□□□□ -1.82
CYK3YDL117W YSF3P0C074 85 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
CYK3YDL117W COX14P39103 70 aa3.69□□□□□ -1.82
CYK3YDL117W YBR219CP38317 127 aa3.68□□□□□ -1.82
CYK3YDL117W YIL102CP40488 101 aa3.68□□□□□ -1.82
CYK3YDL117W YMR321CQ04898 105 aa3.68□□□□□ -1.82
CYK3YDL117W YLR111WQ12528 110 aa3.68□□□□□ -1.82
CYK3YDL117W YFR009W-AP0C5M9 85 aa3.68□□□□□ -1.82
CYK3YDL117W YJR146WP47174 117 aa3.67□□□□□ -1.82
CYK3YDL117W NCE101Q02820 53 aa3.67□□□□□ -1.82
CYK3YDL117W CCW12Q12127 133 aa3.67□□□□□ -1.82
CYK3YDL117W YCR001WP25347 104 aa3.67□□□□□ -1.82
CYK3YDL117W IGD1P43598 195 aa3.67□□□□□ -1.82
CYK3YDL117W ATP17Q06405 101 aa3.65□□□□□ -1.82
CYK3YDL117W YPR010C-AA5Z2X5 72 aa3.64□□□□□ -1.83
CYK3YDL117W AQY2P0CD90 149 aa3.64□□□□□ -1.83
CYK3YDL117W FAS1P07149 2051 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
CYK3YDL117W YLR157W-DP0CE99 70 aa3.64□□□□□ -1.83
CYK3YDL117W YMR001C-AQ8TGS9 76 aa3.64□□□□□ -1.83
CYK3YDL117W ECM19Q06011 112 aa3.63□□□□□ -1.83
CYK3YDL117W YER078W-AQ3E7A2 54 aa3.63□□□□□ -1.83
CYK3YDL117W YBR027CP38220 110 aa3.63□□□□□ -1.83
CYK3YDL117W BLM10P43583 2143 aa3.62□□□□□ -1.83
CYK3YDL117W YEL008WP40001 126 aa3.62□□□□□ -1.83
CYK3YDL117W YDR114CQ04597 100 aa3.62□□□□□ -1.83
CYK3YDL117W YCL048W-AQ2V2Q2 79 aa3.62□□□□□ -1.83
CYK3YDL117W SDH6Q3E785 79 aa3.62□□□□□ -1.83
CYK3YDL117W YJL027CP47063 138 aaPredicted RBP3.61□□□□□ -1.83
CYK3YDL117W YNL122CP53921 115 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
CYK3YDL117W LCL2Q08045 131 aa3.59□□□□□ -1.83
CYK3YDL117W BRR2P32639 2163 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
CYK3YDL117W YOL013W-AP0C272 63 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
CYK3YDL117W YJR085CP47131 105 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
CYK3YDL117W GLT1Q12680 2145 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
CYK3YDL117W YGL014C-AP0C5N1 53 aa3.57□□□□□ -1.84
CYK3YDL117W YHR125WP38831 101 aa3.57□□□□□ -1.84
CYK3YDL117W YMR122W-AQ3E842 84 aa3.57□□□□□ -1.84
CYK3YDL117W FPR1P20081 114 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
CYK3YDL117W YLL006W-AQ3E814 58 aa3.57□□□□□ -1.84
CYK3YDL117W SGF11Q03067 99 aa3.56□□□□□ -1.84
CYK3YDL117W CMC4Q3E7A9 73 aa3.56□□□□□ -1.84
CYK3YDL117W SEN1Q00416 2231 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
CYK3YDL117W YBR200W-AQ3E755 54 aa3.54□□□□□ -1.84
CYK3YDL117W YDR034W-BQ6Q5X2 51 aa3.54□□□□□ -1.84
CYK3YDL117W YEL014CP39999 101 aa3.52□□□□□ -1.85
CYK3YDL117W YDR210WQ03482 75 aa3.52□□□□□ -1.85
CYK3YDL117W VAM10Q08474 114 aa3.52□□□□□ -1.85
CYK3YDL117W YHR213W-BQ8TGK1 99 aa3.51□□□□□ -1.85
CYK3YDL117W SIP18P50263 79 aa3.51□□□□□ -1.85
CYK3YDL117W YOL085CQ99345 113 aa3.51□□□□□ -1.85
CYK3YDL117W Q0032Q9ZZX7 96 aa3.51□□□□□ -1.85
CYK3YDL117W BEM2P39960 2167 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
CYK3YDL117W YJL133C-AQ3E7A3 74 aa3.48□□□□□ -1.85
CYK3YDL117W YKR073CP36153 106 aa3.47□□□□□ -1.85
CYK3YDL117W YGR025WP53216 100 aa3.47□□□□□ -1.85
CYK3YDL117W YHR032W-AP0C5N6 59 aa3.47□□□□□ -1.85
CYK3YDL117W AUA1P32450 94 aa3.47□□□□□ -1.85
CYK3YDL117W RPS27AP35997 82 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
CYK3YDL117W RPS27BP38711 82 aa3.47□□□□□ -1.85
CYK3YDL117W YLR122CQ12312 125 aa3.47□□□□□ -1.85
CYK3YDL117W YDR524C-BQ3E6R4 66 aa3.46□□□□□ -1.86
CYK3YDL117W YDR115WQ04598 105 aa3.46□□□□□ -1.86
CYK3YDL117W COX8P04039 78 aa3.45□□□□□ -1.86
CYK3YDL117W YBL039W-BP0C268 59 aa3.45□□□□□ -1.86
CYK3YDL117W YPR195CQ06594 109 aa3.45□□□□□ -1.86
CYK3YDL117W SEC16P48415 2195 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
CYK3YDL117W YDL012CQ12489 107 aa3.44□□□□□ -1.86
CYK3YDL117W RPL29P05747 59 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
CYK3YDL117W YBR201C-AQ2V2Q3 67 aa3.43□□□□□ -1.86
CYK3YDL117W FAB1P34756 2278 aa3.42□□□□□ -1.86
CYK3YDL117W YOL097W-AQ3E7Y9 61 aa3.42□□□□□ -1.86
CYK3YDL117W YAR064WP39563 99 aa3.4□□□□□ -1.87
CYK3YDL117W YNL162W-AQ3E7A8 72 aa3.4□□□□□ -1.87
CYK3YDL117W YGL041C-BQ3E750 60 aa3.39□□□□□ -1.87
CYK3YDL117W YAL067W-AQ8TGK6 75 aa3.39□□□□□ -1.87
CYK3YDL117W MVB12P42939 101 aa3.38□□□□□ -1.87
CYK3YDL117W RPL33BP41056 107 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
CYK3YDL117W YFL067WP43537 175 aa3.38□□□□□ -1.87
CYK3YDL117W PMP3P87284 55 aa3.38□□□□□ -1.87
CYK3YDL117W ACC1Q00955 2233 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
CYK3YDL117W YJL127C-BQ3E828 52 aa3.37□□□□□ -1.87
CYK3YDL117W YBR230W-AQ3E762 66 aa3.37□□□□□ -1.87
CYK3YDL117W YMR105W-AQ8TGS8 64 aa3.37□□□□□ -1.87
CYK3YDL117W YER084WP40057 128 aa3.37□□□□□ -1.87
CYK3YDL117W YLR307C-AQ3E825 87 aa3.37□□□□□ -1.87
CYK3YDL117W YCL042WP25572 119 aa3.36□□□□□ -1.87
CYK3YDL117W YOR011W-AQ3E807 68 aa3.35□□□□□ -1.87
CYK3YDL117W YOR072WQ08486 104 aa3.35□□□□□ -1.87
CYK3YDL117W POL2P21951 2222 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
CYK3YDL117W YLR255CO13574 117 aa3.34□□□□□ -1.88
CYK3YDL117W RPL33AP05744 107 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.88
CYK3YDL117W DDR2P89113 61 aa3.33□□□□□ -1.88
CYK3YDL117W CUP1-1P0CX80 61 aa3.33□□□□□ -1.88
CYK3YDL117W CUP1-2P0CX81 61 aa3.33□□□□□ -1.88
CYK3YDL117W TOM1Q03280 3268 aa3.32□□□□□ -1.88
CYK3YDL117W RPL39P04650 51 aa3.31□□□□□ -1.88
CYK3YDL117W YGR240C-AQ3E786 66 aa3.31□□□□□ -1.88
CYK3YDL117W YNL146C-AQ3E7Z1 64 aa3.31□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 76.8 ms