RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639501.1

PMS1-222, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, human

TSL 5 BASIC

Gene PMS1, Length 2,506 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PMS1-222	ENST00000639501	ASPH	Q12797	758 aa		21.34	■■□□□ 1.01
PMS1-222	ENST00000639501	BMPR2	Q13873	1038 aa		21.34	■■□□□ 1.01
PMS1-222	ENST00000639501	GRM2	Q14416	872 aa		21.34	■■□□□ 1.01
PMS1-222	ENST00000639501	DNAJC1	Q96KC8	554 aa	Known RBP	21.34	■■□□□ 1.01
PMS1-222	ENST00000639501	UGT1A7	Q9HAW7	530 aa		21.34	■■□□□ 1.01
PMS1-222	ENST00000639501	UGT1A10	Q9HAW8	530 aa		21.34	■■□□□ 1.01
PMS1-222	ENST00000639501	UGT1A8	Q9HAW9	530 aa		21.34	■■□□□ 1.01
PMS1-222	ENST00000639501	PLLP	Q9Y342	182 aa		21.34	■■□□□ 1.01
PMS1-222	ENST00000639501	TEX264	Q9Y6I9	313 aa		21.34	■■□□□ 1.01
PMS1-222	ENST00000639501	ARHGAP42	A6NI28	874 aa		21.34	■■□□□ 1.01
PMS1-222	ENST00000639501	NDC80	O14777	642 aa		21.34	■■□□□ 1.01
PMS1-222	ENST00000639501	FKBP6	O75344	327 aa		21.34	■■□□□ 1.01
PMS1-222	ENST00000639501	UQCRB	P14927	111 aa		21.34	■■□□□ 1.01
PMS1-222	ENST00000639501	SCNN1B	P51168	640 aa		21.34	■■□□□ 1.01
PMS1-222	ENST00000639501	HIRA	P54198	1017 aa	Predicted RBP	21.34	■■□□□ 1.01
PMS1-222	ENST00000639501	MED21	Q13503	144 aa		21.34	■■□□□ 1.01
PMS1-222	ENST00000639501	NCOA4	Q13772	614 aa		21.34	■■□□□ 1.01
PMS1-222	ENST00000639501	CCNI	Q14094	377 aa		21.34	■■□□□ 1.01
PMS1-222	ENST00000639501	ARFGAP1	Q8N6T3	406 aa		21.34	■■□□□ 1.01
PMS1-222	ENST00000639501	PPM1N	Q8N819	430 aa		21.34	■■□□□ 1.01
PMS1-222	ENST00000639501	STKLD1	Q8NE28	680 aa		21.34	■■□□□ 1.01
PMS1-222	ENST00000639501	CFAP36	Q96G28	342 aa		21.34	■■□□□ 1.01
PMS1-222	ENST00000639501	RILP	Q96NA2	401 aa		21.34	■■□□□ 1.01
PMS1-222	ENST00000639501	SIRPG	Q9P1W8	387 aa		21.34	■■□□□ 1.01
PMS1-222	ENST00000639501	WEE2	P0C1S8	567 aa		21.33	■■□□□ 1.01
PMS1-222	ENST00000639501	MTMR1	Q13613	665 aa		21.33	■■□□□ 1.01
PMS1-222	ENST00000639501	EFHC1	Q5JVL4	640 aa		21.33	■■□□□ 1.01
PMS1-222	ENST00000639501	ZBTB41	Q5SVQ8	909 aa		21.33	■■□□□ 1.01
PMS1-222	ENST00000639501	CTAGE3P	Q8IX95	158 aa		21.33	■■□□□ 1.01
PMS1-222	ENST00000639501	TDRD3	Q9H7E2	651 aa	Known RBP	21.33	■■□□□ 1.01
PMS1-222	ENST00000639501	GALNT8	Q9NY28	637 aa		21.33	■■□□□ 1.01
PMS1-222	ENST00000639501	HSFX1	Q9UBD0	423 aa		21.33	■■□□□ 1.01
PMS1-222	ENST00000639501	PIM1	P11309	404 aa	Predicted RBP	21.33	■■□□□ 1
PMS1-222	ENST00000639501	CLDN10	P78369	228 aa		21.33	■■□□□ 1
PMS1-222	ENST00000639501	SLC25A11	Q02978	314 aa	Known RBP	21.33	■■□□□ 1
PMS1-222	ENST00000639501	SDCCAG8	Q86SQ7	713 aa	Predicted RBP	21.33	■■□□□ 1
PMS1-222	ENST00000639501	SLC26A7	Q8TE54	656 aa		21.33	■■□□□ 1
PMS1-222	ENST00000639501	CCDC124	Q96CT7	223 aa	Known RBP	21.33	■■□□□ 1
PMS1-222	ENST00000639501	MPP4	Q96JB8	637 aa		21.33	■■□□□ 1
PMS1-222	ENST00000639501	SOX13	Q9UN79	622 aa		21.33	■■□□□ 1
PMS1-222	ENST00000639501	TTLL3	Q9Y4R7	772 aa		21.33	■■□□□ 1
PMS1-222	ENST00000639501		G3V3G9	751 aa		21.32	■■□□□ 1
PMS1-222	ENST00000639501	PENK	P01210	267 aa	Predicted RBP	21.32	■■□□□ 1
PMS1-222	ENST00000639501	VCL	P18206	1134 aa		21.32	■■□□□ 1
PMS1-222	ENST00000639501	HSD17B4	P51659	736 aa		21.32	■■□□□ 1
PMS1-222	ENST00000639501	EPHB1	P54762	984 aa		21.32	■■□□□ 1
PMS1-222	ENST00000639501	HIC1	Q14526	733 aa		21.32	■■□□□ 1
PMS1-222	ENST00000639501	DCAF8	Q5TAQ9	597 aa		21.32	■■□□□ 1
PMS1-222	ENST00000639501	ADGRG6	Q86SQ4	1221 aa		21.32	■■□□□ 1
PMS1-222	ENST00000639501	NME8	Q8N427	588 aa		21.32	■■□□□ 1
PMS1-222	ENST00000639501	EFCAB3	Q8N7B9	438 aa		21.32	■■□□□ 1
PMS1-222	ENST00000639501	HIPK4	Q8NE63	616 aa		21.32	■■□□□ 1
PMS1-222	ENST00000639501	GDPD5	Q8WTR4	605 aa		21.32	■■□□□ 1
PMS1-222	ENST00000639501	HIC2	Q96JB3	615 aa		21.32	■■□□□ 1
PMS1-222	ENST00000639501	CSRNP1	Q96S65	589 aa		21.32	■■□□□ 1
PMS1-222	ENST00000639501	HAPLN2	Q9GZV7	340 aa		21.32	■■□□□ 1
PMS1-222	ENST00000639501	DDX56	Q9NY93	547 aa	Known RBP	21.32	■■□□□ 1
PMS1-222	ENST00000639501	ZNF219	Q9P2Y4	722 aa	Predicted RBP	21.32	■■□□□ 1
PMS1-222	ENST00000639501	UBIAD1	Q9Y5Z9	338 aa		21.32	■■□□□ 1
PMS1-222	ENST00000639501	HNRNPR	O43390	633 aa	Known RBP	21.32	■■□□□ 1
PMS1-222	ENST00000639501	ASL	P04424	464 aa		21.32	■■□□□ 1
PMS1-222	ENST00000639501	SMIM18	P0DKX4	95 aa		21.32	■■□□□ 1
PMS1-222	ENST00000639501	PSMD6	Q15008	389 aa		21.32	■■□□□ 1
PMS1-222	ENST00000639501	KIAA0319L	Q8IZA0	1049 aa		21.32	■■□□□ 1
PMS1-222	ENST00000639501	SHCBP1L	Q9BZQ2	653 aa		21.32	■■□□□ 1
PMS1-222	ENST00000639501	C1orf21	Q9H246	121 aa		21.32	■■□□□ 1
PMS1-222	ENST00000639501	PLAC1	Q9HBJ0	212 aa		21.32	■■□□□ 1
PMS1-222	ENST00000639501	TJP2	Q9UDY2	1190 aa		21.32	■■□□□ 1
PMS1-222	ENST00000639501	SDR42E2	A6NKP2	422 aa		21.31	■■□□□ 1
PMS1-222	ENST00000639501	RFPL1	O75677	317 aa		21.31	■■□□□ 1
PMS1-222	ENST00000639501	SERPINA6	P08185	405 aa		21.31	■■□□□ 1
PMS1-222	ENST00000639501	GART	P22102	1010 aa		21.31	■■□□□ 1
PMS1-222	ENST00000639501	DPYSL3	Q14195	570 aa		21.31	■■□□□ 1
PMS1-222	ENST00000639501	ZNF394	Q53GI3	561 aa		21.31	■■□□□ 1
PMS1-222	ENST00000639501	TTC39B	Q5VTQ0	682 aa	Predicted RBP	21.31	■■□□□ 1
PMS1-222	ENST00000639501	STYK1	Q6J9G0	422 aa		21.31	■■□□□ 1
PMS1-222	ENST00000639501	BBS12	Q6ZW61	710 aa		21.31	■■□□□ 1
PMS1-222	ENST00000639501	SAMD3	Q8N6K7	520 aa		21.31	■■□□□ 1
PMS1-222	ENST00000639501	DDX55	Q8NHQ9	600 aa	Known RBP eCLIP	21.31	■■□□□ 1
PMS1-222	ENST00000639501	ZNF778	Q96MU6	729 aa		21.31	■■□□□ 1
PMS1-222	ENST00000639501	SMYD2	Q9NRG4	433 aa		21.31	■■□□□ 1
PMS1-222	ENST00000639501	TMCO1	Q9UM00	188 aa		21.31	■■□□□ 1
PMS1-222	ENST00000639501	TMX2	Q9Y320	296 aa		21.31	■■□□□ 1
PMS1-222	ENST00000639501	SCN9A	Q15858	1988 aa		21.31	■■□□□ 1
PMS1-222	ENST00000639501		A0A0B4J269	797 aa		21.31	■■□□□ 1
PMS1-222	ENST00000639501	TUBB3	Q13509	450 aa		21.31	■■□□□ 1
PMS1-222	ENST00000639501	PDK3	Q15120	406 aa		21.31	■■□□□ 1
PMS1-222	ENST00000639501	TAF5	Q15542	800 aa		21.31	■■□□□ 1
PMS1-222	ENST00000639501	AAGAB	Q6PD74	315 aa		21.31	■■□□□ 1
PMS1-222	ENST00000639501	LCA5	Q86VQ0	697 aa		21.31	■■□□□ 1
PMS1-222	ENST00000639501	SLC26A11	Q86WA9	606 aa		21.31	■■□□□ 1
PMS1-222	ENST00000639501	NUDCD3	Q8IVD9	361 aa		21.31	■■□□□ 1
PMS1-222	ENST00000639501	OR5B17	Q8NGF7	314 aa		21.31	■■□□□ 1
PMS1-222	ENST00000639501	MMP19	Q99542	508 aa		21.31	■■□□□ 1
PMS1-222	ENST00000639501	TRIM56	Q9BRZ2	755 aa	Known RBP	21.31	■■□□□ 1
PMS1-222	ENST00000639501	KLHL4	Q9C0H6	718 aa		21.31	■■□□□ 1
PMS1-222	ENST00000639501	CNTN6	Q9UQ52	1028 aa		21.31	■■□□□ 1
PMS1-222	ENST00000639501	TXNDC9	O14530	226 aa		21.3	■■□□□ 1
PMS1-222	ENST00000639501	EXTL3	O43909	919 aa		21.3	■■□□□ 1
PMS1-222	ENST00000639501	SNN	O75324	88 aa	Predicted RBP	21.3	■■□□□ 1

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