RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000631044.2

POLG-213, Transcript of DNA polymerase gamma, catalytic subunit, human

TSL 5

Gene POLG, Length 4,668 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
POLG-213	ENST00000631044	KCNK4	Q9NYG8	393 aa		13.9	□□□□□ -0.18
POLG-213	ENST00000631044	ZMYND8	Q9ULU4	1186 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
POLG-213	ENST00000631044	MED1	Q15648	1581 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
POLG-213	ENST00000631044	KIF1A	Q12756	1690 aa		13.9	□□□□□ -0.18
POLG-213	ENST00000631044	FAM208A	Q9UK61	1670 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
POLG-213	ENST00000631044	C15orf38-AP3S2	A0A0A6YYH1	394 aa		13.9	□□□□□ -0.19
POLG-213	ENST00000631044	KBTBD13	C9JR72	458 aa		13.9	□□□□□ -0.19
POLG-213	ENST00000631044	CYTH3	O43739	400 aa		13.9	□□□□□ -0.19
POLG-213	ENST00000631044	GJB6	O95452	261 aa		13.9	□□□□□ -0.19
POLG-213	ENST00000631044	HSPA1A	P0DMV8	641 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.19
POLG-213	ENST00000631044	HSPA1B	P0DMV9	641 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.19
POLG-213	ENST00000631044	ITGA9	Q13797	1035 aa		13.9	□□□□□ -0.19
POLG-213	ENST00000631044	TNFAIP1	Q13829	316 aa		13.9	□□□□□ -0.19
POLG-213	ENST00000631044	SLC1A5	Q15758	541 aa		13.9	□□□□□ -0.19
POLG-213	ENST00000631044	SPRED3	Q2MJR0	410 aa		13.9	□□□□□ -0.19
POLG-213	ENST00000631044	MFSD7	Q6UXD7	560 aa		13.9	□□□□□ -0.19
POLG-213	ENST00000631044	ZNF572	Q7Z3I7	529 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.19
POLG-213	ENST00000631044	ARPIN	Q7Z6K5	226 aa		13.9	□□□□□ -0.19
POLG-213	ENST00000631044	NOP9	Q86U38	636 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.19
POLG-213	ENST00000631044	SULF1	Q8IWU6	871 aa		13.9	□□□□□ -0.19
POLG-213	ENST00000631044	CCDC33	Q8N5R6	958 aa		13.9	□□□□□ -0.19
POLG-213	ENST00000631044	TSPAN14	Q8NG11	270 aa		13.9	□□□□□ -0.19
POLG-213	ENST00000631044	ZNF398	Q8TD17	642 aa		13.9	□□□□□ -0.19
POLG-213	ENST00000631044	NLRP4	Q96MN2	994 aa		13.9	□□□□□ -0.19
POLG-213	ENST00000631044	CADM1	Q9BY67	442 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.19
POLG-213	ENST00000631044	RPF1	Q9H9Y2	349 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.19
POLG-213	ENST00000631044	XRN1	Q8IZH2	1706 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.19
POLG-213	ENST00000631044	MSH4	O15457	936 aa		13.89	□□□□□ -0.19
POLG-213	ENST00000631044	LINGO3	P0C6S8	592 aa		13.89	□□□□□ -0.19
POLG-213	ENST00000631044	UQCRB	P14927	111 aa		13.89	□□□□□ -0.19
POLG-213	ENST00000631044	SPR	P35270	261 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
POLG-213	ENST00000631044	NR1H2	P55055	460 aa		13.89	□□□□□ -0.19
POLG-213	ENST00000631044	UBAP2L	Q14157	1087 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
POLG-213	ENST00000631044	UTS2B	Q765I0	119 aa		13.89	□□□□□ -0.19
POLG-213	ENST00000631044	PCYOX1L	Q8NBM8	494 aa		13.89	□□□□□ -0.19
POLG-213	ENST00000631044	ZFYVE19	Q96K21	471 aa		13.89	□□□□□ -0.19
POLG-213	ENST00000631044	C12orf65	Q9H3J6	166 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
POLG-213	ENST00000631044	LRRC4	Q9HBW1	653 aa		13.89	□□□□□ -0.19
POLG-213	ENST00000631044	UMODL1	Q5DID0	1318 aa		13.89	□□□□□ -0.19
POLG-213	ENST00000631044	TCRBV7S2A1N4T	A0A589	114 aa		13.89	□□□□□ -0.19
POLG-213	ENST00000631044	ZNF839	A8K0R7	811 aa		13.89	□□□□□ -0.19
POLG-213	ENST00000631044	NOL4	O94818	638 aa		13.89	□□□□□ -0.19
POLG-213	ENST00000631044	VIL1	P09327	827 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
POLG-213	ENST00000631044	SLURP2	P0DP57	97 aa		13.89	□□□□□ -0.19
POLG-213	ENST00000631044	CCR3	P51677	355 aa		13.89	□□□□□ -0.19
POLG-213	ENST00000631044	PPP4C	P60510	307 aa		13.89	□□□□□ -0.19
POLG-213	ENST00000631044	NCOA4	Q13772	614 aa		13.89	□□□□□ -0.19
POLG-213	ENST00000631044	TRIM60	Q495X7	471 aa		13.89	□□□□□ -0.19
POLG-213	ENST00000631044	COBLL1	Q53SF7	1204 aa		13.89	□□□□□ -0.19
POLG-213	ENST00000631044	IL31	Q6EBC2	164 aa		13.89	□□□□□ -0.19
POLG-213	ENST00000631044	ZNF555	Q8NEP9	628 aa		13.89	□□□□□ -0.19
POLG-213	ENST00000631044	ABHD8	Q96I13	439 aa		13.89	□□□□□ -0.19
POLG-213	ENST00000631044	ZNF333	Q96JL9	665 aa		13.89	□□□□□ -0.19
POLG-213	ENST00000631044	NMUR2	Q9GZQ4	415 aa		13.89	□□□□□ -0.19
POLG-213	ENST00000631044	NRDE2	Q9H7Z3	1164 aa		13.89	□□□□□ -0.19
POLG-213	ENST00000631044	PLGRKT	Q9HBL7	147 aa		13.89	□□□□□ -0.19
POLG-213	ENST00000631044	PCDH9	Q9HC56	1237 aa		13.89	□□□□□ -0.19
POLG-213	ENST00000631044	TOPORS	Q9NS56	1045 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
POLG-213	ENST00000631044	C6orf222	P0C671	652 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
POLG-213	ENST00000631044	BST1	Q10588	318 aa		13.89	□□□□□ -0.19
POLG-213	ENST00000631044	TMEM119	Q4V9L6	283 aa		13.89	□□□□□ -0.19
POLG-213	ENST00000631044	RSAD1	Q9HA92	442 aa		13.89	□□□□□ -0.19
POLG-213	ENST00000631044	SLC39A10	Q9ULF5	831 aa		13.89	□□□□□ -0.19
POLG-213	ENST00000631044	CAPN8	A6NHC0	703 aa		13.88	□□□□□ -0.19
POLG-213	ENST00000631044	AP3B1	O00203	1094 aa		13.88	□□□□□ -0.19
POLG-213	ENST00000631044	S100A5	P33763	92 aa		13.88	□□□□□ -0.19
POLG-213	ENST00000631044	SLC1A6	P48664	564 aa		13.88	□□□□□ -0.19
POLG-213	ENST00000631044	PSMC5	P62195	406 aa		13.88	□□□□□ -0.19
POLG-213	ENST00000631044	ACSBG2	Q5FVE4	666 aa		13.88	□□□□□ -0.19
POLG-213	ENST00000631044	PLA2G4F	Q68DD2	849 aa		13.88	□□□□□ -0.19
POLG-213	ENST00000631044	SWSAP1	Q6NVH7	229 aa		13.88	□□□□□ -0.19
POLG-213	ENST00000631044	CYP2R1	Q6VVX0	501 aa		13.88	□□□□□ -0.19
POLG-213	ENST00000631044	ZNF720	Q7Z2F6	126 aa		13.88	□□□□□ -0.19
POLG-213	ENST00000631044	RBM46	Q8TBY0	533 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
POLG-213	ENST00000631044	POLR3F	Q9H1D9	316 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
POLG-213	ENST00000631044	NOL6	Q9H6R4	1146 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
POLG-213	ENST00000631044	ATAD3A	Q9NVI7	634 aa		13.88	□□□□□ -0.19
POLG-213	ENST00000631044	THAP1	Q9NVV9	213 aa		13.88	□□□□□ -0.19
POLG-213	ENST00000631044	UBAP1	Q9NZ09	502 aa		13.88	□□□□□ -0.19
POLG-213	ENST00000631044	NDUFB10	O96000	172 aa		13.88	□□□□□ -0.19
POLG-213	ENST00000631044	STIP1	P31948	543 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
POLG-213	ENST00000631044	JAK3	P52333	1124 aa		13.88	□□□□□ -0.19
POLG-213	ENST00000631044	STX5	Q13190	355 aa		13.88	□□□□□ -0.19
POLG-213	ENST00000631044	C16orf46	Q6P387	395 aa		13.88	□□□□□ -0.19
POLG-213	ENST00000631044	SNX32	Q86XE0	403 aa		13.88	□□□□□ -0.19
POLG-213	ENST00000631044	OR6B3	Q8NGW1	331 aa		13.88	□□□□□ -0.19
POLG-213	ENST00000631044	LRRC19	Q9H756	370 aa		13.88	□□□□□ -0.19
POLG-213	ENST00000631044	TBC1D22B	Q9NU19	505 aa		13.88	□□□□□ -0.19
POLG-213	ENST00000631044	LSM1	O15116	133 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
POLG-213	ENST00000631044	CCDC130	P13994	396 aa		13.88	□□□□□ -0.19
POLG-213	ENST00000631044	ZNF23	P17027	643 aa		13.88	□□□□□ -0.19
POLG-213	ENST00000631044	RGS7	P49802	495 aa		13.88	□□□□□ -0.19
POLG-213	ENST00000631044	EN1	Q05925	392 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
POLG-213	ENST00000631044	GRM1	Q13255	1194 aa		13.88	□□□□□ -0.19
POLG-213	ENST00000631044	SURF1	Q15526	300 aa		13.88	□□□□□ -0.19
POLG-213	ENST00000631044	CCDC85B	Q15834	202 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
POLG-213	ENST00000631044	WDR72	Q3MJ13	1102 aa		13.88	□□□□□ -0.19
POLG-213	ENST00000631044	N4BP2L1	Q5TBK1	243 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
POLG-213	ENST00000631044	SATL1	Q86VE3	508 aa		13.88	□□□□□ -0.19
POLG-213	ENST00000631044	ZNF669	Q96BR6	464 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19

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