RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616558.4

SYTL1-210, Transcript of synaptotagmin like 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYTL1, Length 1,878 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL1-210ENST00000616558 KCNJ1P48048 391 aa20.33■□□□□ 0.85
SYTL1-210ENST00000616558 FAM171A1Q5VUB5 890 aa20.33■□□□□ 0.85
SYTL1-210ENST00000616558 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
SYTL1-210ENST00000616558 POLNQ7Z5Q5 900 aa20.33■□□□□ 0.85
SYTL1-210ENST00000616558 KCTD13Q8WZ19 329 aa20.33■□□□□ 0.85
SYTL1-210ENST00000616558 ITGB8P26012 769 aa20.33■□□□□ 0.84
SYTL1-210ENST00000616558 CHRNA3P32297 505 aa20.33■□□□□ 0.84
SYTL1-210ENST00000616558 CARSP49589 748 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.84
SYTL1-210ENST00000616558 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.84
SYTL1-210ENST00000616558 ADCY2Q08462 1091 aa20.33■□□□□ 0.84
SYTL1-210ENST00000616558 ADCY1Q08828 1119 aa20.33■□□□□ 0.84
SYTL1-210ENST00000616558 PPP2R5EQ16537 467 aa20.33■□□□□ 0.84
SYTL1-210ENST00000616558 EFHC1Q5JVL4 640 aa20.33■□□□□ 0.84
SYTL1-210ENST00000616558 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.84
SYTL1-210ENST00000616558 CNKSR3Q6P9H4 555 aa20.33■□□□□ 0.84
SYTL1-210ENST00000616558 CCDC105Q8IYK2 499 aa20.33■□□□□ 0.84
SYTL1-210ENST00000616558 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.84
SYTL1-210ENST00000616558 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa20.33■□□□□ 0.84
SYTL1-210ENST00000616558 PKMYT1Q99640 499 aa20.33■□□□□ 0.84
SYTL1-210ENST00000616558 TMEM106CQ9BVX2 250 aa20.33■□□□□ 0.84
SYTL1-210ENST00000616558 COLEC11Q9BWP8 271 aa20.33■□□□□ 0.84
SYTL1-210ENST00000616558 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.84
SYTL1-210ENST00000616558 GPR62Q9BZJ7 368 aa20.33■□□□□ 0.84
SYTL1-210ENST00000616558 ULBP1Q9BZM6 244 aa20.33■□□□□ 0.84
SYTL1-210ENST00000616558 TRIM31Q9BZY9 425 aa20.33■□□□□ 0.84
SYTL1-210ENST00000616558 CHST7Q9NS84 486 aa20.33■□□□□ 0.84
SYTL1-210ENST00000616558 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.84
SYTL1-210ENST00000616558 NLRC5Q86WI3 1866 aa20.32■□□□□ 0.84
SYTL1-210ENST00000616558 DPYSL4O14531 572 aa20.32■□□□□ 0.84
SYTL1-210ENST00000616558 PRPSAP2O60256 369 aa20.32■□□□□ 0.84
SYTL1-210ENST00000616558 DESP17661 470 aa20.32■□□□□ 0.84
SYTL1-210ENST00000616558 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
SYTL1-210ENST00000616558 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
SYTL1-210ENST00000616558 SLC39A12Q504Y0 691 aa20.32■□□□□ 0.84
SYTL1-210ENST00000616558 FAM117BQ6P1L5 589 aa20.32■□□□□ 0.84
SYTL1-210ENST00000616558 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
SYTL1-210ENST00000616558 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP20.32■□□□□ 0.84
SYTL1-210ENST00000616558 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
SYTL1-210ENST00000616558 KCTD6Q8NC69 237 aa20.32■□□□□ 0.84
SYTL1-210ENST00000616558 MAIP1Q8WWC4 291 aa20.32■□□□□ 0.84
SYTL1-210ENST00000616558 GDF3Q9NR23 364 aa20.32■□□□□ 0.84
SYTL1-210ENST00000616558 MARCH5Q9NX47 278 aa20.32■□□□□ 0.84
SYTL1-210ENST00000616558 CD48P09326 243 aa20.31■□□□□ 0.84
SYTL1-210ENST00000616558 USP17L7P0C7H9 530 aa20.31■□□□□ 0.84
SYTL1-210ENST00000616558 PCK1P35558 622 aa20.31■□□□□ 0.84
SYTL1-210ENST00000616558 COILP38432 576 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
SYTL1-210ENST00000616558 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
SYTL1-210ENST00000616558 MAP9Q49MG5 647 aa20.31■□□□□ 0.84
SYTL1-210ENST00000616558 TFDP3Q5H9I0 405 aa20.31■□□□□ 0.84
SYTL1-210ENST00000616558 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
SYTL1-210ENST00000616558 NECAB2Q7Z6G3 386 aa20.31■□□□□ 0.84
SYTL1-210ENST00000616558 DEFB106AQ8N104 65 aa20.31■□□□□ 0.84
SYTL1-210ENST00000616558 RUBCNQ92622 972 aa20.31■□□□□ 0.84
SYTL1-210ENST00000616558 ZBTB9Q96C00 473 aa20.31■□□□□ 0.84
SYTL1-210ENST00000616558 VWCEQ96DN2 955 aa20.31■□□□□ 0.84
SYTL1-210ENST00000616558 DPH5Q9H2P9 285 aa20.31■□□□□ 0.84
SYTL1-210ENST00000616558 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP20.31■□□□□ 0.84
SYTL1-210ENST00000616558 NFU1Q9UMS0 254 aa20.31■□□□□ 0.84
SYTL1-210ENST00000616558 PTPRDP23468 1912 aa20.31■□□□□ 0.84
SYTL1-210ENST00000616558 TRIM43BA6NCK2 446 aa20.3■□□□□ 0.84
SYTL1-210ENST00000616558 HSF2BPO75031 334 aa20.3■□□□□ 0.84
SYTL1-210ENST00000616558 CSF2RAP15509 400 aa20.3■□□□□ 0.84
SYTL1-210ENST00000616558 SCNN1AP37088 669 aa20.3■□□□□ 0.84
SYTL1-210ENST00000616558 CDKN2BP42772 138 aa20.3■□□□□ 0.84
SYTL1-210ENST00000616558 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
SYTL1-210ENST00000616558 DYNLT1P63172 113 aa20.3■□□□□ 0.84
SYTL1-210ENST00000616558 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
SYTL1-210ENST00000616558 CYP1B1Q16678 543 aa20.3■□□□□ 0.84
SYTL1-210ENST00000616558 DCAF6Q58WW2 860 aa20.3■□□□□ 0.84
SYTL1-210ENST00000616558 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
SYTL1-210ENST00000616558 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
SYTL1-210ENST00000616558 HAUS1Q96CS2 278 aa20.3■□□□□ 0.84
SYTL1-210ENST00000616558 CALN1Q9BXU9 219 aa20.3■□□□□ 0.84
SYTL1-210ENST00000616558 ADAM33Q9BZ11 813 aa20.3■□□□□ 0.84
SYTL1-210ENST00000616558 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP20.3■□□□□ 0.84
SYTL1-210ENST00000616558 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa20.3■□□□□ 0.84
SYTL1-210ENST00000616558 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
SYTL1-210ENST00000616558 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
SYTL1-210ENST00000616558 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa20.3■□□□□ 0.84
SYTL1-210ENST00000616558 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
SYTL1-210ENST00000616558 HHLA1C9JL84 531 aa20.3■□□□□ 0.84
SYTL1-210ENST00000616558 OAZ2O95190 189 aa20.3■□□□□ 0.84
SYTL1-210ENST00000616558 GALTP07902 379 aa20.3■□□□□ 0.84
SYTL1-210ENST00000616558 KDELR1P24390 212 aa20.3■□□□□ 0.84
SYTL1-210ENST00000616558 ARPP19P56211 112 aa20.3■□□□□ 0.84
SYTL1-210ENST00000616558 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
SYTL1-210ENST00000616558 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
SYTL1-210ENST00000616558 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
SYTL1-210ENST00000616558 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP20.3■□□□□ 0.84
SYTL1-210ENST00000616558 CTXN3Q4LDR2 81 aa20.3■□□□□ 0.84
SYTL1-210ENST00000616558 HFE2Q6ZVN8 426 aa20.3■□□□□ 0.84
SYTL1-210ENST00000616558 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
SYTL1-210ENST00000616558 JAMLQ86YT9 394 aa20.3■□□□□ 0.84
SYTL1-210ENST00000616558 LRRC43Q8N309 656 aa20.3■□□□□ 0.84
SYTL1-210ENST00000616558 TBCBQ99426 244 aa20.3■□□□□ 0.84
SYTL1-210ENST00000616558 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
SYTL1-210ENST00000616558 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa20.29■□□□□ 0.84
SYTL1-210ENST00000616558 DAPK3O43293 454 aa20.29■□□□□ 0.84
SYTL1-210ENST00000616558 TJP3O95049 919 aa20.29■□□□□ 0.84
SYTL1-210ENST00000616558 RAG1P15918 1043 aa20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.5 ms