RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613122.4

CTDP1-208, Transcript of CTD phosphatase subunit 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDP1, Length 5,866 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1-208ENST00000613122 PCDH8O95206 1070 aa20.87■□□□□ 0.93
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CTDP1-208ENST00000613122 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP20.85■□□□□ 0.93
CTDP1-208ENST00000613122 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa20.84■□□□□ 0.93
CTDP1-208ENST00000613122 ERVK-10P10266 1014 aa20.84■□□□□ 0.93
CTDP1-208ENST00000613122 SOX11P35716 441 aa20.84■□□□□ 0.93
CTDP1-208ENST00000613122 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
CTDP1-208ENST00000613122 ZBTB17Q13105 803 aa20.84■□□□□ 0.93
CTDP1-208ENST00000613122 IKBKEQ14164 716 aa20.84■□□□□ 0.93
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