RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612839.1

CCL3L3-201, Transcript of C-C motif chemokine ligand 3 like 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CCL3L3, Length 1,458 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L3-201ENST00000612839 ZXDAP98168 799 aa11.95□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 UBXN1Q04323 297 aa11.95□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 PDE4CQ08493 712 aa11.95□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 CNGA2Q16280 664 aa11.95□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 LCLAT1Q6UWP7 414 aa11.95□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 PIGZQ86VD9 579 aa11.95□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 MON1AQ86VX9 555 aa11.95□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 GPIHBP1Q8IV16 184 aa11.95□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 CMTM8Q8IZV2 173 aa11.95□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 UBA3Q8TBC4 463 aa11.95□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 EDAQ92838 391 aa11.95□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 ELSPBP1Q96BH3 223 aa11.95□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 RSPRY1Q96DX4 576 aa11.95□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 SLITRK1Q96PX8 696 aa11.95□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 SLC22A12Q96S37 553 aa11.95□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 UBXN6Q9BZV1 441 aa11.95□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 GANQ9H2C0 597 aa11.95□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 COMMD8Q9NX08 183 aa11.95□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa11.95□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 ZMYM5Q9UJ78 669 aa11.95□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 DUSP12Q9UNI6 340 aa11.95□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 HELZP42694 1942 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 EPHB6O15197 1021 aa11.95□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 CYP26A1O43174 497 aa11.95□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 TEX33O43247 280 aa11.95□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 PRAMEF12O95522 483 aa11.95□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 RFX1P22670 979 aa11.95□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 GNA15P30679 374 aa11.95□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 USP8P40818 1118 aa11.95□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 PGFP49763 221 aa11.95□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 KIF11P52732 1056 aa11.95□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 BST2Q10589 180 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 RAPGEF1Q13905 1077 aa11.95□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 SYCP1Q15431 976 aa11.95□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 STILQ15468 1287 aa11.95□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 RAB41Q5JT25 222 aa11.95□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 SMYD5Q6GMV2 418 aa11.95□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 LRSAM1Q6UWE0 723 aa11.95□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 VITQ6UXI7 678 aa11.95□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 UBALD2Q8IYN6 164 aa11.95□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 ZNF606Q8WXB4 792 aa11.95□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 OVCA2Q8WZ82 227 aa11.95□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 FBXO32Q969P5 355 aa11.95□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 LRRC3BQ96PB8 259 aa11.95□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 ERGIC2Q96RQ1 377 aa11.95□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 CYP2S1Q96SQ9 504 aa11.95□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 FBXO44Q9H4M3 255 aa11.95□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 HESX1Q9UBX0 185 aa11.95□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 USP3Q9Y6I4 520 aa11.95□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 CUL9Q8IWT3 2517 aa11.94□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 HEPACAM2A8MVW5 462 aa11.94□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 M0QYV0 167 aa11.94□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 OAS1P00973 400 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa11.94□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 SETSIPP0DME0 302 aa11.94□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 SRFP11831 508 aa11.94□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 CLCN1P35523 988 aa11.94□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 AVPR1AP37288 418 aa11.94□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 PLA2G4AP47712 749 aa11.94□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 SLC8A3P57103 927 aa11.94□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 SNX30Q5VWJ9 437 aa11.94□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 FAM71AQ8IYT1 594 aa11.94□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 PDZD8Q8NEN9 1154 aa11.94□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 SLC35F5Q8WV83 523 aa11.94□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 RNF38Q9H0F5 515 aa11.94□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 TRPC7Q9HCX4 862 aa11.94□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 GMIPQ9P107 970 aa11.94□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 SCML2Q9UQR0 700 aa11.94□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 CCL26Q9Y258 94 aa11.94□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 TECTAO75443 2155 aa11.93□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa11.93□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 A0A1B0GTH6 734 aa11.93□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 F8VZ95 297 aa11.93□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 THAP12O43422 761 aa11.93□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 OLFM2O95897 454 aa11.93□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 ABL1P00519 1130 aa11.93□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 CFHP08603 1231 aa11.93□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 PSMC3P17980 439 aa11.93□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 HDCP19113 662 aa11.93□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 GPC5P78333 572 aa11.93□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 SIGLEC14Q08ET2 396 aa11.93□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 GRM2Q14416 872 aa11.93□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 PMF1Q6P1K2 205 aa11.93□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 CCDC186Q7Z3E2 898 aa11.93□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 SLC47A2Q86VL8 602 aa11.93□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 MFSD6LQ8IWD5 586 aa11.93□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 PLPP6Q8IY26 295 aa11.93□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.2 ms