RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590105.1

EFTUD2-216, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 2

Gene EFTUD2, Length 427 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-216ENST00000590105 MGEA5O60502 916 aa8.4□□□□□ -1.06
EFTUD2-216ENST00000590105 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP8.4□□□□□ -1.06
EFTUD2-216ENST00000590105 HIP1RO75146 1068 aa8.4□□□□□ -1.06
EFTUD2-216ENST00000590105 KRT37O76014 449 aa8.4□□□□□ -1.06
EFTUD2-216ENST00000590105 BAIAP3O94812 1187 aa8.4□□□□□ -1.06
EFTUD2-216ENST00000590105 MYBP10242 640 aa8.4□□□□□ -1.06
EFTUD2-216ENST00000590105 DRD2P14416 443 aa8.4□□□□□ -1.06
EFTUD2-216ENST00000590105 IFNGR1P15260 489 aa8.4□□□□□ -1.06
EFTUD2-216ENST00000590105 FSTP19883 344 aa8.4□□□□□ -1.06
EFTUD2-216ENST00000590105 GUCY1B3Q02153 619 aa8.4□□□□□ -1.06
EFTUD2-216ENST00000590105 ST3GAL1Q11201 340 aa8.4□□□□□ -1.06
EFTUD2-216ENST00000590105 EPHA7Q15375 998 aa8.4□□□□□ -1.06
EFTUD2-216ENST00000590105 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
EFTUD2-216ENST00000590105 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
EFTUD2-216ENST00000590105 IZUMO3Q5VZ72 239 aa8.4□□□□□ -1.06
EFTUD2-216ENST00000590105 ICE2Q659A1 982 aa8.4□□□□□ -1.06
EFTUD2-216ENST00000590105 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
EFTUD2-216ENST00000590105 MTHFD1LQ6UB35 978 aa8.4□□□□□ -1.06
EFTUD2-216ENST00000590105 NPNTQ6UXI9 565 aa8.4□□□□□ -1.06
EFTUD2-216ENST00000590105 GPR155Q7Z3F1 870 aa8.4□□□□□ -1.06
EFTUD2-216ENST00000590105 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
EFTUD2-216ENST00000590105 DEFB123Q8N688 67 aa8.4□□□□□ -1.06
EFTUD2-216ENST00000590105 DBF4BQ8NFT6 615 aa8.4□□□□□ -1.06
EFTUD2-216ENST00000590105 TET1Q8NFU7 2136 aa8.4□□□□□ -1.06
EFTUD2-216ENST00000590105 DNAJB3Q8WWF6 145 aa8.4□□□□□ -1.06
EFTUD2-216ENST00000590105 SEPT8Q92599 483 aa8.4□□□□□ -1.06
EFTUD2-216ENST00000590105 ARL8AQ96BM9 186 aa8.4□□□□□ -1.06
EFTUD2-216ENST00000590105 FAM167AQ96KS9 214 aa8.4□□□□□ -1.06
EFTUD2-216ENST00000590105 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
EFTUD2-216ENST00000590105 B3GNT5Q9BYG0 378 aa8.4□□□□□ -1.06
EFTUD2-216ENST00000590105 BTBD1Q9H0C5 482 aa8.4□□□□□ -1.06
EFTUD2-216ENST00000590105 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
EFTUD2-216ENST00000590105 VPS11Q9H270 941 aa8.4□□□□□ -1.06
EFTUD2-216ENST00000590105 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
EFTUD2-216ENST00000590105 UNC45AQ9H3U1 944 aa8.4□□□□□ -1.06
EFTUD2-216ENST00000590105 RASSF1Q9NS23 344 aa8.4□□□□□ -1.06
EFTUD2-216ENST00000590105 MTMR10Q9NXD2 777 aa8.4□□□□□ -1.06
EFTUD2-216ENST00000590105 PDP2Q9P2J9 529 aa8.4□□□□□ -1.06
EFTUD2-216ENST00000590105 TUBE1Q9UJT0 475 aa8.4□□□□□ -1.06
EFTUD2-216ENST00000590105 PCDHA12Q9UN75 941 aa8.4□□□□□ -1.06
EFTUD2-216ENST00000590105 GPR52Q9Y2T5 361 aa8.4□□□□□ -1.06
EFTUD2-216ENST00000590105 KIF3AQ9Y496 699 aa8.4□□□□□ -1.06
EFTUD2-216ENST00000590105 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
EFTUD2-216ENST00000590105 SQORQ9Y6N5 450 aa8.4□□□□□ -1.06
EFTUD2-216ENST00000590105 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
EFTUD2-216ENST00000590105 COL1A2P08123 1366 aa8.39□□□□□ -1.07
EFTUD2-216ENST00000590105 TMEM265A0A087WTH1 108 aa8.39□□□□□ -1.07
EFTUD2-216ENST00000590105 MED26O95402 600 aa8.39□□□□□ -1.07
EFTUD2-216ENST00000590105 CHRNA1P02708 482 aa8.39□□□□□ -1.07
EFTUD2-216ENST00000590105 VAV1P15498 845 aa8.39□□□□□ -1.07
EFTUD2-216ENST00000590105 TMOD1P28289 359 aa8.39□□□□□ -1.07
EFTUD2-216ENST00000590105 PPM1AP35813 382 aa8.39□□□□□ -1.07
EFTUD2-216ENST00000590105 KIF11P52732 1056 aa8.39□□□□□ -1.07
EFTUD2-216ENST00000590105 SLC16A1P53985 500 aa8.39□□□□□ -1.07
EFTUD2-216ENST00000590105 JAM2P57087 298 aa8.39□□□□□ -1.07
EFTUD2-216ENST00000590105 CDC42EP1Q00587 391 aa8.39□□□□□ -1.07
EFTUD2-216ENST00000590105 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
EFTUD2-216ENST00000590105 RAB30Q15771 203 aa8.39□□□□□ -1.07
EFTUD2-216ENST00000590105 XKR3Q5GH77 459 aa8.39□□□□□ -1.07
EFTUD2-216ENST00000590105 ANKRD34AQ69YU3 496 aa8.39□□□□□ -1.07
EFTUD2-216ENST00000590105 CRTC3Q6UUV7 619 aa8.39□□□□□ -1.07
EFTUD2-216ENST00000590105 Q6ZS46 218 aa8.39□□□□□ -1.07
EFTUD2-216ENST00000590105 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
EFTUD2-216ENST00000590105 MAATS1Q7Z4T9 603 aa8.39□□□□□ -1.07
EFTUD2-216ENST00000590105 USP38Q8NB14 1042 aa8.39□□□□□ -1.07
EFTUD2-216ENST00000590105 ETNPPLQ8TBG4 499 aa8.39□□□□□ -1.07
EFTUD2-216ENST00000590105 LRTOMTQ8WZ04 291 aa8.39□□□□□ -1.07
EFTUD2-216ENST00000590105 HAS1Q92839 578 aa8.39□□□□□ -1.07
EFTUD2-216ENST00000590105 RAX2Q96IS3 184 aa8.39□□□□□ -1.07
EFTUD2-216ENST00000590105 HDAC8Q9BY41 377 aa8.39□□□□□ -1.07
EFTUD2-216ENST00000590105 KCNMB3Q9NPA1 279 aa8.39□□□□□ -1.07
EFTUD2-216ENST00000590105 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
EFTUD2-216ENST00000590105 ITIH6Q6UXX5 1313 aa8.38□□□□□ -1.07
EFTUD2-216ENST00000590105 EVPLQ92817 2033 aa8.38□□□□□ -1.07
EFTUD2-216ENST00000590105 LRRC10BA6NIK2 292 aa8.38□□□□□ -1.07
EFTUD2-216ENST00000590105 H7BY64 318 aa8.38□□□□□ -1.07
EFTUD2-216ENST00000590105 J3KRW8 73 aa8.38□□□□□ -1.07
EFTUD2-216ENST00000590105 M0QZ92 97 aa8.38□□□□□ -1.07
EFTUD2-216ENST00000590105 CHMP2AO43633 222 aa8.38□□□□□ -1.07
EFTUD2-216ENST00000590105 SLC37A4O43826 429 aa8.38□□□□□ -1.07
EFTUD2-216ENST00000590105 AGR2O95994 175 aa8.38□□□□□ -1.07
EFTUD2-216ENST00000590105 AMY2AP04746 511 aa8.38□□□□□ -1.07
EFTUD2-216ENST00000590105 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP8.38□□□□□ -1.07
EFTUD2-216ENST00000590105 AMY2BP19961 511 aa8.38□□□□□ -1.07
EFTUD2-216ENST00000590105 SSTR4P31391 388 aa8.38□□□□□ -1.07
EFTUD2-216ENST00000590105 MAPK9P45984 424 aa8.38□□□□□ -1.07
EFTUD2-216ENST00000590105 QARSP47897 775 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
EFTUD2-216ENST00000590105 PRIM2P49643 509 aa8.38□□□□□ -1.07
EFTUD2-216ENST00000590105 CASP5P51878 434 aa8.38□□□□□ -1.07
EFTUD2-216ENST00000590105 PSMC5P62195 406 aa8.38□□□□□ -1.07
EFTUD2-216ENST00000590105 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
EFTUD2-216ENST00000590105 SPIRE1Q08AE8 756 aa8.38□□□□□ -1.07
EFTUD2-216ENST00000590105 PPP2R5CQ13362 524 aa8.38□□□□□ -1.07
EFTUD2-216ENST00000590105 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
EFTUD2-216ENST00000590105 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
EFTUD2-216ENST00000590105 TOR2AQ5JU69 321 aa8.38□□□□□ -1.07
EFTUD2-216ENST00000590105 EFCAB12Q6NXP0 572 aa8.38□□□□□ -1.07
EFTUD2-216ENST00000590105 MZT2BQ6NZ67 158 aa8.38□□□□□ -1.07
EFTUD2-216ENST00000590105 FDX2Q6P4F2 183 aa8.38□□□□□ -1.07
EFTUD2-216ENST00000590105 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa8.38□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29 ms