RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589585.1

CTIF-207, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 4

Gene CTIF, Length 564 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-207ENST00000589585 TSPAN16Q9UKR8 245 aa14.49□□□□□ -0.09
CTIF-207ENST00000589585 KIAA1257Q9ULG3 409 aa14.49□□□□□ -0.09
CTIF-207ENST00000589585 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
CTIF-207ENST00000589585 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa14.49□□□□□ -0.09
CTIF-207ENST00000589585 SCML2Q9UQR0 700 aa14.49□□□□□ -0.09
CTIF-207ENST00000589585 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa14.49□□□□□ -0.09
CTIF-207ENST00000589585 VPS13AQ96RL7 3174 aa14.48□□□□□ -0.09
CTIF-207ENST00000589585 F5P12259 2224 aa14.48□□□□□ -0.09
CTIF-207ENST00000589585 FAM92AA1XBS5 289 aa14.48□□□□□ -0.09
CTIF-207ENST00000589585 KCNJ18B7U540 433 aa14.48□□□□□ -0.09
CTIF-207ENST00000589585 H0Y858 1186 aa14.48□□□□□ -0.09
CTIF-207ENST00000589585 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
CTIF-207ENST00000589585 LEFTY2O00292 366 aa14.48□□□□□ -0.09
CTIF-207ENST00000589585 CYP26A1O43174 497 aa14.48□□□□□ -0.09
CTIF-207ENST00000589585 COCHO43405 550 aa14.48□□□□□ -0.09
CTIF-207ENST00000589585 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
CTIF-207ENST00000589585 OAS1P00973 400 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
CTIF-207ENST00000589585 PAEPP09466 180 aa14.48□□□□□ -0.09
CTIF-207ENST00000589585 GLULP15104 373 aa14.48□□□□□ -0.09
CTIF-207ENST00000589585 ARSAP15289 507 aa14.48□□□□□ -0.09
CTIF-207ENST00000589585 SLC9A1P19634 815 aa14.48□□□□□ -0.09
CTIF-207ENST00000589585 KIF11P52732 1056 aa14.48□□□□□ -0.09
CTIF-207ENST00000589585 SLC7A9P82251 487 aa14.48□□□□□ -0.09
CTIF-207ENST00000589585 KCNJ12Q14500 433 aa14.48□□□□□ -0.09
CTIF-207ENST00000589585 ZNF77Q15935 545 aa14.48□□□□□ -0.09
CTIF-207ENST00000589585 STX1AQ16623 288 aa14.48□□□□□ -0.09
CTIF-207ENST00000589585 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa14.48□□□□□ -0.09
CTIF-207ENST00000589585 VWA3BQ502W6 1294 aa14.48□□□□□ -0.09
CTIF-207ENST00000589585 GJB7Q6PEY0 223 aa14.48□□□□□ -0.09
CTIF-207ENST00000589585 TRIM65Q6PJ69 517 aa14.48□□□□□ -0.09
CTIF-207ENST00000589585 DTWD2Q8NBA8 298 aa14.48□□□□□ -0.09
CTIF-207ENST00000589585 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
CTIF-207ENST00000589585 UBA3Q8TBC4 463 aa14.48□□□□□ -0.09
CTIF-207ENST00000589585 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
CTIF-207ENST00000589585 FAM3CQ92520 227 aa14.48□□□□□ -0.09
CTIF-207ENST00000589585 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
CTIF-207ENST00000589585 KREMEN1Q96MU8 473 aa14.48□□□□□ -0.09
CTIF-207ENST00000589585 FAM83CQ9BQN1 747 aa14.48□□□□□ -0.09
CTIF-207ENST00000589585 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
CTIF-207ENST00000589585 CCSER2Q9H7U1 834 aa14.48□□□□□ -0.09
CTIF-207ENST00000589585 PNPLA8Q9NP80 782 aa14.48□□□□□ -0.09
CTIF-207ENST00000589585 LTB4R2Q9NPC1 389 aa14.48□□□□□ -0.09
CTIF-207ENST00000589585 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
CTIF-207ENST00000589585 CPQQ9Y646 472 aa14.48□□□□□ -0.09
CTIF-207ENST00000589585 WNT6Q9Y6F9 365 aa14.48□□□□□ -0.09
CTIF-207ENST00000589585 GREB1Q4ZG55 1949 aa14.48□□□□□ -0.09
CTIF-207ENST00000589585 COL4A3Q01955 1670 aa14.47□□□□□ -0.09
CTIF-207ENST00000589585 NCAM2O15394 837 aa14.47□□□□□ -0.09
CTIF-207ENST00000589585 CALCAP01258 141 aa14.47□□□□□ -0.09
CTIF-207ENST00000589585 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa14.47□□□□□ -0.09
CTIF-207ENST00000589585 BRD2P25440 801 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
CTIF-207ENST00000589585 TARSP26639 723 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
CTIF-207ENST00000589585 IFNAR2P48551 515 aa14.47□□□□□ -0.09
CTIF-207ENST00000589585 PGFP49763 221 aa14.47□□□□□ -0.09
CTIF-207ENST00000589585 NUBP1P53384 320 aa14.47□□□□□ -0.09
CTIF-207ENST00000589585 BCAT1P54687 386 aa14.47□□□□□ -0.09
CTIF-207ENST00000589585 MFAP3P55082 362 aa14.47□□□□□ -0.09
CTIF-207ENST00000589585 ZXDBP98169 803 aa14.47□□□□□ -0.09
CTIF-207ENST00000589585 APBA1Q02410 837 aa14.47□□□□□ -0.09
CTIF-207ENST00000589585 PDE4CQ08493 712 aa14.47□□□□□ -0.09
CTIF-207ENST00000589585 USP4Q13107 963 aa14.47□□□□□ -0.09
CTIF-207ENST00000589585 RUNX3Q13761 415 aa14.47□□□□□ -0.09
CTIF-207ENST00000589585 PDGFRLQ15198 375 aa14.47□□□□□ -0.09
CTIF-207ENST00000589585 SNX30Q5VWJ9 437 aa14.47□□□□□ -0.09
CTIF-207ENST00000589585 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
CTIF-207ENST00000589585 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
CTIF-207ENST00000589585 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa14.47□□□□□ -0.09
CTIF-207ENST00000589585 PIGZQ86VD9 579 aa14.47□□□□□ -0.09
CTIF-207ENST00000589585 TTC30AQ86WT1 665 aa14.47□□□□□ -0.09
CTIF-207ENST00000589585 CCDC105Q8IYK2 499 aa14.47□□□□□ -0.09
CTIF-207ENST00000589585 OSCP1Q8WVF1 389 aa14.47□□□□□ -0.09
CTIF-207ENST00000589585 TFAP2BQ92481 460 aa14.47□□□□□ -0.09
CTIF-207ENST00000589585 NDST4Q9H3R1 872 aa14.47□□□□□ -0.09
CTIF-207ENST00000589585 TMEM63CQ9P1W3 806 aa14.47□□□□□ -0.09
CTIF-207ENST00000589585 CFAP97Q9P2B7 532 aa14.47□□□□□ -0.09
CTIF-207ENST00000589585 NAGPAQ9UK23 515 aa14.47□□□□□ -0.09
CTIF-207ENST00000589585 MYH10P35580 1976 aa14.47□□□□□ -0.09
CTIF-207ENST00000589585 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
CTIF-207ENST00000589585 DENND4CQ5VZ89 1909 aa14.47□□□□□ -0.09
CTIF-207ENST00000589585 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
CTIF-207ENST00000589585 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
CTIF-207ENST00000589585 A0A1W2PQH9 124 aa14.46□□□□□ -0.09
CTIF-207ENST00000589585 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
CTIF-207ENST00000589585 SHISA7A6NL88 538 aa14.46□□□□□ -0.09
CTIF-207ENST00000589585 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa14.46□□□□□ -0.09
CTIF-207ENST00000589585 TULP2O00295 520 aa14.46□□□□□ -0.09
CTIF-207ENST00000589585 O00370 1275 aa14.46□□□□□ -0.09
CTIF-207ENST00000589585 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
CTIF-207ENST00000589585 TLR5O60602 858 aa14.46□□□□□ -0.09
CTIF-207ENST00000589585 GFRA3O60609 400 aa14.46□□□□□ -0.09
CTIF-207ENST00000589585 OLFM2O95897 454 aa14.46□□□□□ -0.09
CTIF-207ENST00000589585 PON1P27169 355 aa14.46□□□□□ -0.09
CTIF-207ENST00000589585 CTHP32929 405 aa14.46□□□□□ -0.09
CTIF-207ENST00000589585 USP8P40818 1118 aa14.46□□□□□ -0.09
CTIF-207ENST00000589585 TUBP50607 506 aa14.46□□□□□ -0.09
CTIF-207ENST00000589585 BST2Q10589 180 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
CTIF-207ENST00000589585 ARHGAP44Q17R89 818 aa14.46□□□□□ -0.09
CTIF-207ENST00000589585 TCP11X2Q5H9J9 407 aa14.46□□□□□ -0.09
CTIF-207ENST00000589585 MIIPQ5JXC2 388 aa14.46□□□□□ -0.09
CTIF-207ENST00000589585 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.8 ms