RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589162.1

CAPNS1-208, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 701 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-208ENST00000589162 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa6.38□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 DEF6Q9H4E7 631 aa6.38□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa6.38□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 CHST7Q9NS84 486 aa6.38□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 MYO1AQ9UBC5 1043 aa6.38□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 MTRRQ9UBK8 725 aa6.38□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 MSRAQ9UJ68 235 aa6.38□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 CDH9Q9ULB4 789 aa6.38□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP6.38□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 DYRK1BQ9Y463 629 aa6.38□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 PTPRDP23468 1912 aa6.37□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 C2orf71A6NGG8 1288 aa6.37□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa6.37□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 F8VP50 259 aa6.37□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 GOLGA8SH3BPF8 625 aa6.37□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 TEX28O15482 410 aa6.37□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 LPXNO60711 386 aa6.37□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 LILRB3O75022 631 aa6.37□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 GRAP2O75791 330 aa6.37□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 AP1G2O75843 785 aa6.37□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 CTSAP10619 480 aa6.37□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 LCP1P13796 627 aa6.37□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 PCSK1P29120 753 aa6.37□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 GPC1P35052 558 aa6.37□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 PTGIRP43119 386 aa6.37□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 PGFP49763 221 aa6.37□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 NDUFV1P49821 464 aa6.37□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 GALCP54803 685 aa6.37□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 CDK17Q00537 523 aa6.37□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 TSPY1Q01534 308 aa6.37□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 PLCB3Q01970 1234 aa6.37□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 KRT17Q04695 432 aa6.37□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 ADCY1Q08828 1119 aa6.37□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 PTP4A2Q12974 167 aa6.37□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 DUSP4Q13115 394 aa6.37□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 RAB30Q15771 203 aa6.37□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 CNGA2Q16280 664 aa6.37□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 DDR2Q16832 855 aa6.37□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 PTPN20Q4JDL3 420 aa6.37□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 RAB6CQ53S08 254 aa6.37□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 ARHGAP17Q68EM7 881 aa6.37□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 PMF1Q6P1K2 205 aa6.37□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 FAM171BQ6P995 826 aa6.37□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 LCLAT1Q6UWP7 414 aa6.37□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 CLEC20AQ6ZU45 233 aa6.37□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 PIGZQ86VD9 579 aa6.37□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 TMEM86AQ8N2M4 240 aa6.37□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa6.37□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 TIFAQ96CG3 184 aa6.37□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 IQCDQ96DY2 449 aa6.37□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 BTBD6Q96KE9 485 aa6.37□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 CCDC42Q96M95 316 aa6.37□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 KLHL5Q96PQ7 755 aa6.37□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 CPXM1Q96SM3 734 aa6.37□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 ACBD6Q9BR61 282 aa6.37□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 APOL5Q9BWW9 433 aa6.37□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 TRIM7Q9C029 511 aa6.37□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 LACRTQ9GZZ8 138 aa6.37□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 MIS12Q9H081 205 aa6.37□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 RAB6CQ9H0N0 254 aa6.37□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 THAP2Q9H0W7 228 aa6.37□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 GOLPH3Q9H4A6 298 aa6.37□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 PRDM12Q9H4Q4 367 aa6.37□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 SLC28A3Q9HAS3 691 aa6.37□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 ST7Q9NRC1 585 aa6.37□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 CDH22Q9UJ99 828 aa6.37□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 SALL4Q9UJQ4 1053 aa6.37□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 NAGPAQ9UK23 515 aa6.37□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 DSEQ9UL01 958 aa6.37□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa6.37□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa6.37□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 DUSP10Q9Y6W6 482 aa6.37□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 MYH10P35580 1976 aa6.37□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa6.36□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 OR6C75A6NL08 312 aa6.36□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa6.36□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 HHLA1C9JL84 531 aa6.36□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 E5RJQ4 531 aa6.36□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 C5orf67F2Z3F1 127 aa6.36□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 H3BNC9 293 aa6.36□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 H7C4K7 107 aa6.36□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 FSCN2O14926 492 aa6.36□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 LINC01565O15544 149 aa6.36□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 ARHGAP6O43182 974 aa6.36□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 BUB1O43683 1085 aa6.36□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 FTLP02792 175 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 ADH1AP07327 375 aa6.36□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 FAM200BP0CF97 657 aa6.36□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 UNGP13051 313 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 EPCAMP16422 314 aa6.36□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 ATF6P18850 670 aa6.36□□□□□ -1.39
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