RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588921.1

ATP9B-216, Transcript of ATPase phospholipid transporting 9B (putative), humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ATP9B, Length 1,511 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9B-216ENST00000588921 UBXN6Q9BZV1 441 aa14.65□□□□□ -0.06
ATP9B-216ENST00000588921 EPHX3Q9H6B9 360 aa14.65□□□□□ -0.06
ATP9B-216ENST00000588921 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
ATP9B-216ENST00000588921 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
ATP9B-216ENST00000588921 NCANO14594 1321 aa14.64□□□□□ -0.07
ATP9B-216ENST00000588921 CKMP06732 381 aa14.64□□□□□ -0.07
ATP9B-216ENST00000588921 USP17L7P0C7H9 530 aa14.64□□□□□ -0.07
ATP9B-216ENST00000588921 PSMC3P17980 439 aa14.64□□□□□ -0.07
ATP9B-216ENST00000588921 PON1P27169 355 aa14.64□□□□□ -0.07
ATP9B-216ENST00000588921 KCNMA1Q12791 1236 aa14.64□□□□□ -0.07
ATP9B-216ENST00000588921 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa14.64□□□□□ -0.07
ATP9B-216ENST00000588921 CLEC20AQ6ZU45 233 aa14.64□□□□□ -0.07
ATP9B-216ENST00000588921 TMTC1Q8IUR5 882 aa14.64□□□□□ -0.07
ATP9B-216ENST00000588921 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
ATP9B-216ENST00000588921 ARHGEF19Q8IW93 802 aa14.64□□□□□ -0.07
ATP9B-216ENST00000588921 CMTM8Q8IZV2 173 aa14.64□□□□□ -0.07
ATP9B-216ENST00000588921 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
ATP9B-216ENST00000588921 MAB21L3Q8N8X9 362 aa14.64□□□□□ -0.07
ATP9B-216ENST00000588921 ANKRD52Q8NB46 1076 aa14.64□□□□□ -0.07
ATP9B-216ENST00000588921 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
ATP9B-216ENST00000588921 NEK11Q8NG66 645 aa14.64□□□□□ -0.07
ATP9B-216ENST00000588921 RSAD2Q8WXG1 361 aa14.64□□□□□ -0.07
ATP9B-216ENST00000588921 IRF7Q92985 503 aa14.64□□□□□ -0.07
ATP9B-216ENST00000588921 KXD1Q9BQD3 176 aa14.64□□□□□ -0.07
ATP9B-216ENST00000588921 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
ATP9B-216ENST00000588921 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
ATP9B-216ENST00000588921 EDEM3Q9BZQ6 932 aa14.64□□□□□ -0.07
ATP9B-216ENST00000588921 TRPC7Q9HCX4 862 aa14.64□□□□□ -0.07
ATP9B-216ENST00000588921 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa14.64□□□□□ -0.07
ATP9B-216ENST00000588921 WNT16Q9UBV4 365 aa14.64□□□□□ -0.07
ATP9B-216ENST00000588921 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa14.64□□□□□ -0.07
ATP9B-216ENST00000588921 PATJQ8NI35 1801 aa14.64□□□□□ -0.07
ATP9B-216ENST00000588921 SOWAHDA6NJG2 315 aa14.63□□□□□ -0.07
ATP9B-216ENST00000588921 EPHB6O15197 1021 aa14.63□□□□□ -0.07
ATP9B-216ENST00000588921 CCP110O43303 1012 aa14.63□□□□□ -0.07
ATP9B-216ENST00000588921 GPR37L1O60883 481 aa14.63□□□□□ -0.07
ATP9B-216ENST00000588921 ABL1P00519 1130 aa14.63□□□□□ -0.07
ATP9B-216ENST00000588921 SETSIPP0DME0 302 aa14.63□□□□□ -0.07
ATP9B-216ENST00000588921 SLC9A1P19634 815 aa14.63□□□□□ -0.07
ATP9B-216ENST00000588921 CACNA2D1P54289 1103 aa14.63□□□□□ -0.07
ATP9B-216ENST00000588921 BST2Q10589 180 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
ATP9B-216ENST00000588921 TAF10Q12962 218 aa14.63□□□□□ -0.07
ATP9B-216ENST00000588921 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
ATP9B-216ENST00000588921 TANGO2Q6ICL3 276 aa14.63□□□□□ -0.07
ATP9B-216ENST00000588921 TADA2BQ86TJ2 420 aa14.63□□□□□ -0.07
ATP9B-216ENST00000588921 MFSD6LQ8IWD5 586 aa14.63□□□□□ -0.07
ATP9B-216ENST00000588921 UBR7Q8N806 425 aa14.63□□□□□ -0.07
ATP9B-216ENST00000588921 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
ATP9B-216ENST00000588921 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP14.63□□□□□ -0.07
ATP9B-216ENST00000588921 SHDQ96IW2 340 aa14.63□□□□□ -0.07
ATP9B-216ENST00000588921 ZSWIM3Q96MP5 696 aa14.63□□□□□ -0.07
ATP9B-216ENST00000588921 SMOQ99835 787 aa14.63□□□□□ -0.07
ATP9B-216ENST00000588921 MFSD1Q9H3U5 465 aa14.63□□□□□ -0.07
ATP9B-216ENST00000588921 BRD9Q9H8M2 597 aa14.63□□□□□ -0.07
ATP9B-216ENST00000588921 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
ATP9B-216ENST00000588921 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
ATP9B-216ENST00000588921 TSPAN16Q9UKR8 245 aa14.63□□□□□ -0.07
ATP9B-216ENST00000588921 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa14.63□□□□□ -0.07
ATP9B-216ENST00000588921 MYO16Q9Y6X6 1858 aa14.63□□□□□ -0.07
ATP9B-216ENST00000588921 TMEM221A6NGB7 291 aa14.62□□□□□ -0.07
ATP9B-216ENST00000588921 HEPACAM2A8MVW5 462 aa14.62□□□□□ -0.07
ATP9B-216ENST00000588921 PRR33A8MZF0 331 aa14.62□□□□□ -0.07
ATP9B-216ENST00000588921 M0R296 226 aa14.62□□□□□ -0.07
ATP9B-216ENST00000588921 TNFRSF10BO14763 440 aa14.62□□□□□ -0.07
ATP9B-216ENST00000588921 HDCP19113 662 aa14.62□□□□□ -0.07
ATP9B-216ENST00000588921 ACO1P21399 889 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
ATP9B-216ENST00000588921 USP8P40818 1118 aa14.62□□□□□ -0.07
ATP9B-216ENST00000588921 PSEN1P49768 467 aa14.62□□□□□ -0.07
ATP9B-216ENST00000588921 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
ATP9B-216ENST00000588921 CNGA2Q16280 664 aa14.62□□□□□ -0.07
ATP9B-216ENST00000588921 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa14.62□□□□□ -0.07
ATP9B-216ENST00000588921 STXBP5Q5T5C0 1151 aa14.62□□□□□ -0.07
ATP9B-216ENST00000588921 TXNDC8Q6A555 127 aa14.62□□□□□ -0.07
ATP9B-216ENST00000588921 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
ATP9B-216ENST00000588921 RAD9BQ6WBX8 426 aa14.62□□□□□ -0.07
ATP9B-216ENST00000588921 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa14.62□□□□□ -0.07
ATP9B-216ENST00000588921 TMEM150AQ86TG1 271 aa14.62□□□□□ -0.07
ATP9B-216ENST00000588921 ARHGAP18Q8N392 663 aa14.62□□□□□ -0.07
ATP9B-216ENST00000588921 DNASE1L2Q92874 299 aa14.62□□□□□ -0.07
ATP9B-216ENST00000588921 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa14.62□□□□□ -0.07
ATP9B-216ENST00000588921 SLC46A2Q9BY10 475 aa14.62□□□□□ -0.07
ATP9B-216ENST00000588921 NACA2Q9H009 215 aa14.62□□□□□ -0.07
ATP9B-216ENST00000588921 TDP1Q9NUW8 608 aa14.62□□□□□ -0.07
ATP9B-216ENST00000588921 CNTN6Q9UQ52 1028 aa14.62□□□□□ -0.07
ATP9B-216ENST00000588921 ZNF840PA6NDX5 716 aa14.61□□□□□ -0.07
ATP9B-216ENST00000588921 ZNF263O14978 683 aa14.61□□□□□ -0.07
ATP9B-216ENST00000588921 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
ATP9B-216ENST00000588921 FCARP24071 287 aa14.61□□□□□ -0.07
ATP9B-216ENST00000588921 TUBP50607 506 aa14.61□□□□□ -0.07
ATP9B-216ENST00000588921 BPIFB4P59827 614 aa14.61□□□□□ -0.07
ATP9B-216ENST00000588921 USP46P62068 366 aa14.61□□□□□ -0.07
ATP9B-216ENST00000588921 MTF1Q14872 753 aa14.61□□□□□ -0.07
ATP9B-216ENST00000588921 MEA1Q16626 185 aa14.61□□□□□ -0.07
ATP9B-216ENST00000588921 ARHGAP44Q17R89 818 aa14.61□□□□□ -0.07
ATP9B-216ENST00000588921 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa14.61□□□□□ -0.07
ATP9B-216ENST00000588921 LCLAT1Q6UWP7 414 aa14.61□□□□□ -0.07
ATP9B-216ENST00000588921 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP14.61□□□□□ -0.07
ATP9B-216ENST00000588921 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
ATP9B-216ENST00000588921 ZMIZ2Q8NF64 920 aa14.61□□□□□ -0.07
ATP9B-216ENST00000588921 BPIFB1Q8TDL5 484 aa14.61□□□□□ -0.07
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