RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580170.5

PTPRM-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 5,941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-211ENST00000580170 RRN3P2A6NIE6 340 aa22.05■■□□□ 1.12
PTPRM-211ENST00000580170 ARP10275 920 aa22.05■■□□□ 1.12
PTPRM-211ENST00000580170 PLIN5Q00G26 463 aa22.05■■□□□ 1.12
PTPRM-211ENST00000580170 LAMC2Q13753 1193 aa22.05■■□□□ 1.12
PTPRM-211ENST00000580170 C11orf74Q86VG3 221 aa22.05■■□□□ 1.12
PTPRM-211ENST00000580170 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
PTPRM-211ENST00000580170 FAM172AQ8WUF8 416 aa22.05■■□□□ 1.12
PTPRM-211ENST00000580170 FUCA2Q9BTY2 467 aa22.05■■□□□ 1.12
PTPRM-211ENST00000580170 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa22.05■■□□□ 1.12
PTPRM-211ENST00000580170 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
PTPRM-211ENST00000580170 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
PTPRM-211ENST00000580170 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
PTPRM-211ENST00000580170 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP22.05■■□□□ 1.12
PTPRM-211ENST00000580170 GLI1P08151 1106 aa22.05■■□□□ 1.12
PTPRM-211ENST00000580170 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
PTPRM-211ENST00000580170 CYP2B6P20813 491 aa22.05■■□□□ 1.12
PTPRM-211ENST00000580170 NPTX2P47972 431 aa22.05■■□□□ 1.12
PTPRM-211ENST00000580170 GGA3Q9NZ52 723 aa22.05■■□□□ 1.12
PTPRM-211ENST00000580170 STX7O15400 261 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
PTPRM-211ENST00000580170 ATP6V1G2O95670 118 aa22.05■■□□□ 1.12
PTPRM-211ENST00000580170 GSNP06396 782 aa22.05■■□□□ 1.12
PTPRM-211ENST00000580170 ODC1P11926 461 aa22.05■■□□□ 1.12
PTPRM-211ENST00000580170 BGNP21810 368 aa22.05■■□□□ 1.12
PTPRM-211ENST00000580170 NME5P56597 212 aa22.05■■□□□ 1.12
PTPRM-211ENST00000580170 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
PTPRM-211ENST00000580170 GALNTL6Q49A17 601 aa22.05■■□□□ 1.12
PTPRM-211ENST00000580170 CACHD1Q5VU97 1274 aa22.05■■□□□ 1.12
PTPRM-211ENST00000580170 CGRRF1Q99675 332 aa22.05■■□□□ 1.12
PTPRM-211ENST00000580170 SPATA16Q9BXB7 569 aa22.05■■□□□ 1.12
PTPRM-211ENST00000580170 IQCA1LA6NCM1 817 aa22.05■■□□□ 1.12
PTPRM-211ENST00000580170 TIMM44O43615 452 aa22.05■■□□□ 1.12
PTPRM-211ENST00000580170 GZMAP12544 262 aa22.05■■□□□ 1.12
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF333Q96JL9 665 aa22.05■■□□□ 1.12
PTPRM-211ENST00000580170 GOLGA8TH3BQL2 631 aa22.04■■□□□ 1.12
PTPRM-211ENST00000580170 GAS2O43903 313 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
PTPRM-211ENST00000580170 RRM1P23921 792 aa22.04■■□□□ 1.12
PTPRM-211ENST00000580170 ITPK1Q13572 414 aa22.04■■□□□ 1.12
PTPRM-211ENST00000580170 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF23P17027 643 aa22.04■■□□□ 1.12
PTPRM-211ENST00000580170 NAMPTP43490 491 aa22.04■■□□□ 1.12
PTPRM-211ENST00000580170 Q4G0T1 1027 aa22.04■■□□□ 1.12
PTPRM-211ENST00000580170 TRIM69Q86WT6 500 aa22.04■■□□□ 1.12
PTPRM-211ENST00000580170 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
PTPRM-211ENST00000580170 SNX13Q9Y5W8 968 aa22.04■■□□□ 1.12
PTPRM-211ENST00000580170 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
PTPRM-211ENST00000580170 MRNIPQ6NTE8 343 aa22.04■■□□□ 1.12
PTPRM-211ENST00000580170 HOMEZQ8IX15 550 aa22.04■■□□□ 1.12
PTPRM-211ENST00000580170 CCDC126Q96EE4 140 aa22.04■■□□□ 1.12
PTPRM-211ENST00000580170 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
PTPRM-211ENST00000580170 UBAP1Q9NZ09 502 aa22.04■■□□□ 1.12
PTPRM-211ENST00000580170 SPASTQ9UBP0 616 aa22.04■■□□□ 1.12
PTPRM-211ENST00000580170 SREBF1P36956 1147 aa22.04■■□□□ 1.12
PTPRM-211ENST00000580170 HPCAP84074 193 aa22.04■■□□□ 1.12
PTPRM-211ENST00000580170 RASA2Q15283 850 aa22.04■■□□□ 1.12
PTPRM-211ENST00000580170 C2orf81A6NN90 581 aa22.04■■□□□ 1.12
PTPRM-211ENST00000580170 PSMC3P17980 439 aa22.04■■□□□ 1.12
PTPRM-211ENST00000580170 EXD1Q8NHP7 514 aa22.04■■□□□ 1.12
PTPRM-211ENST00000580170 CHST12Q9NRB3 414 aa22.04■■□□□ 1.12
PTPRM-211ENST00000580170 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
PTPRM-211ENST00000580170 AP1G2O75843 785 aa22.03■■□□□ 1.12
PTPRM-211ENST00000580170 PROSCO94903 275 aa22.03■■□□□ 1.12
PTPRM-211ENST00000580170 SEL1L3Q68CR1 1132 aa22.03■■□□□ 1.12
PTPRM-211ENST00000580170 MPZL3Q6UWV2 235 aa22.03■■□□□ 1.12
PTPRM-211ENST00000580170 SLFN11Q7Z7L1 901 aa22.03■■□□□ 1.12
PTPRM-211ENST00000580170 LRRC40Q9H9A6 602 aa22.03■■□□□ 1.12
PTPRM-211ENST00000580170 USE1Q9NZ43 259 aa22.03■■□□□ 1.12
PTPRM-211ENST00000580170 USP18Q9UMW8 372 aa22.03■■□□□ 1.12
PTPRM-211ENST00000580170 OTOAQ7RTW8 1153 aa22.03■■□□□ 1.12
PTPRM-211ENST00000580170 H0YC42 278 aa22.03■■□□□ 1.12
PTPRM-211ENST00000580170 C11orf96Q7Z7L8 435 aa22.03■■□□□ 1.12
PTPRM-211ENST00000580170 DNAAF5Q86Y56 855 aa22.03■■□□□ 1.12
PTPRM-211ENST00000580170 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa22.03■■□□□ 1.12
PTPRM-211ENST00000580170 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa22.03■■□□□ 1.12
PTPRM-211ENST00000580170 DCLRE1BQ9H816 532 aa22.03■■□□□ 1.12
PTPRM-211ENST00000580170 FBXO28Q9NVF7 368 aa22.03■■□□□ 1.12
PTPRM-211ENST00000580170 MPP6Q9NZW5 540 aa22.03■■□□□ 1.12
PTPRM-211ENST00000580170 CPS1P31327 1500 aa22.03■■□□□ 1.12
PTPRM-211ENST00000580170 RNF103O00237 685 aa22.03■■□□□ 1.12
PTPRM-211ENST00000580170 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
PTPRM-211ENST00000580170 KRT87PA6NCN2 255 aa22.02■■□□□ 1.12
PTPRM-211ENST00000580170 GARTP22102 1010 aa22.02■■□□□ 1.12
PTPRM-211ENST00000580170 CCNG2Q16589 344 aa22.02■■□□□ 1.12
PTPRM-211ENST00000580170 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
PTPRM-211ENST00000580170 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa22.02■■□□□ 1.12
PTPRM-211ENST00000580170 STRA8Q7Z7C7 330 aa22.02■■□□□ 1.12
PTPRM-211ENST00000580170 SLC26A11Q86WA9 606 aa22.02■■□□□ 1.12
PTPRM-211ENST00000580170 SLITRK1Q96PX8 696 aa22.02■■□□□ 1.12
PTPRM-211ENST00000580170 CYP4F12Q9HCS2 524 aa22.02■■□□□ 1.12
PTPRM-211ENST00000580170 KBTBD13C9JR72 458 aa22.02■■□□□ 1.12
PTPRM-211ENST00000580170 TM9SF1O15321 606 aa22.02■■□□□ 1.12
PTPRM-211ENST00000580170 UBOX5O94941 541 aa22.02■■□□□ 1.12
PTPRM-211ENST00000580170 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
PTPRM-211ENST00000580170 PDPK2PQ6A1A2 396 aa22.02■■□□□ 1.12
PTPRM-211ENST00000580170 AKAP3O75969 853 aa22.02■■□□□ 1.12
PTPRM-211ENST00000580170 CLPTM1O96005 669 aa22.02■■□□□ 1.12
PTPRM-211ENST00000580170 CYP24A1Q07973 514 aa22.02■■□□□ 1.12
PTPRM-211ENST00000580170 KLHL4Q9C0H6 718 aa22.02■■□□□ 1.12
PTPRM-211ENST00000580170 NDEL1Q9GZM8 345 aa22.02■■□□□ 1.12
PTPRM-211ENST00000580170 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.1 ms