RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578600.1

PTPRM-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRM, Length 578 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-208ENST00000578600 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 PGBD2Q6P3X8 592 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 ANKRD23Q86SG2 305 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 TDHQ8IZJ6 230 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 VEZTQ9HBM0 779 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 IL23AQ9NPF7 189 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 A0A087WV62 115 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 BTN3A1O00481 513 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 MATN4O95460 622 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 HARSP12081 509 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 PPP2R1AP30153 589 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 PHKA1P46020 1223 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 RIPK4P57078 832 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 RPS16P62249 146 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 DUSP8Q13202 625 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 PPIL2Q13356 520 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 RIN1Q13671 783 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 CCDC38Q502W7 563 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 NT5DC1Q5TFE4 455 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 FKBP1CQ5VVH2 108 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 BORAQ6PGQ7 559 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 GPR135Q8IZ08 494 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 TXLNBQ8N3L3 684 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 PAF1Q8N7H5 531 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 RNF152Q8N8N0 203 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 ATP11CQ8NB49 1132 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 IL17RDQ8NFM7 739 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 ZNF566Q969W8 418 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 IQCDQ96DY2 449 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 BORCS6Q96GS4 357 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 TMEM41AQ96HV5 264 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 GDF15Q99988 308 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 MRI1Q9BV20 369 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 SEC61A2Q9H9S3 476 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 MSL2Q9HCI7 577 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 MTMR10Q9NXD2 777 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 COL20A1Q9P218 1284 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 MED16Q9Y2X0 877 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 ADGRA2Q96PE1 1338 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 UBE2QL1A1L167 161 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 TRIM43BA6NCK2 446 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 CHL1O00533 1208 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 PPFIA4O75335 1185 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 THP07101 528 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 SBK3P0C264 359 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 ALAS1P13196 640 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 GRK6P43250 576 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 HSPA7P48741 367 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 ARFIP2P53365 341 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 CTSWP56202 376 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 RAC3P60763 192 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 PPP2CBP62714 309 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 PPP2CAP67775 309 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 MXRA7P84157 204 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 POU5F1BQ06416 359 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 RAB32Q13637 225 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 BLMHQ13867 455 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
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PTPRM-208ENST00000578600 ZNF529Q6P280 563 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 C17orf99Q6UX52 265 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 SEM1Q6ZVN7 128 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 BEND5Q7L4P6 421 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 FRMD5Q7Z6J6 570 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 C1QL4Q86Z23 238 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 MYCT1Q8N699 235 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 ZNF527Q8NB42 609 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 SHCBP1Q8NEM2 672 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa6.29□□□□□ -1.4
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PTPRM-208ENST00000578600 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 MRIQ9BWK5 157 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 CD209Q9NNX6 404 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 RLIMQ9NVW2 624 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 SLC23A1Q9UHI7 598 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 OAZ3Q9UMX2 235 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 MAST3O60307 1309 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 DUOX1Q9NRD9 1551 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 A0A1W2PPC4 97 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
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