RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000570016.5

CDIPT-210, Transcript of CDP-diacylglycerol--inositol 3-phosphatidyltransferase, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CDIPT, Length 1,346 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDIPT-210ENST00000570016 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
CDIPT-210ENST00000570016 ARID3AQ99856 593 aa22.96■■□□□ 1.27
CDIPT-210ENST00000570016 ECT2Q9H8V3 914 aa22.96■■□□□ 1.27
CDIPT-210ENST00000570016 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
CDIPT-210ENST00000570016 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
CDIPT-210ENST00000570016 LEFTY2O00292 366 aa22.95■■□□□ 1.26
CDIPT-210ENST00000570016 P4HA2O15460 535 aa22.95■■□□□ 1.26
CDIPT-210ENST00000570016 GFRA3O60609 400 aa22.95■■□□□ 1.26
CDIPT-210ENST00000570016 GNA14O95837 355 aa22.95■■□□□ 1.26
CDIPT-210ENST00000570016 TDGF1P13385 188 aa22.95■■□□□ 1.26
CDIPT-210ENST00000570016 RAD23BP54727 409 aa22.95■■□□□ 1.26
CDIPT-210ENST00000570016 AMPD2Q01433 879 aa22.95■■□□□ 1.26
CDIPT-210ENST00000570016 PON2Q15165 354 aa22.95■■□□□ 1.26
CDIPT-210ENST00000570016 TMEM196Q5HYL7 178 aa22.95■■□□□ 1.26
CDIPT-210ENST00000570016 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
CDIPT-210ENST00000570016 ASCL5Q7RTU5 278 aa22.95■■□□□ 1.26
CDIPT-210ENST00000570016 SLC4A11Q8NBS3 891 aa22.95■■□□□ 1.26
CDIPT-210ENST00000570016 TMEM176AQ96HP8 235 aa22.95■■□□□ 1.26
CDIPT-210ENST00000570016 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
CDIPT-210ENST00000570016 CTNND2Q9UQB3 1225 aa22.95■■□□□ 1.26
CDIPT-210ENST00000570016 CPQQ9Y646 472 aa22.95■■□□□ 1.26
CDIPT-210ENST00000570016 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
CDIPT-210ENST00000570016 ADORA2BP29275 332 aa22.94■■□□□ 1.26
CDIPT-210ENST00000570016 IFNAR2P48551 515 aa22.94■■□□□ 1.26
CDIPT-210ENST00000570016 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
CDIPT-210ENST00000570016 CUL2Q13617 745 aa22.94■■□□□ 1.26
CDIPT-210ENST00000570016 HECTD3Q5T447 861 aa22.94■■□□□ 1.26
CDIPT-210ENST00000570016 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
CDIPT-210ENST00000570016 ARHGAP17Q68EM7 881 aa22.94■■□□□ 1.26
CDIPT-210ENST00000570016 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP22.94■■□□□ 1.26
CDIPT-210ENST00000570016 TRIM59Q8IWR1 403 aa22.94■■□□□ 1.26
CDIPT-210ENST00000570016 SPEM1Q8N4L4 309 aa22.94■■□□□ 1.26
CDIPT-210ENST00000570016 CPA6Q8N4T0 437 aa22.94■■□□□ 1.26
CDIPT-210ENST00000570016 UBR7Q8N806 425 aa22.94■■□□□ 1.26
CDIPT-210ENST00000570016 ZBTB44Q8NCP5 570 aa22.94■■□□□ 1.26
CDIPT-210ENST00000570016 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
CDIPT-210ENST00000570016 DUSP16Q9BY84 665 aa22.94■■□□□ 1.26
CDIPT-210ENST00000570016 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
CDIPT-210ENST00000570016 SCML2Q9UQR0 700 aa22.94■■□□□ 1.26
CDIPT-210ENST00000570016 WNT6Q9Y6F9 365 aa22.94■■□□□ 1.26
CDIPT-210ENST00000570016 COCHO43405 550 aa22.93■■□□□ 1.26
CDIPT-210ENST00000570016 ABL1P00519 1130 aa22.93■■□□□ 1.26
CDIPT-210ENST00000570016 GJA4P35212 333 aa22.93■■□□□ 1.26
CDIPT-210ENST00000570016 CCR3P51677 355 aa22.93■■□□□ 1.26
CDIPT-210ENST00000570016 CCDC40Q4G0X9 1142 aa22.93■■□□□ 1.26
CDIPT-210ENST00000570016 ZNF394Q53GI3 561 aa22.93■■□□□ 1.26
CDIPT-210ENST00000570016 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa22.93■■□□□ 1.26
CDIPT-210ENST00000570016 LMO3Q8TAP4 145 aa22.93■■□□□ 1.26
CDIPT-210ENST00000570016 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
CDIPT-210ENST00000570016 GMIPQ9P107 970 aa22.93■■□□□ 1.26
CDIPT-210ENST00000570016 MYH10P35580 1976 aa22.92■■□□□ 1.26
CDIPT-210ENST00000570016 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
CDIPT-210ENST00000570016 KIF11P52732 1056 aa22.92■■□□□ 1.26
CDIPT-210ENST00000570016 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
CDIPT-210ENST00000570016 CAMK4Q16566 473 aa22.92■■□□□ 1.26
CDIPT-210ENST00000570016 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
CDIPT-210ENST00000570016 UBXN6Q9BZV1 441 aa22.92■■□□□ 1.26
CDIPT-210ENST00000570016 LINC00597Q9H2U6 94 aa22.92■■□□□ 1.26
CDIPT-210ENST00000570016 CYLDQ9NQC7 956 aa22.92■■□□□ 1.26
CDIPT-210ENST00000570016 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
CDIPT-210ENST00000570016 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa22.92■■□□□ 1.26
CDIPT-210ENST00000570016 USP3Q9Y6I4 520 aa22.92■■□□□ 1.26
CDIPT-210ENST00000570016 R4GN57 208 aa22.92■■□□□ 1.26
CDIPT-210ENST00000570016 LILRB5O75023 590 aa22.91■■□□□ 1.26
CDIPT-210ENST00000570016 NFATC1O95644 943 aa22.91■■□□□ 1.26
CDIPT-210ENST00000570016 PGFP49763 221 aa22.91■■□□□ 1.26
CDIPT-210ENST00000570016 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
CDIPT-210ENST00000570016 FSTL4Q6MZW2 842 aa22.91■■□□□ 1.26
CDIPT-210ENST00000570016 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa22.91■■□□□ 1.26
CDIPT-210ENST00000570016 ZNF276Q8N554 614 aa22.91■■□□□ 1.26
CDIPT-210ENST00000570016 CCSER2Q9H7U1 834 aa22.91■■□□□ 1.26
CDIPT-210ENST00000570016 ZSCAN32Q9NX65 697 aa22.91■■□□□ 1.26
CDIPT-210ENST00000570016 RWDD2AQ9UIY3 292 aa22.91■■□□□ 1.26
CDIPT-210ENST00000570016 E2F8A0AVK6 867 aa22.9■■□□□ 1.26
CDIPT-210ENST00000570016 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
CDIPT-210ENST00000570016 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
CDIPT-210ENST00000570016 CXCL12P48061 93 aa22.9■■□□□ 1.26
CDIPT-210ENST00000570016 STX17P56962 302 aa22.9■■□□□ 1.26
CDIPT-210ENST00000570016 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP22.9■■□□□ 1.26
CDIPT-210ENST00000570016 NR1H3Q13133 447 aa22.9■■□□□ 1.26
CDIPT-210ENST00000570016 PPP2R5DQ14738 602 aa22.9■■□□□ 1.26
CDIPT-210ENST00000570016 Q6ZS52 159 aa22.9■■□□□ 1.26
CDIPT-210ENST00000570016 CCDC186Q7Z3E2 898 aa22.9■■□□□ 1.26
CDIPT-210ENST00000570016 EXOC4Q96A65 974 aa22.9■■□□□ 1.26
CDIPT-210ENST00000570016 MED15Q96RN5 788 aa22.9■■□□□ 1.26
CDIPT-210ENST00000570016 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
CDIPT-210ENST00000570016 SMPD4Q9NXE4 827 aa22.9■■□□□ 1.26
CDIPT-210ENST00000570016 TLR5O60602 858 aa22.89■■□□□ 1.26
CDIPT-210ENST00000570016 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.26
CDIPT-210ENST00000570016 ACO1P21399 889 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.26
CDIPT-210ENST00000570016 DRD1P21728 446 aa22.89■■□□□ 1.26
CDIPT-210ENST00000570016 GALK1P51570 392 aa22.89■■□□□ 1.26
CDIPT-210ENST00000570016 CETN1Q12798 172 aa22.89■■□□□ 1.26
CDIPT-210ENST00000570016 KCNH2Q12809 1159 aa22.89■■□□□ 1.26
CDIPT-210ENST00000570016 GAB4Q2WGN9 574 aa22.89■■□□□ 1.26
CDIPT-210ENST00000570016 RAB41Q5JT25 222 aa22.89■■□□□ 1.26
CDIPT-210ENST00000570016 KLHDC10Q6PID8 442 aa22.89■■□□□ 1.26
CDIPT-210ENST00000570016 ANKRD52Q8NB46 1076 aa22.89■■□□□ 1.26
CDIPT-210ENST00000570016 OTUB2Q96DC9 234 aa22.89■■□□□ 1.26
CDIPT-210ENST00000570016 P2RY13Q9BPV8 354 aa22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.4 ms