RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568331.5

SNAP23-216, Transcript of synaptosome associated protein 23, humanhuman

TSL 4

Gene SNAP23, Length 557 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP23-216ENST00000568331 RNF38Q9H0F5 515 aa22.25■■□□□ 1.15
SNAP23-216ENST00000568331 EBF3Q9H4W6 596 aa22.25■■□□□ 1.15
SNAP23-216ENST00000568331 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
SNAP23-216ENST00000568331 KIAA1257Q9ULG3 409 aa22.25■■□□□ 1.15
SNAP23-216ENST00000568331 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa22.25■■□□□ 1.15
SNAP23-216ENST00000568331 CPQQ9Y646 472 aa22.25■■□□□ 1.15
SNAP23-216ENST00000568331 FAM92AA1XBS5 289 aa22.24■■□□□ 1.15
SNAP23-216ENST00000568331 CTHP32929 405 aa22.24■■□□□ 1.15
SNAP23-216ENST00000568331 AMPD2Q01433 879 aa22.24■■□□□ 1.15
SNAP23-216ENST00000568331 SNX30Q5VWJ9 437 aa22.24■■□□□ 1.15
SNAP23-216ENST00000568331 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP22.24■■□□□ 1.15
SNAP23-216ENST00000568331 LMO3Q8TAP4 145 aa22.24■■□□□ 1.15
SNAP23-216ENST00000568331 RIN3Q8TB24 985 aa22.24■■□□□ 1.15
SNAP23-216ENST00000568331 GPT2Q8TD30 523 aa22.24■■□□□ 1.15
SNAP23-216ENST00000568331 OSCP1Q8WVF1 389 aa22.24■■□□□ 1.15
SNAP23-216ENST00000568331 ATP2A3Q93084 1043 aa22.24■■□□□ 1.15
SNAP23-216ENST00000568331 CLDN23Q96B33 292 aa22.24■■□□□ 1.15
SNAP23-216ENST00000568331 MED15Q96RN5 788 aa22.24■■□□□ 1.15
SNAP23-216ENST00000568331 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
SNAP23-216ENST00000568331 HESX1Q9UBX0 185 aa22.24■■□□□ 1.15
SNAP23-216ENST00000568331 SCML2Q9UQR0 700 aa22.24■■□□□ 1.15
SNAP23-216ENST00000568331 SHISA7A6NL88 538 aa22.23■■□□□ 1.15
SNAP23-216ENST00000568331 HHLA1C9JL84 531 aa22.23■■□□□ 1.15
SNAP23-216ENST00000568331 LEFTY2O00292 366 aa22.23■■□□□ 1.15
SNAP23-216ENST00000568331 OLFM2O95897 454 aa22.23■■□□□ 1.15
SNAP23-216ENST00000568331 VDRP11473 427 aa22.23■■□□□ 1.15
SNAP23-216ENST00000568331 RPS9P46781 194 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
SNAP23-216ENST00000568331 TMEM270Q6UE05 265 aa22.23■■□□□ 1.15
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SNAP23-216ENST00000568331 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa22.23■■□□□ 1.15
SNAP23-216ENST00000568331 C1orf210Q8IVY1 113 aa22.23■■□□□ 1.15
SNAP23-216ENST00000568331 CPA6Q8N4T0 437 aa22.23■■□□□ 1.15
SNAP23-216ENST00000568331 ANKRD52Q8NB46 1076 aa22.23■■□□□ 1.15
SNAP23-216ENST00000568331 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
SNAP23-216ENST00000568331 THAP9Q9H5L6 903 aa22.23■■□□□ 1.15
SNAP23-216ENST00000568331 LMAN1LQ9HAT1 526 aa22.23■■□□□ 1.15
SNAP23-216ENST00000568331 HPS4Q9NQG7 708 aa22.23■■□□□ 1.15
SNAP23-216ENST00000568331 SMPD4Q9NXE4 827 aa22.23■■□□□ 1.15
SNAP23-216ENST00000568331 WNT6Q9Y6F9 365 aa22.23■■□□□ 1.15
SNAP23-216ENST00000568331 COCHO43405 550 aa22.22■■□□□ 1.15
SNAP23-216ENST00000568331 MBD3O95983 291 aa22.22■■□□□ 1.15
SNAP23-216ENST00000568331 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa22.22■■□□□ 1.15
SNAP23-216ENST00000568331 ARSAP15289 507 aa22.22■■□□□ 1.15
SNAP23-216ENST00000568331 TUBP50607 506 aa22.22■■□□□ 1.15
SNAP23-216ENST00000568331 GCNT1Q02742 428 aa22.22■■□□□ 1.15
SNAP23-216ENST00000568331 NR1H3Q13133 447 aa22.22■■□□□ 1.15
SNAP23-216ENST00000568331 LRRC32Q14392 662 aa22.22■■□□□ 1.15
SNAP23-216ENST00000568331 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa22.22■■□□□ 1.15
SNAP23-216ENST00000568331 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
SNAP23-216ENST00000568331 UBR7Q8N806 425 aa22.22■■□□□ 1.15
SNAP23-216ENST00000568331 EXOC4Q96A65 974 aa22.22■■□□□ 1.15
SNAP23-216ENST00000568331 UBXN6Q9BZV1 441 aa22.22■■□□□ 1.15
SNAP23-216ENST00000568331 CCSER2Q9H7U1 834 aa22.22■■□□□ 1.15
SNAP23-216ENST00000568331 CYP26A1O43174 497 aa22.21■■□□□ 1.15
SNAP23-216ENST00000568331 LAMTOR5O43504 91 aa22.21■■□□□ 1.15
SNAP23-216ENST00000568331 PAEPP09466 180 aa22.21■■□□□ 1.15
SNAP23-216ENST00000568331 KIF11P52732 1056 aa22.21■■□□□ 1.15
SNAP23-216ENST00000568331 BCAT1P54687 386 aa22.21■■□□□ 1.15
SNAP23-216ENST00000568331 IRF2BP1Q8IU81 584 aa22.21■■□□□ 1.15
SNAP23-216ENST00000568331 ARHGEF19Q8IW93 802 aa22.21■■□□□ 1.15
SNAP23-216ENST00000568331 FAM86C1Q9NVL1 165 aa22.21■■□□□ 1.15
SNAP23-216ENST00000568331 CFAP97Q9P2B7 532 aa22.21■■□□□ 1.15
SNAP23-216ENST00000568331 TSPAN16Q9UKR8 245 aa22.21■■□□□ 1.15
SNAP23-216ENST00000568331 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
SNAP23-216ENST00000568331 TLR5O60602 858 aa22.2■■□□□ 1.14
SNAP23-216ENST00000568331 NFATC1O95644 943 aa22.2■■□□□ 1.14
SNAP23-216ENST00000568331 PSEN1P49768 467 aa22.2■■□□□ 1.14
SNAP23-216ENST00000568331 PON2Q15165 354 aa22.2■■□□□ 1.14
SNAP23-216ENST00000568331 TXNDC11Q6PKC3 985 aa22.2■■□□□ 1.14
SNAP23-216ENST00000568331 GBP6Q6ZN66 633 aa22.2■■□□□ 1.14
SNAP23-216ENST00000568331 KIAA1958Q8N8K9 716 aa22.2■■□□□ 1.14
SNAP23-216ENST00000568331 KAT5Q92993 513 aa22.2■■□□□ 1.14
SNAP23-216ENST00000568331 FAM81BQ96LP2 452 aa22.2■■□□□ 1.14
SNAP23-216ENST00000568331 CRACR2AQ9BSW2 395 aa22.2■■□□□ 1.14
SNAP23-216ENST00000568331 ECT2Q9H8V3 914 aa22.2■■□□□ 1.14
SNAP23-216ENST00000568331 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
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SNAP23-216ENST00000568331 BST2Q10589 180 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
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SNAP23-216ENST00000568331 EML3Q32P44 896 aa22.19■■□□□ 1.14
SNAP23-216ENST00000568331 DGKKQ5KSL6 1271 aa22.19■■□□□ 1.14
SNAP23-216ENST00000568331 SASS6Q6UVJ0 657 aa22.19■■□□□ 1.14
SNAP23-216ENST00000568331 CCDC186Q7Z3E2 898 aa22.19■■□□□ 1.14
SNAP23-216ENST00000568331 PIGZQ86VD9 579 aa22.19■■□□□ 1.14
SNAP23-216ENST00000568331 TTC30AQ86WT1 665 aa22.19■■□□□ 1.14
SNAP23-216ENST00000568331 ZNF687Q8N1G0 1237 aa22.19■■□□□ 1.14
SNAP23-216ENST00000568331 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
SNAP23-216ENST00000568331 IER2Q9BTL4 223 aa22.19■■□□□ 1.14
SNAP23-216ENST00000568331 NAGPAQ9UK23 515 aa22.19■■□□□ 1.14
SNAP23-216ENST00000568331 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa22.19■■□□□ 1.14
SNAP23-216ENST00000568331 F5P12259 2224 aa22.19■■□□□ 1.14
SNAP23-216ENST00000568331 A0A1W2PQH9 124 aa22.18■■□□□ 1.14
SNAP23-216ENST00000568331 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
SNAP23-216ENST00000568331 CHRNB1P11230 501 aa22.18■■□□□ 1.14
SNAP23-216ENST00000568331 KRT5P13647 590 aa22.18■■□□□ 1.14
SNAP23-216ENST00000568331 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
SNAP23-216ENST00000568331 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
SNAP23-216ENST00000568331 MFAP3P55082 362 aa22.18■■□□□ 1.14
SNAP23-216ENST00000568331 PDE4CQ08493 712 aa22.18■■□□□ 1.14
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