RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559359.1

PSME2-208, Transcript of proteasome activator subunit 2, human

TSL 2

Gene PSME2, Length 484 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PSME2-208	ENST00000559359	CDH8	P55286	799 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PSME2-208	ENST00000559359	DLG4	P78352	724 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PSME2-208	ENST00000559359	CFAP221	Q4G0U5	840 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PSME2-208	ENST00000559359	WDR44	Q5JSH3	913 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PSME2-208	ENST00000559359	TDRD10	Q5VZ19	366 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
PSME2-208	ENST00000559359	CEP135	Q66GS9	1140 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PSME2-208	ENST00000559359	TRIM68	Q6AZZ1	485 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PSME2-208	ENST00000559359	SCARA5	Q6ZMJ2	495 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PSME2-208	ENST00000559359	C4orf50	Q6ZRC1	276 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PSME2-208	ENST00000559359	MON1A	Q86VX9	555 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PSME2-208	ENST00000559359	CELF5	Q8N6W0	485 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
PSME2-208	ENST00000559359	GOLGA5	Q8TBA6	731 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PSME2-208	ENST00000559359	PCED1B	Q96HM7	432 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PSME2-208	ENST00000559359	FUBP3	Q96I24	572 aa	Known RBP eCLIP	11.12	□□□□□ -0.63
PSME2-208	ENST00000559359	SLC22A12	Q96S37	553 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PSME2-208	ENST00000559359	CYP2S1	Q96SQ9	504 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PSME2-208	ENST00000559359	XYLT2	Q9H1B5	865 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PSME2-208	ENST00000559359	CHRD	Q9H2X0	955 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PSME2-208	ENST00000559359	KCTD10	Q9H3F6	313 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PSME2-208	ENST00000559359	SMYD3	Q9H7B4	428 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PSME2-208	ENST00000559359	UTP3	Q9NQZ2	479 aa	Known RBP eCLIP	11.12	□□□□□ -0.63
PSME2-208	ENST00000559359	DMAC2	Q9NW81	257 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PSME2-208	ENST00000559359	CUEDC1	Q9NWM3	386 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
PSME2-208	ENST00000559359	OBP2A	Q9NY56	170 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PSME2-208	ENST00000559359	USP25	Q9UHP3	1055 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PSME2-208	ENST00000559359	FBXO4	Q9UKT5	387 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PSME2-208	ENST00000559359	NUP210	Q8TEM1	1887 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
PSME2-208	ENST00000559359	PATJ	Q8NI35	1801 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PSME2-208	ENST00000559359		A8MXQ7	604 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PSME2-208	ENST00000559359	CLDN5	O00501	218 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PSME2-208	ENST00000559359	C4BPA	P04003	597 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
PSME2-208	ENST00000559359	ARSA	P15289	507 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PSME2-208	ENST00000559359	PTPN1	P18031	435 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
PSME2-208	ENST00000559359	DDX6	P26196	483 aa	Known RBP eCLIP	11.11	□□□□□ -0.63
PSME2-208	ENST00000559359	WEE1	P30291	646 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PSME2-208	ENST00000559359	MAGEA11	P43364	429 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PSME2-208	ENST00000559359	CACNA2D1	P54289	1103 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PSME2-208	ENST00000559359	IFRD2	Q12894	506 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
PSME2-208	ENST00000559359	PSMD2	Q13200	908 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PSME2-208	ENST00000559359	NCOA4	Q13772	614 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PSME2-208	ENST00000559359	GAS6	Q14393	721 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PSME2-208	ENST00000559359	PON2	Q15165	354 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PSME2-208	ENST00000559359	ZNF699	Q32M78	642 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PSME2-208	ENST00000559359	MAP7D1	Q3KQU3	841 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PSME2-208	ENST00000559359	RNFT1	Q5M7Z0	435 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PSME2-208	ENST00000559359	ZC3H14	Q6PJT7	736 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
PSME2-208	ENST00000559359	KRBA2	Q6ZNG9	492 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PSME2-208	ENST00000559359		Q6ZS52	159 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PSME2-208	ENST00000559359	MYCBPAP	Q8TBZ2	947 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PSME2-208	ENST00000559359	PARD3B	Q8TEW8	1205 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PSME2-208	ENST00000559359	MYRFL	Q96LU7	910 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PSME2-208	ENST00000559359	ZNF518B	Q9C0D4	1074 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PSME2-208	ENST00000559359	EBF3	Q9H4W6	596 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PSME2-208	ENST00000559359	C8orf33	Q9H7E9	229 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
PSME2-208	ENST00000559359	HPS4	Q9NQG7	708 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PSME2-208	ENST00000559359	TDP1	Q9NUW8	608 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PSME2-208	ENST00000559359	THG1L	Q9NWX6	298 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
PSME2-208	ENST00000559359	UXT	Q9UBK9	157 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
PSME2-208	ENST00000559359	WDR87	Q6ZQQ6	2873 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PSME2-208	ENST00000559359	EP300	Q09472	2414 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
PSME2-208	ENST00000559359	TRAV19	A0A0A6YYK7	116 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PSME2-208	ENST00000559359	FAM237A	A0A1B0GTK4	181 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PSME2-208	ENST00000559359	C2orf78	A6NCI8	922 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PSME2-208	ENST00000559359	OTOL1	A6NHN0	477 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
PSME2-208	ENST00000559359		F8VP50	259 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PSME2-208	ENST00000559359	PDXK	O00764	312 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PSME2-208	ENST00000559359	KIN	O60870	393 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
PSME2-208	ENST00000559359	TACC1	O75410	805 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PSME2-208	ENST00000559359	VNN1	O95497	513 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PSME2-208	ENST00000559359	CKM	P06732	381 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PSME2-208	ENST00000559359	ANXA13	P27216	316 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PSME2-208	ENST00000559359	HOXC13	P31276	330 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PSME2-208	ENST00000559359	SATB1	Q01826	763 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PSME2-208	ENST00000559359	CENPC	Q03188	943 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PSME2-208	ENST00000559359	DPYD	Q12882	1025 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PSME2-208	ENST00000559359	ORC1	Q13415	861 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PSME2-208	ENST00000559359	MAPRE1	Q15691	268 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
PSME2-208	ENST00000559359	ITPRIPL2	Q3MIP1	535 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PSME2-208	ENST00000559359	ZNF667	Q5HYK9	610 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PSME2-208	ENST00000559359	SPOPL	Q6IQ16	392 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PSME2-208	ENST00000559359	VSTM1	Q6UX27	236 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PSME2-208	ENST00000559359	RIPOR1	Q6ZS17	1223 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PSME2-208	ENST00000559359	RALGPS2	Q86X27	583 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
PSME2-208	ENST00000559359	DCLK2	Q8N568	766 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PSME2-208	ENST00000559359	ARL14EP	Q8N8R7	260 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
PSME2-208	ENST00000559359	PLPP7	Q8NBV4	271 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PSME2-208	ENST00000559359	ATRIP	Q8WXE1	791 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PSME2-208	ENST00000559359	CCDC47	Q96A33	483 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
PSME2-208	ENST00000559359	SYAP1	Q96A49	352 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
PSME2-208	ENST00000559359	TRMT2B	Q96GJ1	504 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
PSME2-208	ENST00000559359	POM121	Q96HA1	1249 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PSME2-208	ENST00000559359	HINFP	Q9BQA5	517 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PSME2-208	ENST00000559359	FAM83C	Q9BQN1	747 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PSME2-208	ENST00000559359	B3GNT5	Q9BYG0	378 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PSME2-208	ENST00000559359	SCAND2P	Q9GZW5	306 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
PSME2-208	ENST00000559359	SDCBP2	Q9H190	292 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PSME2-208	ENST00000559359	PRMT8	Q9NR22	394 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
PSME2-208	ENST00000559359	TMEM30A	Q9NV96	361 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PSME2-208	ENST00000559359	C2orf42	Q9NWW7	574 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PSME2-208	ENST00000559359	ATP6V1D	Q9Y5K8	247 aa		11.1	□□□□□ -0.63

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