RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555743.1

PSMA3-208, Transcript of proteasome subunit alpha 3, human

TSL 2

Gene PSMA3, Length 640 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PSMA3-208	ENST00000555743	B3GNT5	Q9BYG0	378 aa		6.57	□□□□□ -1.36
PSMA3-208	ENST00000555743	DNAI2	Q9GZS0	605 aa		6.57	□□□□□ -1.36
PSMA3-208	ENST00000555743	SDCBP2	Q9H190	292 aa		6.57	□□□□□ -1.36
PSMA3-208	ENST00000555743	ATXN3L	Q9H3M9	355 aa		6.57	□□□□□ -1.36
PSMA3-208	ENST00000555743	MFSD1	Q9H3U5	465 aa		6.57	□□□□□ -1.36
PSMA3-208	ENST00000555743	DPEP3	Q9H4B8	488 aa		6.57	□□□□□ -1.36
PSMA3-208	ENST00000555743	SMYD3	Q9H7B4	428 aa		6.57	□□□□□ -1.36
PSMA3-208	ENST00000555743	C8orf33	Q9H7E9	229 aa	Predicted RBP	6.57	□□□□□ -1.36
PSMA3-208	ENST00000555743	TBC1D17	Q9HA65	648 aa		6.57	□□□□□ -1.36
PSMA3-208	ENST00000555743	APOBEC3G	Q9HC16	384 aa	Known RBP	6.57	□□□□□ -1.36
PSMA3-208	ENST00000555743	DMAP1	Q9NPF5	467 aa	Predicted RBP	6.57	□□□□□ -1.36
PSMA3-208	ENST00000555743	TDP1	Q9NUW8	608 aa		6.57	□□□□□ -1.36
PSMA3-208	ENST00000555743	TMEM30A	Q9NV96	361 aa		6.57	□□□□□ -1.36
PSMA3-208	ENST00000555743	RAB20	Q9NX57	234 aa		6.57	□□□□□ -1.36
PSMA3-208	ENST00000555743	GCNT4	Q9P109	453 aa		6.57	□□□□□ -1.36
PSMA3-208	ENST00000555743	ARMCX3	Q9UH62	379 aa	Predicted RBP	6.57	□□□□□ -1.36
PSMA3-208	ENST00000555743	ARHGAP26	Q9UNA1	814 aa		6.57	□□□□□ -1.36
PSMA3-208	ENST00000555743	MRPS17	Q9Y2R5	130 aa	Known RBP	6.57	□□□□□ -1.36
PSMA3-208	ENST00000555743	SIT1	Q9Y3P8	196 aa		6.57	□□□□□ -1.36
PSMA3-208	ENST00000555743	GPSM3	Q9Y4H4	160 aa		6.57	□□□□□ -1.36
PSMA3-208	ENST00000555743	PIEZO1	Q92508	2521 aa		6.57	□□□□□ -1.36
PSMA3-208	ENST00000555743	NOTCH4	Q99466	2003 aa		6.57	□□□□□ -1.36
PSMA3-208	ENST00000555743	ATP8B3	O60423	1300 aa		6.56	□□□□□ -1.36
PSMA3-208	ENST00000555743		F8VP50	259 aa		6.56	□□□□□ -1.36
PSMA3-208	ENST00000555743	ZNF263	O14978	683 aa		6.56	□□□□□ -1.36
PSMA3-208	ENST00000555743	NCAM2	O15394	837 aa		6.56	□□□□□ -1.36
PSMA3-208	ENST00000555743	PI15	O43692	258 aa		6.56	□□□□□ -1.36
PSMA3-208	ENST00000555743	RTN3	O95197	1032 aa	Predicted RBP	6.56	□□□□□ -1.36
PSMA3-208	ENST00000555743	OAS1	P00973	400 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
PSMA3-208	ENST00000555743	PDGFRB	P09619	1106 aa		6.56	□□□□□ -1.36
PSMA3-208	ENST00000555743	TRIM49	P0CI25	452 aa		6.56	□□□□□ -1.36
PSMA3-208	ENST00000555743	TRIM49C	P0CI26	452 aa		6.56	□□□□□ -1.36
PSMA3-208	ENST00000555743	TRIM21	P19474	475 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
PSMA3-208	ENST00000555743	BDNF	P23560	247 aa		6.56	□□□□□ -1.36
PSMA3-208	ENST00000555743	AVPR1A	P37288	418 aa		6.56	□□□□□ -1.36
PSMA3-208	ENST00000555743	GRIK1	P39086	918 aa		6.56	□□□□□ -1.36
PSMA3-208	ENST00000555743	ANP32A	P39687	249 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
PSMA3-208	ENST00000555743	VIPR2	P41587	438 aa		6.56	□□□□□ -1.36
PSMA3-208	ENST00000555743	PIK3CA	P42336	1068 aa		6.56	□□□□□ -1.36
PSMA3-208	ENST00000555743	NDST1	P52848	882 aa		6.56	□□□□□ -1.36
PSMA3-208	ENST00000555743	CACNA2D1	P54289	1103 aa		6.56	□□□□□ -1.36
PSMA3-208	ENST00000555743	CDH8	P55286	799 aa		6.56	□□□□□ -1.36
PSMA3-208	ENST00000555743	PSMC1	P62191	440 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
PSMA3-208	ENST00000555743	GCNT1	Q02742	428 aa		6.56	□□□□□ -1.36
PSMA3-208	ENST00000555743	USP4	Q13107	963 aa		6.56	□□□□□ -1.36
PSMA3-208	ENST00000555743	PDGFRL	Q15198	375 aa		6.56	□□□□□ -1.36
PSMA3-208	ENST00000555743	ZNF77	Q15935	545 aa		6.56	□□□□□ -1.36
PSMA3-208	ENST00000555743	MEA1	Q16626	185 aa		6.56	□□□□□ -1.36
PSMA3-208	ENST00000555743	CCDC142	Q17RM4	750 aa		6.56	□□□□□ -1.36
PSMA3-208	ENST00000555743	CBWD6	Q4V339	395 aa		6.56	□□□□□ -1.36
PSMA3-208	ENST00000555743	MDH1B	Q5I0G3	518 aa		6.56	□□□□□ -1.36
PSMA3-208	ENST00000555743	CBWD3	Q5JTY5	395 aa		6.56	□□□□□ -1.36
PSMA3-208	ENST00000555743	CBWD5	Q5RIA9	395 aa		6.56	□□□□□ -1.36
PSMA3-208	ENST00000555743	KLHDC10	Q6PID8	442 aa		6.56	□□□□□ -1.36
PSMA3-208	ENST00000555743	VASH1	Q7L8A9	365 aa	Predicted RBP	6.56	□□□□□ -1.36
PSMA3-208	ENST00000555743	FAM35A	Q86V20	835 aa		6.56	□□□□□ -1.36
PSMA3-208	ENST00000555743	TRIM59	Q8IWR1	403 aa		6.56	□□□□□ -1.36
PSMA3-208	ENST00000555743	NUP93	Q8N1F7	819 aa		6.56	□□□□□ -1.36
PSMA3-208	ENST00000555743	UBR7	Q8N806	425 aa		6.56	□□□□□ -1.36
PSMA3-208	ENST00000555743	MLKL	Q8NB16	471 aa		6.56	□□□□□ -1.36
PSMA3-208	ENST00000555743	DTWD2	Q8NBA8	298 aa		6.56	□□□□□ -1.36
PSMA3-208	ENST00000555743	CCDC150	Q8NCX0	1101 aa		6.56	□□□□□ -1.36
PSMA3-208	ENST00000555743	LMO3	Q8TAP4	145 aa		6.56	□□□□□ -1.36
PSMA3-208	ENST00000555743	FAM200A	Q8TCP9	573 aa		6.56	□□□□□ -1.36
PSMA3-208	ENST00000555743	BPIFB1	Q8TDL5	484 aa		6.56	□□□□□ -1.36
PSMA3-208	ENST00000555743	GIPC2	Q8TF65	315 aa		6.56	□□□□□ -1.36
PSMA3-208	ENST00000555743	SEMA4D	Q92854	862 aa		6.56	□□□□□ -1.36
PSMA3-208	ENST00000555743	USP13	Q92995	863 aa	Predicted RBP	6.56	□□□□□ -1.36
PSMA3-208	ENST00000555743	NT5C1A	Q9BXI3	368 aa		6.56	□□□□□ -1.36
PSMA3-208	ENST00000555743	ZNF518B	Q9C0D4	1074 aa		6.56	□□□□□ -1.36
PSMA3-208	ENST00000555743	SEMA4A	Q9H3S1	761 aa		6.56	□□□□□ -1.36
PSMA3-208	ENST00000555743	BRD9	Q9H8M2	597 aa		6.56	□□□□□ -1.36
PSMA3-208	ENST00000555743	ZFAND3	Q9H8U3	227 aa		6.56	□□□□□ -1.36
PSMA3-208	ENST00000555743	LTB4R2	Q9NPC1	389 aa		6.56	□□□□□ -1.36
PSMA3-208	ENST00000555743	PRMT8	Q9NR22	394 aa	Predicted RBP	6.56	□□□□□ -1.36
PSMA3-208	ENST00000555743	THG1L	Q9NWX6	298 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
PSMA3-208	ENST00000555743	NXF1	Q9UBU9	619 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
PSMA3-208	ENST00000555743	RWDD2A	Q9UIY3	292 aa		6.56	□□□□□ -1.36
PSMA3-208	ENST00000555743	FBXO4	Q9UKT5	387 aa		6.56	□□□□□ -1.36
PSMA3-208	ENST00000555743	KIAA1257	Q9ULG3	409 aa		6.56	□□□□□ -1.36
PSMA3-208	ENST00000555743	USP3	Q9Y6I4	520 aa		6.56	□□□□□ -1.36
PSMA3-208	ENST00000555743	COL4A2	P08572	1712 aa		6.56	□□□□□ -1.36
PSMA3-208	ENST00000555743	ZNF292	O60281	2723 aa		6.55	□□□□□ -1.36
PSMA3-208	ENST00000555743	TRAV19	A0A0A6YYK7	116 aa		6.55	□□□□□ -1.36
PSMA3-208	ENST00000555743	HHLA1	C9JL84	531 aa		6.55	□□□□□ -1.36
PSMA3-208	ENST00000555743	FGFR1OP	O95684	399 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
PSMA3-208	ENST00000555743	USP17L7	P0C7H9	530 aa		6.55	□□□□□ -1.36
PSMA3-208	ENST00000555743	GJA1	P17302	382 aa		6.55	□□□□□ -1.36
PSMA3-208	ENST00000555743	TBXAS1	P24557	533 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
PSMA3-208	ENST00000555743	ANXA13	P27216	316 aa		6.55	□□□□□ -1.36
PSMA3-208	ENST00000555743	ERCC5	P28715	1186 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
PSMA3-208	ENST00000555743	GDI1	P31150	447 aa		6.55	□□□□□ -1.36
PSMA3-208	ENST00000555743	HOXA6	P31267	233 aa		6.55	□□□□□ -1.36
PSMA3-208	ENST00000555743	FMO5	P49326	533 aa		6.55	□□□□□ -1.36
PSMA3-208	ENST00000555743	GPR15	P49685	360 aa		6.55	□□□□□ -1.36
PSMA3-208	ENST00000555743	CYP4F8	P98187	520 aa		6.55	□□□□□ -1.36
PSMA3-208	ENST00000555743	CYP27A1	Q02318	531 aa		6.55	□□□□□ -1.36
PSMA3-208	ENST00000555743	PAK1	Q13153	545 aa		6.55	□□□□□ -1.36
PSMA3-208	ENST00000555743	CCIN	Q13939	588 aa		6.55	□□□□□ -1.36
PSMA3-208	ENST00000555743	TAF12	Q16514	161 aa		6.55	□□□□□ -1.36

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.2 ms