RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545204.1

MDM2-233, Transcript of MDM2 proto-oncogene, human

TSL 5 BASIC

Gene MDM2, Length 398 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MDM2-233	ENST00000545204	CAPN11	Q9UMQ6	739 aa		3.67	□□□□□ -1.82
MDM2-233	ENST00000545204	USP22	Q9UPT9	525 aa		3.67	□□□□□ -1.82
MDM2-233	ENST00000545204	CORO2B	Q9UQ03	480 aa		3.67	□□□□□ -1.82
MDM2-233	ENST00000545204	SNX13	Q9Y5W8	968 aa		3.67	□□□□□ -1.82
MDM2-233	ENST00000545204	POLR2A	P24928	1970 aa	Known RBP	3.67	□□□□□ -1.82
MDM2-233	ENST00000545204	ARHGEF17	Q96PE2	2063 aa	Predicted RBP	3.66	□□□□□ -1.82
MDM2-233	ENST00000545204		H7C1Q1	480 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MDM2-233	ENST00000545204	SMIM22	K7EJ46	135 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MDM2-233	ENST00000545204		M0R3H8	397 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MDM2-233	ENST00000545204	AGPS	O00116	658 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MDM2-233	ENST00000545204	PSMD9	O00233	223 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MDM2-233	ENST00000545204	PMPCB	O75439	489 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MDM2-233	ENST00000545204	IL18RAP	O95256	599 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MDM2-233	ENST00000545204	LATS1	O95835	1130 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MDM2-233	ENST00000545204	A1BG	P04217	495 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MDM2-233	ENST00000545204	ANXA2	P07355	339 aa	Known RBP	3.66	□□□□□ -1.82
MDM2-233	ENST00000545204	PARP1	P09874	1014 aa	Known RBP	3.66	□□□□□ -1.82
MDM2-233	ENST00000545204	MYCL	P12524	364 aa	Predicted RBP	3.66	□□□□□ -1.82
MDM2-233	ENST00000545204	SLC5A1	P13866	664 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MDM2-233	ENST00000545204	TPH1	P17752	444 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MDM2-233	ENST00000545204	PIK3CB	P42338	1070 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MDM2-233	ENST00000545204	MTHFS	P49914	203 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MDM2-233	ENST00000545204	PGD	P52209	483 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MDM2-233	ENST00000545204	PSG6	Q00889	435 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MDM2-233	ENST00000545204	SLC10A2	Q12908	348 aa	Predicted RBP	3.66	□□□□□ -1.82
MDM2-233	ENST00000545204	STK3	Q13188	491 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MDM2-233	ENST00000545204	DAG1	Q14118	895 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MDM2-233	ENST00000545204	RNASE12	Q5GAN4	147 aa	Known RBP	3.66	□□□□□ -1.82
MDM2-233	ENST00000545204	PRAMEF17	Q5VTA0	474 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MDM2-233	ENST00000545204	RAB11FIP4	Q86YS3	637 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MDM2-233	ENST00000545204	SFTPA1	Q8IWL2	248 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MDM2-233	ENST00000545204	SDR16C5	Q8N3Y7	309 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MDM2-233	ENST00000545204	SIRT6	Q8N6T7	355 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MDM2-233	ENST00000545204	TERB1	Q8NA31	727 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MDM2-233	ENST00000545204	CTHRC1	Q96CG8	243 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MDM2-233	ENST00000545204	DAZAP1	Q96EP5	407 aa	Known RBP	3.66	□□□□□ -1.82
MDM2-233	ENST00000545204	WDYHV1	Q96HA8	205 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MDM2-233	ENST00000545204	ZNF668	Q96K58	619 aa	Predicted RBP	3.66	□□□□□ -1.82
MDM2-233	ENST00000545204	SNX18	Q96RF0	628 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MDM2-233	ENST00000545204	INO80B	Q9C086	356 aa	Predicted RBP	3.66	□□□□□ -1.82
MDM2-233	ENST00000545204	TRIM36	Q9NQ86	728 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MDM2-233	ENST00000545204	FLRT1	Q9NZU1	646 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MDM2-233	ENST00000545204	ZNF212	Q9UDV6	495 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MDM2-233	ENST00000545204	VPS51	Q9UID3	782 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MDM2-233	ENST00000545204	AMFR	Q9UKV5	643 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MDM2-233	ENST00000545204	FAM50B	Q9Y247	325 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MDM2-233	ENST00000545204	SPRY2	O43597	315 aa		3.65	□□□□□ -1.83
MDM2-233	ENST00000545204	FGA	P02671	866 aa		3.65	□□□□□ -1.83
MDM2-233	ENST00000545204	TRIM27	P14373	513 aa		3.65	□□□□□ -1.83
MDM2-233	ENST00000545204	TSHR	P16473	764 aa		3.65	□□□□□ -1.83
MDM2-233	ENST00000545204	GATM	P50440	423 aa		3.65	□□□□□ -1.83
MDM2-233	ENST00000545204	RENBP	P51606	427 aa		3.65	□□□□□ -1.83
MDM2-233	ENST00000545204	CASP5	P51878	434 aa		3.65	□□□□□ -1.83
MDM2-233	ENST00000545204	SUMO2	P61956	95 aa	Known RBP	3.65	□□□□□ -1.83
MDM2-233	ENST00000545204	TUBA4A	P68366	448 aa		3.65	□□□□□ -1.83
MDM2-233	ENST00000545204	SRSF4	Q08170	494 aa	Known RBP	3.65	□□□□□ -1.83
MDM2-233	ENST00000545204	ZNF543	Q08ER8	600 aa		3.65	□□□□□ -1.83
MDM2-233	ENST00000545204	KCNAB1	Q14722	419 aa		3.65	□□□□□ -1.83
MDM2-233	ENST00000545204	COBLL1	Q53SF7	1204 aa		3.65	□□□□□ -1.83
MDM2-233	ENST00000545204	MANEAL	Q5VSG8	457 aa		3.65	□□□□□ -1.83
MDM2-233	ENST00000545204	MZT2A	Q6P582	158 aa		3.65	□□□□□ -1.83
MDM2-233	ENST00000545204	ZNF66	Q6ZN08	573 aa		3.65	□□□□□ -1.83
MDM2-233	ENST00000545204	PTCHD4	Q6ZW05	846 aa		3.65	□□□□□ -1.83
MDM2-233	ENST00000545204	RNF44	Q7L0R7	432 aa		3.65	□□□□□ -1.83
MDM2-233	ENST00000545204	BCDIN3D	Q7Z5W3	292 aa	Known RBP	3.65	□□□□□ -1.83
MDM2-233	ENST00000545204	DDB2	Q92466	427 aa		3.65	□□□□□ -1.83
MDM2-233	ENST00000545204	IQCD	Q96DY2	449 aa		3.65	□□□□□ -1.83
MDM2-233	ENST00000545204	CIPC	Q9C0C6	399 aa		3.65	□□□□□ -1.83
MDM2-233	ENST00000545204	DNAJB11	Q9UBS4	358 aa		3.65	□□□□□ -1.83
MDM2-233	ENST00000545204	RIMKLB	Q9ULI2	386 aa		3.65	□□□□□ -1.83
MDM2-233	ENST00000545204	POM121B	A6NF01	834 aa		3.64	□□□□□ -1.83
MDM2-233	ENST00000545204	PRRT4	C9JH25	899 aa		3.64	□□□□□ -1.83
MDM2-233	ENST00000545204	EXOC5	O00471	708 aa		3.64	□□□□□ -1.83
MDM2-233	ENST00000545204	CES2	O00748	559 aa		3.64	□□□□□ -1.83
MDM2-233	ENST00000545204	APAF1	O14727	1248 aa		3.64	□□□□□ -1.83
MDM2-233	ENST00000545204	KPNA5	O15131	536 aa		3.64	□□□□□ -1.83
MDM2-233	ENST00000545204	PMM2	O15305	246 aa		3.64	□□□□□ -1.83
MDM2-233	ENST00000545204	THAP12	O43422	761 aa		3.64	□□□□□ -1.83
MDM2-233	ENST00000545204	EXOC3	O60645	756 aa		3.64	□□□□□ -1.83
MDM2-233	ENST00000545204	CELA2A	P08217	269 aa		3.64	□□□□□ -1.83
MDM2-233	ENST00000545204	NTSR1	P30989	418 aa		3.64	□□□□□ -1.83
MDM2-233	ENST00000545204	GNAL	P38405	381 aa		3.64	□□□□□ -1.83
MDM2-233	ENST00000545204	PRIM2	P49643	509 aa		3.64	□□□□□ -1.83
MDM2-233	ENST00000545204	DIO1	P49895	249 aa		3.64	□□□□□ -1.83
MDM2-233	ENST00000545204	GRM1	Q13255	1194 aa		3.64	□□□□□ -1.83
MDM2-233	ENST00000545204	HLTF	Q14527	1009 aa	Known RBP eCLIP	3.64	□□□□□ -1.83
MDM2-233	ENST00000545204	SAFB	Q15424	915 aa	Known RBP eCLIP	3.64	□□□□□ -1.83
MDM2-233	ENST00000545204	KLHDC7A	Q5VTJ3	777 aa		3.64	□□□□□ -1.83
MDM2-233	ENST00000545204	KIAA1614	Q5VZ46	1190 aa		3.64	□□□□□ -1.83
MDM2-233	ENST00000545204	ZKSCAN2	Q63HK3	967 aa		3.64	□□□□□ -1.83
MDM2-233	ENST00000545204	USP49	Q70CQ1	688 aa		3.64	□□□□□ -1.83
MDM2-233	ENST00000545204	KRT28	Q7Z3Y7	464 aa		3.64	□□□□□ -1.83
MDM2-233	ENST00000545204	CHSY1	Q86X52	802 aa		3.64	□□□□□ -1.83
MDM2-233	ENST00000545204	METTL25	Q8N6Q8	603 aa		3.64	□□□□□ -1.83
MDM2-233	ENST00000545204	RNF152	Q8N8N0	203 aa		3.64	□□□□□ -1.83
MDM2-233	ENST00000545204	ZDHHC12	Q96GR4	267 aa		3.64	□□□□□ -1.83
MDM2-233	ENST00000545204	RITA1	Q96K30	269 aa		3.64	□□□□□ -1.83
MDM2-233	ENST00000545204	ZC3H10	Q96K80	434 aa	Known RBP	3.64	□□□□□ -1.83
MDM2-233	ENST00000545204	ASB2	Q96Q27	587 aa		3.64	□□□□□ -1.83
MDM2-233	ENST00000545204	MMS19	Q96T76	1030 aa		3.64	□□□□□ -1.83

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