RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533897.1

CTSC-208, Transcript of cathepsin C, human

TSL 2

Gene CTSC, Length 4,344 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTSC-208	ENST00000533897	MCU	Q8NE86	351 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	APBB2	Q92870	758 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	TMEM143	Q96AN5	459 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	OLFM3	Q96PB7	478 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	NMUR2	Q9GZQ4	415 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	MYOZ2	Q9NPC6	264 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	WDR35	Q9P2L0	1181 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	STK38L	Q9Y2H1	464 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	MTO1	Q9Y2Z2	717 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	DCAF8L1	A6NGE4	600 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897		A8MXQ7	604 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897		H3BNX3	289 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	CASQ2	O14958	399 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	CCDC22	O60826	627 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	LUC7L3	O95232	432 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	LMNA	P02545	664 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	ATP5B	P06576	529 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	PTPRA	P18433	802 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	HMGB2	P26583	209 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	HIRA	P54198	1017 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	ACTR3	P61158	418 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	ATP11A	P98196	1134 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	FAAP100	Q0VG06	881 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	FAM187B	Q17R55	369 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	USP41	Q3LFD5	358 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	HP1BP3	Q5SSJ5	553 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	CYP4A22	Q5TCH4	519 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	TMCO4	Q5TGY1	634 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	MAP1S	Q66K74	1059 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	TICAM1	Q8IUC6	712 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	TMEM151A	Q8N4L1	468 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	AFG1L	Q8WV93	481 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	NUDCD1	Q96RS6	583 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	IMPG2	Q9BZV3	1241 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	MTMR12	Q9C0I1	747 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	GBA2	Q9HCG7	927 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	RNF146	Q9NTX7	359 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	SDAD1	Q9NVU7	687 aa	Known RBP eCLIP	4.61	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	HEY2	Q9UBP5	337 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	ZFP69B	Q9UJL9	534 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	ANKRD36	A6QL64	1941 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	SPDYE16	A6NNV3	312 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	KBTBD13	C9JR72	458 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	UGT1A9	O60656	530 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	CNMD	O75829	334 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	GSTA2	P09210	222 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	CSH1	P0DML2	217 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	CSH2	P0DML3	217 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	FGF3	P11487	239 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	CA4	P22748	312 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	MIP	P30301	263 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	CRHR1	P34998	444 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	ELK3	P41970	407 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	ZNF143	P52747	638 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	MBTD1	Q05BQ5	628 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	SLC34A1	Q06495	639 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	CXCL9	Q07325	125 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	OTUD1	Q5VV17	481 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	ARHGEF16	Q5VV41	709 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	CAPRIN2	Q6IMN6	1127 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	MTHFD1L	Q6UB35	978 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	OLFML1	Q6UWY5	402 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	EP400NL	Q6ZTU2	488 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	ARC	Q7LC44	396 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	NET1	Q7Z628	596 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	ALYREF	Q86V81	257 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	TMEM192	Q8IY95	271 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	DNER	Q8NFT8	737 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	LRRC8C	Q8TDW0	803 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	NSUN6	Q8TEA1	469 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	ARNTL2	Q8WYA1	636 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	ZNF622	Q969S3	477 aa	Known RBP eCLIP	4.61	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	NSL1	Q96IY1	281 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	CCDC77	Q9BR77	488 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	OSBPL1A	Q9BXW6	950 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	R3HDML	Q9H3Y0	253 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	UGT1A7	Q9HAW7	530 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	UGT1A10	Q9HAW8	530 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	UGT1A8	Q9HAW9	530 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	GPAM	Q9HCL2	828 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	ZNF212	Q9UDV6	495 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	GJD2	Q9UKL4	321 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	FAM237B	A0A1B0GVD1	139 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	TRDMT1	O14717	391 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	BIRC5	O15392	142 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	ADCY6	O43306	1168 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	CST8	O60676	142 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	TOM1L1	O75674	476 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	DGKI	O75912	1065 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	TM7SF2	O76062	418 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	UBA1	P22314	1058 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	GRIA2	P42262	883 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	SERPINB4	P48594	390 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	LIG4	P49917	911 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	MRPS35	P82673	323 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	LACTB	P83111	547 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	OVGP1	Q12889	678 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	SLC10A2	Q12908	348 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	FRG1	Q14331	258 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	SEZ6	Q53EL9	994 aa		4.6	□□□□□ -1.67

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