RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529766.5

BBS1-215, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 5

Gene BBS1, Length 1,590 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-215	ENST00000529766	PDGFRA	P16234	1089 aa		13.91	□□□□□ -0.18
BBS1-215	ENST00000529766	GPD1	P21695	349 aa		13.91	□□□□□ -0.18
BBS1-215	ENST00000529766	CXCR5	P32302	372 aa		13.91	□□□□□ -0.18
BBS1-215	ENST00000529766	GRIK1	P39086	918 aa		13.91	□□□□□ -0.18
BBS1-215	ENST00000529766	MAGEA10	P43363	369 aa	Predicted RBP	13.91	□□□□□ -0.18
BBS1-215	ENST00000529766	PTPN9	P43378	593 aa		13.91	□□□□□ -0.18
BBS1-215	ENST00000529766	TAS2R40	P59535	323 aa		13.91	□□□□□ -0.18
BBS1-215	ENST00000529766	YWHAZ	P63104	245 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
BBS1-215	ENST00000529766	ROR1	Q01973	937 aa		13.91	□□□□□ -0.18
BBS1-215	ENST00000529766	PTPRO	Q16827	1216 aa		13.91	□□□□□ -0.18
BBS1-215	ENST00000529766	CCDC14	Q49A88	953 aa		13.91	□□□□□ -0.18
BBS1-215	ENST00000529766	C9orf50	Q5SZB4	431 aa		13.91	□□□□□ -0.18
BBS1-215	ENST00000529766	DCAF12L1	Q5VU92	463 aa		13.91	□□□□□ -0.18
BBS1-215	ENST00000529766	CC2D1A	Q6P1N0	951 aa	Predicted RBP	13.91	□□□□□ -0.18
BBS1-215	ENST00000529766	ZNF572	Q7Z3I7	529 aa	Predicted RBP	13.91	□□□□□ -0.18
BBS1-215	ENST00000529766	VPS52	Q8N1B4	723 aa		13.91	□□□□□ -0.18
BBS1-215	ENST00000529766	SIX6OS1	Q8N1H7	587 aa		13.91	□□□□□ -0.18
BBS1-215	ENST00000529766	RASGEF1C	Q8N431	466 aa		13.91	□□□□□ -0.18
BBS1-215	ENST00000529766	UBL4B	Q8N7F7	174 aa		13.91	□□□□□ -0.18
BBS1-215	ENST00000529766	ZNF461	Q8TAF7	563 aa		13.91	□□□□□ -0.18
BBS1-215	ENST00000529766	CENPI	Q92674	756 aa	Predicted RBP	13.91	□□□□□ -0.18
BBS1-215	ENST00000529766	NT5C3B	Q969T7	300 aa		13.91	□□□□□ -0.18
BBS1-215	ENST00000529766	CEP295NL	Q96MC4	621 aa		13.91	□□□□□ -0.18
BBS1-215	ENST00000529766	DDX23	Q9BUQ8	820 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
BBS1-215	ENST00000529766	PLVAP	Q9BX97	442 aa		13.91	□□□□□ -0.18
BBS1-215	ENST00000529766	ULBP1	Q9BZM6	244 aa		13.91	□□□□□ -0.18
BBS1-215	ENST00000529766	CRISPLD1	Q9H336	500 aa		13.91	□□□□□ -0.18
BBS1-215	ENST00000529766	RXFP1	Q9HBX9	757 aa		13.91	□□□□□ -0.18
BBS1-215	ENST00000529766	FNIP2	Q9P278	1114 aa		13.91	□□□□□ -0.18
BBS1-215	ENST00000529766	TTC7A	Q9ULT0	858 aa	Predicted RBP	13.91	□□□□□ -0.18
BBS1-215	ENST00000529766	KCNK3	O14649	394 aa		13.9	□□□□□ -0.18
BBS1-215	ENST00000529766	PSTPIP1	O43586	416 aa		13.9	□□□□□ -0.18
BBS1-215	ENST00000529766	GRAP2	O75791	330 aa		13.9	□□□□□ -0.18
BBS1-215	ENST00000529766	FYN	P06241	537 aa		13.9	□□□□□ -0.18
BBS1-215	ENST00000529766	CTSA	P10619	480 aa		13.9	□□□□□ -0.18
BBS1-215	ENST00000529766	HAPLN1	P10915	354 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
BBS1-215	ENST00000529766	PSMA2	P25787	234 aa		13.9	□□□□□ -0.18
BBS1-215	ENST00000529766	OR1D2	P34982	312 aa		13.9	□□□□□ -0.18
BBS1-215	ENST00000529766	PCK1	P35558	622 aa		13.9	□□□□□ -0.18
BBS1-215	ENST00000529766	MARCKSL1	P49006	195 aa		13.9	□□□□□ -0.18
BBS1-215	ENST00000529766	RNASE9	P60153	205 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
BBS1-215	ENST00000529766	RAB33A	Q14088	237 aa		13.9	□□□□□ -0.18
BBS1-215	ENST00000529766	TPGS2	Q68CL5	300 aa		13.9	□□□□□ -0.18
BBS1-215	ENST00000529766	BEND5	Q7L4P6	421 aa		13.9	□□□□□ -0.18
BBS1-215	ENST00000529766	BNIPL	Q7Z465	357 aa		13.9	□□□□□ -0.18
BBS1-215	ENST00000529766	RHOT1	Q8IXI2	618 aa		13.9	□□□□□ -0.18
BBS1-215	ENST00000529766	KLHL23	Q8NBE8	558 aa		13.9	□□□□□ -0.18
BBS1-215	ENST00000529766	NDRG1	Q92597	394 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
BBS1-215	ENST00000529766	SPATA17	Q96L03	361 aa		13.9	□□□□□ -0.18
BBS1-215	ENST00000529766	SLC2A13	Q96QE2	648 aa		13.9	□□□□□ -0.18
BBS1-215	ENST00000529766	PSMB7	Q99436	277 aa		13.9	□□□□□ -0.18
BBS1-215	ENST00000529766	ZBP1	Q9H171	429 aa		13.9	□□□□□ -0.18
BBS1-215	ENST00000529766	APOBEC3C	Q9NRW3	190 aa	Known RBP eCLIP	13.9	□□□□□ -0.18
BBS1-215	ENST00000529766	AFF4	Q9UHB7	1163 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
BBS1-215	ENST00000529766	LZTS1	Q9Y250	596 aa		13.9	□□□□□ -0.18
BBS1-215	ENST00000529766	RWDD3	Q9Y3V2	267 aa		13.9	□□□□□ -0.18
BBS1-215	ENST00000529766	FAM92A	A1XBS5	289 aa		13.89	□□□□□ -0.19
BBS1-215	ENST00000529766	LINC01553	A4QN01	128 aa		13.89	□□□□□ -0.19
BBS1-215	ENST00000529766	YJEFN3	A6XGL0	299 aa		13.89	□□□□□ -0.19
BBS1-215	ENST00000529766		E7ENQ6	273 aa		13.89	□□□□□ -0.19
BBS1-215	ENST00000529766	C5orf67	F2Z3F1	127 aa		13.89	□□□□□ -0.19
BBS1-215	ENST00000529766	PDE2A	O00408	941 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
BBS1-215	ENST00000529766	LRCH4	O75427	683 aa		13.89	□□□□□ -0.19
BBS1-215	ENST00000529766	SLU7	O95391	586 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
BBS1-215	ENST00000529766	UROD	P06132	367 aa		13.89	□□□□□ -0.19
BBS1-215	ENST00000529766	RPL17	P18621	184 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
BBS1-215	ENST00000529766	MATK	P42679	507 aa		13.89	□□□□□ -0.19
BBS1-215	ENST00000529766	ARPP19	P56211	112 aa		13.89	□□□□□ -0.19
BBS1-215	ENST00000529766	SHH	Q15465	462 aa		13.89	□□□□□ -0.19
BBS1-215	ENST00000529766	DAB2IP	Q5VWQ8	1189 aa		13.89	□□□□□ -0.19
BBS1-215	ENST00000529766	POLN	Q7Z5Q5	900 aa		13.89	□□□□□ -0.19
BBS1-215	ENST00000529766	TTC9B	Q8N6N2	239 aa		13.89	□□□□□ -0.19
BBS1-215	ENST00000529766	ACTRT1	Q8TDG2	376 aa		13.89	□□□□□ -0.19
BBS1-215	ENST00000529766	PGLYRP2	Q96PD5	576 aa		13.89	□□□□□ -0.19
BBS1-215	ENST00000529766	POPDC2	Q9HBU9	364 aa		13.89	□□□□□ -0.19
BBS1-215	ENST00000529766	MRPL17	Q9NRX2	175 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
BBS1-215	ENST00000529766	FASTKD2	Q9NYY8	710 aa	Known RBP eCLIP	13.89	□□□□□ -0.19
BBS1-215	ENST00000529766	MAFF	Q9ULX9	164 aa		13.89	□□□□□ -0.19
BBS1-215	ENST00000529766	SSX2IP	Q9Y2D8	614 aa		13.89	□□□□□ -0.19
BBS1-215	ENST00000529766	IRAK3	Q9Y616	596 aa		13.89	□□□□□ -0.19
BBS1-215	ENST00000529766	COL4A4	P53420	1690 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
BBS1-215	ENST00000529766	KIAA1671	Q9BY89	1806 aa		13.88	□□□□□ -0.19
BBS1-215	ENST00000529766	C2CD2L	O14523	706 aa		13.88	□□□□□ -0.19
BBS1-215	ENST00000529766	DAB1	O75553	588 aa		13.88	□□□□□ -0.19
BBS1-215	ENST00000529766	ENDOD1	O94919	500 aa		13.88	□□□□□ -0.19
BBS1-215	ENST00000529766	USP17L7	P0C7H9	530 aa		13.88	□□□□□ -0.19
BBS1-215	ENST00000529766	ATF2	P15336	505 aa		13.88	□□□□□ -0.19
BBS1-215	ENST00000529766	TCF4	P15884	667 aa		13.88	□□□□□ -0.19
BBS1-215	ENST00000529766	SDC4	P31431	198 aa		13.88	□□□□□ -0.19
BBS1-215	ENST00000529766	NOS2	P35228	1153 aa		13.88	□□□□□ -0.19
BBS1-215	ENST00000529766	SLC5A3	P53794	718 aa		13.88	□□□□□ -0.19
BBS1-215	ENST00000529766	TERF1	P54274	439 aa		13.88	□□□□□ -0.19
BBS1-215	ENST00000529766	RWDD2B	P57060	319 aa		13.88	□□□□□ -0.19
BBS1-215	ENST00000529766	SLC25A11	Q02978	314 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
BBS1-215	ENST00000529766	CREM	Q03060	361 aa		13.88	□□□□□ -0.19
BBS1-215	ENST00000529766	ITIH3	Q06033	890 aa		13.88	□□□□□ -0.19
BBS1-215	ENST00000529766	DUSP4	Q13115	394 aa		13.88	□□□□□ -0.19
BBS1-215	ENST00000529766	DDR2	Q16832	855 aa		13.88	□□□□□ -0.19
BBS1-215	ENST00000529766	SH3PXD2A	Q5TCZ1	1133 aa		13.88	□□□□□ -0.19
BBS1-215	ENST00000529766	SCN4B	Q8IWT1	228 aa		13.88	□□□□□ -0.19

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