RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527952.1

PTPRJ-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRJ, Length 626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-205ENST00000527952 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
PTPRJ-205ENST00000527952 PNKPQ96T60 521 aa25.53■■□□□ 1.68
PTPRJ-205ENST00000527952 SDCBP2Q9H190 292 aa25.53■■□□□ 1.68
PTPRJ-205ENST00000527952 PCDHA7Q9UN72 937 aa25.53■■□□□ 1.68
PTPRJ-205ENST00000527952 PATE3B3GLJ2 98 aa25.52■■□□□ 1.68
PTPRJ-205ENST00000527952 SGK1O00141 431 aa25.52■■□□□ 1.68
PTPRJ-205ENST00000527952 COCHO43405 550 aa25.52■■□□□ 1.68
PTPRJ-205ENST00000527952 KAT7O95251 611 aa25.52■■□□□ 1.68
PTPRJ-205ENST00000527952 KCNK5O95279 499 aa25.52■■□□□ 1.68
PTPRJ-205ENST00000527952 FAM163BP0C2L3 166 aa25.52■■□□□ 1.68
PTPRJ-205ENST00000527952 ZNF699Q32M78 642 aa25.52■■□□□ 1.68
PTPRJ-205ENST00000527952 PMS2CLQ68D20 193 aa25.52■■□□□ 1.68
PTPRJ-205ENST00000527952 PAQR9Q6ZVX9 377 aa25.52■■□□□ 1.68
PTPRJ-205ENST00000527952 FAM35AQ86V20 835 aa25.52■■□□□ 1.68
PTPRJ-205ENST00000527952 RASSF3Q86WH2 238 aa25.52■■□□□ 1.68
PTPRJ-205ENST00000527952 FRMD1Q8N878 549 aa25.52■■□□□ 1.68
PTPRJ-205ENST00000527952 NAT16Q8N8M0 369 aa25.52■■□□□ 1.68
PTPRJ-205ENST00000527952 CCDC26Q8TAB7 109 aa25.52■■□□□ 1.68
PTPRJ-205ENST00000527952 WBP2Q969T9 261 aa25.52■■□□□ 1.68
PTPRJ-205ENST00000527952 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP25.52■■□□□ 1.68
PTPRJ-205ENST00000527952 BACH2Q9BYV9 841 aa25.52■■□□□ 1.68
PTPRJ-205ENST00000527952 CCSER2Q9H7U1 834 aa25.52■■□□□ 1.68
PTPRJ-205ENST00000527952 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP25.51■■□□□ 1.67
PTPRJ-205ENST00000527952 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP25.51■■□□□ 1.67
PTPRJ-205ENST00000527952 STAU1O95793 577 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
PTPRJ-205ENST00000527952 APODP05090 189 aa25.51■■□□□ 1.67
PTPRJ-205ENST00000527952 ADH5P11766 374 aa25.51■■□□□ 1.67
PTPRJ-205ENST00000527952 PMLP29590 882 aa25.51■■□□□ 1.67
PTPRJ-205ENST00000527952 ATICP31939 592 aa25.51■■□□□ 1.67
PTPRJ-205ENST00000527952 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP25.51■■□□□ 1.67
PTPRJ-205ENST00000527952 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
PTPRJ-205ENST00000527952 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
PTPRJ-205ENST00000527952 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
PTPRJ-205ENST00000527952 BMT2Q1RMZ1 405 aa25.51■■□□□ 1.67
PTPRJ-205ENST00000527952 LY6G5CQ5SRR4 150 aa25.51■■□□□ 1.67
PTPRJ-205ENST00000527952 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa25.51■■□□□ 1.67
PTPRJ-205ENST00000527952 IL17RCQ8NAC3 791 aa25.51■■□□□ 1.67
PTPRJ-205ENST00000527952 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
PTPRJ-205ENST00000527952 ARHGEF4Q9NR80 690 aa25.51■■□□□ 1.67
PTPRJ-205ENST00000527952 SERTAD1Q9UHV2 236 aa25.51■■□□□ 1.67
PTPRJ-205ENST00000527952 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa25.51■■□□□ 1.67
PTPRJ-205ENST00000527952 GIPC1O14908 333 aa25.5■■□□□ 1.67
PTPRJ-205ENST00000527952 IRF1P10914 325 aa25.5■■□□□ 1.67
PTPRJ-205ENST00000527952 ME1P48163 572 aa25.5■■□□□ 1.67
PTPRJ-205ENST00000527952 ZNF667Q5HYK9 610 aa25.5■■□□□ 1.67
PTPRJ-205ENST00000527952 ARMCX6Q7L4S7 300 aa25.5■■□□□ 1.67
PTPRJ-205ENST00000527952 ACOT1Q86TX2 421 aa25.5■■□□□ 1.67
PTPRJ-205ENST00000527952 C12orf56Q8IXR9 622 aa25.5■■□□□ 1.67
PTPRJ-205ENST00000527952 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
PTPRJ-205ENST00000527952 MAGEF1Q9HAY2 307 aa25.5■■□□□ 1.67
PTPRJ-205ENST00000527952 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP25.5■■□□□ 1.671e-7■■■■■ 217.6
PTPRJ-205ENST00000527952 FAM13BQ9NYF5 915 aa25.5■■□□□ 1.67
PTPRJ-205ENST00000527952 GMIPQ9P107 970 aa25.5■■□□□ 1.67
PTPRJ-205ENST00000527952 GON4LQ3T8J9 2241 aa25.49■■□□□ 1.67
PTPRJ-205ENST00000527952 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa25.49■■□□□ 1.67
PTPRJ-205ENST00000527952 LNP1A1A4G5 178 aa25.49■■□□□ 1.67
PTPRJ-205ENST00000527952 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
PTPRJ-205ENST00000527952 VNN1O95497 513 aa25.49■■□□□ 1.67
PTPRJ-205ENST00000527952 ADH1CP00326 375 aa25.49■■□□□ 1.67
PTPRJ-205ENST00000527952 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
PTPRJ-205ENST00000527952 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
PTPRJ-205ENST00000527952 PGFP49763 221 aa25.49■■□□□ 1.67
PTPRJ-205ENST00000527952 SLC5A3P53794 718 aa25.49■■□□□ 1.67
PTPRJ-205ENST00000527952 DLG4P78352 724 aa25.49■■□□□ 1.67
PTPRJ-205ENST00000527952 NCOA4Q13772 614 aa25.49■■□□□ 1.67
PTPRJ-205ENST00000527952 HECTD3Q5T447 861 aa25.49■■□□□ 1.67
PTPRJ-205ENST00000527952 CYP2U1Q7Z449 544 aa25.49■■□□□ 1.67
PTPRJ-205ENST00000527952 PARD3BQ8TEW8 1205 aa25.49■■□□□ 1.67
PTPRJ-205ENST00000527952 PIGKQ92643 395 aa25.49■■□□□ 1.67
PTPRJ-205ENST00000527952 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa25.49■■□□□ 1.67
PTPRJ-205ENST00000527952 ATP8B3O60423 1300 aa25.48■■□□□ 1.67
PTPRJ-205ENST00000527952 TNFRSF10BO14763 440 aa25.48■■□□□ 1.67
PTPRJ-205ENST00000527952 KLRC4O43908 158 aa25.48■■□□□ 1.67
PTPRJ-205ENST00000527952 AP1G2O75843 785 aa25.48■■□□□ 1.67
PTPRJ-205ENST00000527952 BEST1O76090 585 aa25.48■■□□□ 1.67
PTPRJ-205ENST00000527952 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP25.48■■□□□ 1.67
PTPRJ-205ENST00000527952 CCDC130P13994 396 aa25.48■■□□□ 1.67
PTPRJ-205ENST00000527952 STK4Q13043 487 aa25.48■■□□□ 1.67
PTPRJ-205ENST00000527952 RESP18Q5W5W9 173 aa25.48■■□□□ 1.67
PTPRJ-205ENST00000527952 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP25.48■■□□□ 1.67
PTPRJ-205ENST00000527952 BBS7Q8IWZ6 715 aa25.48■■□□□ 1.67
PTPRJ-205ENST00000527952 PDZD8Q8NEN9 1154 aa25.48■■□□□ 1.67
PTPRJ-205ENST00000527952 KRT82Q9NSB4 513 aa25.48■■□□□ 1.67
PTPRJ-205ENST00000527952 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP25.48■■□□□ 1.67
PTPRJ-205ENST00000527952 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa25.47■■□□□ 1.67
PTPRJ-205ENST00000527952 E2F8A0AVK6 867 aa25.47■■□□□ 1.67
PTPRJ-205ENST00000527952 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
PTPRJ-205ENST00000527952 TRIM24O15164 1050 aa25.47■■□□□ 1.67
PTPRJ-205ENST00000527952 ADAM23O75077 832 aa25.47■■□□□ 1.67
PTPRJ-205ENST00000527952 F13A1P00488 732 aa25.47■■□□□ 1.67
PTPRJ-205ENST00000527952 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
PTPRJ-205ENST00000527952 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
PTPRJ-205ENST00000527952 TMEFF1Q8IYR6 380 aa25.47■■□□□ 1.67
PTPRJ-205ENST00000527952 FUKQ8N0W3 1084 aa25.47■■□□□ 1.67
PTPRJ-205ENST00000527952 PGBD3Q8N328 593 aa25.47■■□□□ 1.67
PTPRJ-205ENST00000527952 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa25.47■■□□□ 1.67
PTPRJ-205ENST00000527952 KIAA0895Q8NCT3 520 aa25.47■■□□□ 1.67
PTPRJ-205ENST00000527952 ZMIZ2Q8NF64 920 aa25.47■■□□□ 1.67
PTPRJ-205ENST00000527952 HMGB4Q8WW32 186 aa25.47■■□□□ 1.67
PTPRJ-205ENST00000527952 ERLEC1Q96DZ1 483 aa25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.9 ms