RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524725.5

TMEM25-208, Transcript of transmembrane protein 25, human

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene TMEM25, Length 2,630 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TMEM25-208	ENST00000524725		E7ESA3	106 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TMEM25-208	ENST00000524725	SMNDC1	O75940	238 aa	Known RBP eCLIP	13.72	□□□□□ -0.21
TMEM25-208	ENST00000524725	PDHA1	P08559	390 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TMEM25-208	ENST00000524725	EDNRB	P24530	442 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TMEM25-208	ENST00000524725	PTDSS1	P48651	473 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
TMEM25-208	ENST00000524725	RASSF2	P50749	326 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TMEM25-208	ENST00000524725	DARS2	Q6PI48	645 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
TMEM25-208	ENST00000524725	APBB1IP	Q7Z5R6	666 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
TMEM25-208	ENST00000524725	XYLT1	Q86Y38	959 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TMEM25-208	ENST00000524725	FBXO16	Q8IX29	292 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
TMEM25-208	ENST00000524725	CFAP36	Q96G28	342 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TMEM25-208	ENST00000524725	PEBP4	Q96S96	227 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TMEM25-208	ENST00000524725	PPP1R16B	Q96T49	567 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TMEM25-208	ENST00000524725	TRIM55	Q9BYV6	548 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TMEM25-208	ENST00000524725	KCNK13	Q9HB14	408 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TMEM25-208	ENST00000524725	TXNRD2	Q9NNW7	524 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TMEM25-208	ENST00000524725	CPSF3	Q9UKF6	684 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
TMEM25-208	ENST00000524725	KCNH4	Q9UQ05	1017 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TMEM25-208	ENST00000524725		E5RJQ4	531 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TMEM25-208	ENST00000524725	OGT	O15294	1046 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TMEM25-208	ENST00000524725	HAUS5	O94927	633 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TMEM25-208	ENST00000524725	CYP2C8	P10632	490 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TMEM25-208	ENST00000524725	ARFIP2	P53365	341 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TMEM25-208	ENST00000524725	YWHAE	P62258	255 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
TMEM25-208	ENST00000524725	ZBTB16	Q05516	673 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TMEM25-208	ENST00000524725	EEF1DP3	Q658K8	133 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TMEM25-208	ENST00000524725	C1orf228	Q6PIY5	440 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TMEM25-208	ENST00000524725	CDHR3	Q6ZTQ4	885 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TMEM25-208	ENST00000524725	MECR	Q9BV79	373 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TMEM25-208	ENST00000524725	SSU72	Q9NP77	194 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
TMEM25-208	ENST00000524725	ARMCX1	Q9P291	453 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TMEM25-208	ENST00000524725	LOC285556	D6RIA3	1793 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TMEM25-208	ENST00000524725	INO80B-WBP1	J3KQ70	363 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TMEM25-208	ENST00000524725	ABLIM1	O14639	778 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TMEM25-208	ENST00000524725	MCF2L	O15068	1137 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TMEM25-208	ENST00000524725	TM9SF1	O15321	606 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TMEM25-208	ENST00000524725	CSDE1	O75534	798 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
TMEM25-208	ENST00000524725	GRAP2	O75791	330 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TMEM25-208	ENST00000524725	CPA2	P48052	419 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TMEM25-208	ENST00000524725	ERF	P50548	548 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TMEM25-208	ENST00000524725	CDO1	Q16878	200 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TMEM25-208	ENST00000524725		Q3C1V9	767 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TMEM25-208	ENST00000524725	ZPBP2	Q6X784	338 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TMEM25-208	ENST00000524725	RINL	Q6ZS11	566 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TMEM25-208	ENST00000524725	RFX8	Q6ZV50	586 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TMEM25-208	ENST00000524725	ZBTB8OS	Q8IWT0	167 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TMEM25-208	ENST00000524725	C2orf69	Q8N8R5	385 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TMEM25-208	ENST00000524725	TTC13	Q8NBP0	860 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TMEM25-208	ENST00000524725	UBA3	Q8TBC4	463 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TMEM25-208	ENST00000524725	CYTH2	Q99418	400 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TMEM25-208	ENST00000524725	GPR20	Q99678	358 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TMEM25-208	ENST00000524725	TRIM56	Q9BRZ2	755 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
TMEM25-208	ENST00000524725	INO80B	Q9C086	356 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
TMEM25-208	ENST00000524725	VPS11	Q9H270	941 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TMEM25-208	ENST00000524725	SMYD3	Q9H7B4	428 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TMEM25-208	ENST00000524725	ZNF395	Q9H8N7	513 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
TMEM25-208	ENST00000524725	PPCS	Q9HAB8	311 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TMEM25-208	ENST00000524725	STRIP2	Q9ULQ0	834 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TMEM25-208	ENST00000524725	USP18	Q9UMW8	372 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TMEM25-208	ENST00000524725	FAM237B	A0A1B0GVD1	139 aa		13.71	□□□□□ -0.22
TMEM25-208	ENST00000524725	TRAFD1	O14545	582 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.22
TMEM25-208	ENST00000524725	CXCL11	O14625	94 aa		13.71	□□□□□ -0.22
TMEM25-208	ENST00000524725	CXCL8	P10145	99 aa		13.71	□□□□□ -0.22
TMEM25-208	ENST00000524725	POLR2B	P30876	1174 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.22
TMEM25-208	ENST00000524725	PCK1	P35558	622 aa		13.71	□□□□□ -0.22
TMEM25-208	ENST00000524725	EFNA5	P52803	228 aa		13.71	□□□□□ -0.22
TMEM25-208	ENST00000524725	IGBP1	P78318	339 aa		13.71	□□□□□ -0.22
TMEM25-208	ENST00000524725	BLMH	Q13867	455 aa		13.71	□□□□□ -0.22
TMEM25-208	ENST00000524725	C15orf59	Q2T9L4	293 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.22
TMEM25-208	ENST00000524725	IER5	Q5VY09	327 aa		13.71	□□□□□ -0.22
TMEM25-208	ENST00000524725	CAPRIN2	Q6IMN6	1127 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.22
TMEM25-208	ENST00000524725	C4orf50	Q6ZRC1	276 aa		13.71	□□□□□ -0.22
TMEM25-208	ENST00000524725	CTAGE3P	Q8IX95	158 aa		13.71	□□□□□ -0.22
TMEM25-208	ENST00000524725	PTCD3	Q96EY7	689 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.22
TMEM25-208	ENST00000524725	PIWIL1	Q96J94	861 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.22
TMEM25-208	ENST00000524725	SPATA33	Q96N06	139 aa		13.71	□□□□□ -0.22
TMEM25-208	ENST00000524725	OSBPL1A	Q9BXW6	950 aa		13.71	□□□□□ -0.22
TMEM25-208	ENST00000524725	WDR3	Q9UNX4	943 aa	Known RBP eCLIP	13.71	□□□□□ -0.22
TMEM25-208	ENST00000524725	LRRC42	Q9Y546	428 aa		13.71	□□□□□ -0.22
TMEM25-208	ENST00000524725	IKBKG	Q9Y6K9	419 aa		13.71	□□□□□ -0.22
TMEM25-208	ENST00000524725	EVPL	Q92817	2033 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TMEM25-208	ENST00000524725	ZBTB42	B2RXF5	422 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TMEM25-208	ENST00000524725	APOC4-APOC2	K7ER74	178 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TMEM25-208	ENST00000524725	CNMD	O75829	334 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TMEM25-208	ENST00000524725	TRUB2	O95900	331 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
TMEM25-208	ENST00000524725	APOC2	P02655	101 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TMEM25-208	ENST00000524725	INHBA	P08476	426 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TMEM25-208	ENST00000524725	ETV4	P43268	484 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TMEM25-208	ENST00000524725	AP3M2	P53677	418 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TMEM25-208	ENST00000524725	CDH6	P55285	790 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TMEM25-208	ENST00000524725	ZNF200	P98182	395 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
TMEM25-208	ENST00000524725	WASHC2D	Q5SRD0	308 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TMEM25-208	ENST00000524725	ANO7	Q6IWH7	933 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TMEM25-208	ENST00000524725	PPM1N	Q8N819	430 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TMEM25-208	ENST00000524725	SAR1A	Q9NR31	198 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TMEM25-208	ENST00000524725	STAU2	Q9NUL3	570 aa	Known RBP eCLIP	13.7	□□□□□ -0.22
TMEM25-208	ENST00000524725	GPATCH2L	Q9NWQ4	482 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TMEM25-208	ENST00000524725	LNPEP	Q9UIQ6	1025 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TMEM25-208	ENST00000524725	CXorf49	A8MYA2	514 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
TMEM25-208	ENST00000524725		H7C0C1	242 aa		13.7	□□□□□ -0.22

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