RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524534.5

PTPRK-217, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, human

TSL 5

Gene PTPRK, Length 2,441 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRK-217	ENST00000524534	ENO1	P06733	434 aa	Known RBP	11.99	□□□□□ -0.49
PTPRK-217	ENST00000524534	WEE2	P0C1S8	567 aa		11.99	□□□□□ -0.49
PTPRK-217	ENST00000524534	ANPEP	P15144	967 aa		11.99	□□□□□ -0.49
PTPRK-217	ENST00000524534	CCNF	P41002	786 aa		11.99	□□□□□ -0.49
PTPRK-217	ENST00000524534	TNFSF9	P41273	254 aa		11.99	□□□□□ -0.49
PTPRK-217	ENST00000524534	BST1	Q10588	318 aa		11.99	□□□□□ -0.49
PTPRK-217	ENST00000524534	TRMT5	Q32P41	509 aa	Known RBP	11.99	□□□□□ -0.49
PTPRK-217	ENST00000524534	TEX44	Q53QW1	395 aa		11.99	□□□□□ -0.49
PTPRK-217	ENST00000524534	ANGEL2	Q5VTE6	544 aa	Known RBP	11.99	□□□□□ -0.49
PTPRK-217	ENST00000524534	CES4A	Q5XG92	561 aa		11.99	□□□□□ -0.49
PTPRK-217	ENST00000524534	MYLK4	Q86YV6	388 aa	Predicted RBP	11.99	□□□□□ -0.49
PTPRK-217	ENST00000524534	SCUBE1	Q8IWY4	988 aa		11.99	□□□□□ -0.49
PTPRK-217	ENST00000524534	MTMR14	Q8NCE2	650 aa		11.99	□□□□□ -0.49
PTPRK-217	ENST00000524534	SPATA18	Q8TC71	538 aa		11.99	□□□□□ -0.49
PTPRK-217	ENST00000524534	NSUN6	Q8TEA1	469 aa	Known RBP	11.99	□□□□□ -0.49
PTPRK-217	ENST00000524534	WNK4	Q96J92	1243 aa		11.99	□□□□□ -0.49
PTPRK-217	ENST00000524534	CDHR1	Q96JP9	859 aa		11.99	□□□□□ -0.49
PTPRK-217	ENST00000524534	IQCG	Q9H095	443 aa	Known RBP	11.99	□□□□□ -0.49
PTPRK-217	ENST00000524534	MKS1	Q9NXB0	559 aa		11.99	□□□□□ -0.49
PTPRK-217	ENST00000524534	SIRPG	Q9P1W8	387 aa		11.99	□□□□□ -0.49
PTPRK-217	ENST00000524534	PDP2	Q9P2J9	529 aa		11.99	□□□□□ -0.49
PTPRK-217	ENST00000524534	DNAJB4	Q9UDY4	337 aa		11.99	□□□□□ -0.49
PTPRK-217	ENST00000524534	TAGLN3	Q9UI15	199 aa		11.99	□□□□□ -0.49
PTPRK-217	ENST00000524534	ZBTB12	Q9Y330	459 aa	Predicted RBP	11.99	□□□□□ -0.49
PTPRK-217	ENST00000524534	MAFB	Q9Y5Q3	323 aa	Predicted RBP	11.99	□□□□□ -0.49
PTPRK-217	ENST00000524534	SPATA31C2	B4DYI2	1134 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PTPRK-217	ENST00000524534	TRUB2	O95900	331 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
PTPRK-217	ENST00000524534	SNRPA	P09012	282 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
PTPRK-217	ENST00000524534	HARS	P12081	509 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
PTPRK-217	ENST00000524534	MIP	P30301	263 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PTPRK-217	ENST00000524534	ASPA	P45381	313 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PTPRK-217	ENST00000524534	ACTR3	P61158	418 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PTPRK-217	ENST00000524534	PSMC1	P62191	440 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
PTPRK-217	ENST00000524534	MRPS5	P82675	430 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
PTPRK-217	ENST00000524534	ROR1	Q01973	937 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PTPRK-217	ENST00000524534	NOMO1	Q15155	1222 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PTPRK-217	ENST00000524534	TAF5	Q15542	800 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PTPRK-217	ENST00000524534	NBPF20	Q3BBV1	942 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PTPRK-217	ENST00000524534	WDR78	Q5VTH9	848 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PTPRK-217	ENST00000524534	ATG16L1	Q676U5	607 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PTPRK-217	ENST00000524534	MTHFD1L	Q6UB35	978 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PTPRK-217	ENST00000524534	E2F7	Q96AV8	911 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PTPRK-217	ENST00000524534	PANX3	Q96QZ0	392 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PTPRK-217	ENST00000524534	MECR	Q9BV79	373 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PTPRK-217	ENST00000524534	CCDC106	Q9BWC9	280 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PTPRK-217	ENST00000524534	WWP1	Q9H0M0	922 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PTPRK-217	ENST00000524534	RPAP3	Q9H6T3	665 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
PTPRK-217	ENST00000524534	PPARGC1A	Q9UBK2	798 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
PTPRK-217	ENST00000524534	PCSK1N	Q9UHG2	260 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PTPRK-217	ENST00000524534	TTLL13P	A6NNM8	815 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PTPRK-217	ENST00000524534	AVIL	O75366	819 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PTPRK-217	ENST00000524534	RFPL1	O75677	317 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PTPRK-217	ENST00000524534	KRT37	O76014	449 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PTPRK-217	ENST00000524534	ENDOD1	O94919	500 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PTPRK-217	ENST00000524534	OAT	P04181	439 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PTPRK-217	ENST00000524534	ATP5B	P06576	529 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
PTPRK-217	ENST00000524534	YWHAZ	P63104	245 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
PTPRK-217	ENST00000524534	DARS2	Q6PI48	645 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
PTPRK-217	ENST00000524534	ZPBP2	Q6X784	338 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PTPRK-217	ENST00000524534	RIPOR1	Q6ZS17	1223 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PTPRK-217	ENST00000524534	RFX8	Q6ZV50	586 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PTPRK-217	ENST00000524534	XYLT1	Q86Y38	959 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PTPRK-217	ENST00000524534	ARID3B	Q8IVW6	561 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
PTPRK-217	ENST00000524534	ULK2	Q8IYT8	1036 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PTPRK-217	ENST00000524534	EMC1	Q8N766	993 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PTPRK-217	ENST00000524534	APBB2	Q92870	758 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PTPRK-217	ENST00000524534	ATG4C	Q96DT6	458 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PTPRK-217	ENST00000524534	PPP1R12C	Q9BZL4	782 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PTPRK-217	ENST00000524534	FAM192A	Q9GZU8	254 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PTPRK-217	ENST00000524534	RSAD1	Q9HA92	442 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PTPRK-217	ENST00000524534	PLAC1	Q9HBJ0	212 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PTPRK-217	ENST00000524534	KIAA1217	Q5T5P2	1943 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PTPRK-217	ENST00000524534	CXorf49	A8MYA2	514 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
PTPRK-217	ENST00000524534	SPECC1L-ADORA2A	F8WAN1	911 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PTPRK-217	ENST00000524534	ADCY3	O60266	1144 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PTPRK-217	ENST00000524534	PRKCH	P24723	683 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PTPRK-217	ENST00000524534	TMPRSS15	P98073	1019 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PTPRK-217	ENST00000524534	TBCC	Q15814	346 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PTPRK-217	ENST00000524534	DUOXA2	Q1HG44	320 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PTPRK-217	ENST00000524534	DNAL1	Q4LDG9	190 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PTPRK-217	ENST00000524534	NPNT	Q6UXI9	565 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PTPRK-217	ENST00000524534	PPM1N	Q8N819	430 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PTPRK-217	ENST00000524534	RAB3IL1	Q8TBN0	382 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PTPRK-217	ENST00000524534	ZNF526	Q8TF50	670 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
PTPRK-217	ENST00000524534	HSPH1	Q92598	858 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PTPRK-217	ENST00000524534	FAF2	Q96CS3	445 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PTPRK-217	ENST00000524534	CFAP36	Q96G28	342 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PTPRK-217	ENST00000524534	ZBED3	Q96IU2	234 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
PTPRK-217	ENST00000524534	ACAP3	Q96P50	834 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PTPRK-217	ENST00000524534	CPXM1	Q96SM3	734 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PTPRK-217	ENST00000524534	FRMD8	Q9BZ67	464 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
PTPRK-217	ENST00000524534	XYLT2	Q9H1B5	865 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PTPRK-217	ENST00000524534	C1orf21	Q9H246	121 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PTPRK-217	ENST00000524534	GPAM	Q9HCL2	828 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PTPRK-217	ENST00000524534	ZNF302	Q9NR11	478 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PTPRK-217	ENST00000524534	SLC7A8	Q9UHI5	535 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PTPRK-217	ENST00000524534	KLHL33	A6NCF5	533 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PTPRK-217	ENST00000524534	TRDMT1	O14717	391 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
PTPRK-217	ENST00000524534	SNN	O75324	88 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
PTPRK-217	ENST00000524534	CIB2	O75838	187 aa		11.97	□□□□□ -0.49

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