RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000521865.5

PABPC1-218, Transcript of poly(A) binding protein cytoplasmic 1, humanhuman

TSL 2

Gene PABPC1, Length 628 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC1-218ENST00000521865 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
PABPC1-218ENST00000521865 ARHGEF4Q9NR80 690 aa22.13■■□□□ 1.13
PABPC1-218ENST00000521865 EXOC1Q9NV70 894 aa22.13■■□□□ 1.13
PABPC1-218ENST00000521865 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa22.13■■□□□ 1.13
PABPC1-218ENST00000521865 ATG2BQ96BY7 2078 aa22.12■■□□□ 1.13
PABPC1-218ENST00000521865 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
PABPC1-218ENST00000521865 COCHO43405 550 aa22.12■■□□□ 1.13
PABPC1-218ENST00000521865 KAT7O95251 611 aa22.12■■□□□ 1.13
PABPC1-218ENST00000521865 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
PABPC1-218ENST00000521865 P4HA1P13674 534 aa22.12■■□□□ 1.13
PABPC1-218ENST00000521865 TIE1P35590 1138 aa22.12■■□□□ 1.13
PABPC1-218ENST00000521865 SLC5A3P53794 718 aa22.12■■□□□ 1.13
PABPC1-218ENST00000521865 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
PABPC1-218ENST00000521865 RASSF3Q86WH2 238 aa22.12■■□□□ 1.13
PABPC1-218ENST00000521865 ALLCQ8N6M5 410 aa22.12■■□□□ 1.13
PABPC1-218ENST00000521865 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
PABPC1-218ENST00000521865 MDGA1Q8NFP4 955 aa22.12■■□□□ 1.13
PABPC1-218ENST00000521865 SCAMP5Q8TAC9 235 aa22.12■■□□□ 1.13
PABPC1-218ENST00000521865 PLEKHO2Q8TD55 490 aa22.12■■□□□ 1.13
PABPC1-218ENST00000521865 PARD3BQ8TEW8 1205 aa22.12■■□□□ 1.13
PABPC1-218ENST00000521865 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP22.12■■□□□ 1.13
PABPC1-218ENST00000521865 SERTAD1Q9UHV2 236 aa22.12■■□□□ 1.13
PABPC1-218ENST00000521865 CFAP45Q9UL16 551 aa22.12■■□□□ 1.13
PABPC1-218ENST00000521865 E2F8A0AVK6 867 aa22.11■■□□□ 1.13
PABPC1-218ENST00000521865 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
PABPC1-218ENST00000521865 AP1G2O75843 785 aa22.11■■□□□ 1.13
PABPC1-218ENST00000521865 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
PABPC1-218ENST00000521865 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
PABPC1-218ENST00000521865 LY6G5CQ5SRR4 150 aa22.11■■□□□ 1.13
PABPC1-218ENST00000521865 BTBD8Q5XKL5 378 aa22.11■■□□□ 1.13
PABPC1-218ENST00000521865 PMS2CLQ68D20 193 aa22.11■■□□□ 1.13
PABPC1-218ENST00000521865 C12orf40Q86WS4 652 aa22.11■■□□□ 1.13
PABPC1-218ENST00000521865 SFTPA1Q8IWL2 248 aa22.11■■□□□ 1.13
PABPC1-218ENST00000521865 SNX21Q969T3 373 aa22.11■■□□□ 1.13
PABPC1-218ENST00000521865 SMARCD1Q96GM5 515 aa22.11■■□□□ 1.13
PABPC1-218ENST00000521865 VRTNQ9H8Y1 702 aa22.11■■□□□ 1.13
PABPC1-218ENST00000521865 KRT82Q9NSB4 513 aa22.11■■□□□ 1.13
PABPC1-218ENST00000521865 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa22.11■■□□□ 1.13
PABPC1-218ENST00000521865 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa22.11■■□□□ 1.13
PABPC1-218ENST00000521865 TM4SF5O14894 197 aa22.1■■□□□ 1.13
PABPC1-218ENST00000521865 KRT37O76014 449 aa22.1■■□□□ 1.13
PABPC1-218ENST00000521865 IRF1P10914 325 aa22.1■■□□□ 1.13
PABPC1-218ENST00000521865 GRIA2P42262 883 aa22.1■■□□□ 1.13
PABPC1-218ENST00000521865 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
PABPC1-218ENST00000521865 GAD2Q05329 585 aa22.1■■□□□ 1.13
PABPC1-218ENST00000521865 STK4Q13043 487 aa22.1■■□□□ 1.13
PABPC1-218ENST00000521865 ST3GAL2Q16842 350 aa22.1■■□□□ 1.13
PABPC1-218ENST00000521865 EOGTQ5NDL2 527 aa22.1■■□□□ 1.13
PABPC1-218ENST00000521865 CYP2U1Q7Z449 544 aa22.1■■□□□ 1.13
PABPC1-218ENST00000521865 ACOT1Q86TX2 421 aa22.1■■□□□ 1.13
PABPC1-218ENST00000521865 CCSER2Q9H7U1 834 aa22.1■■□□□ 1.13
PABPC1-218ENST00000521865 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
PABPC1-218ENST00000521865 GMIPQ9P107 970 aa22.1■■□□□ 1.13
PABPC1-218ENST00000521865 TPRP12270 2363 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
PABPC1-218ENST00000521865 C4orf47A7E2U8 309 aa22.09■■□□□ 1.13
PABPC1-218ENST00000521865 SGK1O00141 431 aa22.09■■□□□ 1.13
PABPC1-218ENST00000521865 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
PABPC1-218ENST00000521865 MAP3K13O43283 966 aa22.09■■□□□ 1.13
PABPC1-218ENST00000521865 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
PABPC1-218ENST00000521865 BCKDHBP21953 392 aa22.09■■□□□ 1.13
PABPC1-218ENST00000521865 MESP2Q0VG99 397 aa22.09■■□□□ 1.13
PABPC1-218ENST00000521865 ORC1Q13415 861 aa22.09■■□□□ 1.13
PABPC1-218ENST00000521865 ANO4Q32M45 955 aa22.09■■□□□ 1.13
PABPC1-218ENST00000521865 EMC10Q5UCC4 262 aa22.09■■□□□ 1.13
PABPC1-218ENST00000521865 ATL3Q6DD88 541 aa22.09■■□□□ 1.13
PABPC1-218ENST00000521865 TMEM92Q6UXU6 159 aa22.09■■□□□ 1.13
PABPC1-218ENST00000521865 PAQR9Q6ZVX9 377 aa22.09■■□□□ 1.13
PABPC1-218ENST00000521865 PGBD3Q8N328 593 aa22.09■■□□□ 1.13
PABPC1-218ENST00000521865 NAT16Q8N8M0 369 aa22.09■■□□□ 1.13
PABPC1-218ENST00000521865 IL17RCQ8NAC3 791 aa22.09■■□□□ 1.13
PABPC1-218ENST00000521865 OTUB2Q96DC9 234 aa22.09■■□□□ 1.13
PABPC1-218ENST00000521865 SPACA7Q96KW9 195 aa22.09■■□□□ 1.13
PABPC1-218ENST00000521865 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
PABPC1-218ENST00000521865 SDCBP2Q9H190 292 aa22.09■■□□□ 1.13
PABPC1-218ENST00000521865 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa22.09■■□□□ 1.13
PABPC1-218ENST00000521865 TBC1D3BA6NDS4 549 aa22.08■■□□□ 1.13
PABPC1-218ENST00000521865 TNFRSF10BO14763 440 aa22.08■■□□□ 1.13
PABPC1-218ENST00000521865 KCNK5O95279 499 aa22.08■■□□□ 1.13
PABPC1-218ENST00000521865 VNN1O95497 513 aa22.08■■□□□ 1.13
PABPC1-218ENST00000521865 SLFN14P0C7P3 912 aa22.08■■□□□ 1.13
PABPC1-218ENST00000521865 CCDC130P13994 396 aa22.08■■□□□ 1.13
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PABPC1-218ENST00000521865 DLG4P78352 724 aa22.08■■□□□ 1.13
PABPC1-218ENST00000521865 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
PABPC1-218ENST00000521865 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa22.08■■□□□ 1.13
PABPC1-218ENST00000521865 KMT5BQ4FZB7 885 aa22.08■■□□□ 1.13
PABPC1-218ENST00000521865 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
PABPC1-218ENST00000521865 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa22.08■■□□□ 1.13
PABPC1-218ENST00000521865 CEP135Q66GS9 1140 aa22.08■■□□□ 1.13
PABPC1-218ENST00000521865 FUKQ8N0W3 1084 aa22.08■■□□□ 1.13
PABPC1-218ENST00000521865 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa22.08■■□□□ 1.13
PABPC1-218ENST00000521865 KIAA0895Q8NCT3 520 aa22.08■■□□□ 1.13
PABPC1-218ENST00000521865 SLC2A14Q8TDB8 520 aa22.08■■□□□ 1.13
PABPC1-218ENST00000521865 WHAMMQ8TF30 809 aa22.08■■□□□ 1.13
PABPC1-218ENST00000521865 RLN3Q8WXF3 142 aa22.08■■□□□ 1.13
PABPC1-218ENST00000521865 PAGE5Q96GU1 130 aa22.08■■□□□ 1.13
PABPC1-218ENST00000521865 COMMD8Q9NX08 183 aa22.08■■□□□ 1.13
PABPC1-218ENST00000521865 ACACBO00763 2458 aa22.08■■□□□ 1.13
PABPC1-218ENST00000521865 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa22.08■■□□□ 1.12
PABPC1-218ENST00000521865 KLRC4O43908 158 aa22.07■■□□□ 1.12
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