RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516106.1

RNA5SP406-201, Transcript of RNA, 5S ribosomal pseudogene 406, humanhuman

BASIC

Gene RNA5SP406, Length 112 nt, Biotype rRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNA5SP406-201ENST00000516106 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
RNA5SP406-201ENST00000516106 HPS4Q9NQG7 708 aa14.6□□□□□ -0.07
RNA5SP406-201ENST00000516106 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
RNA5SP406-201ENST00000516106 FAM86C1Q9NVL1 165 aa14.6□□□□□ -0.07
RNA5SP406-201ENST00000516106 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
RNA5SP406-201ENST00000516106 IL37Q9NZH6 218 aa14.6□□□□□ -0.07
RNA5SP406-201ENST00000516106 HESX1Q9UBX0 185 aa14.6□□□□□ -0.07
RNA5SP406-201ENST00000516106 TSPAN16Q9UKR8 245 aa14.6□□□□□ -0.07
RNA5SP406-201ENST00000516106 OBSL1O75147 1896 aa14.6□□□□□ -0.07
RNA5SP406-201ENST00000516106 GREB1Q4ZG55 1949 aa14.6□□□□□ -0.07
RNA5SP406-201ENST00000516106 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa14.6□□□□□ -0.07
RNA5SP406-201ENST00000516106 A0A1W2PQH9 124 aa14.59□□□□□ -0.07
RNA5SP406-201ENST00000516106 SHISA7A6NL88 538 aa14.59□□□□□ -0.07
RNA5SP406-201ENST00000516106 COCHO43405 550 aa14.59□□□□□ -0.07
RNA5SP406-201ENST00000516106 MBD3O95983 291 aa14.59□□□□□ -0.07
RNA5SP406-201ENST00000516106 CALCAP01258 141 aa14.59□□□□□ -0.07
RNA5SP406-201ENST00000516106 IRF1P10914 325 aa14.59□□□□□ -0.07
RNA5SP406-201ENST00000516106 VDRP11473 427 aa14.59□□□□□ -0.07
RNA5SP406-201ENST00000516106 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
RNA5SP406-201ENST00000516106 CTHP32929 405 aa14.59□□□□□ -0.07
RNA5SP406-201ENST00000516106 PGFP49763 221 aa14.59□□□□□ -0.07
RNA5SP406-201ENST00000516106 SLC7A9P82251 487 aa14.59□□□□□ -0.07
RNA5SP406-201ENST00000516106 ZXDBP98169 803 aa14.59□□□□□ -0.07
RNA5SP406-201ENST00000516106 USP4Q13107 963 aa14.59□□□□□ -0.07
RNA5SP406-201ENST00000516106 PON2Q15165 354 aa14.59□□□□□ -0.07
RNA5SP406-201ENST00000516106 PDGFRLQ15198 375 aa14.59□□□□□ -0.07
RNA5SP406-201ENST00000516106 GBP6Q6ZN66 633 aa14.59□□□□□ -0.07
RNA5SP406-201ENST00000516106 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
RNA5SP406-201ENST00000516106 UBR7Q8N806 425 aa14.59□□□□□ -0.07
RNA5SP406-201ENST00000516106 ANKRD52Q8NB46 1076 aa14.59□□□□□ -0.07
RNA5SP406-201ENST00000516106 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
RNA5SP406-201ENST00000516106 OSCP1Q8WVF1 389 aa14.59□□□□□ -0.07
RNA5SP406-201ENST00000516106 OSBPL6Q9BZF3 934 aa14.59□□□□□ -0.07
RNA5SP406-201ENST00000516106 LINC00597Q9H2U6 94 aa14.59□□□□□ -0.07
RNA5SP406-201ENST00000516106 LMAN1LQ9HAT1 526 aa14.59□□□□□ -0.07
RNA5SP406-201ENST00000516106 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa14.59□□□□□ -0.07
RNA5SP406-201ENST00000516106 CFAP97Q9P2B7 532 aa14.59□□□□□ -0.07
RNA5SP406-201ENST00000516106 SCML2Q9UQR0 700 aa14.59□□□□□ -0.07
RNA5SP406-201ENST00000516106 DENND4CQ5VZ89 1909 aa14.58□□□□□ -0.07
RNA5SP406-201ENST00000516106 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.07
RNA5SP406-201ENST00000516106 WDFY4Q6ZS81 3184 aa14.58□□□□□ -0.08
RNA5SP406-201ENST00000516106 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
RNA5SP406-201ENST00000516106 TLR5O60602 858 aa14.58□□□□□ -0.08
RNA5SP406-201ENST00000516106 TBX18O95935 607 aa14.58□□□□□ -0.08
RNA5SP406-201ENST00000516106 SLC9A1P19634 815 aa14.58□□□□□ -0.08
RNA5SP406-201ENST00000516106 BRD2P25440 801 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
RNA5SP406-201ENST00000516106 USP8P40818 1118 aa14.58□□□□□ -0.08
RNA5SP406-201ENST00000516106 KIF11P52732 1056 aa14.58□□□□□ -0.08
RNA5SP406-201ENST00000516106 CCDC183Q5T5S1 534 aa14.58□□□□□ -0.08
RNA5SP406-201ENST00000516106 GJB7Q6PEY0 223 aa14.58□□□□□ -0.08
RNA5SP406-201ENST00000516106 TXNDC11Q6PKC3 985 aa14.58□□□□□ -0.08
RNA5SP406-201ENST00000516106 PIGZQ86VD9 579 aa14.58□□□□□ -0.08
RNA5SP406-201ENST00000516106 TTC30AQ86WT1 665 aa14.58□□□□□ -0.08
RNA5SP406-201ENST00000516106 C1orf210Q8IVY1 113 aa14.58□□□□□ -0.08
RNA5SP406-201ENST00000516106 CPA6Q8N4T0 437 aa14.58□□□□□ -0.08
RNA5SP406-201ENST00000516106 ATP2A3Q93084 1043 aa14.58□□□□□ -0.08
RNA5SP406-201ENST00000516106 MSANTD3Q96H12 275 aa14.58□□□□□ -0.08
RNA5SP406-201ENST00000516106 KREMEN1Q96MU8 473 aa14.58□□□□□ -0.08
RNA5SP406-201ENST00000516106 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa14.58□□□□□ -0.08
RNA5SP406-201ENST00000516106 PNPLA8Q9NP80 782 aa14.58□□□□□ -0.08
RNA5SP406-201ENST00000516106 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
RNA5SP406-201ENST00000516106 NAGPAQ9UK23 515 aa14.58□□□□□ -0.08
RNA5SP406-201ENST00000516106 KIAA1257Q9ULG3 409 aa14.58□□□□□ -0.08
RNA5SP406-201ENST00000516106 MYH10P35580 1976 aa14.57□□□□□ -0.08
RNA5SP406-201ENST00000516106 FAM92AA1XBS5 289 aa14.57□□□□□ -0.08
RNA5SP406-201ENST00000516106 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
RNA5SP406-201ENST00000516106 KCNJ18B7U540 433 aa14.57□□□□□ -0.08
RNA5SP406-201ENST00000516106 TULP2O00295 520 aa14.57□□□□□ -0.08
RNA5SP406-201ENST00000516106 OLFM2O95897 454 aa14.57□□□□□ -0.08
RNA5SP406-201ENST00000516106 PAEPP09466 180 aa14.57□□□□□ -0.08
RNA5SP406-201ENST00000516106 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa14.57□□□□□ -0.08
RNA5SP406-201ENST00000516106 BCAT1P54687 386 aa14.57□□□□□ -0.08
RNA5SP406-201ENST00000516106 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
RNA5SP406-201ENST00000516106 APBA1Q02410 837 aa14.57□□□□□ -0.08
RNA5SP406-201ENST00000516106 GCNT1Q02742 428 aa14.57□□□□□ -0.08
RNA5SP406-201ENST00000516106 PDE4CQ08493 712 aa14.57□□□□□ -0.08
RNA5SP406-201ENST00000516106 BST2Q10589 180 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
RNA5SP406-201ENST00000516106 KCNJ12Q14500 433 aa14.57□□□□□ -0.08
RNA5SP406-201ENST00000516106 MAN2A1Q16706 1144 aa14.57□□□□□ -0.08
RNA5SP406-201ENST00000516106 ARHGAP44Q17R89 818 aa14.57□□□□□ -0.08
RNA5SP406-201ENST00000516106 EXOC3L4Q17RC7 722 aa14.57□□□□□ -0.08
RNA5SP406-201ENST00000516106 EML3Q32P44 896 aa14.57□□□□□ -0.08
RNA5SP406-201ENST00000516106 VWA3BQ502W6 1294 aa14.57□□□□□ -0.08
RNA5SP406-201ENST00000516106 SNX30Q5VWJ9 437 aa14.57□□□□□ -0.08
RNA5SP406-201ENST00000516106 C1orf228Q6PIY5 440 aa14.57□□□□□ -0.08
RNA5SP406-201ENST00000516106 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP14.57□□□□□ -0.08
RNA5SP406-201ENST00000516106 TFAP2BQ92481 460 aa14.57□□□□□ -0.08
RNA5SP406-201ENST00000516106 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa14.57□□□□□ -0.08
RNA5SP406-201ENST00000516106 ECT2Q9H8V3 914 aa14.57□□□□□ -0.08
RNA5SP406-201ENST00000516106 NMUR1Q9HB89 426 aa14.57□□□□□ -0.08
RNA5SP406-201ENST00000516106 LRRC4Q9HBW1 653 aa14.57□□□□□ -0.08
RNA5SP406-201ENST00000516106 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
RNA5SP406-201ENST00000516106 NUDT5Q9UKK9 219 aa14.57□□□□□ -0.08
RNA5SP406-201ENST00000516106 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa14.57□□□□□ -0.08
RNA5SP406-201ENST00000516106 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa14.57□□□□□ -0.08
RNA5SP406-201ENST00000516106 ZNF318Q5VUA4 2279 aa14.57□□□□□ -0.08
RNA5SP406-201ENST00000516106 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa14.56□□□□□ -0.08
RNA5SP406-201ENST00000516106 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa14.56□□□□□ -0.08
RNA5SP406-201ENST00000516106 M0QYV0 167 aa14.56□□□□□ -0.08
RNA5SP406-201ENST00000516106 O00370 1275 aa14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.9 ms