RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515200.5

GRAMD2B-217, Transcript of GRAM domain containing 2B, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene GRAMD2B, Length 3,109 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD2B-217ENST00000515200 PDGFRAP16234 1089 aa16.85■□□□□ 0.29
GRAMD2B-217ENST00000515200 MAGEA4P43358 317 aa16.85■□□□□ 0.29
GRAMD2B-217ENST00000515200 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
GRAMD2B-217ENST00000515200 CYP1B1Q16678 543 aa16.85■□□□□ 0.29
GRAMD2B-217ENST00000515200 CCDC125Q86Z20 511 aa16.85■□□□□ 0.29
GRAMD2B-217ENST00000515200 CCHCR1Q8TD31 782 aa16.85■□□□□ 0.29
GRAMD2B-217ENST00000515200 CHMP6Q96FZ7 201 aa16.85■□□□□ 0.29
GRAMD2B-217ENST00000515200 GALNT8Q9NY28 637 aa16.85■□□□□ 0.29
GRAMD2B-217ENST00000515200 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa16.85■□□□□ 0.29
GRAMD2B-217ENST00000515200 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa16.85■□□□□ 0.29
GRAMD2B-217ENST00000515200 A0A1W2PPM1 405 aa16.85■□□□□ 0.29
GRAMD2B-217ENST00000515200 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
GRAMD2B-217ENST00000515200 TTC4O95801 387 aa16.85■□□□□ 0.29
GRAMD2B-217ENST00000515200 PPIL2Q13356 520 aa16.85■□□□□ 0.29
GRAMD2B-217ENST00000515200 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa16.85■□□□□ 0.29
GRAMD2B-217ENST00000515200 ZNF677Q86XU0 584 aa16.85■□□□□ 0.29
GRAMD2B-217ENST00000515200 TMEM40Q8WWA1 233 aa16.85■□□□□ 0.29
GRAMD2B-217ENST00000515200 PTPRHQ9HD43 1115 aa16.85■□□□□ 0.29
GRAMD2B-217ENST00000515200 CDH23Q9H251 3354 aa16.84■□□□□ 0.29
GRAMD2B-217ENST00000515200 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
GRAMD2B-217ENST00000515200 RASA4BC9J798 803 aa16.84■□□□□ 0.29
GRAMD2B-217ENST00000515200 CXCL11O14625 94 aa16.84■□□□□ 0.29
GRAMD2B-217ENST00000515200 RASA4O43374 803 aa16.84■□□□□ 0.29
GRAMD2B-217ENST00000515200 CCND1P24385 295 aa16.84■□□□□ 0.29
GRAMD2B-217ENST00000515200 LMO2P25791 158 aa16.84■□□□□ 0.29
GRAMD2B-217ENST00000515200 SLC1A1P43005 524 aa16.84■□□□□ 0.29
GRAMD2B-217ENST00000515200 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
GRAMD2B-217ENST00000515200 ZNF132P52740 706 aa16.84■□□□□ 0.29
GRAMD2B-217ENST00000515200 HIC1Q14526 733 aa16.84■□□□□ 0.29
GRAMD2B-217ENST00000515200 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP16.84■□□□□ 0.29
GRAMD2B-217ENST00000515200 MYBPC3Q14896 1274 aa16.84■□□□□ 0.29
GRAMD2B-217ENST00000515200 CA9Q16790 459 aa16.84■□□□□ 0.29
GRAMD2B-217ENST00000515200 RXFP2Q8WXD0 754 aa16.84■□□□□ 0.29
GRAMD2B-217ENST00000515200 RSAD2Q8WXG1 361 aa16.84■□□□□ 0.29
GRAMD2B-217ENST00000515200 TRIM11Q96F44 468 aa16.84■□□□□ 0.29
GRAMD2B-217ENST00000515200 ACAP3Q96P50 834 aa16.84■□□□□ 0.29
GRAMD2B-217ENST00000515200 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
GRAMD2B-217ENST00000515200 TRAIPQ9BWF2 469 aa16.84■□□□□ 0.29
GRAMD2B-217ENST00000515200 SLC12A4Q9UP95 1085 aa16.84■□□□□ 0.29
GRAMD2B-217ENST00000515200 CHMP2BQ9UQN3 213 aa16.84■□□□□ 0.29
GRAMD2B-217ENST00000515200 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
GRAMD2B-217ENST00000515200 CALB1P05937 261 aa16.84■□□□□ 0.29
GRAMD2B-217ENST00000515200 ALDH3A1P30838 453 aa16.84■□□□□ 0.29
GRAMD2B-217ENST00000515200 SLMAPQ14BN4 828 aa16.84■□□□□ 0.29
GRAMD2B-217ENST00000515200 PMF1Q6P1K2 205 aa16.84■□□□□ 0.29
GRAMD2B-217ENST00000515200 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa16.84■□□□□ 0.29
GRAMD2B-217ENST00000515200 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa16.84■□□□□ 0.29
GRAMD2B-217ENST00000515200 UCMAQ8WVF2 138 aa16.84■□□□□ 0.29
GRAMD2B-217ENST00000515200 TLCD1Q96CP7 247 aa16.84■□□□□ 0.29
GRAMD2B-217ENST00000515200 TMEM176AQ96HP8 235 aa16.84■□□□□ 0.29
GRAMD2B-217ENST00000515200 PCDH10Q9P2E7 1040 aa16.84■□□□□ 0.29
GRAMD2B-217ENST00000515200 PNMA3Q9UL41 463 aa16.84■□□□□ 0.29
GRAMD2B-217ENST00000515200 NME7Q9Y5B8 376 aa16.84■□□□□ 0.29
GRAMD2B-217ENST00000515200 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa16.83■□□□□ 0.29
GRAMD2B-217ENST00000515200 E2F8A0AVK6 867 aa16.83■□□□□ 0.29
GRAMD2B-217ENST00000515200 H7C0C1 242 aa16.83■□□□□ 0.29
GRAMD2B-217ENST00000515200 CLDN5O00501 218 aa16.83■□□□□ 0.29
GRAMD2B-217ENST00000515200 CELF2O95319 508 aaKnown RBP16.83■□□□□ 0.29
GRAMD2B-217ENST00000515200 FUT4P22083 530 aa16.83■□□□□ 0.29
GRAMD2B-217ENST00000515200 ATP5OP48047 213 aa16.83■□□□□ 0.29
GRAMD2B-217ENST00000515200 SESN3P58005 492 aa16.83■□□□□ 0.29
GRAMD2B-217ENST00000515200 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP16.83■□□□□ 0.29
GRAMD2B-217ENST00000515200 PPP2R5EQ16537 467 aa16.83■□□□□ 0.29
GRAMD2B-217ENST00000515200 AGBL2Q5U5Z8 902 aa16.83■□□□□ 0.29
GRAMD2B-217ENST00000515200 XYLT1Q86Y38 959 aa16.83■□□□□ 0.29
GRAMD2B-217ENST00000515200 KATNAL2Q8IYT4 538 aa16.83■□□□□ 0.29
GRAMD2B-217ENST00000515200 EXD1Q8NHP7 514 aa16.83■□□□□ 0.29
GRAMD2B-217ENST00000515200 ADAM32Q8TC27 787 aa16.83■□□□□ 0.29
GRAMD2B-217ENST00000515200 PTPN18Q99952 460 aa16.83■□□□□ 0.29
GRAMD2B-217ENST00000515200 C16orf70Q9BSU1 422 aa16.83■□□□□ 0.29
GRAMD2B-217ENST00000515200 MAF1Q9H063 256 aa16.83■□□□□ 0.29
GRAMD2B-217ENST00000515200 ASAP2O43150 1006 aa16.83■□□□□ 0.28
GRAMD2B-217ENST00000515200 TSPAN1O60635 241 aa16.83■□□□□ 0.28
GRAMD2B-217ENST00000515200 TJP3O95049 919 aa16.83■□□□□ 0.28
GRAMD2B-217ENST00000515200 CETN2P41208 172 aa16.83■□□□□ 0.28
GRAMD2B-217ENST00000515200 CDKN2BP42772 138 aa16.83■□□□□ 0.28
GRAMD2B-217ENST00000515200 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP16.83■□□□□ 0.28
GRAMD2B-217ENST00000515200 PTK6Q13882 451 aa16.83■□□□□ 0.28
GRAMD2B-217ENST00000515200 TFDP3Q5H9I0 405 aa16.83■□□□□ 0.28
GRAMD2B-217ENST00000515200 FNBP1LQ5T0N5 605 aa16.83■□□□□ 0.28
GRAMD2B-217ENST00000515200 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP16.83■□□□□ 0.28
GRAMD2B-217ENST00000515200 GPR142Q7Z601 462 aa16.83■□□□□ 0.28
GRAMD2B-217ENST00000515200 SPATA18Q8TC71 538 aa16.83■□□□□ 0.28
GRAMD2B-217ENST00000515200 ZFP42Q96MM3 310 aa16.83■□□□□ 0.28
GRAMD2B-217ENST00000515200 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa16.83■□□□□ 0.28
GRAMD2B-217ENST00000515200 PTPRFP10586 1907 aa16.83■□□□□ 0.28
GRAMD2B-217ENST00000515200 PSTPIP1O43586 416 aa16.83■□□□□ 0.28
GRAMD2B-217ENST00000515200 ITIH2P19823 946 aa16.83■□□□□ 0.28
GRAMD2B-217ENST00000515200 RIPK1Q13546 671 aa16.83■□□□□ 0.28
GRAMD2B-217ENST00000515200 MAIP1Q8WWC4 291 aa16.83■□□□□ 0.28
GRAMD2B-217ENST00000515200 FAM149B1Q96BN6 582 aa16.83■□□□□ 0.28
GRAMD2B-217ENST00000515200 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP16.83■□□□□ 0.28
GRAMD2B-217ENST00000515200 USH1CQ9Y6N9 552 aa16.83■□□□□ 0.28
GRAMD2B-217ENST00000515200 CREB3O43889 395 aa16.82■□□□□ 0.28
GRAMD2B-217ENST00000515200 GHRP10912 638 aa16.82■□□□□ 0.28
GRAMD2B-217ENST00000515200 NCALDP61601 193 aa16.82■□□□□ 0.28
GRAMD2B-217ENST00000515200 C6orf118Q5T5N4 469 aa16.82■□□□□ 0.28
GRAMD2B-217ENST00000515200 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa16.82■□□□□ 0.28
GRAMD2B-217ENST00000515200 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa16.82■□□□□ 0.28
GRAMD2B-217ENST00000515200 C2orf40Q9H1Z8 148 aa16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.7 ms