RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513165.1

HOXC-AS3-202, HOXC cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene HOXC-AS3, Length 533 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS3-202ENST00000513165 K7ESF4 209 aa17.82■□□□□ 0.44
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP17.82■□□□□ 0.44
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CILPO75339 1184 aa17.82■□□□□ 0.44
HOXC-AS3-202ENST00000513165 BEST1O76090 585 aa17.82■□□□□ 0.44
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NFATC1O95644 943 aa17.82■□□□□ 0.44
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FAM200BP0CF97 657 aa17.82■□□□□ 0.44
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CCDC130P13994 396 aa17.82■□□□□ 0.44
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CNR2P34972 360 aa17.82■□□□□ 0.44
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MXI1P50539 228 aa17.82■□□□□ 0.44
HOXC-AS3-202ENST00000513165 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP17.82■□□□□ 0.44
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ORC1Q13415 861 aa17.82■□□□□ 0.44
HOXC-AS3-202ENST00000513165 HECTD3Q5T447 861 aa17.82■□□□□ 0.44
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TTC16Q8NEE8 873 aa17.82■□□□□ 0.44
HOXC-AS3-202ENST00000513165 WHAMMQ8TF30 809 aa17.82■□□□□ 0.44
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CYFIP2Q96F07 1278 aa17.82■□□□□ 0.44
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP17.82■□□□□ 0.44
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TWNKQ96RR1 684 aa17.82■□□□□ 0.44
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MMRN2Q9H8L6 949 aa17.82■□□□□ 0.44
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP17.82■□□□□ 0.44
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa17.81■□□□□ 0.44
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PMS1P54277 932 aaKnown RBP17.81■□□□□ 0.44
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MAP3K7CLP57077 242 aa17.81■□□□□ 0.44
HOXC-AS3-202ENST00000513165 STIM1Q13586 685 aa17.81■□□□□ 0.44
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CCDC26Q8TAB7 109 aa17.81■□□□□ 0.44
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SEMA4DQ92854 862 aa17.81■□□□□ 0.44
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP17.81■□□□□ 0.44
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CD101Q93033 1021 aa17.81■□□□□ 0.44
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP17.81■□□□□ 0.44
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PNPLA8Q9NP80 782 aa17.81■□□□□ 0.44
HOXC-AS3-202ENST00000513165 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP17.81■□□□□ 0.44
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FAM49BQ9NUQ9 324 aa17.81■□□□□ 0.44
HOXC-AS3-202ENST00000513165 COQ4Q9Y3A0 265 aa17.81■□□□□ 0.44
HOXC-AS3-202ENST00000513165 E2F8A0AVK6 867 aa17.8■□□□□ 0.44
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PSMA7O14818 248 aa17.8■□□□□ 0.44
HOXC-AS3-202ENST00000513165 COCHO43405 550 aa17.8■□□□□ 0.44
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP17.8■□□□□ 0.44
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CD58P19256 250 aa17.8■□□□□ 0.44
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LONP2Q86WA8 852 aa17.8■□□□□ 0.44
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP17.8■□□□□ 0.44
HOXC-AS3-202ENST00000513165 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP17.8■□□□□ 0.44
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TBC1D14Q9P2M4 693 aa17.8■□□□□ 0.44
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GPR179Q6PRD1 2367 aa17.8■□□□□ 0.44
HOXC-AS3-202ENST00000513165 HELZP42694 1942 aaKnown RBP17.79■□□□□ 0.44
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa17.79■□□□□ 0.44
HOXC-AS3-202ENST00000513165 EGFP01133 1207 aa17.79■□□□□ 0.44
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ADORA2BP29275 332 aa17.79■□□□□ 0.44
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TCERG1LQ5VWI1 586 aa17.79■□□□□ 0.44
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FOXR2Q6PJQ5 311 aa17.79■□□□□ 0.44
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CLEC20AQ6ZU45 233 aa17.79■□□□□ 0.44
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa17.79■□□□□ 0.44
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP17.79■□□□□ 0.44
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP17.79■□□□□ 0.44
HOXC-AS3-202ENST00000513165 OTUB2Q96DC9 234 aa17.79■□□□□ 0.44
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP17.79■□□□□ 0.44
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SMPD4Q9NXE4 827 aa17.79■□□□□ 0.44
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CFAP97Q9P2B7 532 aa17.79■□□□□ 0.44
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP17.79■□□□□ 0.44
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SCML2Q9UQR0 700 aa17.79■□□□□ 0.44
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FRYLO94915 3013 aa17.79■□□□□ 0.44
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SPTBN4Q9H254 2564 aa17.78■□□□□ 0.44
HOXC-AS3-202ENST00000513165 HHLA1C9JL84 531 aa17.78■□□□□ 0.44
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CBWD6Q4V339 395 aa17.78■□□□□ 0.44
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CBWD3Q5JTY5 395 aa17.78■□□□□ 0.44
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CBWD5Q5RIA9 395 aa17.78■□□□□ 0.44
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CAMKK1Q8N5S9 505 aa17.78■□□□□ 0.44
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SLC35C1Q96A29 364 aa17.78■□□□□ 0.44
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TMEM176AQ96HP8 235 aa17.78■□□□□ 0.44
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP17.78■□□□□ 0.44
HOXC-AS3-202ENST00000513165 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP17.78■□□□□ 0.44
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CEP63Q96MT8 703 aa17.78■□□□□ 0.44
HOXC-AS3-202ENST00000513165 HINFPQ9BQA5 517 aa17.78■□□□□ 0.44
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DUSP16Q9BY84 665 aa17.78■□□□□ 0.44
HOXC-AS3-202ENST00000513165 UBXN6Q9BZV1 441 aa17.78■□□□□ 0.44
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CCSER2Q9H7U1 834 aa17.78■□□□□ 0.44
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CISHQ9NSE2 258 aa17.78■□□□□ 0.44
HOXC-AS3-202ENST00000513165 C2orf42Q9NWW7 574 aa17.78■□□□□ 0.44
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GMIPQ9P107 970 aa17.78■□□□□ 0.44
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NCDNQ9UBB6 729 aa17.78■□□□□ 0.44
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MAN1B1Q9UKM7 699 aa17.78■□□□□ 0.44
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP17.78■□□□□ 0.44
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TRIM49BA6NDI0 452 aa17.77■□□□□ 0.44
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PMM2O15305 246 aa17.77■□□□□ 0.44
HOXC-AS3-202ENST00000513165 HRO43593 1189 aa17.77■□□□□ 0.44
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RNF40O75150 1001 aa17.77■□□□□ 0.44
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FNTBP49356 437 aa17.77■□□□□ 0.44
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DHCR24Q15392 516 aa17.77■□□□□ 0.44
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP17.77■□□□□ 0.44
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP17.77■□□□□ 0.44
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP17.77■□□□□ 0.44
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ISM2Q6H9L7 571 aa17.77■□□□□ 0.44
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PKN3Q6P5Z2 889 aa17.77■□□□□ 0.44
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RHBDF2Q6PJF5 856 aa17.77■□□□□ 0.44
HOXC-AS3-202ENST00000513165 WDR5BQ86VZ2 330 aa17.77■□□□□ 0.44
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DCLK2Q8N568 766 aa17.77■□□□□ 0.44
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TATDN2Q93075 761 aa17.77■□□□□ 0.44
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CYLDQ9NQC7 956 aa17.77■□□□□ 0.44
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RAB23Q9ULC3 237 aa17.77■□□□□ 0.44
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SLC8A2Q9UPR5 921 aa17.77■□□□□ 0.44
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa17.76■□□□□ 0.43
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TLR5O60602 858 aa17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.3 ms