RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485758.1

TPRKB-208, Transcript of TP53RK binding protein, human

TSL 2

Gene TPRKB, Length 730 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TPRKB-208	ENST00000485758	TAF10	Q12962	218 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TPRKB-208	ENST00000485758	NCAPH	Q15003	741 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TPRKB-208	ENST00000485758	SGO2	Q562F6	1265 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TPRKB-208	ENST00000485758	ENOSF1	Q7L5Y1	443 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TPRKB-208	ENST00000485758	BMP8A	Q7Z5Y6	402 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TPRKB-208	ENST00000485758	MFSD6L	Q8IWD5	586 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TPRKB-208	ENST00000485758	CMTM8	Q8IZV2	173 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TPRKB-208	ENST00000485758	MAB21L3	Q8N8X9	362 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TPRKB-208	ENST00000485758	RBBP8NL	Q8NC74	664 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
TPRKB-208	ENST00000485758	PDZD8	Q8NEN9	1154 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TPRKB-208	ENST00000485758	SCAMP5	Q8TAC9	235 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TPRKB-208	ENST00000485758	DEPDC1B	Q8WUY9	529 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TPRKB-208	ENST00000485758	OVCA2	Q8WZ82	227 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TPRKB-208	ENST00000485758	FBXO32	Q969P5	355 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TPRKB-208	ENST00000485758	RSPRY1	Q96DX4	576 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TPRKB-208	ENST00000485758	FAM81B	Q96LP2	452 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TPRKB-208	ENST00000485758	SLITRK1	Q96PX8	696 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TPRKB-208	ENST00000485758	BPIFA3	Q9BQP9	254 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TPRKB-208	ENST00000485758	FUCA2	Q9BTY2	467 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TPRKB-208	ENST00000485758	NAT10	Q9H0A0	1025 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
TPRKB-208	ENST00000485758	SIX2	Q9NPC8	291 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TPRKB-208	ENST00000485758	UBE2T	Q9NPD8	197 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
TPRKB-208	ENST00000485758	FANCL	Q9NW38	375 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TPRKB-208	ENST00000485758	OBP2A	Q9NY56	170 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TPRKB-208	ENST00000485758	TAB2	Q9NYJ8	693 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TPRKB-208	ENST00000485758	TRPM5	Q9NZQ8	1165 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TPRKB-208	ENST00000485758	APEX2	Q9UBZ4	518 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TPRKB-208	ENST00000485758	KIAA1257	Q9ULG3	409 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TPRKB-208	ENST00000485758	CNTN6	Q9UQ52	1028 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TPRKB-208	ENST00000485758	TRAV19	A0A0A6YYK7	116 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TPRKB-208	ENST00000485758	C2orf78	A6NCI8	922 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TPRKB-208	ENST00000485758	ZNF840P	A6NDX5	716 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TPRKB-208	ENST00000485758	RNF225	M0QZC1	329 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
TPRKB-208	ENST00000485758		O00370	1275 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TPRKB-208	ENST00000485758	PES1	O00541	588 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
TPRKB-208	ENST00000485758	CFH	P08603	1231 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TPRKB-208	ENST00000485758	ZNF18	P17022	549 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TPRKB-208	ENST00000485758	PFKL	P17858	780 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TPRKB-208	ENST00000485758	PSMC3	P17980	439 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TPRKB-208	ENST00000485758	AVPR1A	P37288	418 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TPRKB-208	ENST00000485758	MFAP3	P55082	362 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TPRKB-208	ENST00000485758	APBA1	Q02410	837 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TPRKB-208	ENST00000485758	GRM2	Q14416	872 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TPRKB-208	ENST00000485758	ZNF268	Q14587	947 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
TPRKB-208	ENST00000485758	KRT31	Q15323	416 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TPRKB-208	ENST00000485758	GOLGA7B	Q2TAP0	167 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TPRKB-208	ENST00000485758	GJB7	Q6PEY0	223 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TPRKB-208	ENST00000485758	GPRIN1	Q7Z2K8	1008 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TPRKB-208	ENST00000485758	TTC30A	Q86WT1	665 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TPRKB-208	ENST00000485758	AOPEP	Q8N6M6	819 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TPRKB-208	ENST00000485758	ANKRD52	Q8NB46	1076 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TPRKB-208	ENST00000485758	LRFN3	Q9BTN0	628 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TPRKB-208	ENST00000485758	SMG9	Q9H0W8	520 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
TPRKB-208	ENST00000485758	FBXO44	Q9H4M3	255 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TPRKB-208	ENST00000485758	KIF9	Q9HAQ2	790 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TPRKB-208	ENST00000485758	TRPC7	Q9HCX4	862 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TPRKB-208	ENST00000485758	WNT16	Q9UBV4	365 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TPRKB-208	ENST00000485758	TSPAN16	Q9UKR8	245 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TPRKB-208	ENST00000485758	FBXL21	Q9UKT6	434 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TPRKB-208	ENST00000485758	COL4A3	Q01955	1670 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TPRKB-208	ENST00000485758	SYCE3	A1L190	88 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TPRKB-208	ENST00000485758	OAS1	P00973	400 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
TPRKB-208	ENST00000485758	CKM	P06732	381 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TPRKB-208	ENST00000485758	TPM2	P07951	284 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TPRKB-208	ENST00000485758	USP17L7	P0C7H9	530 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TPRKB-208	ENST00000485758	KRT5	P13647	590 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TPRKB-208	ENST00000485758	BRD2	P25440	801 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
TPRKB-208	ENST00000485758	PDE6C	P51160	858 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TPRKB-208	ENST00000485758	BCAT1	P54687	386 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TPRKB-208	ENST00000485758	SLC8A3	P57103	927 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TPRKB-208	ENST00000485758	PFKP	Q01813	784 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TPRKB-208	ENST00000485758	FCHO2	Q0JRZ9	810 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TPRKB-208	ENST00000485758	BST2	Q10589	180 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
TPRKB-208	ENST00000485758	KCNMA1	Q12791	1236 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TPRKB-208	ENST00000485758	STIL	Q15468	1287 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TPRKB-208	ENST00000485758	ARHGAP44	Q17R89	818 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TPRKB-208	ENST00000485758	SKOR2	Q2VWA4	1001 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
TPRKB-208	ENST00000485758	SNX30	Q5VWJ9	437 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TPRKB-208	ENST00000485758	SMYD5	Q6GMV2	418 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TPRKB-208	ENST00000485758	DPY19L2P1	Q6NXN4	242 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TPRKB-208	ENST00000485758	LCLAT1	Q6UWP7	414 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TPRKB-208	ENST00000485758	HFE2	Q6ZVN8	426 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TPRKB-208	ENST00000485758	GPIHBP1	Q8IV16	184 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TPRKB-208	ENST00000485758	YAF2	Q8IY57	180 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TPRKB-208	ENST00000485758	CELF5	Q8N6W0	485 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
TPRKB-208	ENST00000485758	ARL14EP	Q8N8R7	260 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
TPRKB-208	ENST00000485758	ANKRD20A12P	Q8NF67	263 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TPRKB-208	ENST00000485758	BPIFB1	Q8TDL5	484 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TPRKB-208	ENST00000485758	TFAP2B	Q92481	460 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TPRKB-208	ENST00000485758	SHC3	Q92529	594 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TPRKB-208	ENST00000485758	DNASE1L2	Q92874	299 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TPRKB-208	ENST00000485758	USP13	Q92995	863 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
TPRKB-208	ENST00000485758	SLC22A12	Q96S37	553 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TPRKB-208	ENST00000485758	TRMT61B	Q9BVS5	477 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
TPRKB-208	ENST00000485758	TMUB1	Q9BVT8	246 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TPRKB-208	ENST00000485758	UBXN6	Q9BZV1	441 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TPRKB-208	ENST00000485758	VPS16	Q9H269	839 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TPRKB-208	ENST00000485758	HSD3B7	Q9H2F3	369 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TPRKB-208	ENST00000485758	TDP1	Q9NUW8	608 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TPRKB-208	ENST00000485758	GMIP	Q9P107	970 aa		11.11	□□□□□ -0.63

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