RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482054.1

CTSL-205, Transcript of cathepsin L, human

TSL 2

Gene CTSL, Length 908 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTSL-205	ENST00000482054	SNX25	Q9H3E2	840 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054	SLC32A1	Q9H598	525 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054	KIAA1586	Q9HCI6	787 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054	EHD2	Q9NZN4	543 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054	MTMR6	Q9Y217	621 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054	HECTD1	Q9ULT8	2610 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054	MYO16	Q9Y6X6	1858 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054	EIF3D	O15371	548 aa	Known RBP eCLIP	13.76	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054	TACC1	O75410	805 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054	OAS1	P00973	400 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054	CHRM1	P11229	460 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054	HNRNPL	P14866	589 aa	Known RBP eCLIP	13.76	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054	PTPN1	P18031	435 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054	TNNI1	P19237	187 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054	SLC6A11	P48066	632 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054	PPP3CC	P48454	512 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054	NASP	P49321	788 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054	DHCR24	Q15392	516 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054	CRY1	Q16526	586 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054	TMEM92	Q6UXU6	159 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054	EPM2AIP1	Q7L775	607 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054	CHCHD4	Q8N4Q1	142 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054	ADAM32	Q8TC27	787 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054	CGRRF1	Q99675	332 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054	DPEP3	Q9H4B8	488 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054	AGPAT3	Q9NRZ7	376 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054	KBTBD4	Q9NVX7	518 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054	CFAP97	Q9P2B7	532 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054	EVL	Q9UI08	416 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054	HELZ	P42694	1942 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054	CLDN5	O00501	218 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054	SLC9A3R1	O14745	358 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054	TGFB1I1	O43294	461 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054	CYP2J2	P51589	502 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054	TNNC1	P63316	161 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054	ASIC1	P78348	528 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054	MRPS21	P82921	87 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054	CYP24A1	Q07973	514 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054	SCAP	Q12770	1279 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054	IFRD2	Q12894	506 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054	PSMD6	Q15008	389 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054	STK38	Q15208	465 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054	WDR72	Q3MJ13	1102 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054	FAM26F	Q5R3K3	315 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054	TDRD10	Q5VZ19	366 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054	RHBDF2	Q6PJF5	856 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054	C12orf40	Q86WS4	652 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054	ALLC	Q8N6M5	410 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054	KIAA1958	Q8N8K9	716 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054	LINC00301	Q8NCQ3	95 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054	OLIG1	Q8TAK6	271 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054	ZNF507	Q8TCN5	953 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054	CCDC127	Q96BQ5	260 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054	DHX58	Q96C10	678 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054	SLITRK1	Q96PX8	696 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054	FNBP1	Q96RU3	617 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054	LRRC27	Q9C0I9	530 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054	ELOVL4	Q9GZR5	314 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054	SPTA1	P02549	2419 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054	UPK3BL1	B0FP48	263 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054	UPK3BL2	E5RIL1	263 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054		H0Y626	953 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054	SGK1	O00141	431 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054	CLIC2	O15247	247 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054	ALDH1A2	O94788	518 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054	KAT7	O95251	611 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054	TRIM16	O95361	564 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054	KLF8	O95600	359 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054	ADH1C	P00326	375 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054	MBL2	P11226	248 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054	ADH5	P11766	374 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054	TIE1	P35590	1138 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054	EIF2D	P41214	584 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054	MAPK8	P45983	427 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054	DHPS	P49366	369 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054	MYL6	P60660	151 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054	FAM193A	P78312	1265 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054	SEMA3B	Q13214	749 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054	EMC10	Q5UCC4	262 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054	RAB44	Q7Z6P3	723 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054	NELFCD	Q8IXH7	590 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054	IL17RC	Q8NAC3	791 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054	TXNDC5	Q8NBS9	432 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054	B3GALNT2	Q8NCR0	500 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054	RLN3	Q8WXF3	142 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054	ZNF516	Q92618	1163 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054	PIGK	Q92643	395 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054	PNKP	Q96T60	521 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054	B3GNT5	Q9BYG0	378 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054	GZF1	Q9H116	711 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054	CUEDC2	Q9H467	287 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054	ZSCAN16	Q9H4T2	348 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054	ZDHHC4	Q9NPG8	344 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054	ARHGEF4	Q9NR80	690 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054	FOXD4L1	Q9NU39	408 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054	CACNA2D2	Q9NY47	1150 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054	NXF1	Q9UBU9	619 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054	CIZ1	Q9ULV3	898 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054	PTPRD	P23468	1912 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054		A8MXQ7	604 aa		13.73	□□□□□ -0.21

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