RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481229.1

PNISR-208, Transcript of PNN interacting serine and arginine rich protein, humanhuman

TSL 3

Gene PNISR, Length 395 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNISR-208ENST00000481229 TBC1D4O60343 1298 aa5.54□□□□□ -1.52
PNISR-208ENST00000481229 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
PNISR-208ENST00000481229 APEHP13798 732 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
PNISR-208ENST00000481229 SLC13A2Q13183 592 aa5.54□□□□□ -1.52
PNISR-208ENST00000481229 DENND2CQ68D51 928 aa5.54□□□□□ -1.52
PNISR-208ENST00000481229 TMEM65Q6PI78 240 aa5.54□□□□□ -1.52
PNISR-208ENST00000481229 DEF8Q6ZN54 512 aa5.54□□□□□ -1.52
PNISR-208ENST00000481229 MPP5Q8N3R9 675 aa5.54□□□□□ -1.52
PNISR-208ENST00000481229 CTHRC1Q96CG8 243 aa5.54□□□□□ -1.52
PNISR-208ENST00000481229 NT5C1BQ96P26 610 aa5.54□□□□□ -1.52
PNISR-208ENST00000481229 TRIM5Q9C035 493 aa5.54□□□□□ -1.52
PNISR-208ENST00000481229 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
PNISR-208ENST00000481229 SNX15Q9NRS6 342 aa5.54□□□□□ -1.52
PNISR-208ENST00000481229 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
PNISR-208ENST00000481229 GABBR1Q9UBS5 961 aa5.54□□□□□ -1.52
PNISR-208ENST00000481229 UBXN7O94888 489 aa5.53□□□□□ -1.52
PNISR-208ENST00000481229 KITP10721 976 aa5.53□□□□□ -1.52
PNISR-208ENST00000481229 EPHA3P29320 983 aa5.53□□□□□ -1.52
PNISR-208ENST00000481229 DIO1P49895 249 aa5.53□□□□□ -1.52
PNISR-208ENST00000481229 ZNF91Q05481 1191 aa5.53□□□□□ -1.52
PNISR-208ENST00000481229 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP5.53□□□□□ -1.526e-8■□□□□ 9.7
PNISR-208ENST00000481229 RAB32Q13637 225 aa5.53□□□□□ -1.52
PNISR-208ENST00000481229 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
PNISR-208ENST00000481229 AWAT1Q58HT5 328 aa5.53□□□□□ -1.52
PNISR-208ENST00000481229 RANBP10Q6VN20 620 aa5.53□□□□□ -1.52
PNISR-208ENST00000481229 PIP4P1Q86T03 277 aa5.53□□□□□ -1.52
PNISR-208ENST00000481229 LINC01465Q8N7H1 131 aa5.53□□□□□ -1.52
PNISR-208ENST00000481229 DNAJB14Q8TBM8 379 aa5.53□□□□□ -1.52
PNISR-208ENST00000481229 SMURF2Q9HAU4 748 aa5.53□□□□□ -1.52
PNISR-208ENST00000481229 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP5.53□□□□□ -1.52
PNISR-208ENST00000481229 LRP12Q9Y561 859 aa5.53□□□□□ -1.52
PNISR-208ENST00000481229 CDY1Q9Y6F8 540 aa5.53□□□□□ -1.52
PNISR-208ENST00000481229 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa5.53□□□□□ -1.52
PNISR-208ENST00000481229 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa5.52□□□□□ -1.53
PNISR-208ENST00000481229 CD8B2A6NJW9 211 aa5.52□□□□□ -1.53
PNISR-208ENST00000481229 TMEM233B4DJY2 109 aa5.52□□□□□ -1.53
PNISR-208ENST00000481229 TLR2O60603 784 aa5.52□□□□□ -1.53
PNISR-208ENST00000481229 OAZ2O95190 189 aa5.52□□□□□ -1.53
PNISR-208ENST00000481229 CREB1P16220 341 aa5.52□□□□□ -1.53
PNISR-208ENST00000481229 UQCRC1P31930 480 aa5.52□□□□□ -1.53
PNISR-208ENST00000481229 LEXMQ3ZCV2 418 aa5.52□□□□□ -1.53
PNISR-208ENST00000481229 MIDNQ504T8 468 aa5.52□□□□□ -1.53
PNISR-208ENST00000481229 TMTC4Q5T4D3 741 aa5.52□□□□□ -1.53
PNISR-208ENST00000481229 ANO7Q6IWH7 933 aa5.52□□□□□ -1.53
PNISR-208ENST00000481229 ADAMTS15Q8TE58 950 aa5.52□□□□□ -1.53
PNISR-208ENST00000481229 MARK4Q96L34 752 aa5.52□□□□□ -1.53
PNISR-208ENST00000481229 VN1R3Q9BXE9 311 aa5.52□□□□□ -1.53
PNISR-208ENST00000481229 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa5.52□□□□□ -1.53
PNISR-208ENST00000481229 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
PNISR-208ENST00000481229 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
PNISR-208ENST00000481229 POT1Q9NUX5 634 aa5.52□□□□□ -1.53
PNISR-208ENST00000481229 TMEM184CQ9NVA4 438 aa5.52□□□□□ -1.53
PNISR-208ENST00000481229 MGAT4CQ9UBM8 478 aa5.52□□□□□ -1.53
PNISR-208ENST00000481229 HSPA6P17066 643 aa5.51□□□□□ -1.53
PNISR-208ENST00000481229 EN2P19622 333 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
PNISR-208ENST00000481229 TIRAPP58753 221 aa5.51□□□□□ -1.53
PNISR-208ENST00000481229 ID2Q02363 134 aa5.51□□□□□ -1.53
PNISR-208ENST00000481229 SEC23BQ15437 767 aa5.51□□□□□ -1.53
PNISR-208ENST00000481229 INSCQ1MX18 579 aa5.51□□□□□ -1.53
PNISR-208ENST00000481229 DCAF12L1Q5VU92 463 aa5.51□□□□□ -1.53
PNISR-208ENST00000481229 DCDC5Q6ZRR9 648 aa5.51□□□□□ -1.53
PNISR-208ENST00000481229 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
PNISR-208ENST00000481229 SLC35G2Q8TBE7 412 aa5.51□□□□□ -1.53
PNISR-208ENST00000481229 AIFM3Q96NN9 605 aa5.51□□□□□ -1.53
PNISR-208ENST00000481229 NMRK2Q9NPI5 230 aa5.51□□□□□ -1.53
PNISR-208ENST00000481229 MAFFQ9ULX9 164 aa5.51□□□□□ -1.53
PNISR-208ENST00000481229 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa5.51□□□□□ -1.53
PNISR-208ENST00000481229 CCDC187A0A096LP49 1063 aa5.5□□□□□ -1.53
PNISR-208ENST00000481229 SPRY2O43597 315 aa5.5□□□□□ -1.53
PNISR-208ENST00000481229 TMPRSS11DO60235 418 aa5.5□□□□□ -1.53
PNISR-208ENST00000481229 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
PNISR-208ENST00000481229 ME1P48163 572 aa5.5□□□□□ -1.53
PNISR-208ENST00000481229 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
PNISR-208ENST00000481229 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
PNISR-208ENST00000481229 VSTM1Q6UX27 236 aa5.5□□□□□ -1.53
PNISR-208ENST00000481229 B3GNT9Q6UX72 402 aa5.5□□□□□ -1.53
PNISR-208ENST00000481229 ZDHHC24Q6UX98 284 aa5.5□□□□□ -1.53
PNISR-208ENST00000481229 PPP1R35Q8TAP8 253 aa5.5□□□□□ -1.53
PNISR-208ENST00000481229 HS6ST2Q96MM7 605 aa5.5□□□□□ -1.53
PNISR-208ENST00000481229 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
PNISR-208ENST00000481229 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa5.5□□□□□ -1.53
PNISR-208ENST00000481229 BRINP2Q9C0B6 783 aa5.5□□□□□ -1.53
PNISR-208ENST00000481229 TRIM36Q9NQ86 728 aa5.5□□□□□ -1.53
PNISR-208ENST00000481229 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
PNISR-208ENST00000481229 HEY2Q9UBP5 337 aa5.5□□□□□ -1.53
PNISR-208ENST00000481229 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
PNISR-208ENST00000481229 RGS10O43665 173 aa5.49□□□□□ -1.53
PNISR-208ENST00000481229 SRGAP2O75044 1071 aa5.49□□□□□ -1.53
PNISR-208ENST00000481229 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
PNISR-208ENST00000481229 RASAL1O95294 804 aa5.49□□□□□ -1.53
PNISR-208ENST00000481229 ALPLP05186 524 aa5.49□□□□□ -1.53
PNISR-208ENST00000481229 CTSAP10619 480 aa5.49□□□□□ -1.53
PNISR-208ENST00000481229 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
PNISR-208ENST00000481229 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
PNISR-208ENST00000481229 THBS4P35443 961 aa5.49□□□□□ -1.53
PNISR-208ENST00000481229 MTHFSP49914 203 aa5.49□□□□□ -1.53
PNISR-208ENST00000481229 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP5.49□□□□□ -1.534e-6■■□□□ 12.5
PNISR-208ENST00000481229 CFHR1Q03591 330 aa5.49□□□□□ -1.53
PNISR-208ENST00000481229 KCNB1Q14721 858 aa5.49□□□□□ -1.53
PNISR-208ENST00000481229 ANO6Q4KMQ2 910 aa5.49□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.2 ms