RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481204.5

SKAP2-204, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SKAP2, Length 513 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2-204ENST00000481204 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
SKAP2-204ENST00000481204 RAB6CQ53S08 254 aa6.46□□□□□ -1.38
SKAP2-204ENST00000481204 WSCD1Q658N2 575 aa6.46□□□□□ -1.38
SKAP2-204ENST00000481204 DNAJC24Q6P3W2 148 aa6.46□□□□□ -1.38
SKAP2-204ENST00000481204 LYPD4Q6UWN0 246 aa6.46□□□□□ -1.38
SKAP2-204ENST00000481204 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa6.46□□□□□ -1.38
SKAP2-204ENST00000481204 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
SKAP2-204ENST00000481204 NLRP8Q86W28 1048 aa6.46□□□□□ -1.38
SKAP2-204ENST00000481204 TTC30AQ86WT1 665 aa6.46□□□□□ -1.38
SKAP2-204ENST00000481204 XYLT1Q86Y38 959 aa6.46□□□□□ -1.38
SKAP2-204ENST00000481204 RASGEF1CQ8N431 466 aa6.46□□□□□ -1.38
SKAP2-204ENST00000481204 EMC1Q8N766 993 aa6.46□□□□□ -1.38
SKAP2-204ENST00000481204 LRRC52Q8N7C0 313 aa6.46□□□□□ -1.38
SKAP2-204ENST00000481204 SLC43A3Q8NBI5 491 aa6.46□□□□□ -1.38
SKAP2-204ENST00000481204 FEZF2Q8TBJ5 459 aa6.46□□□□□ -1.38
SKAP2-204ENST00000481204 LINC01599Q8WXQ3 324 aa6.46□□□□□ -1.38
SKAP2-204ENST00000481204 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
SKAP2-204ENST00000481204 TRIM11Q96F44 468 aa6.46□□□□□ -1.38
SKAP2-204ENST00000481204 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
SKAP2-204ENST00000481204 HSH2DQ96JZ2 352 aa6.46□□□□□ -1.38
SKAP2-204ENST00000481204 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
SKAP2-204ENST00000481204 MCEEQ96PE7 176 aa6.46□□□□□ -1.38
SKAP2-204ENST00000481204 RPS6KC1Q96S38 1066 aa6.46□□□□□ -1.38
SKAP2-204ENST00000481204 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP6.46□□□□□ -1.38
SKAP2-204ENST00000481204 HERPUD2Q9BSE4 406 aa6.46□□□□□ -1.38
SKAP2-204ENST00000481204 SELENOOQ9BVL4 669 aa6.46□□□□□ -1.38
SKAP2-204ENST00000481204 NT5C1AQ9BXI3 368 aa6.46□□□□□ -1.38
SKAP2-204ENST00000481204 RAB6CQ9H0N0 254 aa6.46□□□□□ -1.38
SKAP2-204ENST00000481204 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
SKAP2-204ENST00000481204 WNT8AQ9H1J5 351 aa6.46□□□□□ -1.38
SKAP2-204ENST00000481204 LHX5Q9H2C1 402 aa6.46□□□□□ -1.38
SKAP2-204ENST00000481204 SNX25Q9H3E2 840 aa6.46□□□□□ -1.38
SKAP2-204ENST00000481204 STARD7Q9NQZ5 370 aa6.46□□□□□ -1.38
SKAP2-204ENST00000481204 CHST12Q9NRB3 414 aa6.46□□□□□ -1.38
SKAP2-204ENST00000481204 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
SKAP2-204ENST00000481204 KLHL11Q9NVR0 708 aa6.46□□□□□ -1.38
SKAP2-204ENST00000481204 TSPAN16Q9UKR8 245 aa6.46□□□□□ -1.38
SKAP2-204ENST00000481204 PTPN22Q9Y2R2 807 aa6.46□□□□□ -1.38
SKAP2-204ENST00000481204 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
SKAP2-204ENST00000481204 ESYT3A0FGR9 886 aa6.45□□□□□ -1.38
SKAP2-204ENST00000481204 KBTBD13C9JR72 458 aa6.45□□□□□ -1.38
SKAP2-204ENST00000481204 E5RJQ4 531 aa6.45□□□□□ -1.38
SKAP2-204ENST00000481204 F8VP50 259 aa6.45□□□□□ -1.38
SKAP2-204ENST00000481204 PI4K2BG5E9Z4 385 aa6.45□□□□□ -1.38
SKAP2-204ENST00000481204 MYO1FO00160 1098 aa6.45□□□□□ -1.38
SKAP2-204ENST00000481204 CLDN5O00501 218 aa6.45□□□□□ -1.38
SKAP2-204ENST00000481204 KRIT1O00522 736 aa6.45□□□□□ -1.38
SKAP2-204ENST00000481204 PODXLO00592 558 aa6.45□□□□□ -1.38
SKAP2-204ENST00000481204 CES2O00748 559 aa6.45□□□□□ -1.38
SKAP2-204ENST00000481204 CYB561D2O14569 222 aa6.45□□□□□ -1.38
SKAP2-204ENST00000481204 RAD51CO43502 376 aa6.45□□□□□ -1.38
SKAP2-204ENST00000481204 GRAP2O75791 330 aa6.45□□□□□ -1.38
SKAP2-204ENST00000481204 THP07101 528 aa6.45□□□□□ -1.38
SKAP2-204ENST00000481204 GLI1P08151 1106 aa6.45□□□□□ -1.38
SKAP2-204ENST00000481204 CCL5P13501 91 aa6.45□□□□□ -1.38
SKAP2-204ENST00000481204 TKTP29401 623 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
SKAP2-204ENST00000481204 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
SKAP2-204ENST00000481204 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
SKAP2-204ENST00000481204 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
SKAP2-204ENST00000481204 SSR1P43307 286 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
SKAP2-204ENST00000481204 BRCC3P46736 316 aa6.45□□□□□ -1.38
SKAP2-204ENST00000481204 GATMP50440 423 aa6.45□□□□□ -1.38
SKAP2-204ENST00000481204 PRMT2P55345 433 aa6.45□□□□□ -1.38
SKAP2-204ENST00000481204 LILRA4P59901 499 aa6.45□□□□□ -1.38
SKAP2-204ENST00000481204 ITIH3Q06033 890 aa6.45□□□□□ -1.38
SKAP2-204ENST00000481204 PDCLQ13371 301 aa6.45□□□□□ -1.38
SKAP2-204ENST00000481204 ARHGEF6Q15052 776 aa6.45□□□□□ -1.38
SKAP2-204ENST00000481204 SV2CQ496J9 727 aa6.45□□□□□ -1.38
SKAP2-204ENST00000481204 KIAA0319Q5VV43 1072 aa6.45□□□□□ -1.38
SKAP2-204ENST00000481204 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa6.45□□□□□ -1.38
SKAP2-204ENST00000481204 TRNP1Q6NT89 227 aa6.45□□□□□ -1.38
SKAP2-204ENST00000481204 PMF1Q6P1K2 205 aa6.45□□□□□ -1.38
SKAP2-204ENST00000481204 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
SKAP2-204ENST00000481204 LCLAT1Q6UWP7 414 aa6.45□□□□□ -1.38
SKAP2-204ENST00000481204 CD300LGQ6UXG3 332 aa6.45□□□□□ -1.38
SKAP2-204ENST00000481204 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa6.45□□□□□ -1.38
SKAP2-204ENST00000481204 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa6.45□□□□□ -1.38
SKAP2-204ENST00000481204 TMC7Q7Z402 723 aa6.45□□□□□ -1.38
SKAP2-204ENST00000481204 LIMS2Q7Z4I7 341 aa6.45□□□□□ -1.38
SKAP2-204ENST00000481204 ECHDC2Q86YB7 292 aa6.45□□□□□ -1.38
SKAP2-204ENST00000481204 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa6.45□□□□□ -1.38
SKAP2-204ENST00000481204 UBL4BQ8N7F7 174 aa6.45□□□□□ -1.38
SKAP2-204ENST00000481204 ACTRT1Q8TDG2 376 aa6.45□□□□□ -1.38
SKAP2-204ENST00000481204 HASPINQ8TF76 798 aa6.45□□□□□ -1.38
SKAP2-204ENST00000481204 COL26A1Q96A83 441 aa6.45□□□□□ -1.38
SKAP2-204ENST00000481204 FAXDC2Q96IV6 333 aa6.45□□□□□ -1.38
SKAP2-204ENST00000481204 VCPIP1Q96JH7 1222 aa6.45□□□□□ -1.38
SKAP2-204ENST00000481204 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa6.45□□□□□ -1.38
SKAP2-204ENST00000481204 SENP8Q96LD8 212 aa6.45□□□□□ -1.38
SKAP2-204ENST00000481204 ZNF560Q96MR9 790 aa6.45□□□□□ -1.38
SKAP2-204ENST00000481204 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa6.45□□□□□ -1.38
SKAP2-204ENST00000481204 RBCK1Q9BYM8 510 aa6.45□□□□□ -1.38
SKAP2-204ENST00000481204 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa6.45□□□□□ -1.38
SKAP2-204ENST00000481204 ST7Q9NRC1 585 aa6.45□□□□□ -1.38
SKAP2-204ENST00000481204 PARVAQ9NVD7 372 aa6.45□□□□□ -1.38
SKAP2-204ENST00000481204 GDAP2Q9NXN4 497 aa6.45□□□□□ -1.38
SKAP2-204ENST00000481204 SAGE1Q9NXZ1 904 aa6.45□□□□□ -1.38
SKAP2-204ENST00000481204 TMEM59LQ9UK28 342 aa6.45□□□□□ -1.38
SKAP2-204ENST00000481204 RAB21Q9UL25 225 aa6.45□□□□□ -1.38
SKAP2-204ENST00000481204 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa6.45□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 68.8 ms