RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479554.5

ATG4B-218, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 4

Gene ATG4B, Length 556 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-218ENST00000479554 PARD6AQ9NPB6 346 aa15.2■□□□□ 0.02
ATG4B-218ENST00000479554 DLL3Q9NYJ7 618 aa15.2■□□□□ 0.02
ATG4B-218ENST00000479554 HMGXB4Q9UGU5 601 aa15.2■□□□□ 0.02
ATG4B-218ENST00000479554 CEP250Q9BV73 2442 aa15.19■□□□□ 0.02
ATG4B-218ENST00000479554 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa15.19■□□□□ 0.02
ATG4B-218ENST00000479554 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
ATG4B-218ENST00000479554 TNFRSF10BO14763 440 aa15.19■□□□□ 0.02
ATG4B-218ENST00000479554 LRP3O75074 770 aa15.19■□□□□ 0.02
ATG4B-218ENST00000479554 AKAP3O75969 853 aa15.19■□□□□ 0.02
ATG4B-218ENST00000479554 ZNF202O95125 648 aa15.19■□□□□ 0.02
ATG4B-218ENST00000479554 CCDC130P13994 396 aa15.19■□□□□ 0.02
ATG4B-218ENST00000479554 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
ATG4B-218ENST00000479554 SDHBP21912 280 aa15.19■□□□□ 0.02
ATG4B-218ENST00000479554 TGM1P22735 817 aa15.19■□□□□ 0.02
ATG4B-218ENST00000479554 RPL13P26373 211 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
ATG4B-218ENST00000479554 ASPAP45381 313 aa15.19■□□□□ 0.02
ATG4B-218ENST00000479554 ARHGAP8P85298 464 aa15.19■□□□□ 0.02
ATG4B-218ENST00000479554 SPEM2Q0P670 501 aa15.19■□□□□ 0.02
ATG4B-218ENST00000479554 UNC93AQ86WB7 457 aa15.19■□□□□ 0.02
ATG4B-218ENST00000479554 FUKQ8N0W3 1084 aa15.19■□□□□ 0.02
ATG4B-218ENST00000479554 CCDC26Q8TAB7 109 aa15.19■□□□□ 0.02
ATG4B-218ENST00000479554 SCAMP5Q8TAC9 235 aa15.19■□□□□ 0.02
ATG4B-218ENST00000479554 SLC2A14Q8TDB8 520 aa15.19■□□□□ 0.02
ATG4B-218ENST00000479554 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
ATG4B-218ENST00000479554 ACDQ96AP0 544 aa15.19■□□□□ 0.02
ATG4B-218ENST00000479554 HHIPQ96QV1 700 aa15.19■□□□□ 0.02
ATG4B-218ENST00000479554 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP15.19■□□□□ 0.022e-6■■■■■ 96.1
ATG4B-218ENST00000479554 FAM49BQ9NUQ9 324 aa15.19■□□□□ 0.02
ATG4B-218ENST00000479554 CFAP97Q9P2B7 532 aa15.19■□□□□ 0.02
ATG4B-218ENST00000479554 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa15.18■□□□□ 0.02
ATG4B-218ENST00000479554 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa15.18■□□□□ 0.02
ATG4B-218ENST00000479554 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
ATG4B-218ENST00000479554 CYP17A1P05093 508 aa15.18■□□□□ 0.02
ATG4B-218ENST00000479554 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
ATG4B-218ENST00000479554 GCLMP48507 274 aa15.18■□□□□ 0.02
ATG4B-218ENST00000479554 ENPEPQ07075 957 aa15.18■□□□□ 0.02
ATG4B-218ENST00000479554 HECTD3Q5T447 861 aa15.18■□□□□ 0.02
ATG4B-218ENST00000479554 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
ATG4B-218ENST00000479554 CRYBG2Q8N1P7 616 aa15.18■□□□□ 0.02
ATG4B-218ENST00000479554 CAMKK1Q8N5S9 505 aa15.18■□□□□ 0.02
ATG4B-218ENST00000479554 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
ATG4B-218ENST00000479554 GAB3Q8WWW8 586 aa15.18■□□□□ 0.02
ATG4B-218ENST00000479554 SMOQ99835 787 aa15.18■□□□□ 0.02
ATG4B-218ENST00000479554 MMRN2Q9H8L6 949 aa15.18■□□□□ 0.02
ATG4B-218ENST00000479554 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
ATG4B-218ENST00000479554 COMMD8Q9NX08 183 aa15.18■□□□□ 0.02
ATG4B-218ENST00000479554 GMIPQ9P107 970 aa15.18■□□□□ 0.02
ATG4B-218ENST00000479554 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
ATG4B-218ENST00000479554 MYO16Q9Y6X6 1858 aa15.17■□□□□ 0.02
ATG4B-218ENST00000479554 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa15.17■□□□□ 0.02
ATG4B-218ENST00000479554 COCHO43405 550 aa15.17■□□□□ 0.02
ATG4B-218ENST00000479554 RPP40O75818 363 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
ATG4B-218ENST00000479554 FAM200BP0CF97 657 aa15.17■□□□□ 0.02
ATG4B-218ENST00000479554 CCDC192P0DO97 292 aa15.17■□□□□ 0.02
ATG4B-218ENST00000479554 OPRD1P41143 372 aa15.17■□□□□ 0.02
ATG4B-218ENST00000479554 TUBP50607 506 aa15.17■□□□□ 0.02
ATG4B-218ENST00000479554 MAP3K7CLP57077 242 aa15.17■□□□□ 0.02
ATG4B-218ENST00000479554 PPP3CAQ08209 521 aa15.17■□□□□ 0.02
ATG4B-218ENST00000479554 INCA1Q0VD86 236 aa15.17■□□□□ 0.02
ATG4B-218ENST00000479554 ADAM9Q13443 819 aa15.17■□□□□ 0.02
ATG4B-218ENST00000479554 DMC1Q14565 340 aa15.17■□□□□ 0.02
ATG4B-218ENST00000479554 ZCWPW2Q504Y3 356 aa15.17■□□□□ 0.02
ATG4B-218ENST00000479554 SNX30Q5VWJ9 437 aa15.17■□□□□ 0.02
ATG4B-218ENST00000479554 SYT13Q7L8C5 426 aa15.17■□□□□ 0.02
ATG4B-218ENST00000479554 C12orf29Q8N999 325 aa15.17■□□□□ 0.02
ATG4B-218ENST00000479554 CCDC150Q8NCX0 1101 aa15.17■□□□□ 0.02
ATG4B-218ENST00000479554 ZMIZ2Q8NF64 920 aa15.17■□□□□ 0.02
ATG4B-218ENST00000479554 TAS1R2Q8TE23 839 aa15.17■□□□□ 0.02
ATG4B-218ENST00000479554 NIF3L1Q9GZT8 377 aa15.17■□□□□ 0.02
ATG4B-218ENST00000479554 NACA2Q9H009 215 aa15.17■□□□□ 0.02
ATG4B-218ENST00000479554 FBXO44Q9H4M3 255 aa15.17■□□□□ 0.02
ATG4B-218ENST00000479554 CCSER2Q9H7U1 834 aa15.17■□□□□ 0.02
ATG4B-218ENST00000479554 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
ATG4B-218ENST00000479554 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa15.17■□□□□ 0.02
ATG4B-218ENST00000479554 SEMA4GQ9NTN9 838 aa15.17■□□□□ 0.02
ATG4B-218ENST00000479554 IL37Q9NZH6 218 aa15.17■□□□□ 0.02
ATG4B-218ENST00000479554 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
ATG4B-218ENST00000479554 E2F8A0AVK6 867 aa15.16■□□□□ 0.02
ATG4B-218ENST00000479554 FAM92AA1XBS5 289 aa15.16■□□□□ 0.02
ATG4B-218ENST00000479554 BEST1O76090 585 aa15.16■□□□□ 0.02
ATG4B-218ENST00000479554 APBB3O95704 486 aa15.16■□□□□ 0.02
ATG4B-218ENST00000479554 ADH1CP00326 375 aa15.16■□□□□ 0.02
ATG4B-218ENST00000479554 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa15.16■□□□□ 0.02
ATG4B-218ENST00000479554 ADORA2BP29275 332 aa15.16■□□□□ 0.02
ATG4B-218ENST00000479554 SEC13P55735 322 aa15.16■□□□□ 0.02
ATG4B-218ENST00000479554 DHCR24Q15392 516 aa15.16■□□□□ 0.02
ATG4B-218ENST00000479554 GAB4Q2WGN9 574 aa15.16■□□□□ 0.02
ATG4B-218ENST00000479554 EDRF1Q3B7T1 1238 aa15.16■□□□□ 0.02
ATG4B-218ENST00000479554 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa15.16■□□□□ 0.02
ATG4B-218ENST00000479554 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
ATG4B-218ENST00000479554 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa15.16■□□□□ 0.02
ATG4B-218ENST00000479554 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
ATG4B-218ENST00000479554 TWNKQ96RR1 684 aa15.16■□□□□ 0.02
ATG4B-218ENST00000479554 NT5C1AQ9BXI3 368 aa15.16■□□□□ 0.02
ATG4B-218ENST00000479554 DNAI2Q9GZS0 605 aa15.16■□□□□ 0.02
ATG4B-218ENST00000479554 CYP3A43Q9HB55 503 aa15.16■□□□□ 0.02
ATG4B-218ENST00000479554 TMEM8AQ9HCN3 771 aa15.16■□□□□ 0.02
ATG4B-218ENST00000479554 RMND1Q9NWS8 449 aa15.16■□□□□ 0.02
ATG4B-218ENST00000479554 TBC1D14Q9P2M4 693 aa15.16■□□□□ 0.02
ATG4B-218ENST00000479554 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.7 ms