RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478887.1

SFI1-222, Transcript of SFI1 centrin binding protein, human

TSL 4

Gene SFI1, Length 662 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SFI1-222	ENST00000478887	GMIP	Q9P107	970 aa		10	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	PCDHGC3	Q9UN70	934 aa		10	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	C5orf42	Q9H799	3197 aa		10	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	GREB1	Q4ZG55	1949 aa		9.99	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	TTC28	Q96AY4	2481 aa		9.99	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	DOCK6	Q96HP0	2047 aa		9.99	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	TRAV19	A0A0A6YYK7	116 aa		9.99	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	HEPACAM2	A8MVW5	462 aa		9.99	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	DLL1	O00548	723 aa		9.99	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	SERPINC1	P01008	464 aa		9.99	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	USP17L7	P0C7H9	530 aa		9.99	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	SRF	P11831	508 aa		9.99	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	TCF3	P15923	654 aa		9.99	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	AVPR1A	P37288	418 aa		9.99	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	VIPR2	P41587	438 aa		9.99	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	GPD2	P43304	727 aa		9.99	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	RPL34	P49207	117 aa	Known RBP	9.99	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	PGF	P49763	221 aa		9.99	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	PDE6C	P51160	858 aa		9.99	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	TKTL1	P51854	596 aa		9.99	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	BPIFB4	P59827	614 aa		9.99	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	SLC7A9	P82251	487 aa		9.99	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	USP4	Q13107	963 aa		9.99	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	NR1I3	Q14994	352 aa		9.99	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	PM20D1	Q6GTS8	502 aa		9.99	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	PMF1	Q6P1K2	205 aa		9.99	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	DENND1B	Q6P3S1	775 aa		9.99	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	VIT	Q6UXI7	678 aa		9.99	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	BHLHA9	Q7RTU4	235 aa		9.99	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	SLC47A2	Q86VL8	602 aa		9.99	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	ST13P5	Q8NFI4	369 aa	Predicted RBP	9.99	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	STK32A	Q8WU08	396 aa		9.99	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	EDA	Q92838	391 aa		9.99	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	USP13	Q92995	863 aa	Predicted RBP	9.99	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	HSFY1	Q96LI6	401 aa		9.99	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	PCMTD1	Q96MG8	357 aa	Predicted RBP	9.99	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	SLC22A12	Q96S37	553 aa		9.99	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	PLA2G2F	Q9BZM2	168 aa		9.99	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	SMOC2	Q9H3U7	446 aa		9.99	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	TRPC7	Q9HCX4	862 aa		9.99	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	NLRC4	Q9NPP4	1024 aa		9.99	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	CYLD	Q9NQC7	956 aa		9.99	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	SLC2A4RG	Q9NR83	387 aa		9.99	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	TLR8	Q9NR97	1041 aa	Known RBP	9.99	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	ARHGAP26	Q9UNA1	814 aa		9.99	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	OBSL1	O75147	1896 aa		9.99	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	NUP210	Q8TEM1	1887 aa	Predicted RBP	9.98	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887		A0A1W2PQH9	124 aa		9.98	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	NARS	O43776	548 aa	Known RBP	9.98	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	GABBR2	O75899	941 aa		9.98	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	ZBED1	O96006	694 aa		9.98	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	CKM	P06732	381 aa		9.98	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	CFH	P08603	1231 aa		9.98	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	CYP11B1	P15538	503 aa		9.98	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	PSMC3	P17980	439 aa		9.98	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	SOX5	P35711	763 aa		9.98	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	PBX1	P40424	430 aa		9.98	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	PSEN1	P49768	467 aa		9.98	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	SIGLEC14	Q08ET2	396 aa		9.98	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	FCHO2	Q0JRZ9	810 aa		9.98	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	ADIG	Q0VDE8	80 aa		9.98	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	ZNF77	Q15935	545 aa		9.98	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	SCD5	Q86SK9	330 aa		9.98	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	MFSD6L	Q8IWD5	586 aa		9.98	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	ZNF276	Q8N554	614 aa		9.98	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	CELF5	Q8N6W0	485 aa	Known RBP	9.98	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	ARL14EP	Q8N8R7	260 aa	Predicted RBP	9.98	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	RIN3	Q8TB24	985 aa		9.98	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	EPS8L1	Q8TE68	723 aa		9.98	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	DDX1	Q92499	740 aa	Known RBP	9.98	□□□□□ -0.81
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SFI1-222	ENST00000478887	SPAG5	Q96R06	1193 aa		9.98	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	ULBP1	Q9BZM6	244 aa		9.98	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	TTYH3	Q9C0H2	523 aa		9.98	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	SMG9	Q9H0W8	520 aa	Known RBP	9.98	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	LHX5	Q9H2C1	402 aa		9.98	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	NMUR1	Q9HB89	426 aa		9.98	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	LRRC4	Q9HBW1	653 aa		9.98	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	CNGB3	Q9NQW8	809 aa		9.98	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	TDP1	Q9NUW8	608 aa		9.98	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	OSER1	Q9NX31	292 aa		9.98	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	CLIC5	Q9NZA1	410 aa		9.98	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	CHORDC1	Q9UHD1	332 aa	Predicted RBP	9.98	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	MYO6	Q9UM54	1294 aa		9.98	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	CCL26	Q9Y258	94 aa		9.98	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	ARNTL	O00327	626 aa		9.97	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	DPYSL4	O14531	572 aa		9.97	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	COCH	O43405	550 aa		9.97	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	TLR5	O60602	858 aa		9.97	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	HDC	P19113	662 aa		9.97	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	CDH5	P33151	784 aa	Predicted RBP	9.97	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	STAT1	P42224	750 aa		9.97	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	ACADSB	P45954	432 aa		9.97	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	RGS7	P49802	495 aa		9.97	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	UBASH3A	P57075	661 aa		9.97	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	DAOA	P59103	153 aa		9.97	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	GPC5	P78333	572 aa		9.97	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	PDCL	Q13371	301 aa		9.97	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	GRM2	Q14416	872 aa		9.97	□□□□□ -0.81
SFI1-222	ENST00000478887	FIGN	Q5HY92	759 aa		9.97	□□□□□ -0.81

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