RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475558.5

SHQ1-207, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 5

Gene SHQ1, Length 666 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-207ENST00000475558 MMP8P22894 467 aa7.4□□□□□ -1.22
SHQ1-207ENST00000475558 GABRB2P47870 512 aa7.4□□□□□ -1.22
SHQ1-207ENST00000475558 OR1G1P47890 313 aa7.4□□□□□ -1.22
SHQ1-207ENST00000475558 BCAT1P54687 386 aa7.4□□□□□ -1.22
SHQ1-207ENST00000475558 GSCP56915 257 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
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SHQ1-207ENST00000475558 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
SHQ1-207ENST00000475558 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
SHQ1-207ENST00000475558 PPP2R5EQ16537 467 aa7.4□□□□□ -1.22
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SHQ1-207ENST00000475558 ATAT1Q5SQI0 421 aa7.4□□□□□ -1.22
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SHQ1-207ENST00000475558 SLC35G2Q8TBE7 412 aa7.4□□□□□ -1.22
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SHQ1-207ENST00000475558 DESI2Q9BSY9 194 aa7.4□□□□□ -1.22
SHQ1-207ENST00000475558 DUSP16Q9BY84 665 aa7.4□□□□□ -1.22
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SHQ1-207ENST00000475558 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
SHQ1-207ENST00000475558 ADAM28Q9UKQ2 775 aa7.4□□□□□ -1.22
SHQ1-207ENST00000475558 AMFRQ9UKV5 643 aa7.4□□□□□ -1.22
SHQ1-207ENST00000475558 POLIQ9UNA4 740 aa7.4□□□□□ -1.22
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SHQ1-207ENST00000475558 USTQ9Y2C2 406 aa7.4□□□□□ -1.22
SHQ1-207ENST00000475558 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
SHQ1-207ENST00000475558 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa7.4□□□□□ -1.22
SHQ1-207ENST00000475558 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP7.4□□□□□ -1.22
SHQ1-207ENST00000475558 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 ARID2Q68CP9 1835 aa7.39□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 C2orf71A6NGG8 1288 aa7.39□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 CASTOR2A6NHX0 329 aa7.39□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 SIGLEC16A6NMB1 481 aa7.39□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 O00370 1275 aa7.39□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 NRP1O14786 923 aa7.39□□□□□ -1.23
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SHQ1-207ENST00000475558 CXCL14O95715 111 aa7.39□□□□□ -1.23
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SHQ1-207ENST00000475558 CLLU1OSQ5K130 101 aa7.39□□□□□ -1.23
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SHQ1-207ENST00000475558 NUDT18Q6ZVK8 323 aa7.39□□□□□ -1.23
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SHQ1-207ENST00000475558 SLC35F5Q8WV83 523 aa7.39□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 PBKQ96KB5 322 aa7.39□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 PCDHB18PQ96TA0 734 aa7.39□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 ARID3AQ99856 593 aa7.39□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 RTP3Q9BQQ7 232 aa7.39□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 ELOVL4Q9GZR5 314 aa7.39□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 LACRTQ9GZZ8 138 aa7.39□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 SDCBP2Q9H190 292 aa7.39□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 SEMA4AQ9H3S1 761 aa7.39□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 SMYD3Q9H7B4 428 aa7.39□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa7.39□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 ABCB6Q9NP58 842 aa7.39□□□□□ -1.23
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