RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467435.1

HDLBP-231, Transcript of high density lipoprotein binding protein, human

TSL 2

Gene HDLBP, Length 639 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDLBP-231	ENST00000467435	RFC2	P35250	354 aa		12.88	□□□□□ -0.35
HDLBP-231	ENST00000467435	COIL	P38432	576 aa	Predicted RBP	12.88	□□□□□ -0.35
HDLBP-231	ENST00000467435	TNNT3	P45378	269 aa	Predicted RBP	12.88	□□□□□ -0.35
HDLBP-231	ENST00000467435	TKTL1	P51854	596 aa		12.88	□□□□□ -0.35
HDLBP-231	ENST00000467435	RABGGTB	P53611	331 aa		12.88	□□□□□ -0.35
HDLBP-231	ENST00000467435	EPHB4	P54760	987 aa		12.88	□□□□□ -0.35
HDLBP-231	ENST00000467435	BCAR1	P56945	870 aa		12.88	□□□□□ -0.35
HDLBP-231	ENST00000467435	TFDP3	Q5H9I0	405 aa		12.88	□□□□□ -0.35
HDLBP-231	ENST00000467435	KCNT1	Q5JUK3	1230 aa		12.88	□□□□□ -0.35
HDLBP-231	ENST00000467435	SH3PXD2A	Q5TCZ1	1133 aa		12.88	□□□□□ -0.35
HDLBP-231	ENST00000467435	KAZN	Q674X7	775 aa		12.88	□□□□□ -0.35
HDLBP-231	ENST00000467435	ARC	Q7LC44	396 aa		12.88	□□□□□ -0.35
HDLBP-231	ENST00000467435	JAML	Q86YT9	394 aa		12.88	□□□□□ -0.35
HDLBP-231	ENST00000467435	CRIPAK	Q8N1N5	446 aa		12.88	□□□□□ -0.35
HDLBP-231	ENST00000467435	LRRC43	Q8N309	656 aa		12.88	□□□□□ -0.35
HDLBP-231	ENST00000467435	AEN	Q8WTP8	325 aa	Known RBP	12.88	□□□□□ -0.35
HDLBP-231	ENST00000467435	C1orf54	Q8WWF1	131 aa		12.88	□□□□□ -0.35
HDLBP-231	ENST00000467435	IFT81	Q8WYA0	676 aa		12.88	□□□□□ -0.35
HDLBP-231	ENST00000467435	HSPH1	Q92598	858 aa		12.88	□□□□□ -0.35
HDLBP-231	ENST00000467435	FAM149B1	Q96BN6	582 aa		12.88	□□□□□ -0.35
HDLBP-231	ENST00000467435	NCAPG	Q9BPX3	1015 aa		12.88	□□□□□ -0.35
HDLBP-231	ENST00000467435	TMEM175	Q9BSA9	504 aa		12.88	□□□□□ -0.35
HDLBP-231	ENST00000467435	COLEC11	Q9BWP8	271 aa		12.88	□□□□□ -0.35
HDLBP-231	ENST00000467435	RHOBTB2	Q9BYZ6	727 aa		12.88	□□□□□ -0.35
HDLBP-231	ENST00000467435	DCLK3	Q9C098	648 aa		12.88	□□□□□ -0.35
HDLBP-231	ENST00000467435	LRRC19	Q9H756	370 aa		12.88	□□□□□ -0.35
HDLBP-231	ENST00000467435	CHST7	Q9NS84	486 aa		12.88	□□□□□ -0.35
HDLBP-231	ENST00000467435	TMLHE	Q9NVH6	421 aa		12.88	□□□□□ -0.35
HDLBP-231	ENST00000467435	MARCH5	Q9NX47	278 aa		12.88	□□□□□ -0.35
HDLBP-231	ENST00000467435	FASTKD2	Q9NYY8	710 aa	Known RBP eCLIP	12.88	□□□□□ -0.35
HDLBP-231	ENST00000467435	HCST	Q9UBK5	93 aa		12.88	□□□□□ -0.35
HDLBP-231	ENST00000467435	ADAM28	Q9UKQ2	775 aa		12.88	□□□□□ -0.35
HDLBP-231	ENST00000467435	UTP11	Q9Y3A2	253 aa	Known RBP	12.88	□□□□□ -0.35
HDLBP-231	ENST00000467435	C3orf70	A6NLC5	250 aa	Predicted RBP	12.87	□□□□□ -0.35
HDLBP-231	ENST00000467435	SYN3	O14994	580 aa		12.87	□□□□□ -0.35
HDLBP-231	ENST00000467435	ATP8B1	O43520	1251 aa		12.87	□□□□□ -0.35
HDLBP-231	ENST00000467435	TJP3	O95049	919 aa		12.87	□□□□□ -0.35
HDLBP-231	ENST00000467435	KRT10	P13645	584 aa		12.87	□□□□□ -0.35
HDLBP-231	ENST00000467435	BDNF	P23560	247 aa		12.87	□□□□□ -0.35
HDLBP-231	ENST00000467435	CDKN2B	P42772	138 aa		12.87	□□□□□ -0.35
HDLBP-231	ENST00000467435	PTGIR	P43119	386 aa		12.87	□□□□□ -0.35
HDLBP-231	ENST00000467435	SLC11A1	P49279	550 aa		12.87	□□□□□ -0.35
HDLBP-231	ENST00000467435	CARS	P49589	748 aa	Known RBP	12.87	□□□□□ -0.35
HDLBP-231	ENST00000467435	LBX1	P52954	281 aa		12.87	□□□□□ -0.35
HDLBP-231	ENST00000467435	MRPS5	P82675	430 aa	Known RBP	12.87	□□□□□ -0.35
HDLBP-231	ENST00000467435	SNX1	Q13596	522 aa		12.87	□□□□□ -0.35
HDLBP-231	ENST00000467435	CUL1	Q13616	776 aa		12.87	□□□□□ -0.35
HDLBP-231	ENST00000467435	LRRC26	Q2I0M4	334 aa		12.87	□□□□□ -0.35
HDLBP-231	ENST00000467435	RAB6C	Q53S08	254 aa		12.87	□□□□□ -0.35
HDLBP-231	ENST00000467435	LIN28B	Q6ZN17	250 aa	Known RBP eCLIP	12.87	□□□□□ -0.35	2e-9	■□□□□ 10
HDLBP-231	ENST00000467435	C4orf50	Q6ZRC1	276 aa		12.87	□□□□□ -0.35
HDLBP-231	ENST00000467435	CYP4V2	Q6ZWL3	525 aa	Predicted RBP	12.87	□□□□□ -0.35
HDLBP-231	ENST00000467435	GPRIN1	Q7Z2K8	1008 aa		12.87	□□□□□ -0.35
HDLBP-231	ENST00000467435	HDX	Q7Z353	690 aa		12.87	□□□□□ -0.35
HDLBP-231	ENST00000467435	SPATA2L	Q8IUW3	424 aa	Predicted RBP	12.87	□□□□□ -0.35
HDLBP-231	ENST00000467435	CCDC105	Q8IYK2	499 aa		12.87	□□□□□ -0.35
HDLBP-231	ENST00000467435	ATG4A	Q8WYN0	398 aa		12.87	□□□□□ -0.35
HDLBP-231	ENST00000467435	PAWR	Q96IZ0	340 aa	Known RBP	12.87	□□□□□ -0.35
HDLBP-231	ENST00000467435	KCNK16	Q96T55	309 aa		12.87	□□□□□ -0.35
HDLBP-231	ENST00000467435	ULBP1	Q9BZM6	244 aa		12.87	□□□□□ -0.35
HDLBP-231	ENST00000467435	RAB6C	Q9H0N0	254 aa		12.87	□□□□□ -0.35
HDLBP-231	ENST00000467435	DPH5	Q9H2P9	285 aa		12.87	□□□□□ -0.35
HDLBP-231	ENST00000467435	CSNK1G1	Q9HCP0	422 aa		12.87	□□□□□ -0.35
HDLBP-231	ENST00000467435	DMAP1	Q9NPF5	467 aa	Predicted RBP	12.87	□□□□□ -0.35
HDLBP-231	ENST00000467435	HOMER3	Q9NSC5	361 aa		12.87	□□□□□ -0.35
HDLBP-231	ENST00000467435	TMEM30A	Q9NV96	361 aa		12.87	□□□□□ -0.35
HDLBP-231	ENST00000467435	R3HDM2	Q9Y2K5	976 aa	Known RBP	12.87	□□□□□ -0.35
HDLBP-231	ENST00000467435	DNAH12	Q6ZR08	3092 aa		12.87	□□□□□ -0.35
HDLBP-231	ENST00000467435	HHLA1	C9JL84	531 aa		12.86	□□□□□ -0.35
HDLBP-231	ENST00000467435	SASH3	O75995	380 aa		12.86	□□□□□ -0.35
HDLBP-231	ENST00000467435	OAZ2	O95190	189 aa		12.86	□□□□□ -0.35
HDLBP-231	ENST00000467435	ECEL1	O95672	775 aa		12.86	□□□□□ -0.35
HDLBP-231	ENST00000467435	OR4Q2	P0C623	313 aa		12.86	□□□□□ -0.35
HDLBP-231	ENST00000467435	KDELR1	P24390	212 aa		12.86	□□□□□ -0.35
HDLBP-231	ENST00000467435	MATK	P42679	507 aa		12.86	□□□□□ -0.35
HDLBP-231	ENST00000467435	NDUFV1	P49821	464 aa		12.86	□□□□□ -0.35
HDLBP-231	ENST00000467435	SULT1E1	P49888	294 aa		12.86	□□□□□ -0.35
HDLBP-231	ENST00000467435	HDAC4	P56524	1084 aa		12.86	□□□□□ -0.35
HDLBP-231	ENST00000467435	DAOA	P59103	153 aa		12.86	□□□□□ -0.35
HDLBP-231	ENST00000467435	IKBKE	Q14164	716 aa		12.86	□□□□□ -0.35
HDLBP-231	ENST00000467435	HLTF	Q14527	1009 aa	Known RBP eCLIP	12.86	□□□□□ -0.35
HDLBP-231	ENST00000467435	RAB41	Q5JT25	222 aa		12.86	□□□□□ -0.35
HDLBP-231	ENST00000467435	VARS2	Q5ST30	1063 aa	Known RBP	12.86	□□□□□ -0.35
HDLBP-231	ENST00000467435	SCYL2	Q6P3W7	929 aa		12.86	□□□□□ -0.35
HDLBP-231	ENST00000467435	EMB	Q6PCB8	327 aa		12.86	□□□□□ -0.35
HDLBP-231	ENST00000467435	LRRTM3	Q86VH5	581 aa		12.86	□□□□□ -0.35
HDLBP-231	ENST00000467435	DCP1B	Q8IZD4	617 aa	Known RBP	12.86	□□□□□ -0.35
HDLBP-231	ENST00000467435	DEFB106A	Q8N104	65 aa		12.86	□□□□□ -0.35
HDLBP-231	ENST00000467435	KCTD6	Q8NC69	237 aa		12.86	□□□□□ -0.35
HDLBP-231	ENST00000467435	GRK7	Q8WTQ7	553 aa		12.86	□□□□□ -0.35
HDLBP-231	ENST00000467435	TEKT4	Q8WW24	435 aa		12.86	□□□□□ -0.35
HDLBP-231	ENST00000467435	NDRG1	Q92597	394 aa	Known RBP	12.86	□□□□□ -0.35
HDLBP-231	ENST00000467435	SLCO2A1	Q92959	643 aa		12.86	□□□□□ -0.35
HDLBP-231	ENST00000467435	CCDC114	Q96M63	670 aa		12.86	□□□□□ -0.35
HDLBP-231	ENST00000467435	TBCB	Q99426	244 aa		12.86	□□□□□ -0.35
HDLBP-231	ENST00000467435	C11orf84	Q9BUA3	381 aa	Predicted RBP	12.86	□□□□□ -0.35
HDLBP-231	ENST00000467435	DDX23	Q9BUQ8	820 aa	Known RBP	12.86	□□□□□ -0.35
HDLBP-231	ENST00000467435	FUT8	Q9BYC5	575 aa		12.86	□□□□□ -0.35
HDLBP-231	ENST00000467435	UBXN6	Q9BZV1	441 aa		12.86	□□□□□ -0.35
HDLBP-231	ENST00000467435	ZCWPW1	Q9H0M4	648 aa		12.86	□□□□□ -0.35

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