RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461219.5

SCAF8-204, Transcript of SR-related CTD associated factor 8, humanhuman

TSL 5

Gene SCAF8, Length 677 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF8-204ENST00000461219 CPA6Q8N4T0 437 aa21.63■■□□□ 1.05
SCAF8-204ENST00000461219 PRSS33Q8NF86 280 aa21.63■■□□□ 1.05
SCAF8-204ENST00000461219 EXOC4Q96A65 974 aa21.63■■□□□ 1.05
SCAF8-204ENST00000461219 FAM81BQ96LP2 452 aa21.63■■□□□ 1.05
SCAF8-204ENST00000461219 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
SCAF8-204ENST00000461219 OSBPL6Q9BZF3 934 aa21.63■■□□□ 1.05
SCAF8-204ENST00000461219 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
SCAF8-204ENST00000461219 CPQQ9Y646 472 aa21.63■■□□□ 1.05
SCAF8-204ENST00000461219 LEFTY2O00292 366 aa21.62■■□□□ 1.05
SCAF8-204ENST00000461219 OAS1P00973 400 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
SCAF8-204ENST00000461219 PAEPP09466 180 aa21.62■■□□□ 1.05
SCAF8-204ENST00000461219 MAGEA9P43362 315 aa21.62■■□□□ 1.05
SCAF8-204ENST00000461219 SOX9P48436 509 aa21.62■■□□□ 1.05
SCAF8-204ENST00000461219 MFAP3P55082 362 aa21.62■■□□□ 1.05
SCAF8-204ENST00000461219 USP4Q13107 963 aa21.62■■□□□ 1.05
SCAF8-204ENST00000461219 NR1H3Q13133 447 aa21.62■■□□□ 1.05
SCAF8-204ENST00000461219 RUNX3Q13761 415 aa21.62■■□□□ 1.05
SCAF8-204ENST00000461219 ZNF77Q15935 545 aa21.62■■□□□ 1.05
SCAF8-204ENST00000461219 TRIM68Q6AZZ1 485 aa21.62■■□□□ 1.05
SCAF8-204ENST00000461219 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa21.62■■□□□ 1.05
SCAF8-204ENST00000461219 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
SCAF8-204ENST00000461219 ARHGEF19Q8IW93 802 aa21.62■■□□□ 1.05
SCAF8-204ENST00000461219 ANKRD52Q8NB46 1076 aa21.62■■□□□ 1.05
SCAF8-204ENST00000461219 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
SCAF8-204ENST00000461219 ATP2A3Q93084 1043 aa21.62■■□□□ 1.05
SCAF8-204ENST00000461219 ANO10Q9NW15 660 aa21.62■■□□□ 1.05
SCAF8-204ENST00000461219 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
SCAF8-204ENST00000461219 TSPAN16Q9UKR8 245 aa21.62■■□□□ 1.05
SCAF8-204ENST00000461219 SCML2Q9UQR0 700 aa21.62■■□□□ 1.05
SCAF8-204ENST00000461219 F5P12259 2224 aa21.61■■□□□ 1.05
SCAF8-204ENST00000461219 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa21.61■■□□□ 1.05
SCAF8-204ENST00000461219 ARNTLO00327 626 aa21.61■■□□□ 1.05
SCAF8-204ENST00000461219 CYP26A1O43174 497 aa21.61■■□□□ 1.05
SCAF8-204ENST00000461219 TARSP26639 723 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
SCAF8-204ENST00000461219 USP8P40818 1118 aa21.61■■□□□ 1.05
SCAF8-204ENST00000461219 TUBP50607 506 aa21.61■■□□□ 1.05
SCAF8-204ENST00000461219 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
SCAF8-204ENST00000461219 SLC7A9P82251 487 aa21.61■■□□□ 1.05
SCAF8-204ENST00000461219 GOLGA8FQ08AF8 430 aa21.61■■□□□ 1.05
SCAF8-204ENST00000461219 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa21.61■■□□□ 1.05
SCAF8-204ENST00000461219 BST2Q10589 180 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
SCAF8-204ENST00000461219 STX1AQ16623 288 aa21.61■■□□□ 1.05
SCAF8-204ENST00000461219 EXOC3L4Q17RC7 722 aa21.61■■□□□ 1.05
SCAF8-204ENST00000461219 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa21.61■■□□□ 1.05
SCAF8-204ENST00000461219 TADA2BQ86TJ2 420 aa21.61■■□□□ 1.05
SCAF8-204ENST00000461219 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
SCAF8-204ENST00000461219 LMO3Q8TAP4 145 aa21.61■■□□□ 1.05
SCAF8-204ENST00000461219 OSCP1Q8WVF1 389 aa21.61■■□□□ 1.05
SCAF8-204ENST00000461219 KAT5Q92993 513 aa21.61■■□□□ 1.05
SCAF8-204ENST00000461219 MED15Q96RN5 788 aa21.61■■□□□ 1.05
SCAF8-204ENST00000461219 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa21.61■■□□□ 1.05
SCAF8-204ENST00000461219 RNF38Q9H0F5 515 aa21.61■■□□□ 1.05
SCAF8-204ENST00000461219 CCSER2Q9H7U1 834 aa21.61■■□□□ 1.05
SCAF8-204ENST00000461219 LRRC4Q9HBW1 653 aa21.61■■□□□ 1.05
SCAF8-204ENST00000461219 IL37Q9NZH6 218 aa21.61■■□□□ 1.05
SCAF8-204ENST00000461219 NAGPAQ9UK23 515 aa21.61■■□□□ 1.05
SCAF8-204ENST00000461219 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa21.61■■□□□ 1.05
SCAF8-204ENST00000461219 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
SCAF8-204ENST00000461219 WNT6Q9Y6F9 365 aa21.61■■□□□ 1.05
SCAF8-204ENST00000461219 MUC6Q6W4X9 2439 aa21.6■■□□□ 1.05
SCAF8-204ENST00000461219 KCNJ18B7U540 433 aa21.6■■□□□ 1.05
SCAF8-204ENST00000461219 H0Y858 1186 aa21.6■■□□□ 1.05
SCAF8-204ENST00000461219 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
SCAF8-204ENST00000461219 COCHO43405 550 aa21.6■■□□□ 1.05
SCAF8-204ENST00000461219 TLR5O60602 858 aa21.6■■□□□ 1.05
SCAF8-204ENST00000461219 RALAP11233 206 aa21.6■■□□□ 1.05
SCAF8-204ENST00000461219 CTHP32929 405 aa21.6■■□□□ 1.05
SCAF8-204ENST00000461219 LRRC32Q14392 662 aa21.6■■□□□ 1.05
SCAF8-204ENST00000461219 KCNJ12Q14500 433 aa21.6■■□□□ 1.05
SCAF8-204ENST00000461219 STILQ15468 1287 aa21.6■■□□□ 1.05
SCAF8-204ENST00000461219 TRIM65Q6PJ69 517 aa21.6■■□□□ 1.05
SCAF8-204ENST00000461219 FAM83CQ9BQN1 747 aa21.6■■□□□ 1.05
SCAF8-204ENST00000461219 CFAP97Q9P2B7 532 aa21.6■■□□□ 1.05
SCAF8-204ENST00000461219 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa21.6■■□□□ 1.05
SCAF8-204ENST00000461219 MYOFQ9NZM1 2061 aa21.59■■□□□ 1.05
SCAF8-204ENST00000461219 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
SCAF8-204ENST00000461219 HHLA1C9JL84 531 aa21.59■■□□□ 1.05
SCAF8-204ENST00000461219 NFATC1O95644 943 aa21.59■■□□□ 1.05
SCAF8-204ENST00000461219 ARSAP15289 507 aa21.59■■□□□ 1.05
SCAF8-204ENST00000461219 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
SCAF8-204ENST00000461219 PLA2G5P39877 138 aa21.59■■□□□ 1.05
SCAF8-204ENST00000461219 PSEN1P49768 467 aa21.59■■□□□ 1.05
SCAF8-204ENST00000461219 KIF11P52732 1056 aa21.59■■□□□ 1.05
SCAF8-204ENST00000461219 ANGPT1Q15389 498 aa21.59■■□□□ 1.05
SCAF8-204ENST00000461219 VWA3BQ502W6 1294 aa21.59■■□□□ 1.05
SCAF8-204ENST00000461219 PIGZQ86VD9 579 aa21.59■■□□□ 1.05
SCAF8-204ENST00000461219 IRF2BP1Q8IU81 584 aa21.59■■□□□ 1.05
SCAF8-204ENST00000461219 ARHGAP18Q8N392 663 aa21.59■■□□□ 1.05
SCAF8-204ENST00000461219 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa21.59■■□□□ 1.05
SCAF8-204ENST00000461219 UBA3Q8TBC4 463 aa21.59■■□□□ 1.05
SCAF8-204ENST00000461219 A0A1W2PQH9 124 aa21.58■■□□□ 1.05
SCAF8-204ENST00000461219 FAM92AA1XBS5 289 aa21.58■■□□□ 1.05
SCAF8-204ENST00000461219 M0QYV0 167 aa21.58■■□□□ 1.05
SCAF8-204ENST00000461219 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
SCAF8-204ENST00000461219 SETSIPP0DME0 302 aa21.58■■□□□ 1.05
SCAF8-204ENST00000461219 IRF1P10914 325 aa21.58■■□□□ 1.05
SCAF8-204ENST00000461219 TCF3P15923 654 aa21.58■■□□□ 1.05
SCAF8-204ENST00000461219 SLC9A1P19634 815 aa21.58■■□□□ 1.05
SCAF8-204ENST00000461219 BRD2P25440 801 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
SCAF8-204ENST00000461219 PDE4CQ08493 712 aa21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.1 ms