RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459627.1

SH3BP5-208, Transcript of SH3 domain binding protein 5, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP5, Length 473 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5-208ENST00000459627 KCNH2Q12809 1159 aa25.26■■□□□ 1.63
SH3BP5-208ENST00000459627 GAS6Q14393 721 aa25.26■■□□□ 1.63
SH3BP5-208ENST00000459627 EML3Q32P44 896 aa25.26■■□□□ 1.63
SH3BP5-208ENST00000459627 Q6ZS52 159 aa25.26■■□□□ 1.63
SH3BP5-208ENST00000459627 ARHGEF19Q8IW93 802 aa25.26■■□□□ 1.63
SH3BP5-208ENST00000459627 PDZD8Q8NEN9 1154 aa25.26■■□□□ 1.63
SH3BP5-208ENST00000459627 OSCP1Q8WVF1 389 aa25.26■■□□□ 1.63
SH3BP5-208ENST00000459627 WBP2Q969T9 261 aa25.26■■□□□ 1.63
SH3BP5-208ENST00000459627 CFAP97Q9P2B7 532 aa25.26■■□□□ 1.63
SH3BP5-208ENST00000459627 RWDD2AQ9UIY3 292 aa25.26■■□□□ 1.63
SH3BP5-208ENST00000459627 RPS9P46781 194 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
SH3BP5-208ENST00000459627 PDGFRLQ15198 375 aa25.25■■□□□ 1.63
SH3BP5-208ENST00000459627 FOXR2Q6PJQ5 311 aa25.25■■□□□ 1.63
SH3BP5-208ENST00000459627 UBR7Q8N806 425 aa25.25■■□□□ 1.63
SH3BP5-208ENST00000459627 LMO3Q8TAP4 145 aa25.25■■□□□ 1.63
SH3BP5-208ENST00000459627 DUSP16Q9BY84 665 aa25.25■■□□□ 1.63
SH3BP5-208ENST00000459627 NUP62CLQ9H1M0 184 aa25.25■■□□□ 1.63
SH3BP5-208ENST00000459627 NMUR1Q9HB89 426 aa25.25■■□□□ 1.63
SH3BP5-208ENST00000459627 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
SH3BP5-208ENST00000459627 OSER1Q9NX31 292 aa25.25■■□□□ 1.63
SH3BP5-208ENST00000459627 NUDT5Q9UKK9 219 aa25.25■■□□□ 1.63
SH3BP5-208ENST00000459627 MYO15AQ9UKN7 3530 aa25.25■■□□□ 1.63
SH3BP5-208ENST00000459627 FAM92AA1XBS5 289 aa25.24■■□□□ 1.63
SH3BP5-208ENST00000459627 TBX18O95935 607 aa25.24■■□□□ 1.63
SH3BP5-208ENST00000459627 IRF1P10914 325 aa25.24■■□□□ 1.63
SH3BP5-208ENST00000459627 CD19P15391 556 aa25.24■■□□□ 1.63
SH3BP5-208ENST00000459627 HOXC13P31276 330 aa25.24■■□□□ 1.63
SH3BP5-208ENST00000459627 NBL1P41271 181 aa25.24■■□□□ 1.63
SH3BP5-208ENST00000459627 PDE6CP51160 858 aa25.24■■□□□ 1.63
SH3BP5-208ENST00000459627 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
SH3BP5-208ENST00000459627 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa25.24■■□□□ 1.63
SH3BP5-208ENST00000459627 HECTD3Q5T447 861 aa25.24■■□□□ 1.63
SH3BP5-208ENST00000459627 CLEC17AQ6ZS10 378 aa25.24■■□□□ 1.63
SH3BP5-208ENST00000459627 RRAGAQ7L523 313 aa25.24■■□□□ 1.63
SH3BP5-208ENST00000459627 PPM1KQ8N3J5 372 aa25.24■■□□□ 1.63
SH3BP5-208ENST00000459627 OVCA2Q8WZ82 227 aa25.24■■□□□ 1.63
SH3BP5-208ENST00000459627 FAXDC2Q96IV6 333 aa25.24■■□□□ 1.63
SH3BP5-208ENST00000459627 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
SH3BP5-208ENST00000459627 NT5C1BQ96P26 610 aa25.24■■□□□ 1.63
SH3BP5-208ENST00000459627 CHRDQ9H2X0 955 aa25.24■■□□□ 1.63
SH3BP5-208ENST00000459627 ECT2Q9H8V3 914 aa25.24■■□□□ 1.63
SH3BP5-208ENST00000459627 COMMD8Q9NX08 183 aa25.24■■□□□ 1.63
SH3BP5-208ENST00000459627 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP25.24■■□□□ 1.63
SH3BP5-208ENST00000459627 A0A1W2PQH9 124 aa25.23■■□□□ 1.63
SH3BP5-208ENST00000459627 TULP2O00295 520 aa25.23■■□□□ 1.63
SH3BP5-208ENST00000459627 AFPP02771 609 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
SH3BP5-208ENST00000459627 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa25.23■■□□□ 1.63
SH3BP5-208ENST00000459627 GJA4P35212 333 aa25.23■■□□□ 1.63
SH3BP5-208ENST00000459627 DPCR1Q3MIW9 517 aa25.23■■□□□ 1.63
SH3BP5-208ENST00000459627 TTC30AQ86WT1 665 aa25.23■■□□□ 1.63
SH3BP5-208ENST00000459627 EHBP1Q8NDI1 1231 aa25.23■■□□□ 1.63
SH3BP5-208ENST00000459627 MSANTD3Q96H12 275 aa25.23■■□□□ 1.63
SH3BP5-208ENST00000459627 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
SH3BP5-208ENST00000459627 C2orf42Q9NWW7 574 aa25.23■■□□□ 1.63
SH3BP5-208ENST00000459627 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
SH3BP5-208ENST00000459627 DMDP11532 3685 aa25.22■■□□□ 1.63
SH3BP5-208ENST00000459627 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
SH3BP5-208ENST00000459627 MDM4O15151 490 aa25.22■■□□□ 1.63
SH3BP5-208ENST00000459627 GNA14O95837 355 aa25.22■■□□□ 1.63
SH3BP5-208ENST00000459627 TCF3P15923 654 aa25.22■■□□□ 1.63
SH3BP5-208ENST00000459627 PFKLP17858 780 aa25.22■■□□□ 1.63
SH3BP5-208ENST00000459627 MAGEA9P43362 315 aa25.22■■□□□ 1.63
SH3BP5-208ENST00000459627 MARSP56192 900 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
SH3BP5-208ENST00000459627 FSTL4Q6MZW2 842 aa25.22■■□□□ 1.63
SH3BP5-208ENST00000459627 TMEM270Q6UE05 265 aa25.22■■□□□ 1.63
SH3BP5-208ENST00000459627 ASCL5Q7RTU5 278 aa25.22■■□□□ 1.63
SH3BP5-208ENST00000459627 IRF2BP1Q8IU81 584 aa25.22■■□□□ 1.63
SH3BP5-208ENST00000459627 CPA6Q8N4T0 437 aa25.22■■□□□ 1.63
SH3BP5-208ENST00000459627 TTC39CQ8N584 583 aa25.22■■□□□ 1.63
SH3BP5-208ENST00000459627 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
SH3BP5-208ENST00000459627 FBXO44Q9H4M3 255 aa25.22■■□□□ 1.63
SH3BP5-208ENST00000459627 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa25.22■■□□□ 1.63
SH3BP5-208ENST00000459627 CCDC192P0DO97 292 aa25.21■■□□□ 1.63
SH3BP5-208ENST00000459627 GALK1P51570 392 aa25.21■■□□□ 1.63
SH3BP5-208ENST00000459627 KIF11P52732 1056 aa25.21■■□□□ 1.63
SH3BP5-208ENST00000459627 SATB1Q01826 763 aa25.21■■□□□ 1.63
SH3BP5-208ENST00000459627 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa25.21■■□□□ 1.63
SH3BP5-208ENST00000459627 SNX30Q5VWJ9 437 aa25.21■■□□□ 1.63
SH3BP5-208ENST00000459627 ARHGAP17Q68EM7 881 aa25.21■■□□□ 1.63
SH3BP5-208ENST00000459627 PKN3Q6P5Z2 889 aa25.21■■□□□ 1.63
SH3BP5-208ENST00000459627 MLKLQ8NB16 471 aa25.21■■□□□ 1.63
SH3BP5-208ENST00000459627 UBA3Q8TBC4 463 aa25.21■■□□□ 1.63
SH3BP5-208ENST00000459627 GPT2Q8TD30 523 aa25.21■■□□□ 1.63
SH3BP5-208ENST00000459627 DNAI2Q9GZS0 605 aa25.21■■□□□ 1.63
SH3BP5-208ENST00000459627 TSPAN16Q9UKR8 245 aa25.21■■□□□ 1.63
SH3BP5-208ENST00000459627 SCML2Q9UQR0 700 aa25.21■■□□□ 1.63
SH3BP5-208ENST00000459627 USP34Q70CQ2 3546 aa25.21■■□□□ 1.63
SH3BP5-208ENST00000459627 PMM2O15305 246 aa25.2■■□□□ 1.62
SH3BP5-208ENST00000459627 TLR5O60602 858 aa25.2■■□□□ 1.62
SH3BP5-208ENST00000459627 EGFP01133 1207 aa25.2■■□□□ 1.62
SH3BP5-208ENST00000459627 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
SH3BP5-208ENST00000459627 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
SH3BP5-208ENST00000459627 APBA1Q02410 837 aa25.2■■□□□ 1.62
SH3BP5-208ENST00000459627 LRRC32Q14392 662 aa25.2■■□□□ 1.62
SH3BP5-208ENST00000459627 SGO2Q562F6 1265 aa25.2■■□□□ 1.62
SH3BP5-208ENST00000459627 SCD5Q86SK9 330 aa25.2■■□□□ 1.62
SH3BP5-208ENST00000459627 PIGZQ86VD9 579 aa25.2■■□□□ 1.62
SH3BP5-208ENST00000459627 TFAP2BQ92481 460 aa25.2■■□□□ 1.62
SH3BP5-208ENST00000459627 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
SH3BP5-208ENST00000459627 ATP2A3Q93084 1043 aa25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22 ms