RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446332.1

SOX9-AS1-207, SOX9 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SOX9-AS1, Length 443 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX9-AS1-207ENST00000446332 NCDNQ9UBB6 729 aa14.84□□□□□ -0.03
SOX9-AS1-207ENST00000446332 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.03
SOX9-AS1-207ENST00000446332 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa14.83□□□□□ -0.04
SOX9-AS1-207ENST00000446332 CLDN5O00501 218 aa14.83□□□□□ -0.04
SOX9-AS1-207ENST00000446332 CETN3O15182 167 aa14.83□□□□□ -0.04
SOX9-AS1-207ENST00000446332 RETP07949 1114 aa14.83□□□□□ -0.04
SOX9-AS1-207ENST00000446332 PIK3CAP42336 1068 aa14.83□□□□□ -0.04
SOX9-AS1-207ENST00000446332 NDST1P52848 882 aa14.83□□□□□ -0.04
SOX9-AS1-207ENST00000446332 ARHGAP8P85298 464 aa14.83□□□□□ -0.04
SOX9-AS1-207ENST00000446332 PPP3CAQ08209 521 aa14.83□□□□□ -0.04
SOX9-AS1-207ENST00000446332 SYT13Q7L8C5 426 aa14.83□□□□□ -0.04
SOX9-AS1-207ENST00000446332 FBXO32Q969P5 355 aa14.83□□□□□ -0.04
SOX9-AS1-207ENST00000446332 MED10Q9BTT4 135 aa14.83□□□□□ -0.04
SOX9-AS1-207ENST00000446332 NT5C1AQ9BXI3 368 aa14.83□□□□□ -0.04
SOX9-AS1-207ENST00000446332 LINC00597Q9H2U6 94 aa14.83□□□□□ -0.04
SOX9-AS1-207ENST00000446332 GMEB2Q9UKD1 530 aa14.83□□□□□ -0.04
SOX9-AS1-207ENST00000446332 WNT6Q9Y6F9 365 aa14.83□□□□□ -0.04
SOX9-AS1-207ENST00000446332 HRO43593 1189 aa14.82□□□□□ -0.04
SOX9-AS1-207ENST00000446332 AP1G2O75843 785 aa14.82□□□□□ -0.04
SOX9-AS1-207ENST00000446332 PPP1R2P41236 205 aa14.82□□□□□ -0.04
SOX9-AS1-207ENST00000446332 RAP1GAPP47736 663 aa14.82□□□□□ -0.04
SOX9-AS1-207ENST00000446332 GCLMP48507 274 aa14.82□□□□□ -0.04
SOX9-AS1-207ENST00000446332 SLC5A3P53794 718 aa14.82□□□□□ -0.04
SOX9-AS1-207ENST00000446332 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
SOX9-AS1-207ENST00000446332 LRRC63Q05C16 580 aa14.82□□□□□ -0.04
SOX9-AS1-207ENST00000446332 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
SOX9-AS1-207ENST00000446332 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP14.82□□□□□ -0.04
SOX9-AS1-207ENST00000446332 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
SOX9-AS1-207ENST00000446332 FOXR2Q6PJQ5 311 aa14.82□□□□□ -0.04
SOX9-AS1-207ENST00000446332 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
SOX9-AS1-207ENST00000446332 KIAA2013Q8IYS2 634 aa14.82□□□□□ -0.04
SOX9-AS1-207ENST00000446332 ABCA7Q8IZY2 2146 aa14.82□□□□□ -0.04
SOX9-AS1-207ENST00000446332 FBXL13Q8NEE6 735 aa14.82□□□□□ -0.04
SOX9-AS1-207ENST00000446332 TAS1R2Q8TE23 839 aa14.82□□□□□ -0.04
SOX9-AS1-207ENST00000446332 ACDQ96AP0 544 aa14.82□□□□□ -0.04
SOX9-AS1-207ENST00000446332 LOXL4Q96JB6 756 aa14.82□□□□□ -0.04
SOX9-AS1-207ENST00000446332 SMOQ99835 787 aa14.82□□□□□ -0.04
SOX9-AS1-207ENST00000446332 UBXN6Q9BZV1 441 aa14.82□□□□□ -0.04
SOX9-AS1-207ENST00000446332 NIF3L1Q9GZT8 377 aa14.82□□□□□ -0.04
SOX9-AS1-207ENST00000446332 GDPD2Q9HCC8 539 aa14.82□□□□□ -0.04
SOX9-AS1-207ENST00000446332 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
SOX9-AS1-207ENST00000446332 DLL3Q9NYJ7 618 aa14.82□□□□□ -0.04
SOX9-AS1-207ENST00000446332 EBF1Q9UH73 591 aa14.82□□□□□ -0.04
SOX9-AS1-207ENST00000446332 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa14.82□□□□□ -0.04
SOX9-AS1-207ENST00000446332 CPQQ9Y646 472 aa14.82□□□□□ -0.04
SOX9-AS1-207ENST00000446332 GON4LQ3T8J9 2241 aa14.81□□□□□ -0.04
SOX9-AS1-207ENST00000446332 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
SOX9-AS1-207ENST00000446332 CILPO75339 1184 aa14.81□□□□□ -0.04
SOX9-AS1-207ENST00000446332 ABL1P00519 1130 aa14.81□□□□□ -0.04
SOX9-AS1-207ENST00000446332 EGFP01133 1207 aa14.81□□□□□ -0.04
SOX9-AS1-207ENST00000446332 EPB41P11171 864 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
SOX9-AS1-207ENST00000446332 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
SOX9-AS1-207ENST00000446332 TGM1P22735 817 aa14.81□□□□□ -0.04
SOX9-AS1-207ENST00000446332 PRCPP42785 496 aa14.81□□□□□ -0.04
SOX9-AS1-207ENST00000446332 FNTBP49356 437 aa14.81□□□□□ -0.04
SOX9-AS1-207ENST00000446332 PSEN1P49768 467 aa14.81□□□□□ -0.04
SOX9-AS1-207ENST00000446332 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
SOX9-AS1-207ENST00000446332 KLHDC10Q6PID8 442 aa14.81□□□□□ -0.04
SOX9-AS1-207ENST00000446332 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa14.81□□□□□ -0.04
SOX9-AS1-207ENST00000446332 DCLK2Q8N568 766 aa14.81□□□□□ -0.04
SOX9-AS1-207ENST00000446332 ZMIZ2Q8NF64 920 aa14.81□□□□□ -0.04
SOX9-AS1-207ENST00000446332 SCAMP5Q8TAC9 235 aa14.81□□□□□ -0.04
SOX9-AS1-207ENST00000446332 SLC2A14Q8TDB8 520 aa14.81□□□□□ -0.04
SOX9-AS1-207ENST00000446332 CYFIP2Q96F07 1278 aa14.81□□□□□ -0.04
SOX9-AS1-207ENST00000446332 TSG101Q99816 390 aa14.81□□□□□ -0.04
SOX9-AS1-207ENST00000446332 CYLDQ9NQC7 956 aa14.81□□□□□ -0.04
SOX9-AS1-207ENST00000446332 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
SOX9-AS1-207ENST00000446332 KRT82Q9NSB4 513 aa14.81□□□□□ -0.04
SOX9-AS1-207ENST00000446332 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
SOX9-AS1-207ENST00000446332 SLC8A2Q9UPR5 921 aa14.81□□□□□ -0.04
SOX9-AS1-207ENST00000446332 SCML2Q9UQR0 700 aa14.81□□□□□ -0.04
SOX9-AS1-207ENST00000446332 COQ4Q9Y3A0 265 aa14.81□□□□□ -0.04
SOX9-AS1-207ENST00000446332 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa14.81□□□□□ -0.04
SOX9-AS1-207ENST00000446332 NUP205Q92621 2012 aa14.81□□□□□ -0.04
SOX9-AS1-207ENST00000446332 PI4KAP42356 2102 aa14.81□□□□□ -0.04
SOX9-AS1-207ENST00000446332 SPTBN2O15020 2390 aa14.8□□□□□ -0.04
SOX9-AS1-207ENST00000446332 PMM2O15305 246 aa14.8□□□□□ -0.04
SOX9-AS1-207ENST00000446332 COCHO43405 550 aa14.8□□□□□ -0.04
SOX9-AS1-207ENST00000446332 RNF40O75150 1001 aa14.8□□□□□ -0.04
SOX9-AS1-207ENST00000446332 CLSTN1O94985 981 aa14.8□□□□□ -0.04
SOX9-AS1-207ENST00000446332 ADH1CP00326 375 aa14.8□□□□□ -0.04
SOX9-AS1-207ENST00000446332 FAM200BP0CF97 657 aa14.8□□□□□ -0.04
SOX9-AS1-207ENST00000446332 OPRD1P41143 372 aa14.8□□□□□ -0.04
SOX9-AS1-207ENST00000446332 MXI1P50539 228 aa14.8□□□□□ -0.04
SOX9-AS1-207ENST00000446332 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
SOX9-AS1-207ENST00000446332 LMNB2Q03252 620 aa14.8□□□□□ -0.04
SOX9-AS1-207ENST00000446332 PNOCQ13519 176 aa14.8□□□□□ -0.04
SOX9-AS1-207ENST00000446332 DHCR24Q15392 516 aa14.8□□□□□ -0.04
SOX9-AS1-207ENST00000446332 SPOPLQ6IQ16 392 aa14.8□□□□□ -0.04
SOX9-AS1-207ENST00000446332 CLEC20AQ6ZU45 233 aa14.8□□□□□ -0.04
SOX9-AS1-207ENST00000446332 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa14.8□□□□□ -0.04
SOX9-AS1-207ENST00000446332 C12orf29Q8N999 325 aa14.8□□□□□ -0.04
SOX9-AS1-207ENST00000446332 KCNV2Q8TDN2 545 aa14.8□□□□□ -0.04
SOX9-AS1-207ENST00000446332 WHAMMQ8TF30 809 aa14.8□□□□□ -0.04
SOX9-AS1-207ENST00000446332 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
SOX9-AS1-207ENST00000446332 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
SOX9-AS1-207ENST00000446332 DUSP16Q9BY84 665 aa14.8□□□□□ -0.04
SOX9-AS1-207ENST00000446332 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
SOX9-AS1-207ENST00000446332 C2orf42Q9NWW7 574 aa14.8□□□□□ -0.04
SOX9-AS1-207ENST00000446332 RAB20Q9NX57 234 aa14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.5 ms