RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446015.6

AP1S3-208, Transcript of adaptor related protein complex 1 subunit sigma 3, human

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene AP1S3, Length 499 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AP1S3-208	ENST00000446015	HOXA4	Q00056	320 aa	Predicted RBP	4.38	□□□□□ -1.71
AP1S3-208	ENST00000446015	FMO1	Q01740	532 aa		4.38	□□□□□ -1.71
AP1S3-208	ENST00000446015	CERKL	Q49MI3	558 aa	Predicted RBP	4.38	□□□□□ -1.71
AP1S3-208	ENST00000446015	PCID2	Q5JVF3	399 aa		4.38	□□□□□ -1.71
AP1S3-208	ENST00000446015	CACHD1	Q5VU97	1274 aa		4.38	□□□□□ -1.71
AP1S3-208	ENST00000446015	TRIM72	Q6ZMU5	477 aa		4.38	□□□□□ -1.71
AP1S3-208	ENST00000446015	CAND1	Q86VP6	1230 aa	Known RBP	4.38	□□□□□ -1.71
AP1S3-208	ENST00000446015	ZNF280B	Q86YH2	543 aa		4.38	□□□□□ -1.71
AP1S3-208	ENST00000446015	SFTPA1	Q8IWL2	248 aa		4.38	□□□□□ -1.71
AP1S3-208	ENST00000446015	PPP2R3C	Q969Q6	453 aa		4.38	□□□□□ -1.71
AP1S3-208	ENST00000446015	ARPC5L	Q9BPX5	153 aa		4.38	□□□□□ -1.71
AP1S3-208	ENST00000446015	VN1R3	Q9BXE9	311 aa		4.38	□□□□□ -1.71
AP1S3-208	ENST00000446015	CPNE7	Q9UBL6	633 aa		4.38	□□□□□ -1.71
AP1S3-208	ENST00000446015	MRPS17	Q9Y2R5	130 aa	Known RBP	4.38	□□□□□ -1.71
AP1S3-208	ENST00000446015	USP19	O94966	1318 aa		4.38	□□□□□ -1.71
AP1S3-208	ENST00000446015	LRRC3C	A6NJW4	275 aa		4.37	□□□□□ -1.71
AP1S3-208	ENST00000446015	CD3EAP	O15446	510 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
AP1S3-208	ENST00000446015	RGS10	O43665	173 aa		4.37	□□□□□ -1.71
AP1S3-208	ENST00000446015	TMPRSS11D	O60235	418 aa		4.37	□□□□□ -1.71
AP1S3-208	ENST00000446015	PQBP1	O60828	265 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
AP1S3-208	ENST00000446015	SRGAP2	O75044	1071 aa		4.37	□□□□□ -1.71
AP1S3-208	ENST00000446015	PIAS2	O75928	621 aa		4.37	□□□□□ -1.71
AP1S3-208	ENST00000446015	USP1	O94782	785 aa		4.37	□□□□□ -1.71
AP1S3-208	ENST00000446015	RASAL1	O95294	804 aa		4.37	□□□□□ -1.71
AP1S3-208	ENST00000446015	PDHA1	P08559	390 aa		4.37	□□□□□ -1.71
AP1S3-208	ENST00000446015	JUP	P14923	745 aa		4.37	□□□□□ -1.71
AP1S3-208	ENST00000446015	TPH1	P17752	444 aa		4.37	□□□□□ -1.71
AP1S3-208	ENST00000446015	ENG	P17813	658 aa		4.37	□□□□□ -1.71
AP1S3-208	ENST00000446015	RPS16	P62249	146 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
AP1S3-208	ENST00000446015	ST3GAL2	Q16842	350 aa		4.37	□□□□□ -1.71
AP1S3-208	ENST00000446015	ZIK1	Q3SY52	487 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
AP1S3-208	ENST00000446015	C10orf62	Q5T681	223 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
AP1S3-208	ENST00000446015	SRRM1	Q8IYB3	904 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
AP1S3-208	ENST00000446015	OR56A3	Q8NH54	315 aa		4.37	□□□□□ -1.71
AP1S3-208	ENST00000446015	NTN5	Q8WTR8	489 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
AP1S3-208	ENST00000446015	FYTTD1	Q96QD9	318 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
AP1S3-208	ENST00000446015	SNX18	Q96RF0	628 aa		4.37	□□□□□ -1.71
AP1S3-208	ENST00000446015	BRIP1	Q9BX63	1249 aa		4.37	□□□□□ -1.71
AP1S3-208	ENST00000446015	STK31	Q9BXU1	1019 aa		4.37	□□□□□ -1.71
AP1S3-208	ENST00000446015	SH3BP4	Q9P0V3	963 aa		4.37	□□□□□ -1.71
AP1S3-208	ENST00000446015	FNIP2	Q9P278	1114 aa		4.37	□□□□□ -1.71
AP1S3-208	ENST00000446015	DNMT3B	Q9UBC3	853 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
AP1S3-208	ENST00000446015	MAFF	Q9ULX9	164 aa		4.37	□□□□□ -1.71
AP1S3-208	ENST00000446015	FRMD4B	Q9Y2L6	1034 aa		4.37	□□□□□ -1.71
AP1S3-208	ENST00000446015	SNX14	Q9Y5W7	946 aa		4.37	□□□□□ -1.71
AP1S3-208	ENST00000446015	PCSK5	Q92824	1860 aa		4.37	□□□□□ -1.71
AP1S3-208	ENST00000446015	BTBD19	C9JJ37	291 aa		4.36	□□□□□ -1.71
AP1S3-208	ENST00000446015	THAP12	O43422	761 aa		4.36	□□□□□ -1.71
AP1S3-208	ENST00000446015	RRP9	O43818	475 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
AP1S3-208	ENST00000446015	ANXA2	P07355	339 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
AP1S3-208	ENST00000446015	MYL3	P08590	195 aa		4.36	□□□□□ -1.71
AP1S3-208	ENST00000446015	IL1R2	P27930	398 aa		4.36	□□□□□ -1.71
AP1S3-208	ENST00000446015	ADORA2A	P29274	412 aa		4.36	□□□□□ -1.71
AP1S3-208	ENST00000446015	GK	P32189	559 aa		4.36	□□□□□ -1.71
AP1S3-208	ENST00000446015	CARS	P49589	748 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
AP1S3-208	ENST00000446015	PROK1	P58294	105 aa		4.36	□□□□□ -1.71
AP1S3-208	ENST00000446015	TUBA4A	P68366	448 aa		4.36	□□□□□ -1.71
AP1S3-208	ENST00000446015	TIAL1	Q01085	375 aa	Known RBP eCLIP	4.36	□□□□□ -1.71
AP1S3-208	ENST00000446015	GRM1	Q13255	1194 aa		4.36	□□□□□ -1.71
AP1S3-208	ENST00000446015	OS9	Q13438	667 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
AP1S3-208	ENST00000446015	CLCA4	Q14CN2	919 aa		4.36	□□□□□ -1.71
AP1S3-208	ENST00000446015	EZH2	Q15910	746 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
AP1S3-208	ENST00000446015	ZNF750	Q32MQ0	723 aa		4.36	□□□□□ -1.71
AP1S3-208	ENST00000446015	COLEC12	Q5KU26	742 aa		4.36	□□□□□ -1.71
AP1S3-208	ENST00000446015	ERAP2	Q6P179	960 aa		4.36	□□□□□ -1.71
AP1S3-208	ENST00000446015	XRRA1	Q6P2D8	792 aa		4.36	□□□□□ -1.71
AP1S3-208	ENST00000446015	USP17L6P	Q6QN14	398 aa		4.36	□□□□□ -1.71
AP1S3-208	ENST00000446015	PARD3B	Q8TEW8	1205 aa		4.36	□□□□□ -1.71
AP1S3-208	ENST00000446015	PHKB	Q93100	1093 aa		4.36	□□□□□ -1.71
AP1S3-208	ENST00000446015	ZDHHC12	Q96GR4	267 aa		4.36	□□□□□ -1.71
AP1S3-208	ENST00000446015	C17orf80	Q9BSJ5	609 aa		4.36	□□□□□ -1.71
AP1S3-208	ENST00000446015	EIF2A	Q9BY44	585 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
AP1S3-208	ENST00000446015	STK32B	Q9NY57	414 aa		4.36	□□□□□ -1.71
AP1S3-208	ENST00000446015	COL20A1	Q9P218	1284 aa		4.36	□□□□□ -1.71
AP1S3-208	ENST00000446015	ZNF212	Q9UDV6	495 aa		4.36	□□□□□ -1.71
AP1S3-208	ENST00000446015	ADAM21	Q9UKJ8	722 aa		4.36	□□□□□ -1.71
AP1S3-208	ENST00000446015	AMFR	Q9UKV5	643 aa		4.36	□□□□□ -1.71
AP1S3-208	ENST00000446015	CAPN11	Q9UMQ6	739 aa		4.36	□□□□□ -1.71
AP1S3-208	ENST00000446015	DRG1	Q9Y295	367 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
AP1S3-208	ENST00000446015	POC1B-GALNT4	F8VUJ3	575 aa		4.35	□□□□□ -1.71
AP1S3-208	ENST00000446015	SNX2	O60749	519 aa		4.35	□□□□□ -1.71
AP1S3-208	ENST00000446015	IL18RAP	O95256	599 aa		4.35	□□□□□ -1.71
AP1S3-208	ENST00000446015	CTGF	P29279	349 aa		4.35	□□□□□ -1.71
AP1S3-208	ENST00000446015	PTDSS1	P48651	473 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
AP1S3-208	ENST00000446015	CASP5	P51878	434 aa		4.35	□□□□□ -1.71
AP1S3-208	ENST00000446015	AK2	P54819	239 aa		4.35	□□□□□ -1.71
AP1S3-208	ENST00000446015	TIRAP	P58753	221 aa		4.35	□□□□□ -1.71
AP1S3-208	ENST00000446015	FOXF2	Q12947	444 aa		4.35	□□□□□ -1.71
AP1S3-208	ENST00000446015	IFIT5	Q13325	482 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
AP1S3-208	ENST00000446015	DAG1	Q14118	895 aa		4.35	□□□□□ -1.71
AP1S3-208	ENST00000446015	DHX8	Q14562	1220 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
AP1S3-208	ENST00000446015	KRT72	Q14CN4	511 aa		4.35	□□□□□ -1.71
AP1S3-208	ENST00000446015	LONRF1	Q17RB8	773 aa		4.35	□□□□□ -1.71
AP1S3-208	ENST00000446015	PROSER3	Q2NL68	480 aa		4.35	□□□□□ -1.71
AP1S3-208	ENST00000446015	FAM83B	Q5T0W9	1011 aa		4.35	□□□□□ -1.71
AP1S3-208	ENST00000446015	SLC9A4	Q6AI14	798 aa		4.35	□□□□□ -1.71
AP1S3-208	ENST00000446015	KIRREL2	Q6UWL6	708 aa		4.35	□□□□□ -1.71
AP1S3-208	ENST00000446015	PTCHD4	Q6ZW05	846 aa		4.35	□□□□□ -1.71
AP1S3-208	ENST00000446015	SKAP1	Q86WV1	359 aa		4.35	□□□□□ -1.71
AP1S3-208	ENST00000446015	GALNT4	Q8N4A0	578 aa		4.35	□□□□□ -1.71

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